BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-282I03
Chromosome6 (Build37)
Map Location 75,570,515 - 75,754,087
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG668145
Upstream geneEG668132, LOC668136, LOC621306, LOC100042942, LOC668143
Downstream geneEG546907, LOC100042952, LOC668153, EG668155, LOC100042956
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-282I03.bB6Ng01-282I03.g
ACCGA081706GA081707
length1,0851,018
definitionB6Ng01-282I03.b B6Ng01-282I03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,570,515 - 75,571,602)(75,753,070 - 75,754,087)
sequence
gattccaaatatgaggttccttaagtaggcaacaatattcagtagatgag
aaagtattaagccctgtcagataaacacctccaataaaactcaccagaat
aactatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat
agatagatagatagatagatagttttaagccttctcttcttcatacccac
aaattttacaagtccaatgactttggcttagtaatcccaatttttgcact
tcatgtactactgtatggagaaattcatggttatcatccttgatgagcta
gactactttcatcagcaggaggcagggtcagttctcctgctgttatatcc
ttggggtggctcacccacaactgcccaggcaagttgcattgttgttctcc
acagtgctacagcagatgataggcaagactatccagcactcttaacagtt
gggacacctctcctgactactgtaggtggcaaggagtgagaaggaagagg
tcatcaccactgtgccctttctacatcatgggggatgagtggtgacagtg
ctaggtctcctacacatattgggatggctcccctgatccccttccatcaa
aggaagctctactgtgctgcccacacaagttgcagtgtctgttctactga
atcctgttgacagcaaagaccagggccatctcaaccactctcaagatcag
aagacatgttttccaattggctaggaggagtagggctgaaagggtatcga
catcattcccatgcctcctcagggcagattattctttatcactttatcag
ttgacaagacaagggatataaatgtgtataccgtagcttatagtttttaa
aaagtgaaacccattctaaagccagctatgtgccagcctcggcagtcttg
ccaacccccatgtccagccccaaacaccatttgaaaaaaactgcactgaa
gctagctcactaagtcttcccttgctaaattaagccgggcgtggtggcca
tgccttttatcccagcacttgggagcagagcagctgattttctgagtttc
gagcagctgtcttacagagtggagtttcaggacat

gaattcatgtgtgaagagttttcctgctgagaagaagtggaatagtgact
ccagtcaaggggagtggatcttctaagagctttctctgcactgtcattat
cttacctggggttctccattgtcctgaatctaatgaaggttgcttcaaaa
tctgtggcatgaagtcatcattcctggaaaccaggcattacccttggtta
ataacacccttgtcgtgttgtttttttctggagatgaagtaagaatcatt
gggcattcacagcttacctggcacagggatattttcactttgttttctct
acagtgttttattattttaaaggcccgattattttaaataattttgaagg
ccctctaattagcaatgactaatgttttacagctggggaatttgaattat
gaacatcaactactcttttgacagatgttttaaactaagattcaaatata
agagactacttcaagagaaaagaaagaagcagatatataaaacactagaa
ttgtaaactagggagaaacatagaaaatagactgcttgaacttagaatta
ccatagttgaaatatttttgtgatatgaatatcactagatgtggtgaaac
aattggagtcatactactctatgggtggggaggaacaataataacagcag
caaatacaatatctttgtcacttttatgtgctatttatcttgttacaaat
agattctatgatcaagatggacccttttgccccagcctctacaacagcag
ttatcaacttgtgggtcccaaacccttggacaaacatctacctccaaaaa
tatttaaaattcataactaccaaattatagttataaaagtaacagcaaaa
ataattttaggactggggaggatctgaattaaagagtttcagcattagga
aagtttagagcaactgttctagaatatttattgcaagtttgcttgtggga
tatcccaactctgtgccagagaaatgtgaaatagaaatcagctaatgaca
ctgaaagcattattgtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_75570515_75571602
seq2: B6Ng01-282I03.b_33_1116

seq1  ATTCCAAATATGAGGTTCCTTAAGTAGGCAACAATATTCAGTAGATGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAAATATGAGGTTCCTTAAGTAGGCAACAATATTCAGTAGATGAGA  50

seq1  AAGTATTAAGCCCTGTCAGATAAACACCTCCAATAAAACTCACCAGAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATTAAGCCCTGTCAGATAAACACCTCCAATAAAACTCACCAGAATA  100

seq1  ACTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  150

seq1  GATAGATAGATAGATAGATAGTTTTAAGCCTTCTCTTCTTCATACCCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATAGATAGTTTTAAGCCTTCTCTTCTTCATACCCACA  200

seq1  AATTTTACAAGTCCAATGACTTTGGCTTAGTAATCCCAATTTTTGCACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTACAAGTCCAATGACTTTGGCTTAGTAATCCCAATTTTTGCACTT  250

seq1  CATGTACTACTGTATGGAGAAATTCATGGTTATCATCCTTGATGAGCTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTACTACTGTATGGAGAAATTCATGGTTATCATCCTTGATGAGCTAG  300

seq1  ACTACTTTCATCAGCAGGAGGCAGGGTCAGTTCTCCTGCTGTTATATCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACTTTCATCAGCAGGAGGCAGGGTCAGTTCTCCTGCTGTTATATCCT  350

seq1  TGGGGTGGCTCACCCACAACTGCCCAGGCAAGTTGCATTGTTGTTCTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTGGCTCACCCACAACTGCCCAGGCAAGTTGCATTGTTGTTCTCCA  400

seq1  CAGTGCTACAGCAGATGATAGGCAAGACTATCCAGCACTCTTAACAGTTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTACAGCAGATGATAGGCAAGACTATCCAGCACTCTTAACAGTTG  450

seq1  GGACACCTCTCCTGACTACTGTAGGTGGCAAGGAGTGAGAAGGAAGAGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACACCTCTCCTGACTACTGTAGGTGGCAAGGAGTGAGAAGGAAGAGGT  500

seq1  CATCACCACTGTGCCCTTTCTACATCATGGGGGATGAGTGGTGACAGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACCACTGTGCCCTTTCTACATCATGGGGGATGAGTGGTGACAGTGC  550

seq1  TAGGTCTCCTACACATATTGGGATGGCTCCCCTGATCCCCTTCCATCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCTCCTACACATATTGGGATGGCTCCCCTGATCCCCTTCCATCAAA  600

seq1  GGAAGCTCTACTGTGCTGCCCACACAAGTTGCAGTGTCTGTTCTACTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTCTACTGTGCTGCCCACACAAGTTGCAGTGTCTGTTCTACTGAA  650

seq1  TCCTGTTGACAGCAAAGACCAGGGCCATCTCAACCACTCTCAAGATCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTTGACAGCAAAGACCAGGGCCATCTCAACCACTCTCAAGATCAGA  700

seq1  AGACATGTTTTCCAATTGGCTAGGAGGAGTAGGGCTGAAAGGGTATCGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATGTTTTCCAATTGGCTAGGAGGAGTAGGGCTGAAAGGGTATCGAC  750

seq1  ATCATTCCCATGCCTCCTCAGGGCAGATTATTCTTTATCACTTTATCAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTCCCATGCCTCCTCAGGGCAGATTATTCTTTATCACTTTATCAGT  800

seq1  TGACAAGACAAGGGATATAAATGTGTATACCGTAGCTTATAGTTTTTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGACAAGGGATATAAATGTGTATACCGTAGCTTATAGTTTTTAAA  850

seq1  AAGTGAAACCCATTCTAAAGCCAGCTATGTGCCAGCCTCGGCAGTCTTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAAACCCATTCTAAAGCCAGCTATGTGCCAGCCTCGGCAGTCTTGC  900

seq1  CAACCCCCATGTCCAGCCCCAAACACCATTTGAAAAAAACTGCACTGAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCCCCATGTCCAGCCCCAAACACCATTTGAAAAAAACTGCACTGAAG  950

seq1  CTAGCTCACTAAGTCTTCCCTTGCTAAATTAAGCCGGGCGTGGTGGCCCA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CTAGCTCACTAAGTCTTCCCTTGCTAAATTAAGCCGGGCGTGGTGG-CCA  999

seq1  TGCCTTTTATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAG-T  1049
      |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |  |||||||| |
seq2  TGCCTTTTATCCCAGCACTTGGGA-GCAGA-GCAGCTGATTTTCTGAGTT  1047

seq1  TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAGT-GAGTTCCAGGACAT  1088
      |||||  ||| |||   |||||||| ||||| ||||||||
seq2  TCGAG--CAG-CTGTCTTACAGAGTGGAGTTTCAGGACAT  1084


seq1: chr6_75753070_75754087
seq2: B6Ng01-282I03.g_64_1081 (reverse)

seq1  AGAC-ATAATGCTTTCAGTGTCATTAGCTGATTTCTATTTCACATTTTCT  49
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGACAATAATGCTTTCAGTGTCATTAGCTGATTTCTATTTCACA-TTTCT  49

seq1  CTGGCACAGAGTTGGGATATCCCACAAGCAAACTTGCAATAAATATTCTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCACAGAGTTGGGATATCCCACAAGCAAACTTGCAATAAATATTCTA  99

seq1  GAACAGTTGCTCTAAACCTTCCTAATGCTGAAACTCTTTAATTCAGATCC  149
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTTGCTCTAAACTTTCCTAATGCTGAAACTCTTTAATTCAGATCC  149

seq1  TCCCCAGTCCTAAAATTATTTTTGCTGTTACTTTTATAACTATAATTTGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGTCCTAAAATTATTTTTGCTGTTACTTTTATAACTATAATTTGG  199

seq1  TAGTTATGAATTTTAAATATTTTTGGAGGTAGATGTTTGTCCAAGGGTTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTATGAATTTTAAATATTTTTGGAGGTAGATGTTTGTCCAAGGGTTT  249

seq1  GGGACCCACAAGTTGATAACTGCTGTTGTAGAGGCTGGGGCAAAAGGGTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCCACAAGTTGATAACTGCTGTTGTAGAGGCTGGGGCAAAAGGGTC  299

seq1  CATCTTGATCATAGAATCTATTTGTAACAAGATAAATAGCACATAAAAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGATCATAGAATCTATTTGTAACAAGATAAATAGCACATAAAAGT  349

seq1  GACAAAGATATTGTATTTGCTGCTGTTATTATTGTTCCTCCCCACCCATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAAGATATTGTATTTGCTGCTGTTATTATTGTTCCTCCCCACCCATA  399

seq1  GAGTAGTATGACTCCAATTGTTTCACCACATCTAGTGATATTCATATCAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGTATGACTCCAATTGTTTCACCACATCTAGTGATATTCATATCAC  449

seq1  AAAAATATTTCAACTATGGTAATTCTAAGTTCAAGCAGTCTATTTTCTAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATATTTCAACTATGGTAATTCTAAGTTCAAGCAGTCTATTTTCTAT  499

seq1  GTTTCTCCCTAGTTTACAATTCTAGTGTTTTATATATCTGCTTCTTTCTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCCCTAGTTTACAATTCTAGTGTTTTATATATCTGCTTCTTTCTT  549

seq1  TTCTCTTGAAGTAGTCTCTTATATTTGAATCTTAGTTTAAAACATCTGTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTGAAGTAGTCTCTTATATTTGAATCTTAGTTTAAAACATCTGTC  599

seq1  AAAAGAGTAGTTGATGTTCATAATTCAAATTCCCCAGCTGTAAAACATTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGTAGTTGATGTTCATAATTCAAATTCCCCAGCTGTAAAACATTA  649

seq1  GTCATTGCTAATTAGAGGGCCTTCAAAATTATTTAAAATAATCGGGCCTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTGCTAATTAGAGGGCCTTCAAAATTATTTAAAATAATCGGGCCTT  699

seq1  TAAAATAATAAAACACTGTAGAGAAAACAAAGTGAAAATATCCCTGTGCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATAATAAAACACTGTAGAGAAAACAAAGTGAAAATATCCCTGTGCC  749

seq1  AGGTAAGCTGTGAATGCCCAATGATTCTTACTTCATCTCCAGAAAAAAAC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAGCTGTGAATGCCCAATGATTCTTACTTCATCTCCAGAAAAAAAC  799

seq1  AACACGACAAGGGTGTTATTAACCAAGGGTAATGCCTGGTTTCCAGGAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACGACAAGGGTGTTATTAACCAAGGGTAATGCCTGGTTTCCAGGAAT  849

seq1  GATGACTTCATGCCACAGATTTTGAAGCAACCTTCATTAGATTCAGGACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACTTCATGCCACAGATTTTGAAGCAACCTTCATTAGATTCAGGACA  899

seq1  ATGGAGAACCCCAGGTAAGATAATGACAGTGCAGAGAAAGCTCTTAGAAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGAACCCCAGGTAAGATAATGACAGTGCAGAGAAAGCTCTTAGAAG  949

seq1  ATCCACTCCCCTTGACTGGAGTCACTATTCCACTTCTTCTCAGCAGGAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCACTCCCCTTGACTGGAGTCACTATTCCACTTCTTCTCAGCAGGAAA  999

seq1  ACTCTTCACACATGAATTC  1018
      |||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCACACATGAATTC  1018


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |