BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-198K23
Chromosome6 (Build37)
Map Location 61,330,253 - 61,443,780
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC130092O11Rik
Upstream geneA530053G22Rik, LOC667066, LOC100041726, Snca, ENSMUSG00000064018, Mmrn1, LOC100041756, LOC100041764
Downstream geneLOC100042694
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-198K23.bB6Ng01-198K23.g
ACCGA020218GA020219
length1,179914
definitionB6Ng01-198K23.b B6Ng01-198K23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,442,604 - 61,443,780)(61,330,253 - 61,331,046)
sequence
gaattccagaagacactaccactccttaattatttttattaaattattgt
tttcctggcagtctaataccaatattacgatgaaaagtggttgctattct
tactgtgctaacattccatgagcgaatgcagatccgtgtgtgactgtagc
tacccatgagtctaacattccatgagcgaatgcagaaccatgtgtgactg
tagctatccatgagtctccttgctgagtactgctcaaccctgtgcagtgg
ctttctgtgataatttgtaataaattctgttgtcaaaaatattttcataa
agtaaaccgtgatttagtatcaatattaaacataaaataatctcctaaga
gtgatctgtagcacaagtgtctgttatcaagctctttcctaattgagata
tattaacagtgtcatataaaaatgctaaatatcattttccaaagaaaagg
atccaaataaaaatgtatataaataaagtgtctaaaattttcatatatat
gttttgtttgttcaagatacttaatgttaaggtgatggacattgttgttt
aatttcaatagcacacaaagcatacatatatcaaaatttcacatggattt
agatcactgaaaacttggtaattaattccacttgtttcctatgtttgcat
tatatttttaaggtagtgtttttctgagttgtaaagtgtggcattgtcta
caagatgtttcaagctcctgctagctggataatttactaagacaaattag
aacctaaatgagcacctgagaatgtgatggtcctgtcacaatgcttgctt
catagttcttcctggcagtgcagtttcaatggatttcatatcctatgtgg
ttgaaaagtaaatgtttgtattgaacttacaaaaatattttctatgcaaa
tgtcggcagcgtgcacatgagcatttgaaagcgccattcacttctatttt
tccttcagccttctgacatgtccctttaatttttgccaataagaacacaa
agctcttcactattaagttttcacataaagacaatgagcaatagttaaaa
gcgactggcacattctcccatctagtgcactcaaattgggccgcaactgc
aagcagcaaataagtttttaaatgatatgtttcacttcagaagcattaac
agtgcgcagacccctaagcctggtcagca
gaattccttctgtgactattaattaagaaggtaatttgttattaatttct
aatgggcaaagtacaacagagttgagatgaagcccggtggctttgctaat
atgaatggcaatgtagaaagaattgcaacattaactcagggatattgtaa
aaatcagctctgagtttgtatgggctgtgaggtacctagaaaaaaagaaa
tgggcataggatgtcttgaactagattgtgtaaaactcagaaacttgtgc
cacttaattttggagatataagttgacacctaataaatgtatgtacaaag
aaagctatgttacttgggctgacagtggtctccacaagagccatagacta
cttaacaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacttatcagatgtgaga
aacctctgtttgaattgttaattatgttagttcaagttttccccaaacag
catcatcaattgctattgtccttggatgactctcagaggttgaagattaa
gtccttattgtgaagacactgaacatttggggcacatgactcatagtact
ccagctgtatctaaccttatattgtctctcctactgtctagtttccatag
taacataaagcagtatgcaagttgacaagagagataattaataatctcat
ctaactgcaagacctatgaactacagcaatgatcagattagcatgatatc
attacaggtgcaatagtgacacttatatttccaggtaaccaacaactgcc
taattgcactgaagacccactcaacaggagggaaatcatgtctcaaacta
gagactgccaactaactggagctagggagagtatggatctgggcaagaga
atctacttcagcctactaattcctgactacatcttaaacttacttatatg
cccagataaaggtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_61442604_61443780
seq2: B6Ng01-198K23.b_45_1223 (reverse)

seq1  TGCTGAC--AGCTTTGGGG-CTGCGGCACTGTTTATTGCCTCCTTGAGTG  47
      |||||||   |||| |||| |||| |||||||| ||   || ||  ||||
seq2  TGCTGACCAGGCTTAGGGGTCTGC-GCACTGTTAAT--GCTTCTGAAGTG  47

seq1  AAACATACCA-TTAAAAAC-TATTTGCTGCTTGCAGTTGCCGCCCAA-TT  94
      ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  AAACATATCATTTAAAAACTTATTTGCTGCTTGCAGTTGCGGCCCAATTT  97

seq1  GAGTGCACTAGATGGGAGAATGTGCCAGTTGCTTTT-ACTA-TGCTCATT  142
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
seq2  GAGTGCACTAGATGGGAGAATGTGCCAGTCGCTTTTAACTATTGCTCA-T  146

seq1  TGTCTTTTATGTGAAAACCTTTAATAGTGAAGAGCTTTGTGTTCTTATTG  192
      |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTC-TTTATGTGAAAAC--TTAATAGTGAAGAGCTTTGTGTTCTTATTG  193

seq1  GCAAAAATT-AAGGGACATGTCAGAAGGCTGAAGGAAAAATAGAAGTGAA  241
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAATTAAAGGGACATGTCAGAAGGCTGAAGGAAAAATAGAAGTGAA  243

seq1  TGGCGCTTTCAAATGCTCATGTGCACGCTGCCGACATTTGCATAGAAAAT  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCGCTTTCAAATGCTCATGTGCACGCTGCCGACATTTGCATAGAAAAT  293

seq1  ATTTTTGTAAGTTCAATACAAACATTTACTTTTCAACCACATAGGATATG  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTGTAAGTTCAATACAAACATTTACTTTTCAACCACATAGGATATG  343

seq1  AAATCCATTGAAACTGCACTGCCAGGAAGAACTATGAAGCAAGCATTGTG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCATTGAAACTGCACTGCCAGGAAGAACTATGAAGCAAGCATTGTG  393

seq1  ACAGGACCATCACATTCTCAGGTGCTCATTTAGGTTCTAATTTGTCTTAG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACCATCACATTCTCAGGTGCTCATTTAGGTTCTAATTTGTCTTAG  443

seq1  TAAATTATCCAGCTAGCAGGAGCTTGAAACATCTTGTAGACAATGCCACA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTATCCAGCTAGCAGGAGCTTGAAACATCTTGTAGACAATGCCACA  493

seq1  CTTTACAACTCAGAAAAACACTACCTTAAAAATATAATGCAAACATAGGA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACAACTCAGAAAAACACTACCTTAAAAATATAATGCAAACATAGGA  543

seq1  AACAAGTGGAATTAATTACCAAGTTTTCAGTGATCTAAATCCATGTGAAA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTGGAATTAATTACCAAGTTTTCAGTGATCTAAATCCATGTGAAA  593

seq1  TTTTGATATATGTATGCTTTGTGTGCTATTGAAATTAAACAACAATGTCC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATATATGTATGCTTTGTGTGCTATTGAAATTAAACAACAATGTCC  643

seq1  ATCACCTTAACATTAAGTATCTTGAACAAACAAAACATATATATGAAAAT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCTTAACATTAAGTATCTTGAACAAACAAAACATATATATGAAAAT  693

seq1  TTTAGACACTTTATTTATATACATTTTTATTTGGATCCTTTTCTTTGGAA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGACACTTTATTTATATACATTTTTATTTGGATCCTTTTCTTTGGAA  743

seq1  AATGATATTTAGCATTTTTATATGACACTGTTAATATATCTCAATTAGGA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATATTTAGCATTTTTATATGACACTGTTAATATATCTCAATTAGGA  793

seq1  AAGAGCTTGATAACAGACACTTGTGCTACAGATCACTCTTAGGAGATTAT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTTGATAACAGACACTTGTGCTACAGATCACTCTTAGGAGATTAT  843

seq1  TTTATGTTTAATATTGATACTAAATCACGGTTTACTTTATGAAAATATTT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTTTAATATTGATACTAAATCACGGTTTACTTTATGAAAATATTT  893

seq1  TTGACAACAGAATTTATTACAAATTATCACAGAAAGCCACTGCACAGGGT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAACAGAATTTATTACAAATTATCACAGAAAGCCACTGCACAGGGT  943

seq1  TGAGCAGTACTCAGCAAGGAGACTCATGGATAGCTACAGTCACACATGGT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGTACTCAGCAAGGAGACTCATGGATAGCTACAGTCACACATGGT  993

seq1  TCTGCATTCGCTCATGGAATGTTAGACTCATGGGTAGCTACAGTCACACA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCATTCGCTCATGGAATGTTAGACTCATGGGTAGCTACAGTCACACA  1043

seq1  CGGATCTGCATTCGCTCATGGAATGTTAGCACAGTAAGAATAGCAACCAC  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGATCTGCATTCGCTCATGGAATGTTAGCACAGTAAGAATAGCAACCAC  1093

seq1  TTTTCATCGTAATATTGGTATTAGACTGCCAGGAAAACAATAATTTAATA  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATCGTAATATTGGTATTAGACTGCCAGGAAAACAATAATTTAATA  1143

seq1  AAAATAATTAAGGAGTGGTAGTGTCTTCTGGAATTC  1177
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAATTAAGGAGTGGTAGTGTCTTCTGGAATTC  1179

seq1: chr6_61330253_61331046
seq2: B6Ng01-198K23.g_68_861

seq1  GAATTCCTTCTGTGACTATTAATTAAGAAGGTAATTTGTTATTAATTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCTGTGACTATTAATTAAGAAGGTAATTTGTTATTAATTTCT  50

seq1  AATGGGCAAAGTACAACAGAGTTGAGATGAAGCCCGGTGGCTTTGCTAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGCAAAGTACAACAGAGTTGAGATGAAGCCCGGTGGCTTTGCTAAT  100

seq1  ATGAATGGCAATGTAGAAAGAATTGCAACATTAACTCAGGGATATTGTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGGCAATGTAGAAAGAATTGCAACATTAACTCAGGGATATTGTAA  150

seq1  AAATCAGCTCTGAGTTTGTATGGGCTGTGAGGTACCTAGAAAAAAAGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGCTCTGAGTTTGTATGGGCTGTGAGGTACCTAGAAAAAAAGAAA  200

seq1  TGGGCATAGGATGTCTTGAACTAGATTGTGTAAAACTCAGAAACTTGTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCATAGGATGTCTTGAACTAGATTGTGTAAAACTCAGAAACTTGTGC  250

seq1  CACTTAATTTTGGAGATATAAGTTGACACCTAATAAATGTATGTACAAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAATTTTGGAGATATAAGTTGACACCTAATAAATGTATGTACAAAG  300

seq1  AAAGCTATGTTACTTGGGCTGACAGTGGTCTCCACAAGAGCCATAGACTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTATGTTACTTGGGCTGACAGTGGTCTCCACAAGAGCCATAGACTA  350

seq1  CTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTATCAGATGTGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTATCAGATGTGAGA  400

seq1  AACCTCTGTTTGAATTGTTAATTATGTTAGTTCAAGTTTTCCCCAAACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCTGTTTGAATTGTTAATTATGTTAGTTCAAGTTTTCCCCAAACAG  450

seq1  CATCATCAATTGCTATTGTCCTTGGATGACTCTCAGAGGTTGAAGATTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCAATTGCTATTGTCCTTGGATGACTCTCAGAGGTTGAAGATTAA  500

seq1  GTCCTTATTGTGAAGACACTGAACATTTGGGGCACATGACTCATAGTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTATTGTGAAGACACTGAACATTTGGGGCACATGACTCATAGTACT  550

seq1  CCAGCTGTATCTAACCTTATATTGTCTCTCCTACTGTCTAGTTTCCATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTGTATCTAACCTTATATTGTCTCTCCTACTGTCTAGTTTCCATAG  600

seq1  TAACATAAAGCAGTATGCAAGTTGACAAGAGAGATAATTAATAATCTCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATAAAGCAGTATGCAAGTTGACAAGAGAGATAATTAATAATCTCAT  650

seq1  CTAACTGCAAGACCTATGAACTACAGCAATGATCAGATTAGCATGATATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTGCAAGACCTATGAACTACAGCAATGATCAGATTAGCATGATATC  700

seq1  ATTACAGGTGCAATAGTGACACTTATATTTCCAGGTAACCAACAACTGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGGTGCAATAGTGACACTTATATTTCCAGGTAACCAACAACTGCC  750

seq1  TAATTGCACTGAAGACCCACTCAACAGGAGGGAAATCATGTCTC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGCACTGAAGACCCACTCAACAGGAGGGAAATCATGTCTC  794