BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-079C15.T7 (MSMg01no079_c15.b1) | MSMg01-079C15.TJ (MSMg01no079_c15.g1) |
ACC | AG300312 | AG300313 |
length | 689 | 684 |
length of high quality (start - end) | 337 (66 - 402) | 535 (58 - 592) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_c15.b1 PHD_FILE: MSMg01no079_c15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:27:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_c15.g1 PHD_FILE: MSMg01no079_c15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:27:43 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (85,355,855 - 85,356,171) | (85,215,882 - 85,216,412) |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCACTTTGTCGATCAGACAGGCCTTGAACTCACAGAGATCTGCCTGTCT
CTGCTGGGATTAAAGGCTTGTGCCACCATGTTCAGCTCCTTACCTCCTCT
TGAAGACTTTAGCTGGTCAAGGTCCAAAATGCCTTATTTCTGATGGAAAA
GGAGATCTGGGTCCAGAGTCTCTGTAGAGGTAGAACAGGAGCTGAAGACA
GGGCCCTGCCTCCCAGAAGCACCTCTGTCTGCCCTTGGGCCGCCGCAGTC
AGTGGTCATGTGGTATGAGTTCAGGGAGATGCAATTTCTGGGTCTCACGA
TCCTCTCATGGCCACTAGCTCCAAGGAGTGGAGCAGCATACAGATGAGCG
GGTCAGAGCGACCGTGTGGTGTCTCCTGAATGCATTAGGGTTGTTTGTGT
CTTCGGCTGGCGGTGTGTATGGATTCTGTTAGGTGAGTGTAGGCTTCTAA
GAGTACTGCCTTTGGGACACAGATCTGGGGACTTTGGTGCGCATGTAGTA
TGTCCTGAATTGTCTAATTTTGTCATGTTTGTCATGTTTGTGGAAGGTGA
GGGGAACTCATGTCTGAGCACCTTGCATATATTGTGTATTGTCTAGGAAT
ATACTCATGTTTCTAGATAGGCTAAAGTTTACATGAGGA
| ATGAAGTGTTAGGCTGGCGGCGCCTTTCAAACACTTTAGGTGACCTATAG
ATTCACCCGCGGAATTCCTGAGCCACATGCTCAGTGGGAAGGTACCAGGG
CGAGGACCTTTCCACTCAAGCCCTTCCCTGTGCTGCGCCCTCCTCCCAGG
TCCTTCTGCTTCATCAGAGCATCTCTAGGAAGGGAAAGGCTGTTGATGCA
CCTGAGCCAGGGAGGCTCTAAACTCCTCTTGCATTACAGAGCAAAAGGGT
GGGGAGGGAGCCCTCTCCCCTCCCGGGAGCTCAGGCCTCAGCCCAGCAGA
GCCAAGCTGCCCCGATTTATCTGACTCTCAAACCAAGTTCCATTGGGGGT
TGCAAGTCTACCGGACAGATTGGCAGTTTCTCCACAGTGAGCCGTCTACA
CAGGCCTGGCTGCATATGGCTTCTAACTGGCAGCAAGGCATTCAGGGAAC
GAATAAGATACCAGGCACAAAAAGGGATGCCCCACTTTCACTTGGAGGTG
GCTTGGTCTACGTGGGAGTAAAATAAAAGGAGCTGTGTGAGGACAGCCCC
AAAGCTCTGCTTTAGAACCACAGCCATGGCAATGACTGGGTAGGATGAAT
GGCTTCCTATCACACAGTGTGTACAGTTGCATTTAGTGATGTACAAGATA
AGGGAAGGGGTGTAATCAAAAGATTTGTACATGT
|
quality values | Open.Hide. 7 8 8 9 9 9 9 23 28 25 17 15 16 12 14 21 15 8 8 8 17 19 39 25 23 10 9 9 7 6 6 6 6 6 8 12 22 27 20 24 24 24 24 29 36 36 50 36 36 33
31 31 31 28 25 23 23 15 7 7 7 7 7 13 19 20 25 28 28 31 31 31 47 48 57 57 57 57 57 37 37 37 37 37 37 37 37 50 50 47 47 47 48 48 48 54 54 68 68 68
68 68 68 57 57 57 50 50 68 68 68 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 51 50 48 46 46 46 46 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68
57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 57 68 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 45 45 45 57 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 43 43 35 35 35
43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 39 39 35 35 35 43 43 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 47 62 52 52 43 43 43 52 52
62 62 52 52 52 62 62 62 62 44 39 28 14 14 14 38 38 35 35 43 43 52 43 43 43 43 35 43 43 47 43 39 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 43 43 43 43 43 41 39 39 57 57 57 52 43 43 43 43 31 43 43 43 43 52 47 43 35 20 19 19 19 18 24 32 43 43 43 42 43 35 36 38 38 20 20 18 18
24 10 10 10 15 24 28 26 15 18 12 11 11 12 12 13 24 32 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 59 50 37 35 32 32 20 20 27 41 33 31 35 35 35 43 43 43 44 50
50 50 50 37 37 37 42 25 25 13 13 24 32 44 57 57 57 57 57 59 48 48 44 57 42 42 37 30 28 36 17 19 17 20 20 32 25 28 25 25 36 28 30 30 36 37 36 28 23 14
23 23 32 32 26 30 25 28 28 37 40 43 34 31 23 20 20 23 23 23 24 20 20 24 32 28 23 20 15 15 13 18 19 20 23 17 12 10 10 10 10 17 18 30 21 26 16 16 11 11
15 22 24 36 39 39 39 39 32 32 23 16 16 30 30 32 32 28 32 37 43 37 39 39 36 35 33 33 28 28 24 23 23 19 19 22 15 15 15 15 18 10 10 13 10 10 11 19 25 15
11 12 11 12 10 9 9 9 10 10 16 12 12 12 18 11 11 8 8 8 8 8 12 15 9 9 9 13 19 12 11 11 11 8 8 8 8 6 6 8 8 9 11 16 13 15 17 23 27 23
24 12 12 12 15 12 8 8 9 8 8 8 8 8 9 10 10 10 13 10 10 8 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 12 11 11 | Open.Hide. 7 10 6 6 8 8 17 7 9 9 8 8 9 14 22 22 28 23 10 10 10 22 16 19 9 12 13 12 8 7 6 6 8 8 10 12 14 13 19 27 21 21 11 11 11 26 21 27 21 12
9 12 6 6 6 6 10 19 19 37 30 28 33 33 33 36 36 53 53 53 53 35 37 36 36 36 40 47 47 47 47 40 40 36 40 54 54 54 54 48 48 48 42 42 41 47 47 47 48 48
68 54 57 57 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50
68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 51 51 50 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57
57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 52 52 57 52 57 57 59 57 57 57 57 54 54 54 57 57 54 57 57 57 57
57 57 57 57 57 43 41 21 28 16 20 27 27 27 36 43 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 54 54 48 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 44 59 39 39 39 43 43
48 57 57 57 48 43 43 43 43 43 46 46 43 43 47 48 54 54 57 57 57 43 43 43 43 43 43 59 59 59 57 47 47 47 40 39 40 39 39 39 37 37 37 43 43 43 43 30 29 18
15 23 18 12 12 12 12 12 15 24 30 39 37 37 30 30 30 37 37 37 37 33 33 33 39 39 39 43 43 36 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 47 43 43 43 43 43 43 43 43
48 48 48 39 39 35 39 59 57 57 57 57 48 59 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 44 44 46 44 48 48 57 57 44 44 43 44 42 42 35 35 32 32 28 33 35 43 33 32 30
30 32 32 37 42 33 32 27 36 36 36 36 42 35 33 33 42 42 30 42 35 33 35 35 33 30 32 32 32 42 42 37 30 30 23 19 19 19 19 21 21 30 28 21 21 25 19 23 31 28
28 24 18 18 18 23 29 31 32 28 22 19 19 12 10 10 19 21 17 28 28 33 29 29 20 19 19 24 20 23 28 28 28 25 28 28 25 22 22 24 24 24 25 19 25 18 13 17 16 15
16 20 18 18 26 16 17 10 10 10 17 13 23 20 24 24 19 15 8 8 8 10 10 10 14 12 12 14 15 14 11 12 12 10 8 8 10 10 11 13 8 6 6 6 6 8 8 10 18 18
18 16 14 14 14 16 24 20 14 16 12 10 10 10 10 15 15 15 15 19 11 11 10 10 11 14 12 10 15 12 13 19 11 11 |