BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163H07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 46,661,228 - 46,745,446
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCntnap2
Upstream geneRbpsuh-rs3
Downstream geneLOC622745, LOC100041064, LOC100041078, A930035D04Rik, Cul1, Ezh2, Rn4.5s, EG384379
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163H07.bB6Ng01-163H07.g
ACCDH956037DH956038
length1,164297
definitionDH956037|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163H07, 5' end.DH956038|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163H07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,661,228 - 46,662,388)(46,745,150 - 46,745,446)
sequence
gaattctactgtctcccagacacatcacctctgtcagagttggctttcct
gaagcatctcagccacactagtttctcttggatctttctacacccacaca
ctgcccaacccccacctcatatctctctgattgcattgtaccacttacct
tttataagtactccttgaacacttcctactcccttgaagcaatgattagg
cacattctactgtgtctaattctgcattatcacagtactgggctaactgt
cttcttcacaggactgtagccccatgatagtaggtgcaggaccagggctg
tggtgcatgactctcaatgtacaattagcatggcaactatttagcaaatg
aaggaattctattatttagacgtggctggaactgtggtccactgttcact
cttgaagctgtattatttgcaatacacgaaattttaaactataggaaaat
cagtgtataaccttaactctaaaattaatttgggttagcagatttaactt
ttctcctgtaaagttttaaatgagtgaaaattctactccaacccaaaggt
attttataaataaatagacatagctgaaatggacttgagctcattatatt
tcaccttgcgattaaccttcatgaataggccagttcaccttaggagtctt
tattcttctgtgtaatcaattagcgcttgtaatagactgaaaaggttata
ttccagagtagtcatcatcctagagaggaagaaaagatacagcagaggac
ctatgcagtgaatatgatgcttgggtctatcaggcattaagaaaggccaa
cagaggcaaatccctatgacaccaagcagtgttaaaggacattcccatag
gtacaatctcaaaagctgagtcctagtgacagtgtgaaagagttggtaag
tagaagcatcaaggctagcccaaagtaaagtttctgaaccttgacctttt
aggctgggttcgttctttgttatcatgagagtgcttagttagggacccaa
caagaagcttctctgtcctaagagtgtctaaatgatgactgtagtcttgt
gtgggtctcctggagatgattaagagccacctaaatttaatataagaagc
aaactggtaagtcttaccaacaaggtcaggtgtgcctcagccaggttttt
gagctttattctga
tctagccatcactggggacgctcacaaatgatcatagtgatgaagtaagt
gagggttgagtaatcagttgtaagaaaggtacctatatcacccctgatgt
tgtgtgcactagattgcccacatcatcacagggcactagcttggacagcc
agctgtcaatcaagcatgaacccaaagaaacttatattctccaattaata
attggagaataattattctccaataataatgattgaaatatatatgtatg
catgcatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_46661228_46662388
seq2: B6Ng01-163H07.b_44_1207

seq1  GAATTCTACTGTCTCCCAGACACATCACCTCTGTCAGAGTTGGCTTTCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTGTCTCCCAGACACATCACCTCTGTCAGAGTTGGCTTTCCT  50

seq1  GAAGCATCTCAGCCACACTAGTTTCTCTTGGATCTTTCTACACCCACACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCATCTCAGCCACACTAGTTTCTCTTGGATCTTTCTACACCCACACA  100

seq1  CTGCCCAACCCCCACCTCATATCTCTCTGATTGCATTGTACCACTTACCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCAACCCCCACCTCATATCTCTCTGATTGCATTGTACCACTTACCT  150

seq1  TTTATAAGTACTCCTTGAACACTTCCTACTCCCTTGAAGCAATGATTAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAAGTACTCCTTGAACACTTCCTACTCCCTTGAAGCAATGATTAGG  200

seq1  CACATTCTACTGTGTCTAATTCTGCATTATCACAGTACTGGGCTAACTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTCTACTGTGTCTAATTCTGCATTATCACAGTACTGGGCTAACTGT  250

seq1  CTTCTTCACAGGACTGTAGCCCCATGATAGTAGGTGCAGGACCAGGGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCACAGGACTGTAGCCCCATGATAGTAGGTGCAGGACCAGGGCTG  300

seq1  TGGTGCATGACTCTCAATGTACAATTAGCATGGCAACTATTTAGCAAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCATGACTCTCAATGTACAATTAGCATGGCAACTATTTAGCAAATG  350

seq1  AAGGAATTCTATTATTTAGACGTGGCTGGAACTGTGGTCCACTGTTCACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATTCTATTATTTAGACGTGGCTGGAACTGTGGTCCACTGTTCACT  400

seq1  CTTGAAGCTGTATTATTTGCAATACACGAAATTTTAAACTATAGGAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAGCTGTATTATTTGCAATACACGAAATTTTAAACTATAGGAAAAT  450

seq1  CAGTGTATAACCTTAACTCTAAAATTAATTTGGGTTAGCAGATTTAACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTATAACCTTAACTCTAAAATTAATTTGGGTTAGCAGATTTAACTT  500

seq1  TTCTCCTGTAAAGTTTTAAATGAGTGAAAATTCTACTCCAACCCAAAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTGTAAAGTTTTAAATGAGTGAAAATTCTACTCCAACCCAAAGGT  550

seq1  ATTTTATAAATAAATAGACATAGCTGAAATGGACTTGAGCTCATTATATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATAAATAAATAGACATAGCTGAAATGGACTTGAGCTCATTATATT  600

seq1  TCACCTTGCGATTAACCTTCATGAATAGGCCAGTTCACCTTAGGAGTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTGCGATTAACCTTCATGAATAGGCCAGTTCACCTTAGGAGTCTT  650

seq1  TATTCTTCTGTGTAATCAATTAGCGCTTGTAATAGACTGAAAAGGTTATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCTTCTGTGTAATCAATTAGCGCTTGTAATAGACTGAAAAGGTTATA  700

seq1  TTCCAGAGTAGTCATCATCCTAGAGAGGAAGAAAAGATACAGCAGAGGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGAGTAGTCATCATCCTAGAGAGGAAGAAAAGATACAGCAGAGGAC  750

seq1  CTATGCAGTGAATATGATGCTTGGGTCTATCAGGCATTAAGAAAGGCCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCAGTGAATATGATGCTTGGGTCTATCAGGCATTAAGAAAGGCCAA  800

seq1  CAGAGGCAAATCCCTATGACACCAAGCAGTGTTAAAGGACATTCCCATAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCAAATCCCTATGACACCAAGCAGTGTTAAAGGACATTCCCATAG  850

seq1  GTACAATCTCAAAAGCTGAGTCCTAGTGACAGTGTGAAAGAGTTGGTAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATCTCAAAAGCTGAGTCCTAGTGACAGTGTGAAAGAGTTGGTAAG  900

seq1  TAGAAGCATCAAGGCTAGCCCAAAGTAAAGTTTCTGAACCTTGACCTTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGCATCAAGGCTAGCCCAAAGTAAAGTTTCTGAACCTTGACCTTTT  950

seq1  AGGCTGGG-TCGTTCTTTGTTATCATGAGAGTGCTTAGTTAGGGACCCAA  999
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGGTTCGTTCTTTGTTATCATGAGAGTGCTTAGTTAGGGACCCAA  1000

seq1  CAAGAAGCTTCTCTGTCCTAGGAGTGTCTAAATGATGACTGTAGGTCTGT  1049
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||
seq2  CAAGAAGCTTCTCTGTCCTAAGAGTGTCTAAATGATGACTGTAGTCTTGT  1050

seq1  GTGGGTCTCCTGGAGAATGATCAGAAGCCACCGAAA-TTAATA-GAGAAG  1097
      ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||| ||||||  |||||
seq2  GTGGGTCTCCTGGAG-ATGATTAAGAGCCACCTAAATTTAATATAAGAAG  1099

seq1  CAAACT-GTAAGTCTTACACAC-AGGTCAGTGTGTG-CTCAGCCAGGGTT  1144
      |||||| |||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||
seq2  CAAACTGGTAAGTCTTACCAACAAGGTCAG-GTGTGCCTCAGCCA-GGTT  1147

seq1  TTTGAGCTTTATTCTGA  1161
      |||||||||||||||||
seq2  TTTGAGCTTTATTCTGA  1164

seq1: chr6_46745150_46745446
seq2: B6Ng01-163H07.g_74_370 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACATGCATGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACATGCATGCAT  50

seq1  ACATATATATTTCAATCATTATTATTGGAGAATAATTATTCTCCAATTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATATATTTCAATCATTATTATTGGAGAATAATTATTCTCCAATTAT  100

seq1  TAATTGGAGAATATAAGTTTCTTTGGGTTCATGCTTGATTGACAGCTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGGAGAATATAAGTTTCTTTGGGTTCATGCTTGATTGACAGCTGGC  150

seq1  TGTCCAAGCTAGTGCCCTGTGATGATGTGGGCAATCTAGTGCACACAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAAGCTAGTGCCCTGTGATGATGTGGGCAATCTAGTGCACACAACA  200

seq1  TCAGGGGTGATATAGGTACCTTTCTTACAACTGATTACTCAACCCTCACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGGTGATATAGGTACCTTTCTTACAACTGATTACTCAACCCTCACT  250

seq1  TACTTCATCACTATGATCATTTGTGAGCGTCCCCAGTGATGGCTAGA  297
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCATCACTATGATCATTTGTGAGCGTCCCCAGTGATGGCTAGA  297