BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169E08
Chromosome6 (Build37)
Map Location 95,928,062 - 96,078,029
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC545867, C630007B19Rik, LOC100043685
Upstream geneLOC100043680, Kbtbd8, LOC435912, Suclg2, LOC665886
Downstream gene1700123L14Rik, C130034I18Rik, A130022J15Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169E08.bB6Ng01-169E08.g
ACCDH960295DH960296
length1,0721,071
definitionDH960295|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169E08, 5' end.DH960296|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169E08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,928,062 - 95,929,155)(96,076,937 - 96,078,029)
sequence
gaattctaatgaggcgtaagttgctgtcgcggtgtttatgatttggtttg
aggaccttacagctagtatgctgctgaaatattggacttaaagatgttta
tggtcatgactccttgaagatcagggtacagatagacatgagggtacacg
aatagacatgagcatcttgcaagtagctctctgcagatggagtagagact
aattgcccattatgtcagtgtgccctggaactgggtatatattgaatgga
gatatcgacatcttggaaatagcaatcaatcagactccaaactttgaata
gagcaagaggagagtactattagcctcttgccttaatactagtcagaatt
gacagatatttagaacaatatcattcatttatcaaataaccacttcagcg
aaaccattggattatctcattaatgacttacttgtctttggaggacagat
tagtccacaacaatgacttaacttgataatggatacctttgatttcatgg
catctgatgccctatagtagcttagctgtgtagtttgggtttgggagttt
caggagattgcactcaaggtattagtagggtctgtacctcagataggctg
agttaaacacaaggttgacaagtgcttgagaaatctcattctttacttga
ccttctttataaagagactctaatgcccttatgtgatgatggttttcatt
ctccagagagacttttcccagtggaaatacatcagaaactatgaagccac
caaccaaaaagcatacacaggctggtccgaggcccccctcacatatgtag
caaaggagtgccttgtttgcttccagtgggagaggatgcacctaatccta
tagagattgatgcctggggaagggagatgcccaggagtgggtagcacctt
ctcagagataaaggggaagaagatagggtgaagattctaggagtgggact
gagaggggacaaaaataaagcacataatgatcaaaaaatttaatgggtca
tttgcaatattggtgatattgctatttatgtatgtgaaaaggactacagg
tgtagttagggagaaaacagtc
gaattcttcccagtgtgaatgatttacaacttcattttgagtattacagg
aaaatttccactacggccatttctcctctgctgctgcttccttgtgtgta
gttcagaagggtctccagggtctactggcaaacaatagccctgaaaaaag
tacttgcaaatgagttactgctcaccaagcaaagaaacaacagaacacat
gtgtcctgctttgcctctttgtcctgcaaaatgaagacaaaggctttcct
taatagcactgtcttacagagactaagtacaagttctcaacaagcaaggt
gcttagctgatagaaaactatggcccttgcatggaaattcgttttctaat
ttctgttggttgagacgaccttgctggtattcctagcagcacatggctaa
ggtgcaagcacgacttgactaagagtcccagcatttcttctaacatttgg
catgcttttgcacattttgctgctgtgtggaacaatgagaatgatgctag
acaacgtatagggctgtgttgcagggaaaatgtggtagagaaggaatcag
gccacactgaaccctgtatacagtaaatggagtcagtctgtatacagtct
gtatacagtaaatggagtcagtctgtatacagtctgtatacagtaaatgg
aggcgccactcagacactgggaagaatccacagagtgccatcccaagcca
tgccccacactagaggggggggtcttaactaaatcaataatcgtattatc
tgcttcgtaaaatgaaaggatatcttgccccacaaggttattgtgaagac
tcatgtttaggatccacatttgttcatcagcaaatattcagttgccctca
ctgtgtgtaaacatggtttcagcatgaccagcatttcctacctctcagaa
catagaagctatgtgtgtaggcattacttaaacaaacaaacaaacaaaca
aacaaacacacacaacaaagtcatctctatatacaggaaaaaatcactgc
acagtaggtggcaagtgacatttgatgaatttaatgtataatgtatgctg
tggtaaagtaaattccgagac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_95928062_95929155
seq2: B6Ng01-169E08.b_46_1117

seq1  GAATTCTAATGAGGCGTAAGTTGCTGTCGCGGTGTTTATGATTTGGTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAATGAGGCGTAAGTTGCTGTCGCGGTGTTTATGATTTGGTTTG  50

seq1  AGGACCTTACAGCTAGTATGCTGCTGAAATATTGGACTTAAAGATGTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCTTACAGCTAGTATGCTGCTGAAATATTGGACTTAAAGATGTTTA  100

seq1  TGGTCATGACTCCTTGAAGATCAGGGTACAGATAGACATGAGGGTACACG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCATGACTCCTTGAAGATCAGGGTACAGATAGACATGAGGGTACACG  150

seq1  AATAGACATGAGCATCTTGCAAGTAGCTCTCTGCAGATGGAGTAGAGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGACATGAGCATCTTGCAAGTAGCTCTCTGCAGATGGAGTAGAGACT  200

seq1  AATTGCCCATTATGTCAGTGTGCCCTGGAACTGGGTATATATTGAATGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCCCATTATGTCAGTGTGCCCTGGAACTGGGTATATATTGAATGGA  250

seq1  GATATCGACATCTTGGAAATAGCAATCAATCAGACTCCAAACTTTGAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATCGACATCTTGGAAATAGCAATCAATCAGACTCCAAACTTTGAATA  300

seq1  GAGCAAGAGGAGAGTACTATTAGCCTCTTGCCTTAATACTAGTCAGAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGAGGAGAGTACTATTAGCCTCTTGCCTTAATACTAGTCAGAATT  350

seq1  GACAGATATTTAGAACAATATCATTCATTTATCAAATAACCACTTCAGCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGATATTTAGAACAATATCATTCATTTATCAAATAACCACTTCAGCG  400

seq1  AAACCATTGGATTATCTCATTAATGACTTACTTGTCTTTGGAGGACAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCATTGGATTATCTCATTAATGACTTACTTGTCTTTGGAGGACAGAT  450

seq1  TAGTCCACAACAATGACTTAACTTGATAATGGATACCTTTGATTTCATGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCACAACAATGACTTAACTTGATAATGGATACCTTTGATTTCATGG  500

seq1  CATCTGATGCCCTATAGTAGCTTAGCTGTGTAGTTTGGGTTTGGGAGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGATGCCCTATAGTAGCTTAGCTGTGTAGTTTGGGTTTGGGAGTTT  550

seq1  CAGGAGATTGCACTCAAGGTATTAGTAGGGTCTGTACCTCAGATAGGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGATTGCACTCAAGGTATTAGTAGGGTCTGTACCTCAGATAGGCTG  600

seq1  AGTTAAACACAAGGTTGACAAGTGCTTGAGAAATCTCATTCTTTACTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAACACAAGGTTGACAAGTGCTTGAGAAATCTCATTCTTTACTTGA  650

seq1  CCTTCTTTATAAAGAGACTCTAATGCCCTTATGTGATGATGGTTTTCATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTTATAAAGAGACTCTAATGCCCTTATGTGATGATGGTTTTCATT  700

seq1  CTCCAGAGAGACTTTTCCCAGTGGAAATACATCAGAAACTATGAAGCCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGAGAGACTTTTCCCAGTGGAAATACATCAGAAACTATGAAGCCAC  750

seq1  CAACCAAAAAGCATACACAGGCTGGTCCGAGGCCCCCCTCACATATGTAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAAAAAGCATACACAGGCTGGTCCGAGGCCCCCCTCACATATGTAG  800

seq1  CAAAGGAGTGCCTTGTTTGCTTCCAGTGGGAGAGGATGCACCTAATCCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGAGTGCCTTGTTTGCTTCCAGTGGGAGAGGATGCACCTAATCCTA  850

seq1  TAGAGATTTGATGCCTGGGGAAGGGAGATGCCCAGGAGTGGGTAGCACCT  900
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGA-TTGATGCCTGGGGAAGGGAGATGCCCAGGAGTGGGTAGCACCT  899

seq1  TCTCAGAGATAAAGGGGAAGGAAGATAGGGTGAAGAATTCTAGGAGTGGG  950
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  TCTCAGAGATAAAGGGGAA-GAAGATAGGGTGAAG-ATTCTAGGAGT-GG  946

seq1  GACTGAGAGGGGGACAAAAAATAAAGCACATAATGATCAAAAAAATTTAA  1000
      |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GACTGAGA-GGGGAC-AAAAATAAAGCACATAATGATC-AAAAAATTTAA  993

seq1  TGGGTCATTTTGCAATATTTGGTTGAATTTATTGGCTTATTTTATGTATT  1050
      ||||||| |||||||||||  | |||   |||| |||   |||||||| |
seq2  TGGGTCA-TTTGCAATATT--GGTGA---TATT-GCT--ATTTATGTA-T  1033

seq1  GTGAGAAAGGACTTACAGGGTGTAAGTATAGGGAGAAAACAGTC  1094
      |||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  GTGA-AAAGGAC-TACA-GGTGT-AGT-TAGGGAGAAAACAGTC  1072

seq1: chr6_96076937_96078029
seq2: B6Ng01-169E08.g_66_1136 (reverse)

seq1  GTCTC-GATTTTACTTTTAACACAGCATACATTTAATACATGATATCCAT  49
      ||||| || ||||| |||| |||||||||||||  |||||| | || |||
seq2  GTCTCGGAATTTAC-TTTACCACAGCATACATT--ATACATTAAATTCAT  47

seq1  CAAATGTCACTTGCCACCTACTGGTTGCAGTGATTTTTTTTCCTGTTATA  99
      |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||
seq2  CAAATGTCACTTGCCACCTACTG--TGCAGTGA--TTTTTTCCTG-TATA  92

seq1  TTAGAGATGACTTTTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTT  149
       |||||||||| ||||||||   ||||  ||||      |||||||   |
seq2  -TAGAGATGAC-TTTGTTGTGTGTGTTTGTTTG------TTTGTTT--GT  132

seq1  TTGTTTTGTTTTAAGTAATGCCTACACAACATAAGCTTCTATGTTCTGAG  199
      ||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
seq2  TTGTTT--GTTTAAGTAATGCCTACAC-ACAT-AGCTTCTATGTTCTGAG  178

seq1  AGGTAGGAAATGCTGGTCATGCTGGAAACCATGTTTACACACAGTGAGGG  249
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGGAAATGCTGGTCATGCT-GAAACCATGTTTACACACAGTGAGGG  227

seq1  CAACTGAATATTTGCTGATGAACAAATGTGGATCCTAAACATGAGTCTTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGAATATTTGCTGATGAACAAATGTGGATCCTAAACATGAGTCTTC  277

seq1  ACAATAACCTTGTGGGGCAAGATATCCTTTCATTTTACGAAGCAGATAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATAACCTTGTGGGGCAAGATATCCTTTCATTTTACGAAGCAGATAAT  327

seq1  ACGATTATTGATTTAGTTAAGACCCCCCCCTCTAGTGTGGGGCATGGCTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATTATTGATTTAGTTAAGACCCCCCCCTCTAGTGTGGGGCATGGCTT  377

seq1  GGGATGGCACTCTGTGGATTCTTCCCAGTGTCTGAGTGGCGCCTCCATTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGGCACTCTGTGGATTCTTCCCAGTGTCTGAGTGGCGCCTCCATTT  427

seq1  ACTGTATACAGACTGTATACAGACTGACTCCATTTACTGTATACAGACTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTATACAGACTGTATACAGACTGACTCCATTTACTGTATACAGACTG  477

seq1  TATACAGACTGACTCCATTTACTGTATACAGGGTTCAGTGTGGCCTGATT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGACTGACTCCATTTACTGTATACAGGGTTCAGTGTGGCCTGATT  527

seq1  CCTTCTCTACCACATTTTCCCTGCAACACAGCCCTATACGTTGTCTAGCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTCTACCACATTTTCCCTGCAACACAGCCCTATACGTTGTCTAGCA  577

seq1  TCATTCTCATTGTTCCACACAGCAGCAAAATGTGCAAAAGCATGCCAAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTCATTGTTCCACACAGCAGCAAAATGTGCAAAAGCATGCCAAAT  627

seq1  GTTAGAAGAAATGCTGGGACTCTTAGTCAAGTCGTGCTTGCACCTTAGCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGAAGAAATGCTGGGACTCTTAGTCAAGTCGTGCTTGCACCTTAGCC  677

seq1  ATGTGCTGCTAGGAATACCAGCAAGGTCGTCTCAACCAACAGAAATTAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTGCTAGGAATACCAGCAAGGTCGTCTCAACCAACAGAAATTAGA  727

seq1  AAACGAATTTCCATGCAAGGGCCATAGTTTTCTATCAGCTAAGCACCTTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGAATTTCCATGCAAGGGCCATAGTTTTCTATCAGCTAAGCACCTTG  777

seq1  CTTGTTGAGAACTTGTACTTAGTCTCTGTAAGACAGTGCTATTAAGGAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGAGAACTTGTACTTAGTCTCTGTAAGACAGTGCTATTAAGGAAA  827

seq1  GCCTTTGTCTTCATTTTGCAGGACAAAGAGGCAAAGCAGGACACATGTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGTCTTCATTTTGCAGGACAAAGAGGCAAAGCAGGACACATGTGT  877

seq1  TCTGTTGTTTCTTTGCTTGGTGAGCAGTAACTCATTTGCAAGTACTTTTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGTTTCTTTGCTTGGTGAGCAGTAACTCATTTGCAAGTACTTTTT  927

seq1  TCAGGGCTATTGTTTGCCAGTAGACCCTGGAGACCCTTCTGAACTACACA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGCTATTGTTTGCCAGTAGACCCTGGAGACCCTTCTGAACTACACA  977

seq1  CAAGGAAGCAGCAGCAGAGGAGAAATGGCCGTAGTGGAAATTTTCCTGTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAAGCAGCAGCAGAGGAGAAATGGCCGTAGTGGAAATTTTCCTGTA  1027

seq1  ATACTCAAAATGAAGTTGTAAATCATTCACACTGGGAAGAATTC  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCAAAATGAAGTTGTAAATCATTCACACTGGGAAGAATTC  1071