BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-079M03.T7 (MSMg01no079_m03.b1) | MSMg01-079M03.TJ (MSMg01no079_m03.g1) |
ACC | AG300762 | AG300763 |
length | 701 | 702 |
length of high quality (start - end) | 648 (46 - 693) | 629 (74 - 702) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_m03.b1 PHD_FILE: MSMg01no079_m03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:28:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no079_m03.g1 PHD_FILE: MSMg01no079_m03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:28:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | TCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCACTTTGTACACCAGGCAGGCCTTGAACTCAGAAATCTGCCTGCCT
CTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCACCACCACAGCCGGCTAA
AATACAATTTCTTATTAAAATATGCATTAACAAAGAAATTTAGTGTAAAT
TTATTTAGGTAATGAATATCACTAACACTGTTATTATTTTTGTGGAATAT
CTTTTACTATTGTATATAAAGTTAAGATGGAAAATGAAGGCAGGTGTGTT
GGCACCCACTTATCACACTTGTGATCCCAGCACTTTCTTTCTCCCTTCCT
TTTTTTTTTTGCTTTCACAATAGTTATTTCTGATGAAGTTACAAAATAGA
CACAAAATACCTATTTTAAAAGTAAAGGTAATTACTTAGAAAAATAAATA
AAGCACTAATGTTTTAAAAATCCAACATAAACTTTTATGTGAGGAATATT
TTAAGTTGTTTCAGAGGGTAACCAAGACTACCTTGTGCACAGTATTTTTG
ATGGAGACCAACACGGAATGCTGTTCTATAATCAGCCCAGAGCACACTGG
CCCATATCCATCCAGACTGGCTTTACAGAATACCTATTTGATACACTCTG
ATGAGGAAAATGGAGTGAATTTCAATGCAGTTGCTGCTATCACATGTGCT
C
| ATTGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAG
AAGCACTTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAAT
CAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCA
AAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACA
CTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATC
AGTCTGGAGGTTTTTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAG
CAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAG
GACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAG
CTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGT
GGTACATCTACATAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTT
ATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGA
GGTAACACATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTATTCACTGATAAGTG
GATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTGCTA
AA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 7 6 10 25 37 37 33 23 23 20 19 16 22 19 15 8 8 8 21 21 40 24 18 11 10 17 11 13 13 10 11 11 16 17 30 33 28 28 31 31 35 35 47 47 47 36
36 36 35 31 31 28 28 28 37 32 22 13 12 12 12 21 22 25 28 28 33 37 44 47 48 48 57 57 57 50 50 37 37 37 36 37 37 48 48 42 42 42 48 48 48 54 54 54 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 47 41 41 47 48 48 51 68 51 50 46 46 46 50 50 50 48 57 57 57 57 47 54 57 57 57 48 48 48 57 57 57 59 57
68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 54 54 46 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 39 39 57 57 44 57 35 35 35
57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 57 54 38 38 21 29 41 44 43 54 57 57 57 52 52 52 52
52 52 52 52 52 52 57 48 50 50 48 50 50 57 57 54 54 54 57 57 57 57 43 43 43 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 47 47 47 47 47 57 57 57 57
57 57 57 54 54 54 57 57 44 44 40 36 25 31 34 43 46 54 54 57 59 48 43 43 43 48 43 48 48 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 47 59 47 48 59 59 59 59 59 59 47
41 41 31 32 35 39 37 39 39 39 39 35 32 28 33 33 43 43 57 48 48 48 48 47 47 46 43 48 48 43 43 37 37 28 37 37 43 43 28 28 23 23 23 36 36 39 37 37 29 29
22 18 27 22 28 28 37 37 36 36 33 37 30 30 32 35 37 37 31 36 43 39 39 33 33 28 28 25 22 19 22 22 34 34 41 40 42 48 43 43 36 28 28 32 32 31 31 26 36 39
37 31 30 24 24 24 30 34 37 37 32 31 24 23 25 25 21 19 17 15 15 12 11 11 15 27 28 30 28 30 29 31 31 34 37 31 31 23 16 12 9 9 9 14 21 22 18 18 11 11
11 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 8 15 7 7 7 8 10 17 20 31 33 33 43 43 36 36 33 33 33 33 23 25 15 19 18 12 12 11 15 15 12 12 13 23 21 33 29 35 35 35 36 36 36 43
43 50 43 43 50 47 27 21 17 11 16 15 20 29 24 48 42 42 42 42 48 50 43 43 41 41 41 41 47 47 47 57 50 50 50 50 47 47 57 57 57 57 57 48 48 48 50 50 48 57
57 57 47 47 47 47 57 57 57 68 68 68 57 48 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 54 50 57 57 50 50 50 50 50 50 43 50 50 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57
52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 45 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 41 46 52 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 57 57 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 43 43 47 59 62 62 62 62 62
43 62 39 43 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 39 43 43 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 57 57 57 57 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 43 57 57 59 59 54 54 54 59 57
68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 54 54 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 47 43
43 46 57 57 57 59 59 57 57 57 54 44 44 44 44 57 57 44 59 54 54 48 44 43 37 43 43 54 57 57 59 54 54 54 54 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 48 43
43 43 43 36 39 37 43 43 37 37 37 41 47 59 43 44 37 41 43 59 47 41 46 46 46 48 43 43 37 43 43 43 43 48 59 46 47 47 59 44 37 31 32 37 37 37 47 47 47 47
44 39 39 31 31 37 37 37 39 39 39 47 47 41 41 32 32 37 37 26 29 32 37 33 32 30 25 24 27 34 34 28 28 28 37 34 34 32 30 30 32 39 43 47 39 48 46 39 39 39
39 36 43 43 43 43 43 39 43 32 32 17 17 19 24 24 37 39 32 32 32 32 33 31 31 35 35 35 39 39 43 59 48 48 48 34 30 24 14 14 17 27 32 37 37 37 32 37 36 19
21 15 19 19 21 23 14 14 15 27 29 32 33 37 28 22 29 32 36 33 31 28 24 30 17 19 19 30 37 37 35 39 39 39 39 25 28 12 18 18 34 34 41 37 32 32 32 32 27 24
24 24 |