BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170E13
Chromosome6 (Build37)
Map Location 145,604,759 - 145,787,882
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRassf8
Upstream gene4933425H06Rik, EG665149, Bcat1, Lrmp, Casc1, Lyrm5, Kras, LOC100039495, LOC100042866, LOC546917, 1700073E17Rik, Ifltd1, LOC100042879, Tuba3b
Downstream geneBhlhb3, Sspn, Itpr2, 4933424B01Rik, Fgfr1op2, Tm7sf3, Surb7, EG626175, Stk38l, LOC621842, Arntl2
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170E13.bB6Ng01-170E13.g
ACCDH961035DH961036
length971931
definitionDH961035|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E13, 5' end.DH961036|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170E13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,604,759 - 145,605,738)(145,786,949 - 145,787,882)
sequence
gaattccagacagatcccatggaattggaaaaagatcgttgtgagccacc
atgtgggtgctcagaattgaaccctggtcctctggaagagcagtcactgt
tcctaaccactgagccaccacctctccagcccccacacgatcattctgaa
ttgtattgccctcgtctctccttactcacgaacatctctccttcaggttg
aagaacttgcgtcagttctggtaagcatagtttttctggttccttagact
gtcagtttcataaaccaatttcaggaaaagattgtgctatatactgaata
tatcgttttactttgaattaataattgatgcacttaagcaagcagtaaag
taaattccccttactcgttacacttagctgaaaagaagcactgacctgtc
ctggcatgctaagcaggaatgcaaacctcctggacccccataatttcttt
gaaatggggaaagttttatcaaagcagagaactatttaaaaagaaaactt
tagaaatataaacctcagcataattctatgcgtgttttggggtgatgtat
aaattttttttgccaaagactaaaattgttatatgtattttttccattcc
ctttccttttaattgtgtataacttcgtgtgtcttgagtgtaggtttgtg
cgtgagtgcagtaccttgcagagaccagaagagggtgctgaatcctctgg
agcagagttagacgcagcagtgagcctcccagtatggtgctggtccctgc
tggcagagcaggaattgctcttagcactaaggatctctgtatctcttaaa
tataatttaaatgttccgttccctcttcagggttagctgcaatcccagat
agcagtataagcagcatgacagtgaggagatcatactgcgagcgtttcca
gccttaccacattcagcttgcccctcttcagaggttgtgttcaccaccgc
gtcgacttcgccctggacttc
gaattcatctacactgcacactaggcatccaagtgtgtagcaatgtgtgt
ggctgttagatttataagaaggtgaagttttcagtgatttaaggggatga
aacagcagctttgtgaggaggtccagggaaagaacatccctgctcagaga
tcaggtatgagttgggaatgcatccaggatattgtacgtccaaagaggag
ctgggagaccactacccctcatagactgggcacagtaggtcaaggggagt
agacatcaaggcaccataatgggttcccttgtgtatggtgacatcagacc
agactcactctccacccatgccgggagaaaggtagccaccttaacctttt
gccaattgaagaattagaggcctggtcaactgccccttcctctctgggcc
caatagcagctttcaaacacatgaagcttggctgcttccaccaaaaggcc
aaccctgtgcccttggcctcagccacatatccccagattacccaactttc
aggagctagttatggtacctgataagtagactttccaagacactggggcc
tttaaaggtcagtgtggggccaatgagatgaccctaaaggcttgctaccc
aacttaagagtctgagcttcatcttggtggttaagaacactggctgctct
ggaaagacaacccaagttaaattcccagcatccacataaagacttacaac
catctctaactccagttccaggacatctgatactcttctggcttccatgg
gcactgcatatgtgacacacagccaaaaagatagtaaaatgcagcggtgg
caacggcggcggtggcagcagtggccgcggcagcggcgttggtggttggc
agcagcagttctttttaaagaacctgagttttatcccaggacccatgtgg
gagaatgaaagaatggattccacagtttgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_145604759_145605738
seq2: B6Ng01-170E13.b_49_1019

seq1  GAATTCCAGACAGATCCCATGGAATTGGATTATAGATCGTTGTGAGCCAC  50
      |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGACAGATCCCATGGAATTGGA-AAAAGATCGTTGTGAGCCAC  49

seq1  CATGTGGGTGCTCAGAATTGAACCCTGGTCCTCTGGAAGAGCAGTCACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGGGTGCTCAGAATTGAACCCTGGTCCTCTGGAAGAGCAGTCACTG  99

seq1  TTCCTAACCACTGAGCCACCACCTCTCCAGCCCCCACACGATCATTCTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAACCACTGAGCCACCACCTCTCCAGCCCCCACACGATCATTCTGA  149

seq1  ATTGTATTGCCCTCGTCTCTCCTTACTCACGAACATCTCTCCTTCAGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATTGCCCTCGTCTCTCCTTACTCACGAACATCTCTCCTTCAGGTT  199

seq1  GAAGAACTTGCGTCAGTTCTGGTAAGCATAGTTTTTCTGGTTCCTTAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACTTGCGTCAGTTCTGGTAAGCATAGTTTTTCTGGTTCCTTAGAC  249

seq1  TGTCAGTTTCATAAACCAATTTCAGGAAAAGATTGTGCTATATACTGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGTTTCATAAACCAATTTCAGGAAAAGATTGTGCTATATACTGAAT  299

seq1  ATATCGTTTTACTTTGAATTAATAATTGATGCACTTAAGCAAGCAGTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCGTTTTACTTTGAATTAATAATTGATGCACTTAAGCAAGCAGTAAA  349

seq1  GTAAATTCCCCTTACTCGTTACACTTAGCTGAAAAGAAGCACTGACCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATTCCCCTTACTCGTTACACTTAGCTGAAAAGAAGCACTGACCTGT  399

seq1  CCTGGCATGCTAAGCAGGAATGCAAACCTCCTGGACCCCCATAATTTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCATGCTAAGCAGGAATGCAAACCTCCTGGACCCCCATAATTTCTT  449

seq1  TGAAATGGGGAAAGTTTTATCAAAGCAGAGAACTATTTAAAAAGAAAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATGGGGAAAGTTTTATCAAAGCAGAGAACTATTTAAAAAGAAAACT  499

seq1  TTAGAAATATAAACCTCAGCATAATTCTATGCGTGTTTTGGGGTGATGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAATATAAACCTCAGCATAATTCTATGCGTGTTTTGGGGTGATGTA  549

seq1  TAAATTTTTTTTGCCAAAGACTAAAATTGTTATATGTATTTTTTCCATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTTTTTTGCCAAAGACTAAAATTGTTATATGTATTTTTTCCATTC  599

seq1  CCTTTCCTTTTAATTGTGTATAACTTCGTGTGTCTTGAGTGTAGGTTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCTTTTAATTGTGTATAACTTCGTGTGTCTTGAGTGTAGGTTTGT  649

seq1  GCGTGAGTGCAGTACCTTGCAGAGACCAGAAGAGGGTGCTGAATCCTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGAGTGCAGTACCTTGCAGAGACCAGAAGAGGGTGCTGAATCCTCTG  699

seq1  GAGCAGAGTTAGACGCAGCAGTGAGCCTCCCAGTATGGTGCTGGTCCCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGAGTTAGACGCAGCAGTGAGCCTCCCAGTATGGTGCTGGTCCCTG  749

seq1  CTGGCAGAGCAGGAATTGCTCTTAAGCACTAAGGATCTCTGTATCTCTTA  800
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAGAGCAGGAATTGCTCTT-AGCACTAAGGATCTCTGTATCTCTTA  798

seq1  AATATAATTTAAATGTTCCGTTCCCTCTTCAGGGTTAGCTGCAATCCCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAATTTAAATGTTCCGTTCCCTCTTCAGGGTTAGCTGCAATCCCAG  848

seq1  ATAGCAGGTATAAGCAGCATGACAGTGAGGAGATCATTACTGCGAGCGTT  900
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ATAGCA-GTATAAGCAGCATGACAGTGAGGAGATCA-TACTGCGAGCGTT  896

seq1  TCCAGCCTTACCACAATCAGCTTGCAAAGTTCCCCAGAGGTTGTGTTCAC  950
      ||||||||||||||| |||||||||     ||  ||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCTTACCACATTCAGCTTGC--CCCTCTTCAGAGGTTGTGTTCAC  944

seq1  CAACCGCGTCAGACCTTCGCCCTGGACTTC  980
      | |||||||| || ||||||||||||||||
seq2  C-ACCGCGTC-GA-CTTCGCCCTGGACTTC  971

seq1: chr6_145786949_145787882
seq2: B6Ng01-170E13.g_69_999 (reverse)

seq1  GACAAACTGTGGGAATCCATTCTCTCATTCTACCACATGGGTCCTGGGAT  50
      |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GACAAACTGT-GGAATCCATTCTTTCATTCTCCCACATGGGTCCTGGGAT  49

seq1  AAAACTCAGGTTCTTTAAAAAGAACTGCTGCTGCCAACCACCAACGCCGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTCAGGTTCTTTAAAAAGAACTGCTGCTGCCAACCACCAACGCCGC  99

seq1  TGCCGCGGCCACTGCTGCCACCGCCGCCGTTGCCACCGCTGCATTTTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGCCGCGGCCACTGCTGCCACCGCCGCCGTTGCCACCGCTGCATTTTAC-  148

seq1  TATCTTTTTGGCTGTGTGTCACATATGCAGTGCCCATGGAAGCCAGAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTTTGGCTGTGTGTCACATATGCAGTGCCCATGGAAGCCAGAAGA  198

seq1  GTATCAGATGTCCTGGAACTGGAGTTAGAGATGGTTGTAAGTCTTTATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAGATGTCCTGGAACTGGAGTTAGAGATGGTTGTAAGTCTTTATGT  248

seq1  GGATGCTGGGAATTTAACTTGGGTTGTCTTTCCAGAGCAGCCAGTGTTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGGGAATTTAACTTGGGTTGTCTTTCCAGAGCAGCCAGTGTTCT  298

seq1  TAACCACCAAGATGAAGCTCAGACTCTTAAGTTGGGTAGCAAGCCTTTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCACCAAGATGAAGCTCAGACTCTTAAGTTGGGTAGCAAGCCTTTAG  348

seq1  GGTCATCTCATTGGCCCCACACTGACCTTTAAAGGCCCCAGTGTCTTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATCTCATTGGCCCCACACTGACCTTTAAAGGCCCCAGTGTCTTGGA  398

seq1  AAGTCTACTTATCAGGTACCATAACTAGCTCCTGAAAGTTGGGTAATCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTACTTATCAGGTACCATAACTAGCTCCTGAAAGTTGGGTAATCTG  448

seq1  GGGATATGTGGCTGAGGCCAAGGGCACAGGGTTGGCCTTTTGGTGGAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATATGTGGCTGAGGCCAAGGGCACAGGGTTGGCCTTTTGGTGGAAGC  498

seq1  AGCCAAGCTTCATGTGTTTGAAAGCTGCTATTGGGCCCAGAGAGGAAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGCTTCATGTGTTTGAAAGCTGCTATTGGGCCCAGAGAGGAAGGG  548

seq1  GCAGTTGACCAGGCCTCTAATTCTTCAATTGGCAAAAGGTTAAGGTGGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTGACCAGGCCTCTAATTCTTCAATTGGCAAAAGGTTAAGGTGGCT  598

seq1  ACCTTTCTCCCGGCATGGGTGGAGAGTGAGTCTGGTCTGATGTCACCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTCTCCCGGCATGGGTGGAGAGTGAGTCTGGTCTGATGTCACCATA  648

seq1  CACAAGGGAACCCATTATGGTGCCTTGATGTCTACTCCCCTTGACCTACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGGGAACCCATTATGGTGCCTTGATGTCTACTCCCCTTGACCTACT  698

seq1  GTGCCCAGTCTATGAGGGGTAGTGGTCTCCCAGCTCCTCTTTGGACGTAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCAGTCTATGAGGGGTAGTGGTCTCCCAGCTCCTCTTTGGACGTAC  748

seq1  AATATCCTGGATGCATTCCCAACTCATACCTGATCTCTGAGCAGGGATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCCTGGATGCATTCCCAACTCATACCTGATCTCTGAGCAGGGATGT  798

seq1  TCTTTCCCTGGACCTCCTCACAAAGCTGCTGTTTCATCCCCTTAAATCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCCTGGACCTCCTCACAAAGCTGCTGTTTCATCCCCTTAAATCAC  848

seq1  TGAAAACTTCACCTTCTTATAAATCTAACAGCCACACACATTGCTACACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACTTCACCTTCTTATAAATCTAACAGCCACACACATTGCTACACA  898

seq1  CTTGGATGCCTAGTGTGCAGTGTGGGATGAATTC  934
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||
seq2  CTTGGATGCCTAGTGTGCAGTGT-AGATGAATTC  931