seq1: chr6_40774531_40774740
seq2: B6Ng01-218H12.b_74_281
seq1 CAGGAAAACAGAATGAAA----CCAAATGAACATAGCTT-CTAGGTACAA 45
|||||||||||||||| | | |||| || | || | || | |
seq2 CAGGAAAACAGAATGACACTCCCTTAATGGGCAGATTTTATTCAGTCCTA 50
seq1 CATGGCTTTGAATAAAGGGTTTGGCCTTTCTGGGTTTC-CATGTTTAACT 94
| |||| || ||||| || || | |
seq2 AA------AGAATGAA----------ATTCTGTCACTCTCAGAAAAAGCA 84
seq1 GGTGTAACAGGAGGATCTCAAATGGCTCTTAGGATTATTCAGATAGCCGT 144
|||| | |||| | | || ||| | | | || || | |
seq2 GGTGACCCTGGAG------ATGAGCCTGTTAAGTGAAATAAGCCAGACAT 128
seq1 GGACAGCCA-----TGTGGA---------AGTCATCTTTAAACTATAAAA 180
||| || || |||| | || | | | | | ||
seq2 GGAAAGACAAATACTGTGTATTCTCTCCCTGTGGGGTCTGGATTTTTAAG 178
seq1 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 210
||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 208
| seq1: chr16_5134858_5135932
seq2: B6Ng01-218H12.g_65_1142
seq1 GAATTCCACTTGGCCCTCATCCACGTTCTCACTCCATGTTCTAAGATAGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCACTTGGCCCTCATCCACGTTCTCACTCCATGTTCTAAGATAGT 50
seq1 CAGCCCAGGGCTGGTGCAGCTGTGTGTGCATGCATGGGTACATGTGCACG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGCCCAGGGCTGGTGCAGCTGTGTGTGCATGCATGGGTACATGTGCACG 100
seq1 TGTGTATGCACATGTGTTCCACACACAGCTGTGGGCAGGCAGGATGGGGC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTGTATGCACATGTGTTCCACACACAGCTGTGGGCAGGCAGGATGGGGC 150
seq1 GGGAGATCTGCCCTCACTCGTACACCCTCTGGGGGGCCAGATGGGGTTAG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGAGATCTGCCCTCACTCGTACACCCTCTGGGGGGCCAGATGGGGTTAG 200
seq1 TTCGGCACTGCCAAGCTGTCTTCTGCCAAGTGACTCATCCCCTCTGCTGT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCGGCACTGCCAAGCTGTCTTCTGCCAAGTGACTCATCCCCTCTGCTGT 250
seq1 GGCGGGGGCGGGGAGGCCAGCAGGAGGATTGCGTAGGTACTTGTTCCAGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCGGGGGCGGGGAGGCCAGCAGGAGGATTGCGTAGGTACTTGTTCCAGG 300
seq1 ATGGTTGAACATCATTGAGGCGGCACCTGCAGGGCTGTGCAGTGCCCAGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGGTTGAACATCATTGAGGCGGCACCTGCAGGGCTGTGCAGTGCCCAGC 350
seq1 AACCAGTGACCCTTGGCCTCCCATACCTGTTTCTTTCCAAAGCTGGAATG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACCAGTGACCCTTGGCCTCCCATACCTGTTTCTTTCCAAAGCTGGAATG 400
seq1 AGGGCTCTGTTTCATTGTTGCAAGGGTCACCCACACCCTCTCTGTGCTCA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGGCTCTGTTTCATTGTTGCAAGGGTCACCCACACCCTCTCTGTGCTCA 450
seq1 ACATTTCCCCAGAAGTTGGAGAGGAATGTACACTCCAGGCTCCCTCACTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACATTTCCCCAGAAGTTGGAGAGGAATGTACACTCCAGGCTCCCTCACTT 500
seq1 TGAACCAGTTTGAAACAGGAAGAACAGCATTCTCTCAATCCGGGAACAGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGAACCAGTTTGAAACAGGAAGAACAGCATTCTCTCAATCCGGGAACAGA 550
seq1 GGGCCCTGCTTACAGGACCAGGATGGAACCTTCTTCTCCCAGGGTGGAGG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGCCCTGCTTACAGGACCAGGATGGAACCTTCTTCTCCCAGGGTGGAGG 600
seq1 CCCAGGGCCATTCTCTTGTGGGCTAGACCCTCTCTCATCTCCTATATGGC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCAGGGCCATTCTCTTGTGGGCTAGACCCTCTCTCATCTCCTATATGGC 650
seq1 TCCACAATCGCTCGAGGAATCTTACTTACATACAGATCCAGGAATGGTAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCACAATCGCTCGAGGAATCTTACTTACATACAGATCCAGGAATGGTAG 700
seq1 CATAGACCTGTCAC-TTCAGTTGAGGCTGAGGCAGGAGGATTAAAACTTC 749
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CATAGACCTGTCACTTTCAGTTGAGGCTGAGGCAGGAGGATTAAAACTTC 750
seq1 AAGGCCTACCTTAGCGCCAGAGTAAGTTCAAGGCTAGCCCAAGTGACTTA 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGGCCTACCTTAGCGCCAGAGTAAGTTCAAGGCTAGCCCAAGTGACTTA 800
seq1 TCAAGGCTAGCCCAAGTGACTTAATAAGACCCTGTCACCTTTAACAAAA- 848
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCAAGGCTAGCCCAAGTGACTTAATAAGACCCTGTCACCTTTAACAAAAG 850
seq1 GTTAAAAGAGCTGGGGTGGAGCTCAGTGGTGTTTGGCTTGCCAGGCACGT 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTAAAAGAGCTGGGGTGGAGCTCAGTGGTGTTTGGCTTGCCAGGCACGT 900
seq1 GTGAGGCCCTACGTTCAAGTTCATGTTTCTTTTCCTGGGATTGTGGCTGA 948
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2 GTGAGGCCCTACGTTCAAGTTCATGTTTCTTTTTCTGGGATTGTGGCTGA 950
seq1 ATTTTATCAG-CACCACACTCTATCCACTGAGATGGAATGTCTCATCTAT 997
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2 ATTTTATCAGCCACCACACTCTATTCACTGAGATGGGATGTCTCATCTAT 1000
seq1 CCAACAGCCAGATGGAAATGCTTTTCAGAGAGTAGCCACCCTC-TGGAGC 1046
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||
seq2 CCAACAGCCAGATGGAATTGCTTTTCAGAGAGTAGCCACCCTCTTGAAGC 1050
seq1 TCTGAAGCAAAGGGGTTTGGGGCTAGCTG 1075
|||| ||| || |||||||||||||||||
seq2 TCTG-AGCCAATGGGTTTGGGGCTAGCTG 1078
|