BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-199K04
Chromosome6 (Build37)
Map Location 126,703,771 - 126,875,348
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC667463, Ndufa9, Akap3, Dyrk4, Rad51ap1
Upstream geneTmem16b, Ntf3, LOC100043565, LOC667427, LOC100043567, Kcna5, Kcna1, Kcna6
Downstream geneD6Wsu163e, LOC667473, LOC624256, Fgf6, Fgf23, 9630033F20Rik, Ccnd2, Tpi-rs11, EG243642, LOC100043578, EG640703, LOC100043848, Parp11, Efcab4b, Prmt8, Tspan11
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-199K04.bB6Ng01-199K04.g
ACCGA020917GA020918
length1,0221,076
definitionB6Ng01-199K04.b B6Ng01-199K04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,703,771 - 126,704,787)(126,874,280 - 126,875,348)
sequence
gaattctctgccagttcccaggacaacttgagctgcctttagggtgtgga
aagaataaagggctcacgagaagaagtctgtctgtcccctcctggatcac
ctcatacacaggagactcagcagtcacatgacaccgtacatatgtcatcc
acgtgacaagcacataagaagcagcttctatgtaccatgcactgtgtacc
ttccaggtctcggagacatttgcacatcgatgctcatttgcagcaccagt
cacagcagctaaactaggtgtcccacagctgaggcacaggtaaagaagat
tgactggggctgggcagagggctcagtggttaagatcactaacttctctt
ctggagggcctaggtttgcctcccagcacctagatggcagctcacaacca
tctgtaactctagtttcagaggatccaatgccctcttctgacctccagtg
gcaccaggcacacatatggtgtccacatacaggcaaaatgtttacatgca
taaaaataaaaataaaaaaatctaaaaaaaagaaagaaaaccagccatat
aaacacaatggaatttttgcagccacagggaaaaataaagatgtatgatg
cccagaaaaatggtaacaaacagacacaaccatatgaagcaaactaagcc
agtcttagaaagatgaatatatgttttcttgtttgttacccttagatttt
atatatatagatgcatagtcacgtgtgtatacatgagatggaagtggaaa
tgaagctatatatgggaaaaggaaggtaggaactatatattaggaaaggg
gagatgggggcacaggaaaatatgttcaactggtgagggtaggcccagtg
ctcctatgtgttcaaattgctaaatactgggcccccaaggtctgggttgc
ccccactccagaaaaggcagaatcatcacatataccaagtgatgttatgc
aactttgctctcaattaaaaaccgttggttagaataacatggctacagcc
aatactgggggagaaatagaaa
gaattctagagaacaggatgcccacatcgtgtgttctctataaccctggg
gtcctctataggactctccctgacatacacagaagaggcattatttgtaa
agtgcctacaagtatgaccttagacgtcaaacgtagtttctaatctgagt
tccaacagtagctgtcagactacaggcaaattgcttcacctctctgctct
tatcattttagacttgaacattatcttcctgcatgacagttgtttttatg
tgtttcaaataagtgacttcagtagacccagctccagctgccatcaagtc
aggatctccatctttaccccaggcagttggtcttccttctgaggccacta
ggaaaccagcaataatgtgcagcccttcagctgaaagcaagaggcccaag
tgggtccccccaggtatggtaatgtgctatcaaggtcaccaacttaggaa
gatatcacaggaattatgtgtgagcagatcccatattatttcaaattctt
ccaagttagtattttagtgtttcagtttattatcttgccgtttctttatc
aggcatttgttctcattgctagaaataaaactgcagtaaatggagacatc
cttacttcaaaaatctatggtcacagccatgattatcatagagtcaagag
tattaacaattttgtttgcttggattttttggcaacaaggtttgacccta
agacctcgtggcctcctcagtttaagagagcacccaggcctgagcactga
aacatgtaacacaaatgccttggcaagtttgtctttgtctttatatgtgt
gttttgctccacagccagaaaagttgaagactttgaaaggtgtcggagtt
ggggttttcagattaggatgctttgcctgcctgtgcttttcctgattgtc
agtgtgggtcttttcttctgatctgttgcagctcatgatgggctctgtag
agcccggacctaaccctttgcttgcctttgggttttctccttgcagctgc
tctggggagcaggaactctagcagccaatgcatggccaggaacaccttgc
cagttcccgaagtcagagctgcgtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_126703771_126704787
seq2: B6Ng01-199K04.b_45_1066

seq1  GAATTCTCTGCCAGTTCCCAGGACAACTTGAGCTGCCTTTAGGGTGTGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGCCAGTTCCCAGGACAACTTGAGCTGCCTTTAGGGTGTGGA  50

seq1  AAGAATAAAGGGCTCACGAGAAGAAGTCTGTCTGTCCCCTCCTGGATCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAAAGGGCTCACGAGAAGAAGTCTGTCTGTCCCCTCCTGGATCAC  100

seq1  CTCATACACAGGAGACTCAGCAGTCACATGACACCGTACATATGTCATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATACACAGGAGACTCAGCAGTCACATGACACCGTACATATGTCATCC  150

seq1  ACGTGACAAGCACATAAGAAGCAGCTTCTATGTACCATGCACTGTGTACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGACAAGCACATAAGAAGCAGCTTCTATGTACCATGCACTGTGTACC  200

seq1  TTCCAGGTCTCGGAGACATTTGCACATCGATGCTCATTTGCAGCACCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGTCTCGGAGACATTTGCACATCGATGCTCATTTGCAGCACCAGT  250

seq1  CACAGCAGCTAAACTAGGTGTCCCACAGCTGAGGCACAGGTAAAGAAGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAGCTAAACTAGGTGTCCCACAGCTGAGGCACAGGTAAAGAAGAT  300

seq1  TGACTGGGGCTGGGCAGAGGGCTCAGTGGTTAAGATCACTAACTTCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGGGGCTGGGCAGAGGGCTCAGTGGTTAAGATCACTAACTTCTCTT  350

seq1  CTGGAGGGCCTAGGTTTGCCTCCCAGCACCTAGATGGCAGCTCACAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGGCCTAGGTTTGCCTCCCAGCACCTAGATGGCAGCTCACAACCA  400

seq1  TCTGTAACTCTAGTTTCAGAGGATCCAATGCCCTCTTCTGACCTCCAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAACTCTAGTTTCAGAGGATCCAATGCCCTCTTCTGACCTCCAGTG  450

seq1  GCACCAGGCACACATATGGTGTCCACATACAGGCAAAATGTTTACATGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAGGCACACATATGGTGTCCACATACAGGCAAAATGTTTACATGCA  500

seq1  TAAAAATAAAAATAAAAAAATCTAAAAAAAAGAAAGAAAACCAGCCATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATAAAAATAAAAAAATCTAAAAAAAAGAAAGAAAACCAGCCATAT  550

seq1  AAACACAATGGAATTTTTGCAGCCACAGGGAAAAATAAAGATGTATGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAATGGAATTTTTGCAGCCACAGGGAAAAATAAAGATGTATGATG  600

seq1  CCCAGAAAAATGGTAACAAACAGACACAACCATATGAAGCAAACTAAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAAAAATGGTAACAAACAGACACAACCATATGAAGCAAACTAAGCC  650

seq1  AGTCTTAGAAAGATGAATATATGTTTTCTTGTTTGTTACCCTTAGATTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTAGAAAGATGAATATATGTTTTCTTGTTTGTTACCCTTAGATTTT  700

seq1  ATATATATAGATGCATAGTCACGTGTGTATACATGAGATGGAAGTGGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATAGATGCATAGTCACGTGTGTATACATGAGATGGAAGTGGAAA  750

seq1  TGAAGCTATATATGGGAAAAGGAAGGTAGGAACTATATATTAGGAAAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTATATATGGGAAAAGGAAGGTAGGAACTATATATTAGGAAAGGG  800

seq1  GAGATGGGGGCACAGGAAAATATGTTCAACTGGTGAGGGTAGGCCCAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGGGGGCACAGGAAAATATGTTCAACTGGTGAGGGTAGGCCCAGTG  850

seq1  CTCCTATGTGTTCAAA-TGCTAAATACT-GGCCCCCAAGGTCT-GGTTGC  897
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  CTCCTATGTGTTCAAATTGCTAAATACTGGGCCCCCAAGGTCTGGGTTGC  900

seq1  CCCCACCCCAGAAAA-GCAG-ATCATCACATATACCAAGTGATGTTATGC  945
      |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACTCCAGAAAAGGCAGAATCATCACATATACCAAGTGATGTTATGC  950

seq1  AACTTTGCTCCCCAATTAAAAACCGTTGGTTAGATAAACATGGCTACAGC  995
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  AACTTTGCT-CTCAATTAAAAACCGTTGGTTAGAATAACATGGCTACAGC  999

seq1  CAATTACT-GGGGAG-AATAGAAA  1017
      ||| |||| |||||| ||||||||
seq2  CAA-TACTGGGGGAGAAATAGAAA  1022

seq1: chr6_126874280_126875348
seq2: B6Ng01-199K04.g_61_1136 (reverse)

seq1  AGACGCAGGCTCTGAC-TCGGGGACTTGGCAGGTGTTCCTGCCAATGCAT  49
      ||||||| |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||| | ||||||
seq2  AGACGCA-GCTCTGACTTCGGGAACTGGCAAGGTGTTCCTGGCCATGCAT  49

seq1  T-GCTGCTAGAGTTCCTGCT-CCCAGAGGCAGCTGC-AGGAGAAA--CCA  94
      | |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||
seq2  TGGCTGCTAGAGTTCCTGCTCCCCAGA-GCAGCTGCAAGGAGAAAACCCA  98

seq1  AAGGCAAGCAAAGGGTTAGGTCC-GGCTCTACAGAGCCCATCATGAGCTG  143
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAGCAAAGGGTTAGGTCCGGGCTCTACAGAGCCCATCATGAGCTG  148

seq1  CAACAGATCAGAAG-AAAGACCCACACTGACAATCAGGAAAAGCACAGGC  192
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGATCAGAAGAAAAGACCCACACTGACAATCAGGAAAAGCACAGGC  198

seq1  AGGCAAAGCATCCTAATCTGAAAACCCCAACTCCGACACC-TTCAAAGTC  241
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGGCAAAGCATCCTAATCTGAAAACCCCAACTCCGACACCTTTCAAAGTC  248

seq1  TTCAACTTTTCTGGCTGTGGAGCAAAACACACATATAAAGACAAAGACAA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTTTTCTGGCTGTGGAGCAAAACACACATATAAAGACAAAGACAA  298

seq1  ACTTGCCAAGGCATTTGTGTTACATGTTTCAGTGCTCAGGCCTGGGTGCT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCCAAGGCATTTGTGTTACATGTTTCAGTGCTCAGGCCTGGGTGCT  348

seq1  CTCTTAAACTGAGGAGGCCACGAGGTCTTAGGGTCAAACCTTGTTGCCAA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTAAACTGAGGAGGCCACGAGGTCTTAGGGTCAAACCTTGTTGCCAA  398

seq1  AAAATCCAAGCAAACAAAATTGTTAATACTCTTGACTCTATGATAATCAT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCCAAGCAAACAAAATTGTTAATACTCTTGACTCTATGATAATCAT  448

seq1  GGCTGTGACCATAGATTTTTGAAGTAAGGATGTCTCCATTTACTGCAGTT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTGACCATAGATTTTTGAAGTAAGGATGTCTCCATTTACTGCAGTT  498

seq1  TTATTTCTAGCAATGAGAACAAATGCCTGATAAAGAAACGGCAAGATAAT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCTAGCAATGAGAACAAATGCCTGATAAAGAAACGGCAAGATAAT  548

seq1  AAACTGAAACACTAAAATACTAACTTGGAAGAATTTGAAATAATATGGGA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGAAACACTAAAATACTAACTTGGAAGAATTTGAAATAATATGGGA  598

seq1  TCTGCTCACACATAATTCCTGTGATATCTTCCTAAGTTGGTGACCTTGAT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCACACATAATTCCTGTGATATCTTCCTAAGTTGGTGACCTTGAT  648

seq1  AGCACATTACCATACCTGGGGGGACCCACTTGGGCCTCTTGCTTTCAGCT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACATTACCATACCTGGGGGGACCCACTTGGGCCTCTTGCTTTCAGCT  698

seq1  GAAGGGCTGCACATTATTGCTGGTTTCCTAGTGGCCTCAGAAGGAAGACC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGCTGCACATTATTGCTGGTTTCCTAGTGGCCTCAGAAGGAAGACC  748

seq1  AACTGCCTGGGGTAAAGATGGAGATCCTGACTTGATGGCAGCTGGAGCTG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGCCTGGGGTAAAGATGGAGATCCTGACTTGATGGCAGCTGGAGCTG  798

seq1  GGTCTACTGAAGTCACTTATTTGAAACACATAAAAACAACTGTCATGCAG  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTACTGAAGTCACTTATTTGAAACACATAAAAACAACTGTCATGCAG  848

seq1  GAAGATAATGTTCAAGTCTAAAATGATAAGAGCAGAGAGGTGAAGCAATT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATAATGTTCAAGTCTAAAATGATAAGAGCAGAGAGGTGAAGCAATT  898

seq1  TGCCTGTAGTCTGACAGCTACTGTTGGAACTCAGATTAGAAACTACGTTT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTAGTCTGACAGCTACTGTTGGAACTCAGATTAGAAACTACGTTT  948

seq1  GACGTCTAAGGTCATACTTGTAGGCACTTTACAAATAATGCCTCTTCTGT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTCTAAGGTCATACTTGTAGGCACTTTACAAATAATGCCTCTTCTGT  998

seq1  GTATGTCAGGGAGAGTCCTATAGAGGACCCCAGGGTTATAGAGAACACAC  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTCAGGGAGAGTCCTATAGAGGACCCCAGGGTTATAGAGAACACAC  1048

seq1  GATGTGGGCATCCTGTTCTCTAGAATTC  1069
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGGGCATCCTGTTCTCTAGAATTC  1076