BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302K07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 93,370,399 - 93,383,774
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePrickle2, LOC545866, A730049H05Rik, LOC384461, LOC100043253
Downstream geneLOC665831, Magi1, LOC100043262, LOC665856
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302K07.bB6Ng01-302K07.g
ACCGA096640GA096641
length1,1121,060
definitionB6Ng01-302K07.b B6Ng01-302K07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,370,399 - 93,371,516)(93,382,722 - 93,383,774)
sequence
gaattctctacaacataacactacacttaaggctcaggggacattgtggg
agaggaggtggaaagactgtaagagtgggagacccaggatgtgtgctgtg
agatagtatcttctataagtgacagggagttgtacccatgaaaccttaac
ttgggtacctggataaggactgcacaatggcaatatcagctgacatctta
atgttgatggagaaaagctcacaagttcccacaccaaagtgaggaattat
agtcaattaattaattagttaattaatggcttctacgagaaggaatatgt
cttctgtggtgataagtcctgataggttatccaatccctaaatgtcagcc
cttagatgtatgagcaactctaaatggactcaacagataacatttataca
cacatgtgtgtgtgttactattacaacgctatttaagaaggatgtgttaa
gttgaggagtaaaagagatacaaaaagattggaagaagagaatatgcgat
agaaattatgtaaataaaatactcatgtgtgacattctcaaaaggtaata
aaaacaaatgcaaagaaagtaaaataaatgttttgttttgttttctttct
gtctttcatttttaaactcagaggcattagctctggaaagaattcataac
agttcctggatcagtttgggacagagacaaaaccctaggtttactccacc
tacccacacccacatcagtggccaaaattgggatgttcaagttaaagacc
tagaatgatgggaaaagacatctccagggacctaaccatgctacattcca
acaccctaccacatctacaggaaacccactctgccaagagtgtcccagca
gctcatatttgtttcagttccaactctgagagccttaacaatacccatac
aggtgtcttaacaactcatgtgtcaagacaaattcagttgtccccagcat
ggctagatctaaaaaggaacatcccctcgacatctctgactagcttagct
ctcttctgaaacgtccgtctcaaagttctctccattgtgctaaaagtaga
ccctgacgatgctagcaatttattgacatgtagaatcttgggggacagta
caggttcttgcc
gaattcagtgtctgggcaggaaaacagactgtggagggataataaggcag
tggtcacagactgaaaccctccaacaactcctttccttggtgtacacagc
ttattagtttacagaggaccctttggcttttttttgaaagcatgtattga
ttccgtcatgtgagaaaatttacagacacagtttgtcagcctcagatgcc
attgaaagctcccctactttggcatgggaaggaaggatacttgtgaaagg
aagggcaagtaatgtcatcatttggcctcatttgtgaaatggatggctgt
gttcctgacacagagaaagatgcccaaagccatctgaaagatgaaagggc
tcaacttgaagcggattgctgcaagatcacaacctaagcatctaatatgt
tagttcagacaaaaggacagcagagaactgccagattcttcacactgaga
tggataattagaattttaacagcgcggagagaaactttctttgctcaaat
ctccggaattaccacatactaaaagagagaaaatttctctatcagttaca
gatagggatgatatttatgtagtgactatgatgttttcatttggtcaggt
cttgctatctgggtgtgtatatttgttggatcctattgaaaaattcgttt
tcaaagttccaggctggtttcagtataaatagtaccactgaactacctta
ggtaaggcattcgaataacattcagctattagctgagtcaaaaacaaaga
gcgtagtacattagtactccatctcagatatcaccctctgttgaggattt
tgttattcttataacatgcagccattagttgaatcaaaaaccaaagagat
gtgggaacatcagtactccatctcagatgtctttcaccttgggttgagga
ttttgatcctccccaatctgttccctcctcagctgttggtctgcgtaact
gggttataaaatacaaatgggatcaagtgccattcttttgggtcataccc
cttgggagaaatatttctgcatctttctgcttaataccaccaatcatatt
tggaattata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_93370399_93371516
seq2: B6Ng01-302K07.b_45_1156

seq1  GAATTCTCTACAACATAACACTACACTTAAGGCTCAGGGGACATTGTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTACAACATAACACTACACTTAAGGCTCAGGGGACATTGTGGG  50

seq1  AGAGGAGGTGGAAAGACTGTAAGAGTGGGAGACCCAGGATGTGTGCTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGGTGGAAAGACTGTAAGAGTGGGAGACCCAGGATGTGTGCTGTG  100

seq1  AGATAGTATCTTCTATAAGTGACAGGGAGTTGTACCCATGAAACCTTAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGTATCTTCTATAAGTGACAGGGAGTTGTACCCATGAAACCTTAAC  150

seq1  TTGGGTACCTGGATAAGGACTGCACAATGGCAATATCAGCTGACATCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTACCTGGATAAGGACTGCACAATGGCAATATCAGCTGACATCTTA  200

seq1  ATGTTGATGGAGAAAAGCTCACAAGTTCCCACACCAAAGTGAGGAATTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGATGGAGAAAAGCTCACAAGTTCCCACACCAAAGTGAGGAATTAT  250

seq1  AGTCAATTAATTAATTAGTTAATTAATGGCTTCTACGAGAAGGAATATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAATTAATTAATTAGTTAATTAATGGCTTCTACGAGAAGGAATATGT  300

seq1  CTTCTGTGGTGATAAGTCCTGATAGGTTATCCAATCCCTAAATGTCAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGTGGTGATAAGTCCTGATAGGTTATCCAATCCCTAAATGTCAGCC  350

seq1  CTTAGATGTATGAGCAACTCTAAATGGACTCAACAGATAACATTTATACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGATGTATGAGCAACTCTAAATGGACTCAACAGATAACATTTATACA  400

seq1  CACATGTGTGTGTGTTACTATTACAACGCTATTTAAGAAGGATGTGTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTGTGTGTGTTACTATTACAACGCTATTTAAGAAGGATGTGTTAA  450

seq1  GTTGAGGAGTAAAAGAGATACAAAAAGATTGGAAGAAGAGAATATGCGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGGAGTAAAAGAGATACAAAAAGATTGGAAGAAGAGAATATGCGAT  500

seq1  AGAAATTATGTAAATAAAATACTCATGTGTGACATTCTCAAAAGGTAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTATGTAAATAAAATACTCATGTGTGACATTCTCAAAAGGTAATA  550

seq1  AAAACAAATGCAAAGAAAGTAAAATAAATGTTTTGTTTTGTTTTCTTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAATGCAAAGAAAGTAAAATAAATGTTTTGTTTTGTTTTCTTTCT  600

seq1  GTCTTTCATTTTTAAACTCAGAGGCATTAGCTCTGGAAAGAATTCATAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTCATTTTTAAACTCAGAGGCATTAGCTCTGGAAAGAATTCATAAC  650

seq1  AGTTCCTGGATCAGTTTGGGACAGAGACAAAACCCTAGGTTTACTCCACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCTGGATCAGTTTGGGACAGAGACAAAACCCTAGGTTTACTCCACC  700

seq1  TACCCACACCCACATCAGTGGCCAAAATTGGGATGTTCAAGTTAAAGACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCACACCCACATCAGTGGCCAAAATTGGGATGTTCAAGTTAAAGACC  750

seq1  TAGAATGATGGGAAAAGACATCTCCAGGGACCTAACCATGCTACATTCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATGATGGGAAAAGACATCTCCAGGGACCTAACCATGCTACATTCCA  800

seq1  ACACCCTACCACATCTACAGGAAACCCACTCTGCCAAGAGTGTCCCAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCTACCACATCTACAGGAAACCCACTCTGCCAAGAGTGTCCCAGCA  850

seq1  GCTCATATTTGTTTCAGTTCCAACTCTGAGAGCCTTAACAATACCCATAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATATTTGTTTCAGTTCCAACTCTGAGAGCCTTAACAATACCCATAC  900

seq1  AGGTGTCTTAACAACTCATGTGTCAAGACAAATTCAGTTGTCCCCAGCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCTTAACAACTCATGTGTCAAGACAAATTCAGTTGTCCCCAGCAT  950

seq1  GGCTAGATCTAAAAAGGAACAT-CCCTCGACATCTCTGACTAGGCTTAGC  999
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GGCTAGATCTAAAAAGGAACATCCCCTCGACATCTCTGACTA-GCTTAGC  999

seq1  TCTCTTCTGAAACGTCCGTTCTCCAAAGTTCTCTCCATTTGGTGCTAAAA  1049
      |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||
seq2  TCTCTTCTGAAACGTCCG-TCT-CAAAGTTCTCTCCATT--GTGCTAAAA  1045

seq1  GTAGACCCTGACGATGCTAAGCATATTTATTGACATGTAAGATCTTGGGG  1099
      |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||
seq2  GTAGACCCTGACGATGCT-AGCA-ATTTATTGACATGTAGAATCTTGGGG  1093

seq1  GACAGGTACA-GTTCTTGCC  1118
      |||| ||||| |||||||||
seq2  GACA-GTACAGGTTCTTGCC  1112

seq1: chr6_93382722_93383774
seq2: B6Ng01-302K07.g_63_1122 (reverse)

seq1  TATAATTTCCAAATATGATTGGTGGTATT-AGCAGAAGGATGCAGAAAAT  49
      ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  
seq2  TATAA-TTCCAAATATGATTGGTGGTATTAAGCAGAAAGATGCAGAAATA  49

seq1  ATTCTCCCA--GGGTATGACC--AAAGAATGGCACTTGAT-CCATTTGTA  94
       ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTTCTCCCAAGGGGTATGACCCAAAAGAATGGCACTTGATCCCATTTGTA  99

seq1  -TTTATAACCCAGTTACGCAGACCAACAGCTGAGGA-GGAACAGATTGGG  142
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTTTATAACCCAGTTACGCAGACCAACAGCTGAGGAGGGAACAGATTGGG  149

seq1  GAGGATCAAAATCCTCAACCCAAGGTGAAAGACATCTGAGATGGAGTACT  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCAAAATCCTCAACCCAAGGTGAAAGACATCTGAGATGGAGTACT  199

seq1  GATGTT-CCACATCTCTTTGGTTTTTTGATTCAACTAATGGCTGCATGTT  241
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTCCCACATCTCTTTGG-TTTTTGATTCAACTAATGGCTGCATGTT  248

seq1  ATAAGAATAACAAAATCCTCAACAGAGGGTGATATCTGAGATGGAGTACT  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAATAACAAAATCCTCAACAGAGGGTGATATCTGAGATGGAGTACT  298

seq1  AATGTACTACGCTCTTTGTTTTTGACTCAGCTAATAGCTGAATGTTATTC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTACTACGCTCTTTGTTTTTGACTCAGCTAATAGCTGAATGTTATTC  348

seq1  GAATGCCTTACCTAAGGTAGTTCAGTGGTACTATTTATACTGAAACCAGC  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCCTTACCTAAGGTAGTTCAGTGGTACTATTTATACTGAAACCAGC  398

seq1  CTGGAACTTTGAAAACGAATTTTTCAATAGGATCCAACAAATATACACAC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACTTTGAAAACGAATTTTTCAATAGGATCCAACAAATATACACAC  448

seq1  CCAGATAGCAAGACCTGACCAAATGAAAACATCATAGTCACTACATAAAT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAGCAAGACCTGACCAAATGAAAACATCATAGTCACTACATAAAT  498

seq1  ATCATCCCTATCTGTAACTGATAGAGAAATTTTCTCTCTTTTAGTATGTG  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCCCTATCTGTAACTGATAGAGAAATTTTCTCTCTTTTAGTATGTG  548

seq1  GTAATTCCGGAGATTTGAGCAAAGAAAGTTTCTCTCCGCGCTGTTAAAAT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTCCGGAGATTTGAGCAAAGAAAGTTTCTCTCCGCGCTGTTAAAAT  598

seq1  TCTAATTATCCATCTCAGTGTGAAGAATCTGGCAGTTCTCTGCTGTCCTT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATTATCCATCTCAGTGTGAAGAATCTGGCAGTTCTCTGCTGTCCTT  648

seq1  TTGTCTGAACTAACATATTAGATGCTTAGGTTGTGATCTTGCAGCAATCC  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTGAACTAACATATTAGATGCTTAGGTTGTGATCTTGCAGCAATCC  698

seq1  GCTTCAAGTTGAGCCCTTTCATCTTTCAGATGGCTTTGGGCATCTTTCTC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAAGTTGAGCCCTTTCATCTTTCAGATGGCTTTGGGCATCTTTCTC  748

seq1  TGTGTCAGGAACACAGCCATCCATTTCACAAATGAGGCCAAATGATGACA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAGGAACACAGCCATCCATTTCACAAATGAGGCCAAATGATGACA  798

seq1  TTACTTGCCCTTCCTTTCACAAGTATCCTTCCTTCCCATGCCAAAGTAGG  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTGCCCTTCCTTTCACAAGTATCCTTCCTTCCCATGCCAAAGTAGG  848

seq1  GGAGCTTTCAATGGCATCTGAGGCTGACAAACTGTGTCTGTAAATTTTCT  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTTTCAATGGCATCTGAGGCTGACAAACTGTGTCTGTAAATTTTCT  898

seq1  CACATGACGGAATCAATACATGCTTTCAAAAAAAAGCCAAAGGGTCCTCT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGACGGAATCAATACATGCTTTCAAAAAAAAGCCAAAGGGTCCTCT  948

seq1  GTAAACTAATAAGCTGTGTACACCAAGGAAAGGAGTTGTTGGAGGGTTTC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACTAATAAGCTGTGTACACCAAGGAAAGGAGTTGTTGGAGGGTTTC  998

seq1  AGTCTGTGACCACTGCCTTATTATCCCTCCACAGTCTGTTTTCCTGCCCA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTGACCACTGCCTTATTATCCCTCCACAGTCTGTTTTCCTGCCCA  1048

seq1  GACACTGAATTC  1053
      ||||||||||||
seq2  GACACTGAATTC  1060