BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-260D07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 128,570,515 - 128,722,169
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlrb1a, EG545878, LOC677440, Clec2h, LOC100043863, LOC100043861
Upstream geneEfcab4b, Prmt8, Tspan11, Tspan9, LOC100043853, LOC667560, Tead4, LOC652986, Tulp3, 5930416I19Rik, Foxm1, Nrip2, Itfg2, Fkbp4, EG667598, Pzp, LOC384494, EG667610, BC048546
Downstream geneKlrb1c, LOC100043862, Klrb1d, LOC667706, Clec2i, Clec2g, LOC667715, BC064078, Clec2f, Klrb1f, Clec2e, Klrb1-ps1, Clec2d, Cd69, 4922502D21Rik, Clec12a, 4933425B16Rik, Clec1b, Clec9a, Clec1a, Clec7a, Olr1, D630042F21Rik, Gabarapl1, Klre1, Klrd1, Klrk1, Klrc3, Klrc2, Klrc1, LOC640755, Klri1, Klri2, Gm156
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-260D07.bB6Ng01-260D07.g
ACCGA065184GA065185
length1,208991
definitionB6Ng01-260D07.b B6Ng01-260D07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,720,957 - 128,722,169)(128,570,515 - 128,571,388)
sequence
gaattcagcatttacagcctctgctttccttcccaagtgtttattattaa
aatgattttgatgcagggcctggagacccatgccaaagataacaacatcg
agggaggaggctcaagagttcaagcccaggctgggctacatagctagagc
ttgtctccggaagctaagacccaataaaaccaatgctttgaggatgagtt
ttatttagcttgaactgatttccaagccctccagccttgatggtggaaaa
tgtgatatttgtccatgaccttgtctttttcttgctagtatcaaaagcag
gtcaacaaatccttttatttaagggaaacttgatcccaataattctattt
taacaatatgtgagggataaagtcagtactttacacagatacatgcaagg
ctattttcatattgcagactctccatagagccaagatatggaagccacct
aatcaagcaccagtggttgattgaataataacaatgcacaggtgacttta
gtttcctcagttgcccatcatagtcttatgtcttagtaacattacaaaat
taatcagcaagggagtcaggtcttggactcagaactctttctgatcgctg
cttcagtctttagtcagctttccactactttagtttgttttgttttgttt
tgttttgttttgttttgttttgttttgctttgtttggagacagggtcctg
aagctctgtgtggagttgaaggatggcccttaaatcatcttgccttgttg
cctagggagtgctgggattaaaggcggttgagattaagcccagccctacc
acaccaatttggacattaactactgttgtgtgaatcctcccagggctccc
ttcctgccttctgaagcatctctacacatttctcttcctagacccagcaa
gagaagatgttatctttggaagtttttactttcacagcatgagtgttagc
tcatagattcaaagggaatctgtcgctatacgacagattatataccgcac
cactgaaactttaaaagcaaattgccactggggagaaattccacatttgc
cacctggtgagtcttgcaggccttatgctgtgataagataacacaaggag
tttcagtctagcacatcttggaggaattgttcagcagtccatagaagaga
tacttttaatcaacggatatatcgacagcattatttgcttggctccttcg
gctccaag
gaattccatgagatgaactctccgttaggttcagatgtttgctttgataa
agcaggactgaaagaataatacttatgtatgtattatgcacaaaggagca
tcggctgaatcaatctcgatacatgtgattgagtgctgtccattggctga
atcaatctcgatacatgtgattgagtgctgtccaaaagtaaatggtatgt
tctattttgggaagggagtcagagcatctctaaggaagatcctttaatca
agagatgcttttgatgctcagttttgtggtactgatgactttcagtgcta
atgacatatgattctattcctggacatgaagtcttcttcactgttgtcta
caatgatctccattttgaatcaaaggcgtgatatccaaggggaagcaact
tgtgatttcagacggtatttcagtatttcagttgtgttagtcccccctta
ttggctgaattccaaacaccctaatggttagatgaactgaaactgtggtt
agcaccagcctctatatatacacacccatgcacacacattaagcatacac
taaatacaatctgactgtagctttcacagtgttccttccttaaatagagt
actttcaaaatttctttttgttgtgctctgttatgtttctaagacagggt
tactcctcagtccaggctgactgctaactctgtgtggctgaagatgacct
tgagctcctgattctcctgcctctgcctcccaagtgatggaattataagt
gtgcaccacccagaacaagtagagaataagagactatgaagtactcagcc
ctaagtggcacatctgcatctcatcccatccctaaccaaaggctctgcca
tcatcacagcagaggggacagaataactgcagagtcagagatggtggaca
actgtaatgaaacactgtctttcagacacagcaggcagttgcacatatga
actcatgccatttgtatagcctgcacagaccttcaaaactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_128720957_128722169
seq2: B6Ng01-260D07.b_44_1251 (reverse)

seq1  CTTGGAGCCGAAGGAG-CAAGCAAATAATGCTGTTCTGAT-TATCCGTTG  48
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||
seq2  CTTGGAGCCGAAGGAGCCAAGCAAATAATGCTGT--CGATATATCCGTTG  48

seq1  TATTAAAAAGTA-CTC-TCTATGGACTGCTGAACAAATCCCTCCAAGATG  96
       ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  -ATT-AAAAGTATCTCTTCTATGGACTGCTGAAC-AATTCCTCCAAGATG  95

seq1  TGCTAGACTGAAACTCCTTTGTGGTTATC-TATCACAGCATAGGCCCTGC  145
      ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||| 
seq2  TGCTAGACTGAAACTCC-TTGT-GTTATCTTATCACAGCATAAGGCCTG-  142

seq1  CAAGACTTCACCAGGTGGCAAATGTGAAATTTCTCCCCAGTGGCAATTTG  195
      |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAC-TCACCAGGTGGCAAATGTGGAATTTCTCCCCAGTGGCAATTTG  191

seq1  CTTTTAAAGTTTCAGTGGTGCGGTATATAATCTGTCGTATAGCGACAGAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAGTTTCAGTGGTGCGGTATATAATCTGTCGTATAGCGACAGAT  241

seq1  TCCCCTTTGAATCTATGAGCTAACACTCATGCTGTGAAAGTAAAAACTTC  295
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-CCCTTTGAATCTATGAGCTAACACTCATGCTGTGAAAGTAAAAACTTC  290

seq1  CAAAGATAACATCTTCTCTTGCTGGGTCTAGGAAGAGAAATGTGTAGAGA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATAACATCTTCTCTTGCTGGGTCTAGGAAGAGAAATGTGTAGAGA  340

seq1  TGCTTCAGAAGGCAGGAAGGGAGCCCTGGGAGGATTCACACAACAGTAGT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCAGAAGGCAGGAAGGGAGCCCTGGGAGGATTCACACAACAGTAGT  390

seq1  TAATGTCCAAATTGGTGTGGTAGGGCTGGGCTTAATCTCAACCGCCTTTA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTCCAAATTGGTGTGGTAGGGCTGGGCTTAATCTCAACCGCCTTTA  440

seq1  ATCCCAGCACTCCCTAGGCAACAAGGCAAGATGATTTAAGGGCCATCCTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAGCACTCCCTAGGCAACAAGGCAAGATGATTTAAGGGCCATCCTT  490

seq1  CAACTCCACACAGAGCTTCAGGACCCTGTCTCCAAACAAAGCAAAACAAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCCACACAGAGCTTCAGGACCCTGTCTCCAAACAAAGCAAAACAAA  540

seq1  ACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAACTAAAGTAGTGGAAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAACTAAAGTAGTGGAAA  590

seq1  GCTGACTAAAGACTGAAGCAGCGATCAGAAAGAGTTCTGAGTCCAAGACC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACTAAAGACTGAAGCAGCGATCAGAAAGAGTTCTGAGTCCAAGACC  640

seq1  TGACTCCCTTGCTGATTAATTTTGTAATGTTACTAAGACATAAGACTATG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCCCTTGCTGATTAATTTTGTAATGTTACTAAGACATAAGACTATG  690

seq1  ATGGGCAACTGAGGAAACTAAAGTCACCTGTGCATTGTTATTATTCAATC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCAACTGAGGAAACTAAAGTCACCTGTGCATTGTTATTATTCAATC  740

seq1  AACCACTGGTGCTTGATTAGGTGGCTTCCATATCTTGGCTCTATGGAGAG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACTGGTGCTTGATTAGGTGGCTTCCATATCTTGGCTCTATGGAGAG  790

seq1  TCTGCAATATGAAAATAGCCTTGCATGTATCTGTGTAAAGTACTGACTTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAATATGAAAATAGCCTTGCATGTATCTGTGTAAAGTACTGACTTT  840

seq1  ATCCCTCACATATTGTTAAAATAGAATTATTGGGATCAAGTTTCCCTTAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTCACATATTGTTAAAATAGAATTATTGGGATCAAGTTTCCCTTAA  890

seq1  ATAAAAGGATTTGTTGACCTGCTTTTGATACTAGCAAGAAAAAGACAAGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGGATTTGTTGACCTGCTTTTGATACTAGCAAGAAAAAGACAAGG  940

seq1  TCATGGACAAATATCACATTTTCCACCATCAAGGCTGGAGGGCTTGGAAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGACAAATATCACATTTTCCACCATCAAGGCTGGAGGGCTTGGAAA  990

seq1  TCAGTTCAAGCTAAATAAAACTCATCCTCAAAGCATTGGTTTTATTGGGT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCAAGCTAAATAAAACTCATCCTCAAAGCATTGGTTTTATTGGGT  1040

seq1  CTTAGCTTCCGGAGACAAGCTCTAGCTATGTAGCCCAGCCTGGGCTTGAA  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCTTCCGGAGACAAGCTCTAGCTATGTAGCCCAGCCTGGGCTTGAA  1090

seq1  CTCTTGAGCCTCCTCCCTCGATGTTGTTATCTTTGGCATGGGTCTCCAGG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGAGCCTCCTCCCTCGATGTTGTTATCTTTGGCATGGGTCTCCAGG  1140

seq1  CCCTGCATCAAAATCATTTTAATAATAAACACTTGGGAAGGAAAGCAGAG  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCATCAAAATCATTTTAATAATAAACACTTGGGAAGGAAAGCAGAG  1190

seq1  GCTGTAAATGCTGAATTC  1213
      ||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAAATGCTGAATTC  1208

seq1: chr6_128570515_128571388
seq2: B6Ng01-260D07.g_65_939

seq1  GAATTCCATGAGATGAACTCTCCGTTAGGTTCAGATGTTTGCTTTGATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGAGATGAACTCTCCGTTAGGTTCAGATGTTTGCTTTGATAA  50

seq1  AGCAGGACTGAAAGAATAATACTTATGTATGTATTATGCACAAAGGAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGACTGAAAGAATAATACTTATGTATGTATTATGCACAAAGGAGCA  100

seq1  TCGGCTGAATCAATCTCGATACATGTGATTGAGTGCTGTCCATTGGCTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGCTGAATCAATCTCGATACATGTGATTGAGTGCTGTCCATTGGCTGA  150

seq1  ATCAATCTCGATACATGTGATTGAGTGCTGTCCAAAAGTAAATGGTATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATCTCGATACATGTGATTGAGTGCTGTCCAAAAGTAAATGGTATGT  200

seq1  TCTATTTTGGGAAGGGAGTCAGAGCATCTCTAAGGAAGATCCTTTAATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTTGGGAAGGGAGTCAGAGCATCTCTAAGGAAGATCCTTTAATCA  250

seq1  AGAGATGCTTTTGATGCTCAGTTTTGTGGTACTGATGACTTTCAGTGCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGCTTTTGATGCTCAGTTTTGTGGTACTGATGACTTTCAGTGCTA  300

seq1  ATGACATATGATTCTATTCCTGGACATGAAGTCTTCTTCACTGTTGTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATATGATTCTATTCCTGGACATGAAGTCTTCTTCACTGTTGTCTA  350

seq1  CAATGATCTCCATTTTGAATCAAAGGCGTGATATCCAAGGGGAAGCAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGATCTCCATTTTGAATCAAAGGCGTGATATCCAAGGGGAAGCAACT  400

seq1  TGTGATTTCAGACGGTATTTCAGTATTTCAGTTGTGTTAGTCCCCCCTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTTCAGACGGTATTTCAGTATTTCAGTTGTGTTAGTCCCCCCTTA  450

seq1  TTGGCTGAATTCCAAACACCCTAATGGTTAGATGAACTGAAACTGTGGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGAATTCCAAACACCCTAATGGTTAGATGAACTGAAACTGTGGTT  500

seq1  AGCACCAGCCTCTATATATACACACCCATGCACACACATTAAGCATACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCAGCCTCTATATATACACACCCATGCACACACATTAAGCATACAC  550

seq1  TAAATACAATCTGACTGTAGCTTTCACAGTGTTCCTTCCTTAAATAGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATACAATCTGACTGTAGCTTTCACAGTGTTCCTTCCTTAAATAGAGT  600

seq1  ACTTTCAAAATTTCTTTTTGTTGTGCTCTGTTATGTTTCTAAGACAGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCAAAATTTCTTTTTGTTGTGCTCTGTTATGTTTCTAAGACAGGGT  650

seq1  TACTCCTCAGTCCAGGCTGACTGCTAACTCTGTGTGGCTGAAGATGACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCTCAGTCCAGGCTGACTGCTAACTCTGTGTGGCTGAAGATGACCT  700

seq1  TGAGCTCCTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGATGGAATTATAAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCCTGATTCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGATGGAATTATAAGT  750

seq1  GTGCACCACCCAGAACAAGTAGAGAATAAGAGACTATGAAGTACTCAGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACCACCCAGAACAAGTAGAGAATAAGAGACTATGAAGTACTCAGCC  800

seq1  CTAAGTGGCACATCTGCATCTCATCCCATCCCTAACC-AAGGCTCTGCCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTAAGTGGCACATCTGCATCTCATCCCATCCCTAACCAAAGGCTCTGCCA  850

seq1  TCATCACAGCAGAGGGGACAGAATA  874
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCACAGCAGAGGGGACAGAATA  875