BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322D07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 129,334,341 - 129,497,613
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933425B16Rik, Clec1b, Clec9a, Clec1a, Clec7a, Olr1, D630042F21Rik, Gabarapl1
Upstream geneNrip2, Itfg2, Fkbp4, EG667598, Pzp, LOC384494, EG667610, BC048546, Klrb1a, EG545878, LOC677440, Clec2h, LOC100043863, LOC100043861, Klrb1c, LOC100043862, Klrb1d, LOC667706, Clec2i, Clec2g, LOC667715, BC064078, Clec2f, Klrb1f, Clec2e, Klrb1-ps1, Clec2d, Cd69, 4922502D21Rik, Clec12a
Downstream geneKlre1, Klrd1, Klrk1, Klrc3, Klrc2, Klrc1, LOC640755, Klri1, Klri2, Gm156, Klra17, Klra5, LOC667764, Klra6, LOC100038893, LOC100038894, LOC100038895, Klra4, LOC667769, LOC100038897, Klra8, EG654449, Klra9, Klra7, LOC100038898, Klra12, Klra10, Klra13, Klra3, Klra1, LOC100038902, LOC100038903, LOC625436, EG625473, LOC640779
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322D07.bB6Ng01-322D07.g
ACCGA111108GA111109
length1,1561,115
definitionB6Ng01-322D07.b B6Ng01-322D07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(129,334,341 - 129,335,515)(129,496,493 - 129,497,613)
sequence
gaattccaagattagacatctaaatgaaaaatttcacaagtatataaaat
ataaacactgtattatgccagaagttgaataataaatgcagcagctttgg
cctcaaaattcttttgggggctaatgataattaacactctgactatgaaa
aggttataatacacttcttgggacgtggcaatgtgcccaggctggcgtgg
agatttcctttctgtctcttacccttggaactgcaagagctaccagcctg
agaacagacaattgcgctttggtaaaatgtgcctcttgattcttaaaagt
tgggctatggagttgatgaggggaaatgattgtaaaagataaatctgttc
tgtcccagtttatcagtgatgattaaactatgaccaacaggcagttaaaa
cacatgtccagcgatgaaaaatgatatgatcgatgttttggaaaaacatg
aatctatccttgcctattgagttctgtatgaagatagaaacaccctgact
gctagtcagtcagactgcaaggttgacccagtggctgtgcctgacttact
tcttcaccaactccttatccttatccctcaataggacctggccattgcca
cagctggcccccgcagggttctagcaacagtaagttaaaaaacagcctaa
gagcaaaagctagctcatgatcatttctgatttaactctactcaactcct
tcccttcatttagttatgccacacaccagcaaggtttccttttacatagt
ttcgaatcatttttggcttctagaagaacatctccctggcattgctaatg
aggcgtaagaatctaaggacagttataaatagaaatcttcactgccagac
ccaaactctgacatacccattaacttttcccctaccatgattccattcaa
ttcacacagtcttgaaagccccatcaattctcttaaggagattcactctg
ctagttgtctctatttgggaacgatgtcacatattcctccctgcccctaa
gtcaaagctacatctccaagcacttaacactgcattccagtcacgtatgc
tttctctaagctctactcttttctagttatttccatccgatccccttcac
tcttgcagagtcctgagcatcattcgcataggtcacgttcaatcagaact
ctagga
gaattccttagaatcttcagagaccattaagaaaaagttcatcagtcctt
gatcacttcctctctatgatcacatgaccaagtccttgatcacttcctct
ctatgatcacatgaccaagtccttgatcacttcctgtctatgatcacatg
accaaggaagctgtcttgaatgaggactgtggccagttgatgaggagtgg
agacaggagcagcctgggtctgaggaggcagcccctaatccaagcctggg
tttttatactaaggtagaataactataactactatatcatttgaggttgt
ccaaaatcctcgtgcagagatcctcctgtagaactcattgggcacatggg
acaaagacagacagtccatacatggaacagtagaagagggctggctgttg
atataaaataacctgaggtatttatgacatcaaacacaaccattccaggg
gaaagggacatcacaaaaggaaattgaaacatttagtggggtcaaccttt
tccccttttaaaactcacacacactaactgaaacatccaaatatgccttg
accatcgtgaggatccatcatgcactgtgcagggaggcttgggtttatac
tcaaccccgtggattcaacacaagtactttgaaaatactggccatccccc
tagtactatagtcagtacattatttaccccatgacttattgctaaagatg
agtttattgttcgctagcacaatttctatatatgctcctacaaaagccaa
gactttgcatggcactgcaaagggagttggaaatctagttgaccaagggt
ttgttctgtcttcctaattcctcaactgcaccaaccctctgtagtccatt
tcttgcttacccaggggtaattaggaaatgtgggtcccccaaagacttgc
tagttagggatttcaagaaggcaaaaatgaggttggaaagatggctctca
tggagttcagttctcagcatccaggacaggaaagacacaaccacctgcaa
ctccagatgcaggatctgatgtcagcagcctcatgatacccaacacatgt
ctacataagtaataaatctatttttaaaagtgaaagaactattcatgtgc
ccattgttcattggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_129334341_129335515
seq2: B6Ng01-322D07.b_49_1204

seq1  GAATTCCAAGATTAGACATCTAAATGAAAAATTTCACAAGTATATAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGATTAGACATCTAAATGAAAAATTTCACAAGTATATAAAAT  50

seq1  ATAAACACTGTATTATGCCAGAAGTTGAATAATAAATGCAGCAGCTTTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACACTGTATTATGCCAGAAGTTGAATAATAAATGCAGCAGCTTTGG  100

seq1  CCTCAAAATTCTTTTGGGGGCTAATGATAATTAACACTCTGACTATGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAAATTCTTTTGGGGGCTAATGATAATTAACACTCTGACTATGAAA  150

seq1  AGGTTATAATACACTTCTTGGGACGTGGCAATGTGCCCAGGCTGGCGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTATAATACACTTCTTGGGACGTGGCAATGTGCCCAGGCTGGCGTGG  200

seq1  AGATTTCCTTTCTGTCTCTTACCCTTGGAACTGCAAGAGCTACCAGCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTCCTTTCTGTCTCTTACCCTTGGAACTGCAAGAGCTACCAGCCTG  250

seq1  AGAACAGACAATTGCGCTTTGGTAAAATGTGCCTCTTGATTCTTAAAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAGACAATTGCGCTTTGGTAAAATGTGCCTCTTGATTCTTAAAAGT  300

seq1  TGGGCTATGGAGTTGATGAGGGGAAATGATTGTAAAAGATAAATCTGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTATGGAGTTGATGAGGGGAAATGATTGTAAAAGATAAATCTGTTC  350

seq1  TGTCCCAGTTTATCAGTGATGATTAAACTATGACCAACAGGCAGTTAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCAGTTTATCAGTGATGATTAAACTATGACCAACAGGCAGTTAAAA  400

seq1  CACATGTCCAGCGATGAAAAATGATATGATCGATGTTTTGGAAAAACATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTCCAGCGATGAAAAATGATATGATCGATGTTTTGGAAAAACATG  450

seq1  AATCTATCCTTGCCTATTGAGTTCTGTATGAAGATAGAAACACCCTGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATCCTTGCCTATTGAGTTCTGTATGAAGATAGAAACACCCTGACT  500

seq1  GCTAGTCAGTCAGACTGCAAGGTTGACCCAGTGGCTGTGCCTGACTTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTCAGTCAGACTGCAAGGTTGACCCAGTGGCTGTGCCTGACTTACT  550

seq1  TCTTCACCAACTCCTTATCCTTATCCCTCAATAGGACCTGGCCATTGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCACCAACTCCTTATCCTTATCCCTCAATAGGACCTGGCCATTGCCA  600

seq1  CAGCTGGCCCCCGCAGGGTTCTAGCAACAGTAAGTTAAAAAACAGCCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGGCCCCCGCAGGGTTCTAGCAACAGTAAGTTAAAAAACAGCCTAA  650

seq1  GAGCAAAAGCTAGCTCATGATCATTTCTGATTTAACTCTACTCAACTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAAAGCTAGCTCATGATCATTTCTGATTTAACTCTACTCAACTCCT  700

seq1  TCCCTTCATTTAGTTATGCCACACACCAGCAAGGTTTCCTTTTACATAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTCATTTAGTTATGCCACACACCAGCAAGGTTTCCTTTTACATAGT  750

seq1  TTCGAATCATTTTTGGCTTCTAGAAGAACATCTCCCTGGCATTGCTAATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGAATCATTTTTGGCTTCTAGAAGAACATCTCCCTGGCATTGCTAATG  800

seq1  AGGCGTAAGAATCTAAGGACAGTTATAAATAGAAATCTTCACTGCCAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGTAAGAATCTAAGGACAGTTATAAATAGAAATCTTCACTGCCAGAC  850

seq1  CCAAACTCTGACATACCCATTAACTTTTCCCCTACCATGATTCCATTCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAACTCTGACATACCCATTAACTTTTCCCCTACCATGATTCCATTCAA  900

seq1  TTCACACAGTCTTGAAAGCCCCATCAATTCTCTTAAGGAGATTCACTCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACAGTCTTGAAAGCCCCATCAATTCTCTTAAGGAGATTCACTCTG  950

seq1  CTAGTTTGTCTCTATTTTGGGAACGATGTCACATATTCCTCCCTGCCCCT  1000
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAG-TTGTCTCTA-TTTGGGAACGATGTCACATATTCCTCCCTGCCCCT  998

seq1  AAGGTCAAAGCCTACATCTCCAAGCACTTAACACCTGCCATTTCCAAGGT  1050
      || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||
seq2  AA-GTCAAAG-CTACATCTCCAAGCACTTAACA-CTGC--ATTCCA--GT  1041

seq1  CACGGTATGCTTTCTCTAAGCTCTTACCTTCTTTTCTTAGGTTATTTCCA  1100
      ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||   ||||||||||
seq2  CAC-GTATGCTTTCTCTAAGCTC-TAC--TCTTTTCT--AGTTATTTCCA  1085

seq1  TCCCGATTCCCCCTCACTCTTGCAGAGTCCTGAAGCATCAGTGTCGCATA  1150
      | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||
seq2  T-CCGA-TCCCCTTCACTCTTGCAGAGTCCTG-AGCATCA--TTCGCATA  1130

seq1  GGTCAC-TTC-ATCAGACATCCTAGGA  1175
      |||||| ||| |||||| |  ||||||
seq2  GGTCACGTTCAATCAGA-ACTCTAGGA  1156

seq1: chr6_129496493_129497613
seq2: B6Ng01-322D07.g_66_1180 (reverse)

seq1  GCCAATG-ACAAATGGCACATGATATGTCTTTTCACCTTTTAAAAATAGA  49
      ||||||| ||||  |||||||||   ||  ||||| ||||||||||||||
seq2  GCCAATGAACAATGGGCACATGAATAGTTCTTTCA-CTTTTAAAAATAGA  49

seq1  TTTTATTACTTATGTAGACATGTGTTGGGGTATCCATGGAGGCCTGCTGA  99
       ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||
seq2  -TTTATTACTTATGTAGACATGTGTT-GGGTAT-CAT-GAGG-CTGCTGA  94

seq1  CATCAGATCCCTGCATCTGGAGTTGCAGGTGGTTGTGTCTTTCCTGTCCT  149
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGAT-CCTGCATCTGGAGTTGCAGGTGGTTGTGTCTTTCCTGTCCT  143

seq1  GGATGCTGAGAACTGAACTCCATGAGAGCCATCTTTCCAACCTCATTTTT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGAGAACTGAACTCCATGAGAGCCATCTTTCCAACCTCATTTTT  193

seq1  GCCTTCTTGAAATCCCTAACTAGCAAGTCTTTGGGGGACCCACATTTCCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCTTGAAATCCCTAACTAGCAAGTCTTTGGGGGACCCACATTTCCT  243

seq1  AATTACCCCTGGGTAAGCAAGAAATGGACTACAGAGGGTTGGTGCAGTTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACCCCTGGGTAAGCAAGAAATGGACTACAGAGGGTTGGTGCAGTTG  293

seq1  AGGAATTAGGAAGACAGAACAAACCCTTGGTCAACTAGATTTCCAACTCC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATTAGGAAGACAGAACAAACCCTTGGTCAACTAGATTTCCAACTCC  343

seq1  CTTTGCAGTGCCATGCAAAGTCTTGGCTTTTGTAGGAGCATATATAGAAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCAGTGCCATGCAAAGTCTTGGCTTTTGTAGGAGCATATATAGAAA  393

seq1  TTGTGCTAGCGAACAATAAACTCATCTTTAGCAATAAGTCATGGGGTAAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCTAGCGAACAATAAACTCATCTTTAGCAATAAGTCATGGGGTAAA  443

seq1  TAATGTACTGACTATAGTACTAGGGGGATGGCCAGTATTTTCAAAGTACT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTACTGACTATAGTACTAGGGGGATGGCCAGTATTTTCAAAGTACT  493

seq1  TGTGTTGAATCCACGGGGTTGAGTATAAACCCAAGCCTCCCTGCACAGTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTGAATCCACGGGGTTGAGTATAAACCCAAGCCTCCCTGCACAGTG  543

seq1  CATGATGGATCCTCACGATGGTCAAGGCATATTTGGATGTTTCAGTTAGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATGGATCCTCACGATGGTCAAGGCATATTTGGATGTTTCAGTTAGT  593

seq1  GTGTGTGAGTTTTAAAAGGGGAAAAGGTTGACCCCACTAAATGTTTCAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGAGTTTTAAAAGGGGAAAAGGTTGACCCCACTAAATGTTTCAAT  643

seq1  TTCCTTTTGTGATGTCCCTTTCCCCTGGAATGGTTGTGTTTGATGTCATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTTGTGATGTCCCTTTCCCCTGGAATGGTTGTGTTTGATGTCATA  693

seq1  AATACCTCAGGTTATTTTATATCAACAGCCAGCCCTCTTCTACTGTTCCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCTCAGGTTATTTTATATCAACAGCCAGCCCTCTTCTACTGTTCCA  743

seq1  TGTATGGACTGTCTGTCTTTGTCCCATGTGCCCAATGAGTTCTACAGGAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGGACTGTCTGTCTTTGTCCCATGTGCCCAATGAGTTCTACAGGAG  793

seq1  GATCTCTGCACGAGGATTTTGGACAACCTCAAATGATATAGTAGTTATAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTGCACGAGGATTTTGGACAACCTCAAATGATATAGTAGTTATAG  843

seq1  TTATTCTACCTTAGTATAAAAACCCAGGCTTGGATTAGGGGCTGCCTCCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTACCTTAGTATAAAAACCCAGGCTTGGATTAGGGGCTGCCTCCT  893

seq1  CAGACCCAGGCTGCTCCTGTCTCCACTCCTCATCAACTGGCCACAGTCCT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCCAGGCTGCTCCTGTCTCCACTCCTCATCAACTGGCCACAGTCCT  943

seq1  CATTCAAGACAGCTTCCTTGGTCATGTGATCATAGACAGGAAGTGATCAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCAAGACAGCTTCCTTGGTCATGTGATCATAGACAGGAAGTGATCAA  993

seq1  GGACTTGGTCATGTGATCATAGAGAGGAAGTGATCAAGGACTTGGTCATG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGGTCATGTGATCATAGAGAGGAAGTGATCAAGGACTTGGTCATG  1043

seq1  TGATCATAGAGAGGAAGTGATCAAGGACTGATGAACTTTTTCTTAATGGT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCATAGAGAGGAAGTGATCAAGGACTGATGAACTTTTTCTTAATGGT  1093

seq1  CTCTGAAGATTCTAAGGAATTC  1121
      ||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAAGATTCTAAGGAATTC  1115