BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-262N07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 37,700,808 - 37,829,959
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039636, LOC665102, Trim24
Upstream genePtn, Dgki, EG665024, Creb3l2, Akr1d1, LOC665046, Ybx1-ps2
Downstream geneSvopl, Atp6v0a4, LOC100039657, D630002J15Rik, D630045J12Rik, LOC665125, Zc3hav1l, Zc3hav1, Rpl30-ps1, Ttc26, D130059P03Rik, 3110054G05Rik, 1110001J03Rik, LOC621228, Luc7l2, Klrg2, LOC665180, Hipk2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-262N07.bB6Ng01-262N07.g
ACCGA067146GA067147
length7881,118
definitionB6Ng01-262N07.b B6Ng01-262N07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,700,808 - 37,701,590)(37,828,834 - 37,829,959)
sequence
gaattctggttttgttgttatcgcagtgtgtgtgaatttttctaagattt
atttcattttttttaaattatgtgttgttgtgtctgggtaagggactata
cccttgagtccaggttcctgcagaggccaaaggaggtgtgaagtctggag
ctaaaggaaggggtgaaccatccagtgtggatgctaaaaactgaactcag
gtcctctgcaaaagcagtcagtgccactaaggccccctccagctcccagc
actcttttctaaagaccaccatgtctaacttccatatctgcttccccata
tttctagagcatatgcttctaggatactcagttcgcaatgtgaagaaact
gctagaagataggtacccacttcagttgaaaggagcccagtgtatgagtt
tattaaaatagattcatctcctccaagagttgagcaagattaggttggaa
acctcagtagctcctcatcacacttgaagatcctgcggaatgacaggttg
ggaaggtgtgatgctgactagccttgggtgtagaaaacagaggggaagta
gaaaagacttgaagcagaagacaactaggctcatgaagagaataaaggtc
accgagatggggtgcactgagaggaatggaagacaggacagatgcagagc
ttgcatggccttggagtgtataagatatggcctttgtgggggtgggggtg
acttttttttttaataaaacattaaagactattaaaaaaaaaaaaaacca
tctgggctatgggtggcacacagcctttaaatcccagc
gaattctttctgtcctctttttcttggcaaactccaggttcagaggatcc
aactccctcttctagcctcaaaggataccagggactcatgcagtacacat
tatagacagacatgcaggaaaaacactcacacacaaagtaaaattaaatg
tttaggactcctgtataagacaacttaacagtgctggagagttggtccag
tggtgagaagtgctcggtgctcttgcagagaacctgggctcacatctata
acttcaattccagagaatctgacacactcttctggcatctatgagcacca
ggcacatatgtgttatatatacatacatacatacatgcatgcagacatgc
aggcaggcaaaacaattcatatgcattaaggagaacctaggggaggggaa
tgaagataaatacaaaaatacatctaagaattaaaaactgggagcttcat
ggtagtgagtgctttatatttacaaggcttactcctcagcatcaacataa
cattattgcaattaagattaagatttgagcctgataaagcatgcctttga
acctagcactcaagagtcagaggtcacccaaggttacatagaataagatt
aatgttatacctgcattacctttccagcaagcaagcccctttgagacaaa
ctactatgagattccacctttcctgcaacctaataaagaatcccaagttt
cacagatagtaagtttcttatgacaatggcaagtaactcaaggattagag
acaaaaaaaggtggtttattataaatagcaacagcataaactcaagtatt
tgtgacaaagcaactcagtgcagaggttcctccatctatattcttgccca
ggccactttatgtttgacaagatctccttgatgtaaaaagcccagaggaa
aatcactaaactctattctaggaacccgaggtcacgataccccagctaat
tgatccctgcttcaccagaagagatgacattccacctcttttatgttctg
actgaccaatgggaaatacaaaagagctagagaaaatggttctccccaga
gggagccaggaagcttactctacctacactatccctctccccctccctat
catgctctgcatggggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_37700808_37701590
seq2: B6Ng01-262N07.b_50_837

seq1  GAATTCTGGTTTTGTTGTTATCGCAGTGTGTGTGAATTTTTCTAAGATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGTTTTGTTGTTATCGCAGTGTGTGTGAATTTTTCTAAGATTT  50

seq1  ATTTCATTTTTTTTAAATTATGTGTTGTTGTGTCTGGGTAAGGGACTATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATTTTTTTTAAATTATGTGTTGTTGTGTCTGGGTAAGGGACTATA  100

seq1  CCCTTGAGTCCAGGTTCCTGCAGAGGCCAAAGGAGGTGTGAAGTCTGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGAGTCCAGGTTCCTGCAGAGGCCAAAGGAGGTGTGAAGTCTGGAG  150

seq1  CTAAAGGAAGGGGTGAACCATCCAGTGTGGATGCTAAAAACTGAACTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGAAGGGGTGAACCATCCAGTGTGGATGCTAAAAACTGAACTCAG  200

seq1  GTCCTCTGCAAAAGCAGTCAGTGCCACTAAGGCCCCCTCCAGCTCCCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTGCAAAAGCAGTCAGTGCCACTAAGGCCCCCTCCAGCTCCCAGC  250

seq1  ACTCTTTTCTAAAGACCACCATGTCTAACTTCCATATCTGCTTCCCCATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTTTCTAAAGACCACCATGTCTAACTTCCATATCTGCTTCCCCATA  300

seq1  TTTCTAGAGCATATGCTTCTAGGATACTCAGTTCGCAATGTGAAGAAACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTAGAGCATATGCTTCTAGGATACTCAGTTCGCAATGTGAAGAAACT  350

seq1  GCTAGAAGATAGGTACCCACTTCAGTTGAAAGGAGCCCAGTGTATGAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAAGATAGGTACCCACTTCAGTTGAAAGGAGCCCAGTGTATGAGTT  400

seq1  TATTAAAATAGATTCATCTCCTCCAAGAGTTGAGCAAGATTAGGTTGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAATAGATTCATCTCCTCCAAGAGTTGAGCAAGATTAGGTTGGAA  450

seq1  ACCTCAGTAGCTCCTCATCACACTTGAAGATCCTGCGGAATGACAGGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCAGTAGCTCCTCATCACACTTGAAGATCCTGCGGAATGACAGGTTG  500

seq1  GGAAGGTGTGATGCTGACTAGCCTTGGGTGTAGAAAACAGAGGGGAAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGTGTGATGCTGACTAGCCTTGGGTGTAGAAAACAGAGGGGAAGTA  550

seq1  GAAAAGACTTGAAGCAGAAGACAACTAGGCTCATGAAGAGAATAAAGGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGACTTGAAGCAGAAGACAACTAGGCTCATGAAGAGAATAAAGGTC  600

seq1  ACCGAGATGGGGTGCACTGAGAGGAATGGAAGACAGGACAGATGCAGAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGAGATGGGGTGCACTGAGAGGAATGGAAGACAGGACAGATGCAGAGC  650

seq1  TTGCATGGCCTTGGAGTGTATAAGATATGGCCTTTGTGGGGGTGGGGGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATGGCCTTGGAGTGTATAAGATATGGCCTTTGTGGGGGTGGGGGTG  700

seq1  AC-TTTTTTTTTAATCAAACATTAAAGACTATT-AAAAAAAAAAAACCCA  748
      || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  ACTTTTTTTTTTAATAAAACATTAAAGACTATTAAAAAAAAAAAAAACCA  750

seq1  TCTGGGCTAT-GGTGGCACAC-GCCTTT-AATCCCAGC  783
      |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||
seq2  TCTGGGCTATGGGTGGCACACAGCCTTTAAATCCCAGC  788

seq1: chr6_37828834_37829959
seq2: B6Ng01-262N07.g_69_1186 (reverse)

seq1  CTCCCCATGGCCAGAGGCATGATAGGGAGGGGGAGAAGGGACCAGGTGTA  50
      |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||
seq2  CTCCCCATG--CAGA-GCATGATAGGGAGGGGGAG-AGGGA--TAGTGTA  44

seq1  -GTAGAGTTAGCTTCCTGGCCTTCCCTCTGGGGAGAACCATTTTCTCTAG  99
       ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGAGTAAGCTTCCTGGC--TCCCTCTGGGGAGAACCATTTTCTCTAG  92

seq1  CTCCTTTTGTATTTCCCATTGGTCCAGTCAGAACAT-AAAGAGGTGGAAT  148
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  CT-CTTTTGTATTTCCCATTGGT-CAGTCAGAACATAAAAGAGGTGGAAT  140

seq1  GTCCTTCTCTTCTGGTG-AGCAGGGATCAATTAGCTGGGGTATCGTGACC  197
      || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GT-CATCTCTTCTGGTGAAGCAGGGATCAATTAGCTGGGGTATCGTGACC  189

seq1  TCGGGTTCCTAGAATAGAGTTTAGTGATTTTCCTCTGGGCTTTTTACATC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGTTCCTAGAATAGAGTTTAGTGATTTTCCTCTGGGCTTTTTACATC  239

seq1  AAGGAGATCTTGTCAAACATAAAGTGGCCTGGGCAAGAATATAGATGGAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGATCTTGTCAAACATAAAGTGGCCTGGGCAAGAATATAGATGGAG  289

seq1  GAACCTCTGCACTGAGTTGCTTTGTCACAAATACTTGAGTTTATGCTGTT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCTGCACTGAGTTGCTTTGTCACAAATACTTGAGTTTATGCTGTT  339

seq1  GCTATTTATAATAAACCACCTTTTTTTGTCTCTAATCCTTGAGTTACTTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTATAATAAACCACCTTTTTTTGTCTCTAATCCTTGAGTTACTTG  389

seq1  CCATTGTCATAAGAAACTTACTATCTGTGAAACTTGGGATTCTTTATTAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGTCATAAGAAACTTACTATCTGTGAAACTTGGGATTCTTTATTAG  439

seq1  GTTGCAGGAAAGGTGGAATCTCATAGTAGTTTGTCTCAAAGGGGCTTGCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCAGGAAAGGTGGAATCTCATAGTAGTTTGTCTCAAAGGGGCTTGCT  489

seq1  TGCTGGAAAGGTAATGCAGGTATAACATTAATCTTATTCTATGTAACCTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGAAAGGTAATGCAGGTATAACATTAATCTTATTCTATGTAACCTT  539

seq1  GGGTGACCTCTGACTCTTGAGTGCTAGGTTCAAAGGCATGCTTTATCAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGACCTCTGACTCTTGAGTGCTAGGTTCAAAGGCATGCTTTATCAGG  589

seq1  CTCAAATCTTAATCTTAATTGCAATAATGTTATGTTGATGCTGAGGAGTA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAATCTTAATCTTAATTGCAATAATGTTATGTTGATGCTGAGGAGTA  639

seq1  AGCCTTGTAAATATAAAGCACTCACTACCATGAAGCTCCCAGTTTTTAAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTGTAAATATAAAGCACTCACTACCATGAAGCTCCCAGTTTTTAAT  689

seq1  TCTTAGATGTATTTTTGTATTTATCTTCATTCCCCTCCCCTAGGTTCTCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGATGTATTTTTGTATTTATCTTCATTCCCCTCCCCTAGGTTCTCC  739

seq1  TTAATGCATATGAATTGTTTTGCCTGCCTGCATGTCTGCATGCATGTATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGCATATGAATTGTTTTGCCTGCCTGCATGTCTGCATGCATGTATG  789

seq1  TATGTATGTATATATAACACATATGTGCCTGGTGCTCATAGATGCCAGAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATGTATATATAACACATATGTGCCTGGTGCTCATAGATGCCAGAA  839

seq1  GAGTGTGTCAGATTCTCTGGAATTGAAGTTATAGATGTGAGCCCAGGTTC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTGTCAGATTCTCTGGAATTGAAGTTATAGATGTGAGCCCAGGTTC  889

seq1  TCTGCAAGAGCACCGAGCACTTCTCACCACTGGACCAACTCTCCAGCACT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAGAGCACCGAGCACTTCTCACCACTGGACCAACTCTCCAGCACT  939

seq1  GTTAAGTTGTCTTATACAGGAGTCCTAAACATTTAATTTTACTTTGTGTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGTTGTCTTATACAGGAGTCCTAAACATTTAATTTTACTTTGTGTG  989

seq1  TGAGTGTTTTTCCTGCATGTCTGTCTATAATGTGTACTGCATGAGTCCCT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTGTTTTTCCTGCATGTCTGTCTATAATGTGTACTGCATGAGTCCCT  1039

seq1  GGTATCCTTTGAGGCTAGAAGAGGGAGTTGGATCCTCTGAACCTGGAGTT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATCCTTTGAGGCTAGAAGAGGGAGTTGGATCCTCTGAACCTGGAGTT  1089

seq1  TGCCAAGAAAAAGAGGACAGAAAGAATTC  1126
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGAAAAAGAGGACAGAAAGAATTC  1118