BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268H16
Chromosome6 (Build37)
Map Location 27,296,530 - 27,297,670
singlet/doubletsinglet
Overlap geneGrm8
Upstream geneLOC100041247
Downstream gene6530409C15Rik, AA407452, LOC100041304
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268H16.bB6Ng01-268H16.g
ACCGA071323GA071324
length1101,132
definitionB6Ng01-268H16.b B6Ng01-268H16.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctctgtttagttctgccagatttggactcagtcagaaaagatgta
cctaaccctcaagagactggagaactcggggagtggggaggtttggtggg
gtgggtccaa
gaattcctgaccttgcagtattgtattaacaacctttggttgctaacagg
gctggcctcagacctctaagatgaagtcctcagctaatggataagtaaaa
cacaatttcagaaatctactgttgttgaaatccagagaatatacatgtgt
gaagaatttgtaatttttttttcgagacagggtttctctgtatagccctg
gctgtcctagaactcacttttagaccaggctggaatcaaactcagaaatc
tgcctgcctctgcctctcaagtgcttggattaaagttgtgtgccaccaca
cctggctgtaatttgtaatgtttgaaggaaaagattttatggtttggtta
gaagaataatttcaataaaattaaaagtaatcttgggtagacaaaattta
gaaactttaagccttaacttatggaattgacaataaatttagtttatttc
tgttaataaattacataattgtagttttacttgtaggataactgataaca
caggtaagaatttctagtgagtgactaattctgtagtcaagcattttaat
ccagatgctttgctggtcatacttaacttcatgaatgcatctgcctcaaa
cactgttatgtgtgttcaacaggtaaaggtgtcaaataaaatgtggttaa
gtgggaagagctacgaaaaactgactaagcatcagtactataaaattcac
tcatgaaataaatcaaagaatcactgccaaatagtgtgatggtttgaata
agaatgggtcatgtaggttaaaatattcaaatgttaggaggtatggtctt
actggagaagatatgtcattggggtaagcctgtaaggtttaaaaatacct
aagccatttccaagtcactgtttttctgactcatgtttatgggttcagat
ataatttcttagccatgctttccttcctcctgtcatgatgctcatggact
cacccccctctgaatgataagcctaagaagctctttcttgataagttgcc
ttggtcatattatcaaatgaccagaaaaggaagttagacaaagtaaccaa
atagattgcacatatgccattattgtgcatgagatgagtggaagaatttg
gacattagagtacagtgcacattcaggaatca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_27296530_27297670
seq2: B6Ng01-268H16.g_64_1195

seq1  GAATTCCTGACCTTGCAGTATTGTATTAACAACCTTTGGTTGCTAACAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGACCTTGCAGTATTGTATTAACAACCTTTGGTTGCTAACAGG  50

seq1  GCTGGCCTCAGACCTCTAAGATGAAGTCCTCAGCTAATGGATAAGTAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCCTCAGACCTCTAAGATGAAGTCCTCAGCTAATGGATAAGTAAAA  100

seq1  CACAATTTCAGAAATCTACTGTTGTTGAAATCCAGAGAATATACATGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATTTCAGAAATCTACTGTTGTTGAAATCCAGAGAATATACATGTGT  150

seq1  GAAGAATTTGTAATTTTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATTTGTAATTTTTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTG  200

seq1  GCTGTCCTAGAACTCACTTTTAGACCAGGCTGGAATCAAACTCAGAAATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCCTAGAACTCACTTTTAGACCAGGCTGGAATCAAACTCAGAAATC  250

seq1  TGCCTGCCTCTGCCTCTCAAGTGCTTGGATTAAAGTTGTGTGCCACCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGCCTCTGCCTCTCAAGTGCTTGGATTAAAGTTGTGTGCCACCACA  300

seq1  CCTGGCTGTAATTTGTAATGTTTGAAGGAAAAGATTTTATGGTTTGGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTGTAATTTGTAATGTTTGAAGGAAAAGATTTTATGGTTTGGTTA  350

seq1  GAAGAATAATTTCAATAAAATTAAAAGTAATCTTGGGTAGACAAAATTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATAATTTCAATAAAATTAAAAGTAATCTTGGGTAGACAAAATTTA  400

seq1  GAAACTTTAAGCCTTAACTTATGGAATTGACAATAAATTTAGTTTATTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTTTAAGCCTTAACTTATGGAATTGACAATAAATTTAGTTTATTTC  450

seq1  TGTTAATAAATTACATAATTGTAGTTTTACTTGTAGGATAACTGATAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATAAATTACATAATTGTAGTTTTACTTGTAGGATAACTGATAACA  500

seq1  CAGGTAAGAATTTCTAGTGAGTGACTAATTCTGTAGTCAAGCATTTTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTAAGAATTTCTAGTGAGTGACTAATTCTGTAGTCAAGCATTTTAAT  550

seq1  CCAGATGCTTTGCTGGTCATACTTAACTTCATGAATGCATCTGCCTCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATGCTTTGCTGGTCATACTTAACTTCATGAATGCATCTGCCTCAAA  600

seq1  CACTGTTATGTGTGTTCAACAGGTAAAGGTGTCAAATAAAATGTGGTTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTTATGTGTGTTCAACAGGTAAAGGTGTCAAATAAAATGTGGTTAA  650

seq1  GTGGGAAGAGCTACGAAAAACTGACTAAGCATCAGTACTATAAAATTCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAGAGCTACGAAAAACTGACTAAGCATCAGTACTATAAAATTCAC  700

seq1  TCATGAAATAAATCAAAGAATCACTGCCAAATAGTGTGATGGTTTGAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAAATAAATCAAAGAATCACTGCCAAATAGTGTGATGGTTTGAATA  750

seq1  AGAATGGGTCATGTAGGTTAAAATATTCAAATGTTAGGAGGTATGGTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGGTCATGTAGGTTAAAATATTCAAATGTTAGGAGGTATGGTCTT  800

seq1  ACTGGAGAAGATATGTCATTGGGGTAAGCCTGTAAGGTTTAAAAATACCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGAAGATATGTCATTGGGGTAAGCCTGTAAGGTTTAAAAATACCT  850

seq1  AAGCCATTTCCAAGTCACTGTTTTTCTGACTCATGTTTAT-GGTTCAGAT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AAGCCATTTCCAAGTCACTGTTTTTCTGACTCATGTTTATGGGTTCAGAT  900

seq1  ATAATTTCTTAGCCATGCTTTCCTTCCTCCTGTCATGATGCTCATGGACT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTTCTTAGCCATGCTTTCCTTCCTCCTGTCATGATGCTCATGGACT  950

seq1  CA-CCCCCTCTGAAATGATAAGCCCTAAGAAGCTCTTTCTTGAATAAGTT  998
      || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CACCCCCCTCTG-AATGATAAG-CCTAAGAAGCTCTTTCTTG-ATAAGTT  997

seq1  GCCTTGGTCATATTATCAAATGACCAAGAAAAAGAAAGTAAGACAAAAGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||| |||||
seq2  GCCTTGGTCATATTATCAAATGACCA--GAAAAGGAAGTTAGAC-AAAGT  1044

seq1  AAACCAAATAGATTGGCACATATGCCATTAATGTGGCATGGAGATGAGGT  1098
       ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  
seq2  -AACCAAATAGATT-GCACATATGCCATTATTGT-GCAT-GAGATGAGTG  1090

seq1  GGAG-ATTTGACAATAAGAGTACAGTGCACATTCAGGGAAATCA  1141
      | || |||||   || |||||||||||||||||||||  |||||
seq2  GAAGAATTTGGACATTAGAGTACAGTGCACATTCAGG--AATCA  1132