BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-350K14
Chromosome6 (Build37)
Map Location 128,095,580 - 128,239,065
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043853, LOC667560, Tead4
Upstream geneCcnd2, Tpi-rs11, EG243642, LOC100043578, EG640703, LOC100043848, Parp11, Efcab4b, Prmt8, Tspan11, Tspan9
Downstream geneLOC652986, Tulp3, 5930416I19Rik, Foxm1, Nrip2, Itfg2, Fkbp4, EG667598, Pzp, LOC384494, EG667610, BC048546, Klrb1a, EG545878, LOC677440, Clec2h, LOC100043863, LOC100043861, Klrb1c, LOC100043862, Klrb1d, LOC667706, Clec2i, Clec2g, LOC667715, BC064078, Clec2f, Klrb1f, Clec2e, Klrb1-ps1, Clec2d, Cd69
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-350K14.bB6Ng01-350K14.g
ACCGA131266GA131267
length8211,153
definitionB6Ng01-350K14.b B6Ng01-350K14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,095,580 - 128,096,400)(128,237,902 - 128,239,065)
sequence
gaattccactatgtttcagaaacagtgaaggataactgtatattgagcta
gatacacatacaggaagttcatccaagttctgggggcacattacatccac
tgctcttgccctggcatggcttttaataattctgcttttgctctcaggat
accctaatttgcacaataaattatatgccactttaactatgaccacaggc
gatactcggaacagctcctcccagccccgaatgccaatgatatttctggc
ttttctgggtctcccagagtttcgtaagatagaaagttggtttatcccct
taaaattaccataccaaatcaaaaatgataataagcaaaaagtacatttg
cagccagccgccccaagtcaagggacagtggctgatggatggtgccacct
catgggaagaattggtcctgcaaggacactgagtttcctgtagactgtga
cagctaacatctaccaagagcttgtgtgccaccactgtctccacaacaac
ctctaccatcccatcattctatagaaagggagattgagcctcagaaagcc
agggaattcctctcaggccattcaaacggcaacaaagactaagcgaggag
gccggggaggtgacttaattgataaaatgttttactaagtatgaggacct
gaacgtaatacgtccgttggtaatcccccagtaaggagctctgacaggag
gatagtggggactcactagacagtggggcaaactccagaccctaactcaa
caaagaagatggaaaagaataggaaaagacaccacactgacctggggggt
ggggcggggggagaggatgat
gaattcacatctccatgcagagacagacgctcatacactgtatttgaacc
tgccaccctggtttccaggatgcactgttttgcgattctacttagcaaca
cgtgagtgtgttccacgttcagcctcccagcagggtgttgctgctattta
tttgttctatgtgtatgctgtaccacttgtgtgtctgctgcccacggggg
ccagaagttgcataagatcctgggttgggcagtagttgcgcagagagaga
ggcaggtaacctggcttacagggcaagttctaggacagctagggctacac
aaagaaaaccttgccacaacagcagcagcagcaacagcaacaacaacaac
aacaaaacagacagaaaaaaatcctttgggaattgcagttaaaggtggtt
gtgagccacctcatgggtgctaggaacaggagctgggtccctgtaagaag
agccagtgctcttaactgctgagctgtctttccagccatgttttatattt
tctaatggttaatgatgttgaacatctcatttgattataactcatttgcg
tataactatagtgaagggtctgtctgatctttttaagatttatttattta
tttttgtgtgtctccgtctgtgtaccatacgtgtgcttggtgccccctag
gaggtgggaagccgccatgtgggtgctgtggatggaacctgggtggtcta
tagagaagaggtagaacagtgctacccctccccctcccccatcgtcaacc
ccaccatcacccgtgaacgactgctcctggctttagcacccgctgtagaa
cccactttcagaggaagaggctcaggttccggtgggcatcctctctggct
gggccagtgttaggtacctggtctttcatgcatggtgggtcaggcaaatc
tatctccacccagaaaaaaaacaaagctattgccccagccctgcacctca
gccatttacatggcctttatttccaatggatgaccatttgttctgatggg
gaggtggggtgcttgccagcttcagggtgctgggggtgttggctgagacc
tcagtggggactcatggggtgagtttctggtcagatgcttcatctgattg
tacttgctcagtctctgtctcttccagtccttggctctcagaatgttcta
tgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_128095580_128096400
seq2: B6Ng01-350K14.b_50_870

seq1  GAATTCCACTATGTTTCAGAAACAGTGAAGGATAACTGTATATTGAGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACTATGTTTCAGAAACAGTGAAGGATAACTGTATATTGAGCTA  50

seq1  GATACACATACAGGAAGTTCATCCAAGTTCTGGGGGCACATTACATCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACACATACAGGAAGTTCATCCAAGTTCTGGGGGCACATTACATCCAC  100

seq1  TGCTCTTGCCCTGGCATGGCTTTTAATAATTCTGCTTTTGCTCTCAGGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTGCCCTGGCATGGCTTTTAATAATTCTGCTTTTGCTCTCAGGAT  150

seq1  ACCCTAATTTGCACAATAAATTATATGCCACTTTAACTATGACCACAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTAATTTGCACAATAAATTATATGCCACTTTAACTATGACCACAGGC  200

seq1  GATACTCGGAACAGCTCCTCCCAGCCCCGAATGCCAATGATATTTCTGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTCGGAACAGCTCCTCCCAGCCCCGAATGCCAATGATATTTCTGGC  250

seq1  TTTTCTGGGTCTCCCAGAGTTTCGTAAGATAGAAAGTTGGTTTATCCCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGGGTCTCCCAGAGTTTCGTAAGATAGAAAGTTGGTTTATCCCCT  300

seq1  TAAAATTACCATACCAAATCAAAAATGATAATAAGCAAAAAGTACATTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTACCATACCAAATCAAAAATGATAATAAGCAAAAAGTACATTTG  350

seq1  CAGCCAGCCGCCCCAAGTCAAGGGACAGTGGCTGATGGATGGTGCCACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGCCGCCCCAAGTCAAGGGACAGTGGCTGATGGATGGTGCCACCT  400

seq1  CATGGGAAGAATTGGTCCTGCAAGGACACTGAGTTTCCTGTAGACTGTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGGAAGAATTGGTCCTGCAAGGACACTGAGTTTCCTGTAGACTGTGA  450

seq1  CAGCTAACATCTACCAAGAGCTTGTGTGCCACCACTGTCTCCACAACAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAACATCTACCAAGAGCTTGTGTGCCACCACTGTCTCCACAACAAC  500

seq1  CTCTACCATCCCATCATTCTATAGAAAGGGAGATTGAGCCTCAGAAAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACCATCCCATCATTCTATAGAAAGGGAGATTGAGCCTCAGAAAGCC  550

seq1  AGGGAATTCCTCTCAGGCCATTCAAACGGCAACAAAGACTAAGCGAGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAATTCCTCTCAGGCCATTCAAACGGCAACAAAGACTAAGCGAGGAG  600

seq1  GCCGGGGAGGTGACTTAATTGATAAAATGTTTTACTAAGTATGAGGACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGGGAGGTGACTTAATTGATAAAATGTTTTACTAAGTATGAGGACCT  650

seq1  GAACGTAATACGTCCGTTGGTAATCCCCCAGTAAGGAGCTCTGACAGGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTAATACGTCCGTTGGTAATCCCCCAGTAAGGAGCTCTGACAGGAG  700

seq1  GATAGTGGGGACTCACTAGACAGTGGGGCAAACTCCAGACCCTAACTCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGTGGGGACTCACTAGACAGTGGGGCAAACTCCAGACCCTAACTCAA  750

seq1  CAAAGAAGATGGAAAAGAATAGGAAAAGACACCACACTGACCTGGGGGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAGATGGAAAAGAATAGGAAAAGACACCACACTGACCTGGGGGGT  800

seq1  GGGGCGGGGGGAGAGGATGAT  821
      |||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCGGGGGGAGAGGATGAT  821

seq1: chr6_128237902_128239065
seq2: B6Ng01-350K14.g_70_1222 (reverse)

seq1  CCATAGAAATGTCTGAGAGCCAAGAGATGGGGAAGAAGACAGAGACACTG  50
      ||||||||   |||||||||||||   |  ||||| ||||||||||    
seq2  CCATAGAACATTCTGAGAGCCAAGGACT--GGAAG-AGACAGAGAC---T  44

seq1  GACCAAGGTTACCAAATCAGAGGAGCCACCCTGACCCAGAAAACTCACCC  100
      || ||||  |||  ||||||| ||  ||  |||| |||| ||||||||||
seq2  GAGCAAG--TAC--AATCAGATGAAGCA-TCTGA-CCAG-AAACTCACCC  87

seq1  CACTGAGT-CCCACTGA-GTCTCAGCC-ACACCCCCAGCACCCCTGAAGG  147
      || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| 
seq2  CA-TGAGTCCCCACTGAGGTCTCAGCCAACACCCCCAGCA-CCCTGAAG-  134

seq1  CCTGCCAAGCACCCCACCTCCCATTCCAGAACAAATGGTCATTCCATTTG  197
       ||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||
seq2  -CTGGCAAGCACCCCACCTCCCCAT-CAGAACAAATGGTCA-TCCA-TTG  180

seq1  GAAAT-AAGGCCATGTAAATGGCTGAGGTGCA-GGCTGGGGCAATAGCTT  245
      ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAAATAAAGGCCATGTAAATGGCTGAGGTGCAGGGCTGGGGCAATAGCTT  230

seq1  TG-TTTTTTTCTGGGTGGAGATAGATTTGCCTGACCCACCATGCATGAAA  294
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTTTTCTGGGTGGAGATAGATTTGCCTGACCCACCATGCATGAAA  280

seq1  GACCAGGTACCTAACACTGG-CCAGCCAGAGAGGATGCCCACCGGAACCT  343
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGGTACCTAACACTGGCCCAGCCAGAGAGGATGCCCACCGGAACCT  330

seq1  GAGCCTCTTCCTCTG-AAGTGGGTTCTACAGCGGGTGCT-AAGCCAGGAG  391
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAGCCTCTTCCTCTGAAAGTGGGTTCTACAGCGGGTGCTAAAGCCAGGAG  380

seq1  CAGTCGTTCACGGGTGATGGTGGGGTTGACGATGGGGGAGGGGGAGGGGT  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCGTTCACGGGTGATGGTGGGGTTGACGATGGGGGAGGGGGAGGGGT  430

seq1  AGCACTGTTCTACCTCTTCTCTATAGACCACCCAGGTTCCATCCACAGCA  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTGTTCTACCTCTTCTCTATAGACCACCCAGGTTCCATCCACAGCA  480

seq1  CCCACATGGCGGCTTCCCACCTCCTAGGGGGCACCAAGCACACGTATGGT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACATGGCGGCTTCCCACCTCCTAGGGGGCACCAAGCACACGTATGGT  530

seq1  ACACAGACGGAGACACACAAAAATAAATAAATAAATCTTAAAAAGATCAG  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGACGGAGACACACAAAAATAAATAAATAAATCTTAAAAAGATCAG  580

seq1  ACAGACCCTTCACTATAGTTATACGCAAATGAGTTATAATCAAATGAGAT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCCTTCACTATAGTTATACGCAAATGAGTTATAATCAAATGAGAT  630

seq1  GTTCAACATCATTAACCATTAGAAAATATAAAACATGGCTGGAAAGACAG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAACATCATTAACCATTAGAAAATATAAAACATGGCTGGAAAGACAG  680

seq1  CTCAGCAGTTAAGAGCACTGGCTCTTCTTACAGGGACCCAGCTCCTGTTC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCAGTTAAGAGCACTGGCTCTTCTTACAGGGACCCAGCTCCTGTTC  730

seq1  CTAGCACCCATGAGGTGGCTCACAACCACCTTTAACTGCAATTCCCAAAG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCACCCATGAGGTGGCTCACAACCACCTTTAACTGCAATTCCCAAAG  780

seq1  GATTTTTTTCTGTCTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGCTGCT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTTTCTGTCTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGCTGCT  830

seq1  GCTGTTGTGGCAAGGTTTTCTTTGTGTAGCCCTAGCTGTCCTAGAACTTG  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTGTGGCAAGGTTTTCTTTGTGTAGCCCTAGCTGTCCTAGAACTTG  880

seq1  CCCTGTAAGCCAGGTTACCTGCCTCTCTCTCTGCGCAACTACTGCCCAAC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTAAGCCAGGTTACCTGCCTCTCTCTCTGCGCAACTACTGCCCAAC  930

seq1  CCAGGATCTTATGCAACTTCTGGCCCCCGTGGGCAGCAGACACACAAGTG  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATCTTATGCAACTTCTGGCCCCCGTGGGCAGCAGACACACAAGTG  980

seq1  GTACAGCATACACATAGAACAAATAAATAGCAGCAACACCCTGCTGGGAG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGCATACACATAGAACAAATAAATAGCAGCAACACCCTGCTGGGAG  1030

seq1  GCTGAACGTGGAACACACTCACGTGTTGCTAAGTAGAATCGCAAAACAGT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAACGTGGAACACACTCACGTGTTGCTAAGTAGAATCGCAAAACAGT  1080

seq1  GCATCCTGGAAACCAGGGTGGCAGGTTCAAATACAGTGTATGAGCGTCTG  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCTGGAAACCAGGGTGGCAGGTTCAAATACAGTGTATGAGCGTCTG  1130

seq1  TCTCTGCATGGAGATGTGAATTC  1164
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCATGGAGATGTGAATTC  1153