BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-318P05
Chromosome6 (Build37)
Map Location 134,761,320 - 134,862,521
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCrebl2, Gpr19
Upstream geneKap, LOC100043655, LOC100043656, LOC668063, Etv6, LOC100043660, Bcl2l14, Lrp6, Mansc1, Loh12cr1, LOC100043884, Dusp16
Downstream geneCdkn1b, 1190002F15Rik, Apold1, Ddx47, Gprc5a, Gprc5d, LOC100043668, Hebp1, 8430419L09Rik, Gsg1, Pbp2, LOC100043890, Emp1, Grin2b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-318P05.bB6Ng01-318P05.g
ACCGA108709GA108710
length9991,097
definitionB6Ng01-318P05.b B6Ng01-318P05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(134,761,320 - 134,762,315)(134,861,513 - 134,862,521)
sequence
gaattcaaatcccaggcaccacatggtggctcacaaccaccagtacagct
acagtgtactcacatacataaaataaaacattacaggtaactctgcccac
cactgttgttcctcattcctcagaaacagccttggctcaccatctctgct
gactcagtaatacagcattctttaagaatcagaaggaactgcagagttgg
ctcagtggtaagagcacttgttgctcttccgtaagacccaggtacagggc
tggagagatggctcagaggttaagagcactgactgctcttccagaggtcc
tgagttcaattcccagcaaccacatggtggctcacaaccatctgtaatga
tgatctgataccctcttctggtgtgtctaaagacagctacagtgtactca
tatacatagaataaataaatcttaaaaaaaatctttgtttaaaaacaaaa
caaaacaggtacaacccagtacaattcccagcacccacctcaagcactcc
agctccaagattcaactcctctcttcctcaaatgtaagaacacaaaaggc
caaagagatggttaagagcttagaaagaaccagggttcaattcccaaatt
cccagcacgcacatgttggcttacaatctttcagtagtgccccctctctt
tcagtagtgccctcttctagcctcaaagggccaagtcatgaatacagaac
acttatatactctgaggtaatatctatctttgatattggagtatgcttct
tgtatgcagcagaatgatggacactgtttttgcatccattctgatagtat
cttttctttggggaattgagcccattgatttgtacacaaagtgtgtacca
ctgcagctggctttacacgtgctctgggaatcaagctcaagtcctgaagc
ttgttgtcaagtgtctacatgctgagcatctcctgggccctgtgagtgct
ttcaatgtaccttctttgttgaaacctgcttccattggtagaaggatgc
gaattcttcgatacagtggcatgtgtgtggagacctgaatgggggaggcg
atagactatgtaagttcctgtgttccaggcagaggaaacagcaaatctca
agtctcaaaggttcagaatgtcctcgagatggttgagggacaacatgtga
gcagtaatccagtagggatcccatagtgatcggggctgggtggtagatgg
atcagagaggaacacaggggcttggatgatgtacagtttataaaccatgg
taaagactcagcttcattccaattccagtaggttgtctttgagcagagtt
ttgatctgactttggccaacttgaatggctttgactgttcagtgagaagc
ccttaaaagagcaagaagtaggggcaccagttggcagactgtataatact
ctaggtatgaagtctcaggccagggtggtaccagtgtacatgaagagaca
gggaaagttgctggggttcttcgatatctgtgtctgagagcgaggagacc
ataaggacgaagggtttggcctaaaccacgaaggaaaccatttgctagga
tggagtgtactgaagaagtaacaaattttgctttaagcatattgggttta
agccacatatagtagtgtacacttggaatcctagtattggggagacagac
attgtgtcaaatgtacaacatttttaaaatttatttattatacataagcc
ctgtatcagacacaccaggagaaggcatccgatctcattacagatggttg
tgagccaccatgtggttgcagggatttgaactcaggacctccagaagagc
agtcagtgctcttaaccgctgagctatctctccagcccctgtaaaacatt
tttaaatgttaaatttgagatgtctatggacatccaggtggaagtttaaa
taggtacttggtttgaatccaagggagaaagagatctatgttgggcagtg
tgactttgacattttaagcacataggtgacattacactgtagggctagct
gggaataataaggtgggtgatgcctgtgatccgcaattagggagctggag
acagaaggatcagtaaggtcaggatcatcccaatcaatcttcagtta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_134761320_134762315
seq2: B6Ng01-318P05.b_48_1046

seq1  GAATTCAAATCCCAGGCACCACATGGTGGCTCACAACCACCAGTACAGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATCCCAGGCACCACATGGTGGCTCACAACCACCAGTACAGCT  50

seq1  ACAGTGTACTCACATACATAAAATAAAACATTACAGGTAACTCTGCCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGTACTCACATACATAAAATAAAACATTACAGGTAACTCTGCCCAC  100

seq1  CACTGTTGTTCCTCATTCCTCAGAAACAGCCTTGGCTCACCATCTCTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTTGTTCCTCATTCCTCAGAAACAGCCTTGGCTCACCATCTCTGCT  150

seq1  GACTCAGTAATACAGCATTCTTTAAGAATCAGAAGGAACTGCAGAGTTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCAGTAATACAGCATTCTTTAAGAATCAGAAGGAACTGCAGAGTTGG  200

seq1  CTCAGTGGTAAGAGCACTTGTTGCTCTTCCGTAAGACCCAGGTACAGGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTGGTAAGAGCACTTGTTGCTCTTCCGTAAGACCCAGGTACAGGGC  250

seq1  TGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCC  300

seq1  TGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGA  350

seq1  TGATCTGATACCCTCTTCTGGTGTGTCTAAAGACAGCTACAGTGTACTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCTGATACCCTCTTCTGGTGTGTCTAAAGACAGCTACAGTGTACTCA  400

seq1  TATACATAGAATAAATAAATCTTAAAAAAAATCTTTGTTTAAAAACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATAGAATAAATAAATCTTAAAAAAAATCTTTGTTTAAAAACAAAA  450

seq1  CAAAACAGGTACAACCCAGTACAATTCCCAGCACCCACCTCAAGCACTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAGGTACAACCCAGTACAATTCCCAGCACCCACCTCAAGCACTCC  500

seq1  AGCTCCAAGATTCAACTCCTCTCTTCCTCAAATGTAAGAACACAAAAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCAAGATTCAACTCCTCTCTTCCTCAAATGTAAGAACACAAAAGGC  550

seq1  CAAAGAGATGGTTAAGAGCTTAGAAAGAACCAGGGTTCAATTCCCAAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAGATGGTTAAGAGCTTAGAAAGAACCAGGGTTCAATTCCCAAATT  600

seq1  CCCAGCACGCACATGTTGGCTTACAATCTTTCAGTAGTGCCCCCTCTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCACGCACATGTTGGCTTACAATCTTTCAGTAGTGCCCCCTCTCTT  650

seq1  TCAGTAGTGCCCTCTTCTAGCCTCAAAGGGCCAAGTCATGAATACAGAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGTGCCCTCTTCTAGCCTCAAAGGGCCAAGTCATGAATACAGAAC  700

seq1  ACTTATATACTCTGAGGTAATATCTATCTTTGATATTGGAGTATGCTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATATACTCTGAGGTAATATCTATCTTTGATATTGGAGTATGCTTCT  750

seq1  TGTATGCAGCAGAATGATGGACACTGTTTTTGCATCCATTCTGATAGTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGCAGCAGAATGATGGACACTGTTTTTGCATCCATTCTGATAGTAT  800

seq1  CTTTTCTTTGGGGAATTGAGCCCATTGATTTTGTACAC-AAGTGTGTACC  849
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  CTTTTCTTTGGGGAATTGAGCCCATTGA-TTTGTACACAAAGTGTGTACC  849

seq1  ACTGCAGCTGGCTTTTACACGTGCTCTGGGAATCAAGCTCAAGTCCTGAA  899
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAGCTGGC-TTTACACGTGCTCTGGGAATCAAGCTCAAGTCCTGAA  898

seq1  GCTTGTTGTCAAGTGTCTACATGCTGAGCATCTCCTGGGCCCTGTGAGTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTGTCAAGTGTCTACATGCTGAGCATCTCCTGGGCCCTGTGAGTG  948

seq1  CTTTCAATGTA-CTTCTTTGTTGAAACCTGC-TCCA-TGGTAGAA-GATG  995
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||
seq2  CTTTCAATGTACCTTCTTTGTTGAAACCTGCTTCCATTGGTAGAAGGATG  998

seq1  C  996
      |
seq2  C  999

seq1: chr6_134861513_134862521
seq2: B6Ng01-318P05.g_147_1162 (reverse)

seq1  TAACTGAAGATGGATGGGAATGATCTTGACC-TACTGATCTTCTTGTCTT  49
      ||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |  ||||| 
seq2  TAACTGAAGATTGATTGGGATGATCCTGACCTTACTGATCCTTCTGTCTC  50

seq1  CAGCT-CCTAAATGCCGGGATCACAGGCATCACC------ACTATATCCA  92
      ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||      | |||  |||
seq2  CAGCTCCCTAATTGC--GGATCACAGGCATCACCCACCTTATTATTCCCA  98

seq1  GCTAGCCCTACAGTGTTAATGTCACCTATGTGCTTAAATTGTCAAAGTCA  142
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GCTAGCCCTACAGTG-TAATGTCACCTATGTGCTTAAAATGTCAAAGTCA  147

seq1  CACTG-CCAACATAGATCTCTTTCTCCCTTGGATTC-AACCAAGTACCTA  190
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CACTGCCCAACATAGATCTCTTTCTCCCTTGGATTCAAACCAAGTACCTA  197

seq1  TTTAAACTTCCACCTGGATGTCCATAGACATCTCAAATTTAACATTTAAA  240
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAACTTCCACCTGGATGTCCATAGACATCTCAAATTTAACATTTAAA  247

seq1  AATGTTTTACAGGGGCTGGAGAGATAGCTCAGCGGTTAAGAGCACTGACT  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTTACAGGGGCTGGAGAGATAGCTCAGCGGTTAAGAGCACTGACT  297

seq1  GCTCTTCTGGAGGTCCTGAGTTCAAATCCCTGCAACCACATGGTGGCTCA  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTCTGGAGGTCCTGAGTTCAAATCCCTGCAACCACATGGTGGCTCA  347

seq1  CAACCATCTGTAATGAGATCGGATGCCTTCTCCTGGTGTGTCTGATACAG  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCATCTGTAATGAGATCGGATGCCTTCTCCTGGTGTGTCTGATACAG  397

seq1  GGCTTATGTATAATAAATAAATTTTAAAAATGTTGTACATTTGACACAAT  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTATGTATAATAAATAAATTTTAAAAATGTTGTACATTTGACACAAT  447

seq1  GTCTGTCTCCCCAATACTAGGATTCCAAGTGTACACTACTATATGTGGCT  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTCTCCCCAATACTAGGATTCCAAGTGTACACTACTATATGTGGCT  497

seq1  TAAACCCAATATGCTTAAAGCAAAATTTGTTACTTCTTCAGTACACTCCA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCCAATATGCTTAAAGCAAAATTTGTTACTTCTTCAGTACACTCCA  547

seq1  TCCTAGCAAATGGTTTCCTTCGTGGTTTAGGCCAAACCCTTCGTCCTTAT  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGCAAATGGTTTCCTTCGTGGTTTAGGCCAAACCCTTCGTCCTTAT  597

seq1  GGTCTCCTCGCTCTCAGACACAGATATCGAAGAACCCCAGCAACTTTCCC  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCCTCGCTCTCAGACACAGATATCGAAGAACCCCAGCAACTTTCCC  647

seq1  TGTCTCTTCATGTACACTGGTACCACCCTGGCCTGAGACTTCATACCTAG  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTTCATGTACACTGGTACCACCCTGGCCTGAGACTTCATACCTAG  697

seq1  AGTATTATACAGTCTGCCAACTGGTGCCCCTACTTCTTGCTCTTTTAAGG  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTATACAGTCTGCCAACTGGTGCCCCTACTTCTTGCTCTTTTAAGG  747

seq1  GCTTCTCACTGAACAGTCAAAGCCATTCAAGTTGGCCAAAGTCAGATCAA  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTCACTGAACAGTCAAAGCCATTCAAGTTGGCCAAAGTCAGATCAA  797

seq1  AACTCTGCTCAAAGACAACCTACTGGAATTGGAATGAAGCTGAGTCTTTA  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGCTCAAAGACAACCTACTGGAATTGGAATGAAGCTGAGTCTTTA  847

seq1  CCATGGTTTATAAACTGTACATCATCCAAGCCCCTGTGTTCCTCTCTGAT  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGTTTATAAACTGTACATCATCCAAGCCCCTGTGTTCCTCTCTGAT  897

seq1  CCATCTACCACCCAGCCCCGATCACTATGGGATCCCTACTGGATTACTGC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTACCACCCAGCCCCGATCACTATGGGATCCCTACTGGATTACTGC  947

seq1  TCACATGTTGTCCCTCAACCATCTCGAGGACATTCTGAACCTTTGAGACT  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGTTGTCCCTCAACCATCTCGAGGACATTCTGAACCTTTGAGACT  997

seq1  TGAGATTTGCTGTTTCCTC  1009
      |||||||||||||||||||
seq2  TGAGATTTGCTGTTTCCTC  1016