BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-056G18.T7 (MSMg01no056_g18.b1) | MSMg01-056G18.TJ (MSMg01no056_g18.g1) |
ACC | AG283836 | AG283837 |
length | 720 | 709 |
length of high quality (start - end) | 290 (60 - 349) | 602 (73 - 674) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no056_g18.b1 PHD_FILE: MSMg01no056_g18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:58:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no056_g18.g1 PHD_FILE: MSMg01no056_g18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:58:05 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAGTAA
TACACACCAAAAATAAAATGAGGGGAAAAAAATCAAAGGTGAGTGGAAAA
TCCACCAGAGATCCAGAAGTCATTAAAAAAAATTAAACAGAATTCTTAGA
GCTAAAACTTCAGCGAATGAAATAAGAAACACAAGGAGAGCTTCCAAGAT
AGGCCACACCAAGGAAGAGAAAGAAATTCTGAACCAGAAGATGGATCTTT
TAAATTATCCAGTTATTGAGACAAAGGGCAAAGAAGAAAACAGAATGAAG
AAGCTACCAGACTTATGACCCATTACGAAGCAAACTGGTATTTCAGTGCT
GGAATTCCAGAGGCCACAAAAAGGAGGAAAGTCTCCAAGAAACGATCTTC
ATGAACCAAACACCCAAACATTCCAAAACTCCAAATACAAATGCACATTT
AGATGTAAGATGCTTAAAGGACCAACTAGGTCCAACCAAAGCAGACAATA
TATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACA
CATACCTACCTATTATCGTACAATATCATAAAAATAATCTCAATACTATA
AAGCAGAGGATATTATCTTCCATATAATTATAACTTTCTTTTATGACTTT
ATGTTCCCAATAATTCCCTCGGATGAAATCTGGGGAACGACCTATGTCCA
ATAGGTCCCTTGTATTTGTG
| NACAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXTTTACACACGGAATTCAGTTCTTAGGCTTTTGGAATCCT
TAACAGAGCGTATGGTTTTGTGAATGATCTTACATAATTTTTGTTTTTTT
CCTCATCAAACACTTGTTCCTCTGTTCTTTAGCAGGGATGTTTTCCTTAA
AAGCCAGTTAGAAAATATAATTGTTCTTGAATTATTTAAAGTTCCCTTGC
TAACTTTTCATTTTATTCTTTGAACATCTTTAACAAAAATAAAAATTGTC
CCCAAATATTAATTAATGGAGTACATGCCTAGTATGCATGAGGCTCTGGA
TGCAATCTCCATCCTCTTAAGGAAAAAAAATGATATTTTTCCCCTTCTGG
CTGTACGAATATTTTTCATGTGTTTAAGAGATCTTTTGTGTGAAAGTTTG
TGGTGAGATTTTAAGGAATTAGGATTTTAAGGTGCTCTGTTAAGGAGTTC
ATTTCTTTTAAAATATCTCTTTTTTTTTGGCTTTTTTTTTTCCTAGTGCT
TGCAGGGAGGAGGGTGTCAAACCTAAGGTCTTAATGCATGCAATGTATAT
ACTTTACCAATTGATCTCTACCCTTAATATGTATTTTTAATAATTTAACT
GGTCAAATAATTGTATATACTTCTAAGGTAAGGTATGTTTCAATTCATGT
GCGTTATAT
|
quality values | Open.Hide.11 11 23 23 37 25 24 25 26 26 33 43 43 43 59 31 31 31 28 17 13 8 8 8 8 8 14 28 37 37 31 31 31 31 30 35 47 57 53 36 31 31 33 31 31 22 21 11 9 9
9 10 9 9 9 15 15 20 19 19 18 30 37 37 37 37 36 36 38 36 36 57 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 48 48 48 50 59 57 48 48 57 57 59 59 59 59 53 53 53
53 41 41 37 37 37 23 18 11 11 11 12 12 23 23 37 37 47 50 48 48 48 48 57 57 57 57 59 59 53 53 53 50 50 50 57 53 48 48 48 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57
57 59 59 59 57 57 57 50 53 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 57 50 50 50 50 59 57 57 57 57 52 52 52 52 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 59
59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 57 48 48 48 48 57 57 59 59 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 54
54 57 57 57 57 44 34 24 13 12 12 18 21 40 42 54 59 59 68 68 68 50 50 50 50 50 57 59 59 59 48 48 48 48 57 39 43 39 43 41 41 37 47 47 41 36 18 10 10 8
8 8 9 15 18 28 28 14 12 12 12 12 12 13 12 15 13 15 15 28 32 39 47 47 57 57 48 57 57 59 54 54 57 54 54 54 57 57 57 59 54 54 54 57 59 57 57 57 57 48
48 48 57 57 57 57 57 47 47 39 42 37 39 36 37 35 42 44 57 48 48 46 57 57 57 57 54 57 57 42 40 32 28 28 32 32 43 29 42 42 50 59 59 57 57 43 50 43 43 43
44 59 59 59 59 59 50 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 50 50 50 37 37 43 43 43 43 44 43 44 43 43 44 44 59 59 48 48
48 48 57 57 57 57 57 47 57 47 46 46 39 39 42 35 35 41 41 35 30 30 32 44 42 42 36 28 22 22 22 22 28 26 26 25 25 25 44 36 30 30 41 24 22 13 12 12 12 12
21 20 18 18 12 12 10 10 16 19 12 10 12 10 15 11 11 10 10 9 9 9 10 10 10 12 11 11 11 13 15 10 11 9 10 8 8 8 8 9 13 12 12 10 10 8 8 8 8 10
10 10 8 7 7 8 8 16 10 10 10 9 9 13 12 11 13 12 11 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 13 16 15 11 11 10 11 10 10 10
10 10 9 9 10 9 9 9 9 10 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 12 10 10 11 11 11 11 11 11 12 18 13 17 10 11 8 8 8 8 8 11 7 6
8 8 10 10 10 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 8 12 23 15 8 8 8 8 13 23 29 22 23 28 26 28 37 32 33 41 40 40 40 40 40 41 41 27 23 9 10 10 10 8 9 9 9 9 12 10 16 14 22 15 25 30 44
53 53 44 44 37 37 42 28 23 12 9 10 10 10 10 9 9 9 11 11 12 11 15 25 28 30 30 31 31 36 47 48 57 57 48 48 48 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 50 54 59
68 50 50 50 48 48 48 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 48 48 39 35 39 39 46 43 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 68 68 59 59 57 59
59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 57 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 59 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 43 39 20 20 13 16 16 21 23 43 43 44 44 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 54 54 54 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 57 57 57 57 52
57 59 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 43 43 43 43 29 43 35 43 43 57 57 57 59 59 59 43 35 34 43 43 57 57 43 43 35 35 43 43
43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54 54 50 50 50 50 50 47 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 48 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 59
57 57 57 59 59 59 54 54 54 54 54 48 57 48 48 48 48 54 57 59 54 57 54 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 48 48 59 57 57 57 57 48 47 39 39 30 37 37 48 41 46
59 47 47 36 35 31 31 39 35 35 36 37 37 18 17 13 16 21 23 37 41 41 47 37 59 35 29 29 32 37 37 37 37 37 41 41 41 41 59 59 59 59 37 37 28 28 28 36 34 46
46 48 42 42 47 43 43 42 42 34 36 39 43 43 43 39 39 36 39 36 36 36 37 37 32 31 19 24 15 24 14 24 24 37 47 48 48 48 48 41 41 40 39 39 39 39 31 31 35 32
22 14 17 10 11 11 21 25 37 37 37 37 37 30 30 32 32 39 33 28 24 24 20 24 28 28 22 22 24 16 15 15 18 23 34 33 30 30 30 18 18 20 19 18 22 23 18 18 12 9
9 9 9 14 18 11 12 12 12 |