BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150L14
Chromosome6 (Build37)
Map Location 97,146,872 - 97,336,628
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUbe1c, Arl6ip5, Lmod3, Frmd4b
Upstream geneC630007B19Rik, C130034I18Rik, A130022J15Rik, Tmf1
Downstream geneLOC641241, LOC100043692, Mitf, Gm765, LOC666019
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150L14.bB6Ng01-150L14.g
ACCDH946731DH946732
length223896
definitionDH946731|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150L14, 5' end.DH946732|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150L14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,146,872 - 97,147,094)(97,335,734 - 97,336,628)
sequence
tgcagcaacttcagccttgggtcttccgacatctttaggcctagagaaaa
cattgtattaagttgtcatctataatatccatttaaatggtctacataat
tagcttccaaatgaaagaatggacagtttatctataacatactttgaaaa
aatattaactacaacttttttattactcttaagattgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
gaattccagagcagacacaggagtttaggaataacctttttcaattctgt
tcctcattttgacttgatggggttgtgttgagatttcatgttaagaatgc
acaaaatcaggctggagagatggctcagtgattaagagcactgactgatc
ttgcagaggtcctcctagtaaccacatggtggctcacaaccatctgtact
aggatccatgtcctttgtggtgtgtctgaagacagccacagggtactcct
atacataaaatgaataagtccttttaaaaggcacaaaatccttagaatgg
atatagtagcccagacctttaatctaagcacttgggaagtcaaggtacta
agtagaagggtaaacacgggtttgagcagggctgagccagagttacagag
agagttcaagtcagtttgggataaactgagatgttgacttaaaagacaac
aaataagaatgtataaggttcatttccttcctaatgggaaggaaaggaat
gagagaagagccccttcagtgctcaggatgttgggctctcagagcctttg
gatgactaaaagcaagaacacagaccagatagttaccttaataactagtg
agtggctacagtggtaactccttggagttaggccagcagcagacccggcc
ccttaaaagcatctctcgtttatctttgtttcagtcactgttcttggaag
acaaaattgcccttaataaattaggattcgggatattgtccccactgctc
agagtagagcaggccatagcagtctctaagtggggaaacggcttgtaatt
catccacactttttgtatacacttaggtttttctgttgttgattttgtta
ttttagttctcatgctgcccccattagctaagatctcttgtaattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_97146872_97147094
seq2: B6Ng01-150L14.b_50_272

seq1  TGCAGCAACTTCAGCCTTGGGTCTTCCGACATCTTTAGGCCTAGAGAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCAACTTCAGCCTTGGGTCTTCCGACATCTTTAGGCCTAGAGAAAA  50

seq1  CATTGTATTAAGTTGTCATCTATAATATCCATTTAAATGGTCTACATAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTATTAAGTTGTCATCTATAATATCCATTTAAATGGTCTACATAAT  100

seq1  TAGCTTCCAAATGAAAGAATGGACAGTTTATCTATAACATACTTTGAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTCCAAATGAAAGAATGGACAGTTTATCTATAACATACTTTGAAAA  150

seq1  AATATTAACTACAACTTTTTTATTACTCTTAAGATTGTGTGTGTGTGTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTAACTACAACTTTTTTATTACTCTTAAGATTGTGTGTGTGTGTGT  200

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  223
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  223

seq1: chr6_97335734_97336628
seq2: B6Ng01-150L14.g_70_965 (reverse)

seq1  GAATAACAAGAGATCTTAGCTAATGGGGGCAGCATGAGAACTAAAATAAC  50
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTACAAGAGATCTTAGCTAATGGGGGCAGCATGAGAACTAAAATAAC  50

seq1  AAAATCAACAACAG-AAAACCTAAGTGTATACAAAAAGTGTGGATTGAAT  99
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AAAATCAACAACAGAAAAACCTAAGTGTATACAAAAAGTGTGGA-TGAAT  99

seq1  TAC-AGCCGTTTCCCCACTTAGAGACTGCTATGGCCTGCTCTACTCTGAG  148
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGCCGTTTCCCCACTTAGAGACTGCTATGGCCTGCTCTACTCTGAG  149

seq1  CAGTGGGGACAATATCCCGAATCCTAATTTATTAAGGGCAATTTTGTCTT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGGACAATATCCCGAATCCTAATTTATTAAGGGCAATTTTGTCTT  199

seq1  CCAAGAACAGTGACTGAAACAAAGATAAACGAGAGATGCTTTTAAGGGGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAACAGTGACTGAAACAAAGATAAACGAGAGATGCTTTTAAGGGGC  249

seq1  CGGGTCTGCTGCTGGCCTAACTCCAAGGAGTTACCACTGTAGCCACTCAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTCTGCTGCTGGCCTAACTCCAAGGAGTTACCACTGTAGCCACTCAC  299

seq1  TAGTTATTAAGGTAACTATCTGGTCTGTGTTCTTGCTTTTAGTCATCCAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTATTAAGGTAACTATCTGGTCTGTGTTCTTGCTTTTAGTCATCCAA  349

seq1  AGGCTCTGAGAGCCCAACATCCTGAGCACTGAAGGGGCTCTTCTCTCATT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCTGAGAGCCCAACATCCTGAGCACTGAAGGGGCTCTTCTCTCATT  399

seq1  CCTTTCCTTCCCATTAGGAAGGAAATGAACCTTATACATTCTTATTTGTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCTTCCCATTAGGAAGGAAATGAACCTTATACATTCTTATTTGTT  449

seq1  GTCTTTTAAGTCAACATCTCAGTTTATCCCAAACTGACTTGAACTCTCTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTAAGTCAACATCTCAGTTTATCCCAAACTGACTTGAACTCTCTC  499

seq1  TGTAACTCTGGCTCAGCCCTGCTCAAACCCGTGTTTACCCTTCTACTTAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACTCTGGCTCAGCCCTGCTCAAACCCGTGTTTACCCTTCTACTTAG  549

seq1  TACCTTGACTTCCCAAGTGCTTAGATTAAAGGTCTGGGCTACTATATCCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTGACTTCCCAAGTGCTTAGATTAAAGGTCTGGGCTACTATATCCA  599

seq1  TTCTAAGGATTTTGTGCCTTTTAAAAGGACTTATTCATTTTATGTATAGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGGATTTTGTGCCTTTTAAAAGGACTTATTCATTTTATGTATAGG  649

seq1  AGTACCCTGTGGCTGTCTTCAGACACACCACAAAGGACATGGATCCTAGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCCTGTGGCTGTCTTCAGACACACCACAAAGGACATGGATCCTAGT  699

seq1  ACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTACTAGGAGGACCTCTGCAAGAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTACTAGGAGGACCTCTGCAAGAT  749

seq1  CAGTCAGTGCTCTTAATCACTGAGCCATCTCTCCAGCCTGATTTTGTGCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCAGTGCTCTTAATCACTGAGCCATCTCTCCAGCCTGATTTTGTGCA  799

seq1  TTCTTAACATGAAATCTCAACACAACCCCATCAAGTCAAAATGAGGAACA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAACATGAAATCTCAACACAACCCCATCAAGTCAAAATGAGGAACA  849

seq1  GAATTGAAAAAGGTTATTCCTAAACTCCTGTGTCTGCTCTGGAATTC  895
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGAAAAAGGTTATTCCTAAACTCCTGTGTCTGCTCTGGAATTC  896