BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-306F09
Chromosome6 (Build37)
Map Location 19,700,202 - 19,772,752
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG545829, Lsm8, Ankrd7, LOC626180, Eif3s6-ps4
Downstream geneLOC100040838
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-306F09.bB6Ng01-306F09.g
ACCGA099401GA099402
length1,1401,087
definitionB6Ng01-306F09.b B6Ng01-306F09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,700,202 - 19,701,341)(19,771,672 - 19,772,752)
sequence
gaattctgggatattgtcattatatactaagtacagagagaatagagata
ctgaagacaaagggaatgtataaaaggatgtactaaaatttagctgtctt
ttcttcctgttgaatgatgttcaaagtcacacatatacatgtggacatgt
gcaggcatctgcacacacatatatacaaacacacacacacacatacacac
aatatgaatgctgaggcttgttcctagtgaaatcattagagatattgttt
ctatgtttctctataaggatcccagttattgttctaacttattataatta
gaaatctctttaaattataagtcttttggatgtaatctgaggattctgtc
gagactcttgtcacaggtattccctatagaaatgggaaatgatgatactt
catgagttgtacagttaatgatatgccaaactactcttagcacccatgta
ttcacttctgcagaattctaattttaaaatatagatttacattcatcatt
atttatgtgtctatctgttcatctgtgtgtctattaaagtgcatacaaag
atacatgtggatgtgagaaaaggagggtcagatctcttggagtgaaggta
cagatatttgtaagatgctcagaggaggtattgagatccaatctgttttc
cttatgatagagccctgttaagtgcaaagtcatatctctatcatctttag
tcatattcagaaagcattattaaatattcactacagccatttgcatttat
aattagagtccattctttagagttttgtgcctttagaaaaatggctcacc
atatgtagtctaattttatgagtagactataagtaacttttatacataat
ccatagaattctctcatgatcaaataaaatcatccacataaagtacttga
taagcagcatttggcactagattgcctagttggcatctataatgtcatgc
tctatttttccttgggtcacttcttttgttggtgtatgctagaataacct
tttctagttagtgaggaagattataaatcatacagagacatactgaatag
tcaatcctactattcatgtgcttaatggaattcctggtttaagcagagct
aattacagaatttagtctatgcttgcttatgcgaagtgta
gaattctgtaatgagtgaatcagatttacacaataaccaataagcactga
gattgtagagtactgaaatacagctaaactaacactttcaaggtgatggg
cataaatctgaaatacctgagaccaaagagcatctcatagacagcagctt
ttagaaatcatcagaaactgttagcaggaaaccattattagccaaacatt
tcatcaaaagaataaaaattaaatagataatggagactaaatgactacta
aattaaagatcagatatccataagtctcattgacatttatatgcaaatga
ataaatagtaaataatgaaagacaattttccattgcaaattaacactaca
taaatagttattattcatggatatagatatcatggctgcaatatggtaag
ttacttatggattttccttggcaacccaaaacactaggcttattttgaga
ggataacatgttagatgcacccaagtaaaagattcttggaaacagtggac
aagagctaacaatcttcatgccccactaaactaagcataaggtccaaatg
atggttcaaactaaatcatagtcagtgaagctttttcagtgggaaaagat
gaaaaagaatagctaaaactaagtaaataaaaatatagggtaggcaaatt
gcacaaaattatctcaagtaagttataaaaaaaaagtactcctgtgagtc
ttttataattgaacattatacaatggatatatacggactctgttttatct
tttgtatttttcttcttgtctaaagctatttaaaatagtgtctatatttt
taaaatttgactgagaacattcatgagatagagtttagtcctcaaggatg
ggagttgatgcaagaagaagacagaaaggagaattttaagatttcatgtt
tgagaattttaattctatgtttgggaaacatatacatgcctggagaggct
attgtagggcacattaaacactaaagcttggagttacttgcagctgtgag
ctgcctacataggtgcttggaactaatgtcttgtctttaaattagtactt
tttcttaaccatcctttctattccttgccagagaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_19700202_19701341
seq2: B6Ng01-306F09.b_49_1188

seq1  GAATTCTGGGATATTGTCATTATATACTAAGTACAGAGAGAATAGAGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGATATTGTCATTATATACTAAGTACAGAGAGAATAGAGATA  50

seq1  CTGAAGACAAAGGGAATGTATAAAAGGATGTACTAAAATTTAGCTGTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGACAAAGGGAATGTATAAAAGGATGTACTAAAATTTAGCTGTCTT  100

seq1  TTCTTCCTGTTGAATGATGTTCAAAGTCACACATATACATGTGGACATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCTGTTGAATGATGTTCAAAGTCACACATATACATGTGGACATGT  150

seq1  GCAGGCATCTGCACACACATATATACAAACACACACACACACATACACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGCATCTGCACACACATATATACAAACACACACACACACATACACAC  200

seq1  AATATGAATGCTGAGGCTTGTTCCTAGTGAAATCATTAGAGATATTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGAATGCTGAGGCTTGTTCCTAGTGAAATCATTAGAGATATTGTTT  250

seq1  CTATGTTTCTCTATAAGGATCCCAGTTATTGTTCTAACTTATTATAATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTTTCTCTATAAGGATCCCAGTTATTGTTCTAACTTATTATAATTA  300

seq1  GAAATCTCTTTAAATTATAAGTCTTTTGGATGTAATCTGAGGATTCTGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCTCTTTAAATTATAAGTCTTTTGGATGTAATCTGAGGATTCTGTC  350

seq1  GAGACTCTTGTCACAGGTATTCCCTATAGAAATGGGAAATGATGATACTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTCTTGTCACAGGTATTCCCTATAGAAATGGGAAATGATGATACTT  400

seq1  CATGAGTTGTACAGTTAATGATATGCCAAACTACTCTTAGCACCCATGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTTGTACAGTTAATGATATGCCAAACTACTCTTAGCACCCATGTA  450

seq1  TTCACTTCTGCAGAATTCTAATTTTAAAATATAGATTTACATTCATCATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTTCTGCAGAATTCTAATTTTAAAATATAGATTTACATTCATCATT  500

seq1  ATTTATGTGTCTATCTGTTCATCTGTGTGTCTATTAAAGTGCATACAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGTGTCTATCTGTTCATCTGTGTGTCTATTAAAGTGCATACAAAG  550

seq1  ATACATGTGGATGTGAGAAAAGGAGGGTCAGATCTCTTGGAGTGAAGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGTGGATGTGAGAAAAGGAGGGTCAGATCTCTTGGAGTGAAGGTA  600

seq1  CAGATATTTGTAAGATGCTCAGAGGAGGTATTGAGATCCAATCTGTTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATTTGTAAGATGCTCAGAGGAGGTATTGAGATCCAATCTGTTTTC  650

seq1  CTTATGATAGAGCCCTGTTAAGTGCAAAGTCATATCTCTATCATCTTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGATAGAGCCCTGTTAAGTGCAAAGTCATATCTCTATCATCTTTAG  700

seq1  TCATATTCAGAAAGCATTATTAAATATTCACTACAGCCATTTGCATTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATTCAGAAAGCATTATTAAATATTCACTACAGCCATTTGCATTTAT  750

seq1  AATTAGAGTCCATTCTTTAGAGTTTTGTGCCTTTAGAAAAATGGCTCACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGAGTCCATTCTTTAGAGTTTTGTGCCTTTAGAAAAATGGCTCACC  800

seq1  ATATGTAGTCTAATTTTATGAGTAGACTATAAGTAACTTTTATACATAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTAGTCTAATTTTATGAGTAGACTATAAGTAACTTTTATACATAAT  850

seq1  CCATAGAATTCTCTCATGATCAAATAAAATCATCCACATAAAGTACTTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGAATTCTCTCATGATCAAATAAAATCATCCACATAAAGTACTTGA  900

seq1  TAAGCAGCATTTGGCACTAGATTGCCTAGTTGGCATCTAT-ATGTCATGC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAAGCAGCATTTGGCACTAGATTGCCTAGTTGGCATCTATAATGTCATGC  950

seq1  TCTATTTTTCCTT-GGTCACTTCTTTTGTTGGTGTATGCTAGAATAACC-  997
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TCTATTTTTCCTTGGGTCACTTCTTTTGTTGGTGTATGCTAGAATAACCT  1000

seq1  TTTCTAGTTAGTGAGGAAGATTATAAATCATTAACAGAGACAATACTG-A  1046
      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |
seq2  TTTCTAGTTAGTGAGGAAGATTATAAATCAT--ACAGAGAC-ATACTGAA  1047

seq1  TAGTCAATCCTACTAATCATTGTGCTTAAATGGATTCCTGGTTTAAAGCA  1096
      ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||| |||||
seq2  TAGTCAATCCTACTATTCA-TGTGCTTAATGGAATTCCTGGTTT-AAGCA  1095

seq1  GAGCTTATTACAG-ATTTAGTCTATGC-TGCTTATGCCGAAGTGTA  1140
      ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||
seq2  GAGCTAATTACAGAATTTAGTCTATGCTTGCTTATG-CGAAGTGTA  1140

seq1: chr6_19771672_19772752
seq2: B6Ng01-306F09.g_67_1153 (reverse)

seq1  AATTCTCTGGCA--GGATAGAAA-GATGGTTAAG-AAAAGTACTAATTTT  46
      ||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||
seq2  AATTCTCTGGCAAGGAATAGAAAGGATGGTTAAGAAAAAGTACTAA-TTT  49

seq1  AAAGAC-AGACATTAGTTTCCAAGCACCTATGTAGGGCAGCTCACAGCTG  95
      |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAAGACAAGACATTAG-TTCCAAGCACCTATGTA-GGCAGCTCACAGCTG  97

seq1  CCAGTAACTCC-AGCTTTAGTGTTTAATGTGCCCTACAATAGCCTCTCCA  144
      | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAACTCCAAGCTTTAGTGTTTAATGTGCCCTACAATAGCCTCTCCA  147

seq1  GGCATGTATATGTTT-CCAAACATAGAATTAAAATTCTCAAACATGAAAT  193
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGTATATGTTTCCCAAACATAGAATTAAAATTCTCAAACATGAAAT  197

seq1  CTTAAAATTCTCC-TTCTGTCTTCTTCTTGCATCAACT-CCATCCTTGAG  241
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTTAAAATTCTCCTTTCTGTCTTCTTCTTGCATCAACTCCCATCCTTGAG  247

seq1  GACTAAACTCTATCTCATGAATGTTCTCAGTCAAATTTTAAAAATATAGA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAACTCTATCTCATGAATGTTCTCAGTCAAATTTTAAAAATATAGA  297

seq1  CACTATTTTAAATAGCTTTAGACAAGAAGAAAAATACAAAAGATAAAACA  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATTTTAAATAGCTTTAGACAAGAAGAAAAATACAAAAGATAAAACA  347

seq1  GAGTCCGTATATATCCATTGTATAATGTTCAATTATAAAAGACTCACAGG  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCGTATATATCCATTGTATAATGTTCAATTATAAAAGACTCACAGG  397

seq1  AGTACTTTTTTTTTATAACTTACTTGAGATAATTTTGTGCAATTTGCCTA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTTTTTTTTTATAACTTACTTGAGATAATTTTGTGCAATTTGCCTA  447

seq1  CCCTATATTTTTATTTACTTAGTTTTAGCTATTCTTTTTCATCTTTTCCC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATATTTTTATTTACTTAGTTTTAGCTATTCTTTTTCATCTTTTCCC  497

seq1  ACTGAAAAAGCTTCACTGACTATGATTTAGTTTGAACCATCATTTGGACC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAAAGCTTCACTGACTATGATTTAGTTTGAACCATCATTTGGACC  547

seq1  TTATGCTTAGTTTAGTGGGGCATGAAGATTGTTAGCTCTTGTCCACTGTT  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCTTAGTTTAGTGGGGCATGAAGATTGTTAGCTCTTGTCCACTGTT  597

seq1  TCCAAGAATCTTTTACTTGGGTGCATCTAACATGTTATCCTCTCAAAATA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGAATCTTTTACTTGGGTGCATCTAACATGTTATCCTCTCAAAATA  647

seq1  AGCCTAGTGTTTTGGGTTGCCAAGGAAAATCCATAAGTAACTTACCATAT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTAGTGTTTTGGGTTGCCAAGGAAAATCCATAAGTAACTTACCATAT  697

seq1  TGCAGCCATGATATCTATATCCATGAATAATAACTATTTATGTAGTGTTA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCCATGATATCTATATCCATGAATAATAACTATTTATGTAGTGTTA  747

seq1  ATTTGCAATGGAAAATTGTCTTTCATTATTTACTATTTATTCATTTGCAT  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCAATGGAAAATTGTCTTTCATTATTTACTATTTATTCATTTGCAT  797

seq1  ATAAATGTCAATGAGACTTATGGATATCTGATCTTTAATTTAGTAGTCAT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTCAATGAGACTTATGGATATCTGATCTTTAATTTAGTAGTCAT  847

seq1  TTAGTCTCCATTATCTATTTAATTTTTATTCTTTTGATGAAATGTTTGGC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCTCCATTATCTATTTAATTTTTATTCTTTTGATGAAATGTTTGGC  897

seq1  TAATAATGGTTTCCTGCTAACAGTTTCTGATGATTTCTAAAAGCTGCTGT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATGGTTTCCTGCTAACAGTTTCTGATGATTTCTAAAAGCTGCTGT  947

seq1  CTATGAGATGCTCTTTGGTCTCAGGTATTTCAGATTTATGCCCATCACCT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGAGATGCTCTTTGGTCTCAGGTATTTCAGATTTATGCCCATCACCT  997

seq1  TGAAAGTGTTAGTTTAGCTGTATTTCAGTACTCTACAATCTCAGTGCTTA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTGTTAGTTTAGCTGTATTTCAGTACTCTACAATCTCAGTGCTTA  1047

seq1  TTGGTTATTGTGTAAATCTGATTCACTCATTACAGAATTC  1081
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTATTGTGTAAATCTGATTCACTCATTACAGAATTC  1087