BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-304K15
Chromosome6 (Build37)
Map Location 67,062,646 - 67,186,401
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667310
Upstream geneLOC100041916, Tpm3-rs3, LOC627751, Mad2l1, V1rc15, LOC100041941, Aurkb-ps, V1rc14, LOC546901, V1rc12, LOC627833, V1rc11, V1rc10, LOC100042816, LOC546902, V1rc13, EG546903, LOC100042008, 4930597O21Rik, Gng12, LOC100042837, Gadd45a, E230016M11Rik
Downstream geneLOC667318, Serbp1, Il12rb2, LOC667324, EG667326, LOC672137, EG209589, LOC100042890, Il23r, Tacstd2, Igk, Igkv2-137, 4930515G16Rik, Igkv1-136, Igkv1-135, LOC723992, EG628006, Igkv14-134-1, Igkv17-134, EG628027, LOC384401, EG628042, EG243423, EG628056, EG628072, Igkv9-129, Igkv9-128, EG243433, Igkv14-126-1, LOC723993, EG628127, ENSMUSG00000050218, EG243431, EG628144, Igkv1-122, EG667435, EG434025, Igkv9-119, Igkv14-118-2, Igkv14-118-1, EG384405, Igkv11-118, Igkv1-117, EG434026, EG628206, Igkv11-114, Igkv2-113, LOC232047, EG381776
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-304K15.bB6Ng01-304K15.g
ACCGA098163GA098164
length1,091910
definitionB6Ng01-304K15.b B6Ng01-304K15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,185,317 - 67,186,401)(67,062,646 - 67,063,554)
sequence
gaattcactttgtagaccaggctggcctcaaactcagagatctgcctgcc
tctgtctccaagtgctgggattaaaggcatgcgctaccactgctcagcaa
ggttttaattccttgtcctaaacacgagttttatagtacctgatagaaaa
cactcatagttgatgtttcctacatgagtatatggaaataattgaataaa
gaggtgactcagatggtttgctgcactcatattttgttgcaatttacagg
caaaaatacctctgtgggagagagatgttttaatctagcataaaagatgc
tgagaggtagggggtatgttctccagcaaacattcccaactctgaagttg
ccatgtgcattgaactatttcccatcatcaaccataataatgctgaggag
gacgttaatcatgctgtttataggtttgtaaatgcatttcttccaaagac
ctcaagtgtttaatggacatgacctaatttaccctcacaagtctagcctc
ctttaatagatgaggaaaccgaggcataaagaagctgagtaacttcttca
aggtcaagcatgttcctagggaacggagccagatgccagacctctgctgt
ttctgcctagctctgtctctctagaccttgaagatgatgtgcatgcatcc
catggcactaggtgcttctgtgtctaccccttgcccattgcatagccagt
gatcaggaatggttattttatgttcctgaggaaggaacttctttaatatt
gctaaaatattaactatatagcatgtctctttgagagacaatttttgctt
atatgttaagatggcataaataaatataaattttgattgataagggaagc
atagattgggaatatcgttttctcagtgaaagccagtcaacaggagcccc
tcccaaagtaaggcatttgagttgatcatcttttcttatgcttgggcatt
ggacgtacttgaattctcaactatactctataaattagaaaacaaattat
tcaaaatttaaggtatttatgtaatgccacagaaactaataatttaacaa
agctgacattatccccccacattcatttatgtttacctgag
gaattctttttttgtttggtttggtttggtttttgtcgagacagggtttc
tctgtgtagctctggctgtcctggaactcactctgtagaccaggctggcc
tcgaactcagaaatccacctgcctctgcctcccgagtgtgtgcaccacca
ctccctggctagccctggaattctttgagtggaggagaaactaacacaag
ctcttctcagggtcactgccaggaggataaggtggggacctcatctcctc
ttctcccacactggttgatctctgtgtgcagagggttaaggagacacgaa
caaagcctggcagttaaatgggcaggtgatggcacaagaggaccaaggtt
caaatcctggctcctccatttccaggggaggacaatttagctgaaactgt
gcatatgaggccccacttctttatttgcccaaatgggggcggcacctgta
atgcttaaattgacttgggtgagtctacacaacccaagtatgagtacaca
tttgatggatactgccgttagttctgcctggcccgtaatgggtgctttaa
atactgggttggctcgaatgtctttcttcaacgcgtgcttgcttgccgct
tggtttgttacgggccagagaatgtgggtgctgcacatccaggatgtgtg
taaggatactgtccttacagagcttacagatgctgcatcacccagtgctt
cccttgaagcctggctttctcttagagggtgtcgagttgttcttttaaaa
agcatgctttgtggagcagctcagcatgtaatcccagagcttgggaggtg
ggagtaggaggatctggagttcaaggtcatcttctgcttatagccagttc
caggctagcaagggctacattgaaatttcccacccctaactcacccctca
agaaaaggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_67185317_67186401
seq2: B6Ng01-304K15.b_47_1137 (reverse)

seq1  CTCA-GTAAACAT-AATG-ATGTGGGGGATTAAATGTCAGCTTTGTT-AA  46
      |||| |||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||
seq2  CTCAGGTAAACATAAATGAATGTGGGGGGAT-AATGTCAGCTTTGTTAAA  49

seq1  TTATTAG-TTCTGTGGCATTACATAAATACC-TAAATTTTGAATAATTTG  94
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTATTAGTTTCTGTGGCATTACATAAATACCTTAAATTTTGAATAATTTG  99

seq1  TTTTCTAATTTATAGAGTATAGTTGAGAATTCAAGTACGTCCAATG-CCA  143
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTTCTAATTTATAGAGTATAGTTGAGAATTCAAGTACGTCCAATGCCCA  149

seq1  AGCATAAGAAAAGATGATCAACTCAAATGCCTTACTTTGGGAGGGGCTCC  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAAGAAAAGATGATCAACTCAAATGCCTTACTTTGGGAGGGGCTCC  199

seq1  TGTTGACTGGCTTTCACTGAGAAAACGATATTCCCAATCTATGCTTCCCT  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGACTGGCTTTCACTGAGAAAACGATATTCCCAATCTATGCTTCCCT  249

seq1  TATCAATCAAAATTTATATTTATTTATGCCATCTTAACATATAAGCAAAA  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAATCAAAATTTATATTTATTTATGCCATCTTAACATATAAGCAAAA  299

seq1  ATTGTCTCTCAAAGAGACATGCTATATAGTTAATATTTTAGCAATATTAA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCTCTCAAAGAGACATGCTATATAGTTAATATTTTAGCAATATTAA  349

seq1  AGAAGTTCCTTCCTCAGGAACATAAAATAACCATTCCTGATCACTGGCTA  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTCCTTCCTCAGGAACATAAAATAACCATTCCTGATCACTGGCTA  399

seq1  TGCAATGGGCAAGGGGTAGACACAGAAGCACCTAGTGCCATGGGATGCAT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATGGGCAAGGGGTAGACACAGAAGCACCTAGTGCCATGGGATGCAT  449

seq1  GCACATCATCTTCAAGGTCTAGAGAGACAGAGCTAGGCAGAAACAGCAGA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATCATCTTCAAGGTCTAGAGAGACAGAGCTAGGCAGAAACAGCAGA  499

seq1  GGTCTGGCATCTGGCTCCGTTCCCTAGGAACATGCTTGACCTTGAAGAAG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGGCATCTGGCTCCGTTCCCTAGGAACATGCTTGACCTTGAAGAAG  549

seq1  TTACTCAGCTTCTTTATGCCTCGGTTTCCTCATCTATTAAAGGAGGCTAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCAGCTTCTTTATGCCTCGGTTTCCTCATCTATTAAAGGAGGCTAG  599

seq1  ACTTGTGAGGGTAAATTAGGTCATGTCCATTAAACACTTGAGGTCTTTGG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGAGGGTAAATTAGGTCATGTCCATTAAACACTTGAGGTCTTTGG  649

seq1  AAGAAATGCATTTACAAACCTATAAACAGCATGATTAACGTCCTCCTCAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATGCATTTACAAACCTATAAACAGCATGATTAACGTCCTCCTCAG  699

seq1  CATTATTATGGTTGATGATGGGAAATAGTTCAATGCACATGGCAACTTCA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTATGGTTGATGATGGGAAATAGTTCAATGCACATGGCAACTTCA  749

seq1  GAGTTGGGAATGTTTGCTGGAGAACATACCCCCTACCTCTCAGCATCTTT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGGGAATGTTTGCTGGAGAACATACCCCCTACCTCTCAGCATCTTT  799

seq1  TATGCTAGATTAAAACATCTCTCTCCCACAGAGGTATTTTTGCCTGTAAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTAGATTAAAACATCTCTCTCCCACAGAGGTATTTTTGCCTGTAAA  849

seq1  TTGCAACAAAATATGAGTGCAGCAAACCATCTGAGTCACCTCTTTATTCA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAACAAAATATGAGTGCAGCAAACCATCTGAGTCACCTCTTTATTCA  899

seq1  ATTATTTCCATATACTCATGTAGGAAACATCAACTATGAGTGTTTTCTAT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTTCCATATACTCATGTAGGAAACATCAACTATGAGTGTTTTCTAT  949

seq1  CAGGTACTATAAAACTCGTGTTTAGGACAAGGAATTAAAACCTTGCTGAG  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTACTATAAAACTCGTGTTTAGGACAAGGAATTAAAACCTTGCTGAG  999

seq1  CAGTGGTAGCGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGAGACAGAGGCAGGCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTAGCGCATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGAGACAGAGGCAGGCA  1049

seq1  GATCTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAATTC  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAATTC  1091

seq1: chr6_67062646_67063554
seq2: B6Ng01-304K15.g_68_977

seq1  GAATTCTTTTTTTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTGTCGAGACAGGGTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTTTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTTGTCGAGACAGGGTTTC  50

seq1  TCTGTGTAGCTCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTAGCTCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCC  100

seq1  TCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGTGTGCACCACCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGTGTGCACCACCA  150

seq1  CTCCCTGGCTAGCCCTGGAATTCTTTGAGTGGAGGAGAAACTAACACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTGGCTAGCCCTGGAATTCTTTGAGTGGAGGAGAAACTAACACAAG  200

seq1  CTCTTCTCAGGGTCACTGCCAGGAGGATAAGGTGGGGACCTCATCTCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTCAGGGTCACTGCCAGGAGGATAAGGTGGGGACCTCATCTCCTC  250

seq1  TTCTCCCACACTGGTTGATCTCTGTGTGCAGAGGGTTAAGGAGACACGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCCACACTGGTTGATCTCTGTGTGCAGAGGGTTAAGGAGACACGAA  300

seq1  CAAAGCCTGGCAGTTAAATGGGCAGGTGATGGCACAAGAGGACCAAGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCCTGGCAGTTAAATGGGCAGGTGATGGCACAAGAGGACCAAGGTT  350

seq1  CAAATCCTGGCTCCTCCATTTCCAGGGGAGGACAATTTAGCTGAAACTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCCTGGCTCCTCCATTTCCAGGGGAGGACAATTTAGCTGAAACTGT  400

seq1  GCATATGAGGCCCCACTTCTTTATTTGCCCAAATGGGGGCGGCACCTGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATGAGGCCCCACTTCTTTATTTGCCCAAATGGGGGCGGCACCTGTA  450

seq1  ATGCTTAAATTGACTTGGGTGAGTCTACACAACCCAAGTATGAGTACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTAAATTGACTTGGGTGAGTCTACACAACCCAAGTATGAGTACACA  500

seq1  TTTGATGGATACTGCCGTTAGTTCTGCCTGGCCCGTAATGGGTGCTTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATGGATACTGCCGTTAGTTCTGCCTGGCCCGTAATGGGTGCTTTAA  550

seq1  ATACTGGGTTGGCTCGAATGTCTTTCTTCAACGCGTGCTTGCTTGCCGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGGTTGGCTCGAATGTCTTTCTTCAACGCGTGCTTGCTTGCCGCT  600

seq1  TGGTTTGTTACGGGCCAGAGAATGTGGGTGCTGCACATCCAGGATGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGTTACGGGCCAGAGAATGTGGGTGCTGCACATCCAGGATGTGTG  650

seq1  TAAGGATACTGTCCTTACAGAGCTTACAGATGCTGCATCACCCAGTGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGATACTGTCCTTACAGAGCTTACAGATGCTGCATCACCCAGTGCTT  700

seq1  CCCTTGAAGCCTGGCTTTCTCTTAGAGGGTGTCGAGTTGTTCTTTTAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGAAGCCTGGCTTTCTCTTAGAGGGTGTCGAGTTGTTCTTTTAAAA  750

seq1  AGCATGCTTTGTGGAGCAGCTCAGCATGTAATCCCAGAGCTTGGGAGGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGCTTTGTGGAGCAGCTCAGCATGTAATCCCAGAGCTTGGGAGGTG  800

seq1  GGAGTAGGAGGATCTGGAGTTCAAGGTCATCTTCTGCTTATAGCCAGTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTAGGAGGATCTGGAGTTCAAGGTCATCTTCTGCTTATAGCCAGTTC  850

seq1  CAGGCTAGCAAGGGCTACATTGAAA-TTCCCACCCCTAACTCACCCCTCA  899
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTAGCAAGGGCTACATTGAAATTTCCCACCCCTAACTCACCCCTCA  900

seq1  AAGAAAGGGA  909
      |  |||||||
seq2  AGAAAAGGGA  910