BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-257I07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 75,336,237 - 75,470,697
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG668132, LOC668136, LOC621306, LOC100042942, LOC668143
Downstream geneEG668145, EG546907, LOC100042952, LOC668153, EG668155
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-257I07.bB6Ng01-257I07.g
ACCGA063197GA063198
length2411,127
definitionB6Ng01-257I07.b B6Ng01-257I07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,470,457 - 75,470,697)(75,336,237 - 75,337,353)
sequence
agtttttcaagtgtgccactgtatttgttcgaaaactgataaatgtgtgt
gtgtgtgtgtgtattctcactttatatttgtgatatcacaaaagatatca
tccttttactatcttagtactgataattatgatttgagtttatatagatc
aaataagatgtatcttcctttataggtttatctgtccaattcccccaatg
attaaagtgtgtgtttgtatgggagtgtggtatgtgtggtg

gaattccgtaaaattcaaagtggactcttgtttacacagagaactcatcc
atttctcctaacttcggaaaaaaatggacaagtgcaaagagagattaatc
tcaaaatatacacaactggttatgtggtataactttataagccttaaaat
ggaggggatcttttcacttgagacattctggccatggcttacttaaataa
attacagatgcaagtttgtctctactgccttcctatttaaaaacaaggag
ttaaaattaacagtgttgatgcatgttcttggaatgtatctccagctgag
atggtcaatggttgaccagggcacaaacttctaacactatttctgatgct
atattgcttgtaaacagaagcatagcatcatgactgtcctctaagagcag
cagctgacagagacagatgcaaatgtagccacacattgaactgaggcagc
aacctctgtggaagagttaggggaaggaattaaagggataacaagcccaa
taggaagaccaacagtcaacagcatcacctaacctggaccctgggagctc
tcagagttttagctaccaaccaaagagccaaactggctggccagaggctc
ccagcacatgtatagtagagaactgccttgtctgggcttagtggaagagg
atgcacctaaccgtgtggagacttaatgctccaaggtggggtgatgcctg
tgcggggtaccctctcagaggagaagaggaggggaagggtggaaaaattg
ctagggcggcctggaggggggcaacattggtatgcaagtaaataaaataa
tcaagaaaatgctgggaaacaaataagcaacctatgatttcaccaaattt
catgtcctgtttgatttgaattttagatatattttctcctctgactataa
cttcaaattactgtattatggattaattttatttgtttctttgtcctttt
attcattgctccttgtattatttaaaataccttcacttcctgatgtttct
tctgtgtccctctctcttatctctctcccgggtcctctctccgtctcctc
ccagaattttacaagcctatatcggcttaaaatcaattaatttcagaatt
gggcatgagatgccatgttgtgcatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_75470457_75470697
seq2: B6Ng01-257I07.b_50_290 (reverse)

seq1  CACCACACATACCACACTCCCATACAAACACACACTTTAATCATTGGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACACATACCACACTCCCATACAAACACACACTTTAATCATTGGGGG  50

seq1  AATTGGACAGATAAACCTATAAAGGAAGATACATCTTATTTGATCTATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGACAGATAAACCTATAAAGGAAGATACATCTTATTTGATCTATAT  100

seq1  AAACTCAAATCATAATTATCAGTACTAAGATAGTAAAAGGATGATATCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCAAATCATAATTATCAGTACTAAGATAGTAAAAGGATGATATCTT  150

seq1  TTGTGATATCACAAATATAAAGTGAGAATACACACACACACACACACATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGATATCACAAATATAAAGTGAGAATACACACACACACACACACATT  200

seq1  TATCAGTTTTCGAACAAATACAGTGGCACACTTGAAAAACT  241
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGTTTTCGAACAAATACAGTGGCACACTTGAAAAACT  241


seq1: chr6_75336237_75337353
seq2: B6Ng01-257I07.g_66_1192

seq1  GAATTCCGTAAAATTCAAAGTGGACTCTTGTTTACACAGAGAACTCATCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCGTAAAATTCAAAGTGGACTCTTGTTTACACAGAGAACTCATCC  50

seq1  ATTTCTCCTAACTTCGGAAAAAAATGGACAAGTGCAAAGAGAGATTAATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCCTAACTTCGGAAAAAAATGGACAAGTGCAAAGAGAGATTAATC  100

seq1  TCAAAATATACACAACTGGTTATGTGGTATAACTTTATAAGCCTTAAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATATACACAACTGGTTATGTGGTATAACTTTATAAGCCTTAAAAT  150

seq1  GGAGGGGATCTTTTCACTTGAGACATTCTGGCCATGGCTTACTTAAATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGGATCTTTTCACTTGAGACATTCTGGCCATGGCTTACTTAAATAA  200

seq1  ATTACAGATGCAAGTTTGTCTCTACTGCCTTCCTATTTAAAAACAAGGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGATGCAAGTTTGTCTCTACTGCCTTCCTATTTAAAAACAAGGAG  250

seq1  TTAAAATTAACAGTGTTGATGCATGTTCTTGGAATGTATCTCCAGCTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATTAACAGTGTTGATGCATGTTCTTGGAATGTATCTCCAGCTGAG  300

seq1  ATGGTCAATGGTTGACCAGGGCACAAACTTCTAACACTATTTCTGATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCAATGGTTGACCAGGGCACAAACTTCTAACACTATTTCTGATGCT  350

seq1  ATATTGCTTGTAAACAGAAGCATAGCATCATGACTGTCCTCTAAGAGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGCTTGTAAACAGAAGCATAGCATCATGACTGTCCTCTAAGAGCAG  400

seq1  CAGCTGACAGAGACAGATGCAAATGTAGCCACACATTGAACTGAGGCAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGACAGAGACAGATGCAAATGTAGCCACACATTGAACTGAGGCAGC  450

seq1  AACCTCTGTGGAAGAGTTAGGGGAAGGAATTAAAGGGATAACAAGCCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCTGTGGAAGAGTTAGGGGAAGGAATTAAAGGGATAACAAGCCCAA  500

seq1  TAGGAAGACCAACAGTCAACAGCATCACCTAACCTGGACCCTGGGAGCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAGACCAACAGTCAACAGCATCACCTAACCTGGACCCTGGGAGCTC  550

seq1  TCAGAGTTTTAGCTACCAACCAAAGAGCCAAACTGGCTGGCCAGAGGCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTTTTAGCTACCAACCAAAGAGCCAAACTGGCTGGCCAGAGGCTC  600

seq1  CCAGCACATGTATAGTAGAGAACTGCCTTGTCTGGGCTTAGTGGAAGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACATGTATAGTAGAGAACTGCCTTGTCTGGGCTTAGTGGAAGAGG  650

seq1  ATGCACCTAACCGTGTGGAGACTTAATGCTCCAAGGTGGGGTGATGCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACCTAACCGTGTGGAGACTTAATGCTCCAAGGTGGGGTGATGCCTG  700

seq1  TGCGGGGTACCCTCTCAGAGGAGAAGAGGAGGGGAAGGGTGGAAAAATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGGGGTACCCTCTCAGAGGAGAAGAGGAGGGGAAGGGTGGAAAAATTG  750

seq1  CTAGGGCGGCCTGGAGGGGGGCAACATTGGTATGCAAGTAAATAAAATAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGCGGCCTGGAGGGGGGCAACATTGGTATGCAAGTAAATAAAATAA  800

seq1  TCAAGAAAATGCTGGGAAACAAATAAGCAACCTATGATTTCACCAAATTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAAAATGCTGGGAAACAAATAAGCAACCTATGATTTCACCAAATTT  850

seq1  CATGTCCTGTTTGATTTGAATTTTAGATATATTTTCTCCTCTGACTATAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCCTGTTTGATTTGAATTTTAGATATATTTTCTCCTCTGACTATAA  900

seq1  CTTCAAATTACTGTATTATGGATTAATTTTATTTGTTTCTTTGTCCTTT-  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTTCAAATTACTGTATTATGGATTAATTTTATTTGTTTCTTTGTCCTTTT  950

seq1  -ATCATTGCTCCTTGTTATTATTTAAAATACC-TCACTTCCCTGATGTTT  997
        ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  ATTCATTGCTCCTTG-TATTATTTAAAATACCTTCACTT-CCTGATGTTT  998

seq1  CTCTCTGTGTCTCTCTCTCTTTATCTCTCTCTCTGTGTCTCTCTCTGTCT  1047
      || |||||||| ||||||| ||||||||||| | |   ||||||| ||||
seq2  CT-TCTGTGTCCCTCTCTC-TTATCTCTCTCCCGGGTCCTCTCTCCGTCT  1046

seq1  CTCTCTCAATATTTTAC-AGCCTATATCGGCTTAAAAATCAATATATTTC  1096
      | ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||
seq2  C-CTCCCAGAATTTTACAAGCCTATATCGGCTT-AAAATCAATTAATTTC  1094

seq1  AGAA-TGTGCATGA-----------GTGCATGT  1117
      |||| || ||||||           ||||||||
seq2  AGAATTGGGCATGAGATGCCATGTTGTGCATGT  1127


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |