BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-269A12
Chromosome6 (Build37)
Map Location 42,709,972 - 42,850,838
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr38, Olfr452, Olfr451-ps1, Olfr450, Olfr449, Olfr448
Upstream geneOlfr459, Pip, Sval2, Sval1, Sval3, Sva, Tas2r139, Tas2r144, Gstk1, Tmem139, Casp2, Clcn1, 6330503C03Rik, Zyx, Epha1, Tas2r143, Tas2r135, Tas2r126, Olfr458, Olfr457, Olfr456, LOC232745, EG546896, Eapa2, BC011487, 3321401G04Rik, LOC100039918, GA_x5J8B7W6337-801345-802245, Olfr453
Downstream geneOlfr447, Olfr446, GA_x5J8B7W6337-1014614-1015483, Olfr444, EG622841, Igk-V, Olfr443-ps1, GA_x5J8B7W6337-1183223-1183810, Olfr441, Olfr440-ps1, GA_x5J8B7W6337-1221999-1222591, Olfr438, Olfr437, Olfr13, GA_x5J8B7W6337-1270568-1271367, Olfr435, Olfr434, LOC665745, Olfr47, Arhgef5, Nobox, Tpk1, LOC665747, LOC546897, LOC665779
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-269A12.bB6Ng01-269A12.g
ACCGA071739GA071740
length8341,147
definitionB6Ng01-269A12.b B6Ng01-269A12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(42,850,258 - 42,850,838)(42,709,972 - 42,711,153)
sequence
gaattcagtaagtcctgacagagctgaagcacaacagagtgttgatattt
ggtctgttgctatgtattgtaacgctaaattctgtaccaagaaagtctaa
ttgcttatgagtgaattctcacttttaatagcttttgttgagcaaacctt
gctccttaattttccattatggattatacaaaaatggaagagccagttac
tggagggctaagagataggtgggttttgagttactttgttgggtgttgca
gtaagtggggagaggagaagggagactgagagatgaagaagccaccatga
gaggagatggaccgtgagcacatggccaggagaaacagtgagtatttggg
gtatgctgtaagggtcactggatgaagacagcagatttagagagtataca
aagacaaagagtgtttatttggcagaaacattcagcatgtgtggtcaacc
attcttctaaatggtgaccccagacaaaagcatgcaggccttctcttagg
gaactggggaaactctctagaaggattaggtaatctaaaatttcattggt
gggtgctggggagggcacgtgtagtctgtggtttgcattcctatgtcttg
agcttttaaccacaagataagatagggctgcctagcagagctggcccatc
ctgagataagatatcttccccatttttctgattatccccaggctgttttt
tgggaagaaggtttttatgaccttgttactggattttgatggtctgtcct
ggagctggtacccatgacttcttttcaatatcatgtctgtgtccttaaat
ggagacaaatttgggtttttgttgtcctttctat
gaattcctccttcctggtgctatatccaaggagactaactgccaaattat
atccttctttcttgatgtcttgttgcagagaggtatgctttgaaatttgc
caatgaccgaagatatttaatcaaaagaaaaatgaaaagcaattttatca
tttgctacacttggcataggtttatggcaaatgtgtatgtagttctttct
tgacaatgacagggaaacaatgacaaactgcccctatacaggaagtttga
gctaaacagcacacagccttggttgttcaacactcattgtgagtaccatc
tacacatccacccttgtgctaagatatctgtgtttccttgttgtatgaaa
taaaaacactaatacttttcccttagttattcgagttcataaaaaaggaa
gtgtagaaagactacaaattattaatatctgaaaagactaagatcttgtt
tccttatggaaaaattatacacagattaaattacaaaccacttgcatctt
cactatgatattagaataaaaattgcaattggcttttgagaaagcccagt
ataatgctgaaatagcctttgctgagagttgtgttaatgttatctgacca
acccattttttctccttcatttggcttcaaatagcgcatcctgtattctt
tatagatttgcaagagggacactagaacttaaagaatgggtttaacagaa
tattaattgggggagggttgtctgaagatgtagtccagttgttagggtgc
ttggctagcatacattaatcactggacttgatgtccaggtataatgatac
acatctgcaaccttgaaacttatgaggcagaggcaggaagagcaaggttc
aaggtcatcttgagctacagagggagctcaaggctagctttagctacagc
tcctatctcaaaaaaaaaaaaaaaaatcccttgaattgagatcagtggta
caagctagcccttggaaacctgaaggagatagtgagcttcaggctaaccc
actcaaaccccaaatttatctcaaaacaaaaacagtagataaatatttta
aagtcagcacagctacagttagtgatagagtctcatagataacattacta
ctaagtaactatgatcatatcaattaacgtcatggattatacgcaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_42850258_42850838
seq2: B6Ng01-269A12.b_298_882 (reverse)

seq1  ATTGAAAGGACAACAAAAACCC-AATTTGTCTCCATTTAAGGAC-CAGAC  48
      || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATAGAAAGGACAACAAAAACCCAAATTTGTCTCCATTTAAGGACACAGAC  50

seq1  CTGATTTTGAAAAGAAGGTCATGGGTACCAGCTCCAGGAACAGACCAT-A  97
       |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
seq2  ATGATATTGAAAAGAA-GTCATGGGTACCAGCTCCAGG-ACAGACCATCA  98

seq1  AAATCCAGTAACAAGGTCAT-AAAACCTTCTT-CCAAAAAACAGCCTGGG  145
      |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AAATCCAGTAACAAGGTCATAAAAACCTTCTTCCCAAAAAACAGCCTGGG  148

seq1  GATAATCAGAAAAAT-GGGAAGATATCTTATCTCAGGATGGGCCAGCTCT  194
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAATCAGAAAAATGGGGAAGATATCTTATCTCAGGATGGGCCAGCTCT  198

seq1  GCTAGGCAGCCCTATCTTATCTTGTGGTTAAAAGCTCAAGACATAGGAAT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGCAGCCCTATCTTATCTTGTGGTTAAAAGCTCAAGACATAGGAAT  248

seq1  GCAAACCACAGACTACACGTGCCCTCCCCAGCACCCACCAATGAAATTTT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACCACAGACTACACGTGCCCTCCCCAGCACCCACCAATGAAATTTT  298

seq1  AGATTACCTAATCCTTCTAGAGAGTTTCCCCAGTTCCCTAAGAGAAGGCC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTACCTAATCCTTCTAGAGAGTTTCCCCAGTTCCCTAAGAGAAGGCC  348

seq1  TGCATGCTTTTGTCTGGGGTCACCATTTAGAAGAATGGTTGACCACACAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGCTTTTGTCTGGGGTCACCATTTAGAAGAATGGTTGACCACACAT  398

seq1  GCTGAATGTTTCTGCCAAATAAACACTCTTTGTCTTTGTATACTCTCTAA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAATGTTTCTGCCAAATAAACACTCTTTGTCTTTGTATACTCTCTAA  448

seq1  ATCTGCTGTCTTCATCCAGTGACCCTTACAGCATACCCCAAATACTCACT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCTGTCTTCATCCAGTGACCCTTACAGCATACCCCAAATACTCACT  498

seq1  GTTTCTCCTGGCCATGTGCTCACGGTCCATCTCCTCTCATGGTGGCTTCT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCCTGGCCATGTGCTCACGGTCCATCTCCTCTCATGGTGGCTTCT  548

seq1  TCATCTCTCAGTCTCCCTTCTCCTCTCCCCACTTACT  581
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCTCAGTCTCCCTTCTCCTCTCCCCACTTACT  585

seq1: chr6_42709972_42711153
seq2: B6Ng01-269A12.g_65_1211

seq1  GAATTCCTCCTTCCTGGTGCTATATCCAAGGAGACTAACTGCCAAATTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCTTCCTGGTGCTATATCCAAGGAGACTAACTGCCAAATTAT  50

seq1  ATCCTTCTTTCTTGATGTCTTGTTGCAGAGAGGTATGCTTTGAAATTTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCTTTCTTGATGTCTTGTTGCAGAGAGGTATGCTTTGAAATTTGC  100

seq1  CAATGACCGAAGATATTTAATCAAAAGAAAAATGAAAAGCAATTTTATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACCGAAGATATTTAATCAAAAGAAAAATGAAAAGCAATTTTATCA  150

seq1  TTTGCTACACTTGGCATAGGTTTATGGCAAATGTGTATGTAGTTCTTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTACACTTGGCATAGGTTTATGGCAAATGTGTATGTAGTTCTTTCT  200

seq1  TGACAATGACAGGGAAACAATGACAAACTGCCCCTATACAGGAAGTTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATGACAGGGAAACAATGACAAACTGCCCCTATACAGGAAGTTTGA  250

seq1  GCTAAACAGCACACAGCCTTGGTTGTTCAACACTCATTGTGAGTACCATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAACAGCACACAGCCTTGGTTGTTCAACACTCATTGTGAGTACCATC  300

seq1  TACACATCCACCCTTGTGCTAAGATATCTGTGTTTCCTTGTTGTATGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATCCACCCTTGTGCTAAGATATCTGTGTTTCCTTGTTGTATGAAA  350

seq1  TAAAAACACTAATACTTTTCCCTTAGTTATTCGAGTTCATAAAAAAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACACTAATACTTTTCCCTTAGTTATTCGAGTTCATAAAAAAGGAA  400

seq1  GTGTAGAAAGACTACAAATTATTAATATCTGAAAAGACTAAGATCTTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAGAAAGACTACAAATTATTAATATCTGAAAAGACTAAGATCTTGTT  450

seq1  TCCTTATGGAAAAATTATACACAGATTAAATTACAAACCACTTGCATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATGGAAAAATTATACACAGATTAAATTACAAACCACTTGCATCTT  500

seq1  CACTATGATATTAGAATAAAAATTGCAATTGGCTTTTGAGAAAGCCCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATGATATTAGAATAAAAATTGCAATTGGCTTTTGAGAAAGCCCAGT  550

seq1  ATAATGCTGAAATAGCCTTTGCTGAGAGTTGTGTTAATGTTATCTGACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGCTGAAATAGCCTTTGCTGAGAGTTGTGTTAATGTTATCTGACCA  600

seq1  ACCCATTTTTTCTCCTTCATTTGGCTTCAAATAGCGCATCCTGTATTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATTTTTTCTCCTTCATTTGGCTTCAAATAGCGCATCCTGTATTCTT  650

seq1  TATAGATTTGCAAGAGGGACACTAGAACTTAAAGAATGGGTTTAACAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGATTTGCAAGAGGGACACTAGAACTTAAAGAATGGGTTTAACAGAA  700

seq1  TATTAATTGGGGGAGGGTTGTCTGAAGATGTAGTCCAGTTGTTAGGGTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAATTGGGGGAGGGTTGTCTGAAGATGTAGTCCAGTTGTTAGGGTGC  750

seq1  TTGGCTAGCATACATTAATCACTGGACTTGATGTCCAGGTATAATGATAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTAGCATACATTAATCACTGGACTTGATGTCCAGGTATAATGATAC  800

seq1  ACATCTGCAACCTTGAAACTTATGAGGCAGAGGCAGGAAGAGCAAAGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ACATCTGCAACCTTGAAACTTATGAGGCAGAGGCAGGAAGAGC-AAGGTT  849

seq1  CAAGGTCATCTTGAGCTACAGAGGGAGCTCAAGGCTAGCTTTTAGCTACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAAGGTCATCTTGAGCTACAGAGGGAGCTCAAGGCTAGC-TTTAGCTACA  898

seq1  GCTCCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCCTTGAATTGAGATCAGTG  950
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTATCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAATCCCTTGAATTGAGATCAGTG  947

seq1  GTACAAGCTAGCCCTTGGAAACCTGAAGGAGAATAGTGAGCTTCAGGCTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTACAAGCTAGCCCTTGGAAACCTGAAGGAG-ATAGTGAGCTTCAGGCTA  996

seq1  ACCCACTCAAAACCCCAAATTTATCTCAAAAACAAAAAACAATTAAGAAT  1050
      |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |  |||  
seq2  ACCCACTC-AAACCCCAAATTTATCTCAAAA--CAAAAACAGT--AGA--  1039

seq1  TAAAATAATTTTTAAAGTCAGGCAACAGCCTTACAGGTAAGTGAATAGGA  1100
        |||||  ||||||||||||   |||||  |||| || |||| ||| ||
seq2  -TAAATA--TTTTAAAGTCAG--CACAGC--TACA-GTTAGTG-ATA-GA  1079

seq1  GTCTCAATAGGATAAACATAATTACATAAATTAAACATAATTAA--ATCA  1148
      ||||| ||| ||| ||||| | |||            ||| |||  || |
seq2  GTCTC-ATA-GAT-AACATTACTAC------------TAAGTAACTATGA  1114

seq1  ATATATCAATTAACTGTATTGGATTATACGCAAA  1182
        |||||||||||| ||  |||||||||||||||
seq2  TCATATCAATTAAC-GTCATGGATTATACGCAAA  1147