BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-165G12
Chromosome6 (Build37)
Map Location 60,583,249 - 60,668,571
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG634166, EG627108, EG434019, LOC671300, EG627178, LOC100041706, LOC100041717, A530053G22Rik, LOC667066, LOC100041726
Downstream geneSnca, ENSMUSG00000064018, Mmrn1, LOC100041756, LOC100041764, C130092O11Rik, LOC100042694
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-165G12.bB6Ng01-165G12.g
ACCDH957471DH957472
length9971,113
definitionDH957471|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165G12, 5' end.DH957472|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-165G12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,667,573 - 60,668,571)(60,583,249 - 60,584,364)
sequence
gaattccatgctatagaatgccagcgtaccaggaaatggctctaaggagg
aacaaacaaaatacttctctaaggcttagaattcattgcactttactccc
tggagccagtatgttcatctttacttccagatgtttcttattgctatagg
caatgaagtaactgtgtgatagaaatttcatataaatgtataggaaagta
aacatcaagttctatgcctaaacattaagccataagaacagaacataaaa
tcaggctaagagccaaccatacgtctgcaaaaatataatctcatcaaatc
cctggacatattttcagagccttcctatcagcctctgtagcttcttgctc
acaggaattatctgcatgaaaaagaatcaagtcattaggcattatgtttc
catgtaaaatttcttataccaaggcagagacagaagctgtttgtatactc
actgaatgtcaaaatgtttcattaggcttgttatattattcaagcatgtg
attaatatctaagtataggatagataacctttcaagggcttcccatagag
cacaatggcatttgcttttgaaatgctatctctctgttcttcaaaccatg
accaaattgtcttgatcctttaaatgcagagactgcaggttaatgaaaaa
gggaaacagtgctaagacagaaaagcatcagtcatcttaggacagcatca
gcttgaagacgacagtcctttttttggattatgtttgacattttcatata
ttttaggaaggtcttcccgatctaaaattgtagcagatggagaagcagca
gtgtgacttcagcaactccacaagagacaagactgcaaactgggccagcc
acatacggccttcctcacttgagattagcaaggagacttacttttaaaaa
gatggaggtgtgtgtgtgtgtgttcatgtgtgtatgttgtgtatatgtga
aaaatgtattaaaatgatgagattagagtagttttctgtatgacata
gaattcattcactggtccaaaagcaaaactcaaataacacctgttctgtg
ggatagatttaatttaaaaaccagtaagtggttaggtcagtgattttcaa
gatggaagggaatgattccagaaatggtagatgaataacattggctcctg
catactctcataaaatacccaaattctgtcaaagaaggtgagaaaaagag
acacaaataacattccacagataggattgacagaaaaattcacaaagcag
aaattgatgaagaacatagagatttttctgcaatggggcaggtatttttt
gctaatagcttctgtaagaggtgcccctcctcaggcatctctaattctgc
tttacaatgaccactttgagtatggctttcaaaagcctgaatactgaaac
cttgtctgactttttttaagtccaaagccagtaatatgtttgctctctca
ccttgcagataactatctcataactaactcagacattttgtgatataatt
ttagctcaactgttatactataccccatattggttaacttgctcttgtat
aaatacttttttgtactgattttttttaattaatttattttttacactct
atattccattacctgcccacaccatcaaccctctgactgctaaattctaa
tggattactgtgtccattaaccttggatggatttgaagatggattttttc
aaaatgtacagtccaggatgtaggtgaacttcacgatgcagaacttaaaa
aaagatcataaacttcatcaaagaattaaaggagtttaaaggaagataca
aagtgatatttcaaatctattaatgaaaatgagttcaaatgaaataaata
cctgtgttgatgcccaagaaaatataatgttaaagtaatgaaaaagaaaa
tttaaggattcaaaatttaaattgaataaaatgatcaaaatattgataat
gaactcaaactcaatgagatgaaattgtagagctcataatgcattataaa
actcaaggaaaaagtcttaagaataagaatacaaatagattgattcagta
ggagagaagaatagtagagcgcaaaagttcccctcaagcaagctggtaac
acagaaaccagac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_60667573_60668571
seq2: B6Ng01-165G12.b_42_1038 (reverse)

seq1  TATGTCATACAGAAAACTACTCTAATCTCATCATTTTAATACATTTTTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCATACAGAAAACTACTCTAATCTCATCATTTTAATACATTTTTCA  50

seq1  CATATACACAACATACACACATGAACACACACACACACACCTCCATCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATATACACAACATACACACATGAACACACACACACACACCTCCATC-TT  99

seq1  TTTAAAAGTAAGTCTCCTTGCTAATCTCAAGTGAGGAAGGCCGTATGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAGTAAGTCTCCTTGCTAATCTCAAGTGAGGAAGGCCGTATGTGG  149

seq1  CTGGCCCAGTTTGCAGTCTTGTCTCTTGTGGAGTTGCTGAAGTCACACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTGGCCCAGTTTGCAGTCTTGTCTCTTGTGGAGTTGCTGAAGTCACA-CT  198

seq1  GCTGCTTCTCCATCTGCTACAATTTTAGATCGGGAAGACCTTCCTAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTTCTCCATCTGCTACAATTTTAGATCGGGAAGACCTTCCTAAAAT  248

seq1  ATATGAAAATGTCAAACATAATCCAAAAAAAGGACTGTCGTCTTCAAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAAATGTCAAACATAATCCAAAAAAAGGACTGTCGTCTTCAAGCT  298

seq1  GATGCTGTCCTAAGATGACTGATGCTTTTCTGTCTTAGCACTGTTTCCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGTCCTAAGATGACTGATGCTTTTCTGTCTTAGCACTGTTTCCCT  348

seq1  TTTTCATTAACCTGCAGTCTCTGCATTTAAAGGATCAAGACAATTTGGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATTAACCTGCAGTCTCTGCATTTAAAGGATCAAGACAATTTGGTC  398

seq1  ATGGTTTGAAGAACAGAGAGATAGCATTTCAAAAGCAAATGCCATTGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTTGAAGAACAGAGAGATAGCATTTCAAAAGCAAATGCCATTGTGC  448

seq1  TCTATGGGAAGCCCTTGAAAGGTTATCTATCCTATACTTAGATATTAATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGGGAAGCCCTTGAAAGGTTATCTATCCTATACTTAGATATTAATC  498

seq1  ACATGCTTGAATAATATAACAAGCCTAATGAAACATTTTGACATTCAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCTTGAATAATATAACAAGCCTAATGAAACATTTTGACATTCAGTG  548

seq1  AGTATACAAACAGCTTCTGTCTCTGCCTTGGTATAAGAAATTTTACATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATACAAACAGCTTCTGTCTCTGCCTTGGTATAAGAAATTTTACATGG  598

seq1  AAACATAATGCCTAATGACTTGATTCTTTTTCATGCAGATAATTCCTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATAATGCCTAATGACTTGATTCTTTTTCATGCAGATAATTCCTGTG  648

seq1  AGCAAGAAGCTACAGAGGCTGATAGGAAGGCTCTGAAAATATGTCCAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGAAGCTACAGAGGCTGATAGGAAGGCTCTGAAAATATGTCCAGGG  698

seq1  ATTTGATGAGATTATATTTTTGCAGACGTATGGTTGGCTCTTAGCCTGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGATGAGATTATATTTTTGCAGACGTATGGTTGGCTCTTAGCCTGAT  748

seq1  TTTATGTTCTGTTCTTATGGCTTAATGTTTAGGCATAGAACTTGATGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTTCTGTTCTTATGGCTTAATGTTTAGGCATAGAACTTGATGTTT  798

seq1  ACTTTCCTATACATTTATATGAAATTTCTATCACACAGTTACTTCATTGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCCTATACATTTATATGAAATTTCTATCACACAGTTACTTCATTGC  848

seq1  CTATAGCAATAAGAAACATCTGGAAGTAAAGATGAACATACTGGCTCCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGCAATAAGAAACATCTGGAAGTAAAGATGAACATACTGGCTCCAG  898

seq1  GGAGTAAAGTGCAATGAATTCTAAGCCTTAGAGAAGTATTTTGTTTGTTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTAAAGTGCAATGAATTCTAAGCCTTAGAGAAGTATTTTGTTTGTTC  948

seq1  CTCCTTAGAGCCATTTCCTGGTACGCTGGCATTCTATAGCATGGAATTC  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTAGAGCCATTTCCTGGTACGCTGGCATTCTATAGCATGGAATTC  997

seq1: chr6_60583249_60584364
seq2: B6Ng01-165G12.g_69_1181

seq1  GAATTCATTCACTGGTCCAAAAGCAAAACTCAAATAACACCTGTTCTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCACTGGTCCAAAAGCAAAACTCAAATAACACCTGTTCTGTG  50

seq1  GGATAGATTTAATTTAAAAACCAGTAAGTGGTTAGGTCAGTGATTTTCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAGATTTAATTTAAAAACCAGTAAGTGGTTAGGTCAGTGATTTTCAA  100

seq1  GATGGAAGGGAATGATTCCAGAAATGGTAGATGAATAACATTGGCTCCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAAGGGAATGATTCCAGAAATGGTAGATGAATAACATTGGCTCCTG  150

seq1  CATACTCTCATAAAATACCCAAATTCTGTCAAAGAAGGTGAGAAAAAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTCTCATAAAATACCCAAATTCTGTCAAAGAAGGTGAGAAAAAGAG  200

seq1  ACACAAATAACATTCCACAGATAGGATTGACAGAAAAATTCACAAAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAATAACATTCCACAGATAGGATTGACAGAAAAATTCACAAAGCAG  250

seq1  AAATTGATGAAGAACATAGAGATTTTTCTGCAATGGGGCAGGTATTTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGATGAAGAACATAGAGATTTTTCTGCAATGGGGCAGGTATTTTTT  300

seq1  GCTAATAGCTTCTGTAAGAGGTGCCCCTCCTCAGGCATCTCTAATTCTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATAGCTTCTGTAAGAGGTGCCCCTCCTCAGGCATCTCTAATTCTGC  350

seq1  TTTACAATGACCACTTTGAGTATGGCTTTCAAAAGCCTGAATACTGAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAATGACCACTTTGAGTATGGCTTTCAAAAGCCTGAATACTGAAAC  400

seq1  CTTGTCTGACTTTTTTTAAGTCCAAAGCCAGTAATATGTTTGCTCTCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCTGACTTTTTTTAAGTCCAAAGCCAGTAATATGTTTGCTCTCTCA  450

seq1  CCTTGCAGATAACTATCTCATAACTAACTCAGACATTTTGTGATATAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCAGATAACTATCTCATAACTAACTCAGACATTTTGTGATATAATT  500

seq1  TTAGCTCAACTGTTATACTATACCCCATATTGGTTAACTTGCTCTTGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTCAACTGTTATACTATACCCCATATTGGTTAACTTGCTCTTGTAT  550

seq1  AAATACTTTTTTGTACTGATTTTTTTTAATTAATTTATTTTTTACACTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACTTTTTTGTACTGATTTTTTTTAATTAATTTATTTTTTACACTCT  600

seq1  ATATTCCATTACCTGCCCACACCATCAACCCTCTGACTGCTAAATTCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCCATTACCTGCCCACACCATCAACCCTCTGACTGCTAAATTCTAA  650

seq1  TGGATTACTGTGTCCATTAACCTTGGATGGATTTGAAGATGGATTTTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTACTGTGTCCATTAACCTTGGATGGATTTGAAGATGGATTTTTTC  700

seq1  AAAATGTACAGTCCAGGATGTAGGTGAACTTCACGATGCAGAACTTAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTACAGTCCAGGATGTAGGTGAACTTCACGATGCAGAACTTAAAA  750

seq1  AAAGATCATAAACTTCATCAAAGAATTAAAGGAGTTT-AAGGAAGATACA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAAGATCATAAACTTCATCAAAGAATTAAAGGAGTTTAAAGGAAGATACA  800

seq1  AAGTGATATTTCAAATCTATTAATGAAAATGAGTTCAAATGAAATAAATA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGATATTTCAAATCTATTAATGAAAATGAGTTCAAATGAAATAAATA  850

seq1  CCTGTG-TGATGCCCAAGAAAATATAATGTTAAAGTAATGAAAAAGAAAA  898
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTTGATGCCCAAGAAAATATAATGTTAAAGTAATGAAAAAGAAAA  900

seq1  TTT-AGGATTCAAAAATTAAATTGAATAAAATGATCAAAATATTGAT-AT  946
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTAAGGATTCAAAATTTAAATTGAATAAAATGATCAAAATATTGATAAT  950

seq1  GAACTCAAACTCAAATGAAGATGAAATTGTAGAGCTCAATAATGCAATTA  996
      |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  GAACTCAAACTC-AATG-AGATGAAATTGTAGAGCTC-ATAATGC-ATTA  996

seq1  TAAAACTCAGGGAAAAAAGTCTT-AGAAATAGAATACAAATAGAATGAAT  1045
      ||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |
seq2  TAAAACTCAAGG-AAAAAGTCTTAAGAATAAGAATACAAATAGATTGATT  1045

seq1  CAAGTAGAAGAG-AGAATAGTAGAGCGCAAAAG-TCCCCTCAAGCAAAGC  1093
      | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  C-AGTAGGAGAGAAGAATAGTAGAGCGCAAAAGTTCCCCTCAAGC-AAGC  1093

seq1  ATGTAAAACACAGAAACACAGAC  1116
        ||  ||||||||||| |||||
seq2  TGGT--AACACAGAAAC-CAGAC  1113