BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274I23
Chromosome6 (Build37)
Map Location 94,294,883 - 94,366,536
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043262
Upstream geneLOC665831, Magi1
Downstream geneLOC665856, Slc25a26, Lrig1, LOC625941, EG665865, LOC100043276, LOC100043680, Kbtbd8, LOC435912
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274I23.bB6Ng01-274I23.g
ACCGA075830GA075831
length6841,099
definitionB6Ng01-274I23.b B6Ng01-274I23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(94,365,853 - 94,366,536)(94,294,883 - 94,295,994)
sequence
gaattcaaacatatgagactgttgaggccattctcattcaaaccaccata
aagtgggtaatcagacatgggtcattcagggctggaaagatggctcagca
ggtaagggcactgctatgcttccaagtgtcctgaattcaattcccagcat
gcacatggtggctctaactgtagtcccatgagatccaatgccttcttctg
gtgtacagatgcacatatagacaaaacacccatatacataaaatgcatac
ataaatccttaaagtagagctggagagatggcttgtccagtgaaggctag
gctcacaactaaaactataagagatgggtccttcagcatggagtccatga
ctccactcctgttgtcctctcttctccctgtccaccgtgaggcaaagagt
cttctcctttacatgtgtctgctgctgtggtggttggtcgacctctccac
aggccccaaatcagtgggtcccagcaggactattaatcgagccgtttgaa
gcagcggtcccaaagaaactcttccttgtataaattgttctctctgatac
tattgctacagttacataaaagaaattaatacagggaccctataaagctc
caagtaggattcttagcaccaaaaatagtaataatggtgctgctggtggt
ggtgatgatgatgatggtgctggtggtgatgatg

gaattcaagaccagcctggtctaaaaagtgagttccaggatagccagggc
tacacagagaaaccctatctcagaaaacccaaccaatccaaaccaaagaa
ccaactaaacaaccacatgtagtagcatgcatctgaataagagcatgggg
ctctatagacagatggattcttggggtttactagtcccctaccctaacct
acgtggtgagttcaaggacagtgagagaccctatcttctccccaaaagga
aacagaacatgaggaacaacaaccaaagatgttcttggaccttcatatat
atatttatatgtgtgcacgaaccagagtgtatacacatgcatgtgcacat
acagacaaattaaaagccaaatgttggaacaagcttatttatgttgatct
taggaatccagaaaacaaaagacacccaaacccaggcccacctggatcta
ttgtcctaggttgtactaaggctggcccttcccatccatggtcaggcagt
gaaaacctctctggtggggttactttagatagattgctgcaaaaagagag
gaaagaaagccaacaagacacatcattctttagactgaattagacctgtg
aggtaatgctgttttgattatgtaaggaaccttactattaatttcagcca
ctcttcaatgaagccacaggtgactggttatcactgtcactctgtccctc
ctcctcccagggaccagcaacaattgtgtctaggaaagagtatgaccttt
tgttcctgctgccaacaatcgaggatgtagtgatagataagagagaggta
caagttcacttagggtgtttgtatgggaaggcatccttaggtcagtgttt
cctttaaagatgaaacaaaccaaactgtggacaaccatcttctaaaactt
accagtcatttaagcaaaatcaaacttcaaaattaaacctctctaaatgc
ctataaaaagattctcctctgtaaacagaaccattactaactctgagctc
cttgcttctttaaaaacatctgttttggcagagaggcagtgtggtggaca
tgttttaatcccaaacttgttgcagttggctgatctctatagtttgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_94365853_94366536
seq2: B6Ng01-274I23.b_47_730 (reverse)

seq1  CATCATCACCACCAGCACCATCATCATCATCACCACCACCAGCAGCACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCACCACCAGCACCATCATCATCATCACCACCACCAGCAGCACCA  50

seq1  TTATTACTATTTTTGGTGCTAAGAATCCTACTTGGAGCTTTATAGGGTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTACTATTTTTGGTGCTAAGAATCCTACTTGGAGCTTTATAGGGTCC  100

seq1  CTGTATTAATTTCTTTTATGTAACTGTAGCAATAGTATCAGAGAGAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATTAATTTCTTTTATGTAACTGTAGCAATAGTATCAGAGAGAACAA  150

seq1  TTTATACAAGGAAGAGTTTCTTTGGGACCGCTGCTTCAAACGGCTCGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATACAAGGAAGAGTTTCTTTGGGACCGCTGCTTCAAACGGCTCGATT  200

seq1  AATAGTCCTGCTGGGACCCACTGATTTGGGGCCTGTGGAGAGGTCGACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTCCTGCTGGGACCCACTGATTTGGGGCCTGTGGAGAGGTCGACCA  250

seq1  ACCACCACAGCAGCAGACACATGTAAAGGAGAAGACTCTTTGCCTCACGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCACAGCAGCAGACACATGTAAAGGAGAAGACTCTTTGCCTCACGG  300

seq1  TGGACAGGGAGAAGAGAGGACAACAGGAGTGGAGTCATGGACTCCATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAGGGAGAAGAGAGGACAACAGGAGTGGAGTCATGGACTCCATGCT  350

seq1  GAAGGACCCATCTCTTATAGTTTTAGTTGTGAGCCTAGCCTTCACTGGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGACCCATCTCTTATAGTTTTAGTTGTGAGCCTAGCCTTCACTGGAC  400

seq1  AAGCCATCTCTCCAGCTCTACTTTAAGGATTTATGTATGCATTTTATGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATCTCTCCAGCTCTACTTTAAGGATTTATGTATGCATTTTATGTA  450

seq1  TATGGGTGTTTTGTCTATATGTGCATCTGTACACCAGAAGAAGGCATTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGTGTTTTGTCTATATGTGCATCTGTACACCAGAAGAAGGCATTGG  500

seq1  ATCTCATGGGACTACAGTTAGAGCCACCATGTGCATGCTGGGAATTGAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATGGGACTACAGTTAGAGCCACCATGTGCATGCTGGGAATTGAAT  550

seq1  TCAGGACACTTGGAAGCATAGCAGTGCCCTTACCTGCTGAGCCATCTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGACACTTGGAAGCATAGCAGTGCCCTTACCTGCTGAGCCATCTTTC  600

seq1  CAGCCCTGAATGACCCATGTCTGATTACCCACTTTATGGTGGTTTGAATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCCTGAATGACCCATGTCTGATTACCCACTTTATGGTGGTTTGAATG  650

seq1  AGAATGGCCTCAACAGTCTCATATGTTTGAATTC  684
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGCCTCAACAGTCTCATATGTTTGAATTC  684


seq1: chr6_94294883_94295994
seq2: B6Ng01-274I23.g_65_1163

seq1  GAATTCAAGACCAGCCTGGTCTAAAAAGTGAGTTCCAGGATAGCCAGGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACCAGCCTGGTCTAAAAAGTGAGTTCCAGGATAGCCAGGGC  50

seq1  TACACAGAGAAACCCTATCTCAGAAAACCCAACCAATCCAAACCAAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGAGAAACCCTATCTCAGAAAACCCAACCAATCCAAACCAAAGAA  100

seq1  CCAACTAAACAACCACATGTAGTAGCATGCATCTGAATAAGAGCATGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTAAACAACCACATGTAGTAGCATGCATCTGAATAAGAGCATGGGG  150

seq1  CTCTATAGACAGATGGATTCTTGGGGTTTACTAGTCCCCTACCCTAACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATAGACAGATGGATTCTTGGGGTTTACTAGTCCCCTACCCTAACCT  200

seq1  ACGTGGTGAGTTCAAGGACAGTGAGAGACCCTATCTTCTCCCCAAAAGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGGTGAGTTCAAGGACAGTGAGAGACCCTATCTTCTCCCCAAAAGGA  250

seq1  AACAGAACATGAGGAACAACAACCAAAGATGTTCTTGGACCTTCATATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAACATGAGGAACAACAACCAAAGATGTTCTTGGACCTTCATATAT  300

seq1  ATATTTATATGTGTGCACGAACCAGAGTGTATACACATGCATGTGCACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTATATGTGTGCACGAACCAGAGTGTATACACATGCATGTGCACAT  350

seq1  ACAGACAAATTAAAAGCCAAATGTTGGAACAAGCTTATTTATGTTGATCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAAATTAAAAGCCAAATGTTGGAACAAGCTTATTTATGTTGATCT  400

seq1  TAGGAATCCAGAAAACAAAAGACACCCAAACCCAGGCCCACCTGGATCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATCCAGAAAACAAAAGACACCCAAACCCAGGCCCACCTGGATCTA  450

seq1  TTGTCCTAGGTTGTACTAAGGCTGGCCCTTCCCATCCATGGTCAGGCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTAGGTTGTACTAAGGCTGGCCCTTCCCATCCATGGTCAGGCAGT  500

seq1  GAAAACCTCTCTGGTGGGGTTACTTTAGATAGATTGCTGCAAAAAGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAACCTCTCTGGTGGGGTTACTTTAGATAGATTGCTGCAAAAAGAGAG  550

seq1  GAAAGAAAGCCAACAAGACACATCATTCTTTAGACTGAATTAGACCTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAAGCCAACAAGACACATCATTCTTTAGACTGAATTAGACCTGTG  600

seq1  AGGTAATGCTGTTTTGATTATGTAAGGAACCTTACTATTAATTTCAGCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAATGCTGTTTTGATTATGTAAGGAACCTTACTATTAATTTCAGCCA  650

seq1  CTCTTCAATGAAGCCACAGGTGACTGGTTATCACTGTCACTCTGTCCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCAATGAAGCCACAGGTGACTGGTTATCACTGTCACTCTGTCCCTC  700

seq1  CTCCTCCCAGGGACCAGCAACAATTGTGTCTAGGAAAGAGTATGACCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCCAGGGACCAGCAACAATTGTGTCTAGGAAAGAGTATGACCTTT  750

seq1  TGTTCCTGCTGCCAACAATCGAGGATGTAGTGATAGATAAGAGAGAGGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTGCTGCCAACAATCGAGGATGTAGTGATAGATAAGAGAGAGGTA  800

seq1  CAAGTTCACTTAGGGTGTTTGTATGGGAAGGCATCCTTAGGTCAGTGTTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTCACTTAGGGTGTTTGTATGGGAAGGCATCCTTAGGTCAGTGTTT  850

seq1  CCTTTAAAGATGAAACAAACCAAACTGTGGACAACCATCTTCTAAAACTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAAAGATGAAACAAACCAAACTGTGGACAACCATCTTCTAAAACTT  900

seq1  ACCAGTCATTTAAGCAAAATCAAACTTCAAAAATTAAACCTCTCTAAATG  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTCATTTAAGCAAAATCAAACTTC-AAAATTAAACCTCTCTAAATG  949

seq1  CCTATAAAAAGATTCTCCTCTGTAAACAGAACCATTACTAACTCTTGAGC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCTATAAAAAGATTCTCCTCTGTAAACAGAACCATTACTAACTC-TGAGC  998

seq1  TCCTTGCTTCTTTAAAAACAATCTGTTTTGGGCAGAGAGGGCAGGTGTGG  1050
      ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||
seq2  TCCTTGCTTCTTTAAAAAC-ATCTGTTTT-GGCAGAGA-GGCA-GTGTGG  1044

seq1  TGGGACATGTTTTAATCCCAAAACTTTGGTGGCAGGGTGGGCTGATCTCT  1100
      | ||||||||||||||||| ||||||  || |||  || |||||||||||
seq2  T-GGACATGTTTTAATCCC-AAACTT--GTTGCA--GTTGGCTGATCTCT  1088

seq1  ATTAGTTTGAGA  1112
      | ||||||||||
seq2  A-TAGTTTGAGA  1099


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |