BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106F02.T7 (MSMg01no106_f02.b1) | MSMg01-106F02.TJ (MSMg01no106_f02.g1) |
ACC | AG320438 | AG320439 |
length | 1,226 | 1,227 |
length of high quality (start - end) | 564 (127 - 690) | 278 (139 - 416) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_f02.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_f02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:06:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_f02.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_f02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:06:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NCCAATTCTTNNNNAACATTGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCAAGGTATTGATTTCTCCCTTTAATTACAGTTATGGGCAGTT
GCTTTAATAGTGATGCCTTGATTTAGCATAAATATCTTTTAAAATAAACT
GATTTCCATATTCACTGAAAATTTACTGATTATTCCTGAATTTTCTTTTA
TAAATGGACCCAGGAACAAATGGAAAACTACATGTGACTAAGTATGATAT
CACATCCCTCAGCACTGTGTTTGATGACAAAACTCAGTTGAGATGCTCAG
TGTTGAGCTGGCATTTGAGAAGAATGAATTATAGATTATTAACATGGAAA
AGAGCTTGAAGTTCATCTGTTACTTTGGTTGTGGAAGAGATCGGTTCTCA
TTAAGATTACTAACATGCCTAGGAATGTGTTTGGTTTATGCTTCAAGAAG
CACACAAGCATCTCTTGGAGAAGCCCTTCTCACTCCTCTTTCCAACCAAT
TATTTCTTTATTCACTTGCATTACTGTAATGGTGTTCTCTATGGTTGACC
AAAAACTATGCTTAATTTCCAAAAATTTTAATGTATTTTCTCTCCCACTA
AACTGTGAGTATCTCAGGACTGAATGCTGCCTGCTTCTGCCTTCCTGATC
TTTTTATTTTGTTCATGTTCAAAGGGCTTTAGTGTATGTATTTTAAGTAC
CATTATCTGAGCTCTTCAGAGTCTATGGAATATTTTACTGTTATGGAAAT
GAATACTGAGTTCTTTGAAGGACCACTAAGTTTGCTTCCTTATGTAAAAA
AAGAATTGTGCATTTACCCTGTTCCTGAGAAACTATCATATTTGTTTTTA
AGAAATGAACCAGTTCTGTGCCAATCCTCTTATTTTTTCCCCCTGGCAAA
TAATGAAGTTCTATTTCTGAACTTTTCTTACTTTTAAATGTGAAAAGGGG
GAATTTAGGCTAATTGGATGGTCCCTCAATTTTCCTAAGGAATTAACTCT
TTTAAAGTTTCACAACAAATTTGTTTGAATACCCATTAAACCTATGGGGG
TCTTATTTTTTTAAAATTTAAGCCTCATCCAAAATGGAATTTTATTCATA
ACATCCTCGGATTAATTGGGTGTCCATAAAAATATTAACCTCTTTTATAC
CTCTTTTTTCTTTAAACTAGAGTTGATATGCCCACGCCTTNTAATTACAC
CTTTACCCTCTCTCCAAAATGAAAAA
| NNTTCGAAACCACATNNAAAGATCGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGGACCTATAAAGAGCCCCCAGA
TTAGACCTTAGTACAAGGAGATCCCATTAAAAACCCCAACTCAAAGAAAA
AAACCACATGATCATCTCAGATGCTGAGAAAGCATTTGACAAAATCCAAC
ACTCATTCATGATAAAAGTCTTGGAAAGATCAGAAATTCAAGGCCCATAC
CTAAACATGATAAAAGCAATCTACAGCAAACCAGTAGCCAGCATCAAAGT
AAATGGTGAGAAGCTTGAAGCAATCCCACTAAAATCAGGGACTAGACAAG
GCTGCCCACTTTCTCCCTACCTATTCAACACAGTACTTGAAGTCCTAGCT
AGAGCAATTAGAAAACATTTTTAGATCAAGGGGATACAAATTGGAAAGGA
AGATGTCAAAATATCACTTTTTGCAGACGATATGATAGTATATATACGTG
ACCCTAAAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAGCCTGATAAACAGCTTCAGT
GAAGTAGCTGGATATAAAATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTA
CACAAAGGACAAACAGGCTGAGAAAGAAATTAGGGAAACAACACCCTTCT
CAATAGCCACAAATAATATAAAATATCTTGGTGTGACTCTAACCATGGAA
GTGCAAGATCTGTATGACAAGAACTTCATGTCTCTGAAGAAAGAAACTAA
AGAAGATCTCAGAAGATGCAAAGACCTCCCATGCTCATGGATCGGCAGGA
TCAATATAGTAACAATGGGTATCTTGCCAAAAGCAATCTACAGAATTCCA
TGTCATCCCCCATCCAAAATTCCAATTCAATTCTTCAACGAAATAAAAAG
GGCAACTCCCAAAATCCTTCTGCAATACCAAAACACCCAGGGAAAGCAAA
AACCTCTTCCCAGGGAAAAAAAAACCCCCGGGGGGAAAATCCCAGGGCCG
AACCTAAAGGCGGTATCTACAAAATCAATTGGGAAAAAAAATCGGATGGG
TACCGGGTAAAGTGGGCCGAACACCGAAACCTCAGGGAAAAACAAATTGT
GAAACCCCAAAAAATAACCCCCCACCCCCCCAATGGCCCTCTTGGAACTT
TGGACCAAAAAAACCTTAAAATCCCCTCCTCGGTGCAAAATAAAACAAGT
GATTTTTCAAACCAAGGCGGGAGCGGC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 6 6 6 8 3 0 0 0 0 3 8 8 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 19 21 28 23 24 24 24 30 33 37 37 37
37 37 37 25 24 19 19 12 9 9 21 21 31 31 31 31 33 50 50 37 25 21 10 10 10 11 11 15 16 12 12 10 10 18 13 11 12 15 18 29 30 47 47 57 57 47 50 36 42 38
38 36 35 35 35 36 31 31 31 30 28 30 21 19 13 10 10 13 13 13 12 21 18 22 12 19 15 25 25 33 34 36 42 42 42 42 53 47 47 53 53 47 47 47 47 47 47 47 68 68
68 68 68 68 68 50 43 43 43 43 43 48 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 57 59 59 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 45 45 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 33 34 29 24 11 11 11 24 33 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
57 57 44 57 43 43 35 35 27 38 26 43 43 52 28 34 24 35 35 47 47 57 43 52 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52
52 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 54 54 54 59 59 57 57 48 50 57 59 59 59 68 68 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57
57 59 59 54 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 59 59 54 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 48 34 30 19 26 30 32 34 18 18 20 32 32 47 40 40 40 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 57 48 48 48 48 48
48 59 59 50 50 50 50 50 47 48 48 50 50 42 42 41 41 37 37 32 26 26 30 34 28 23 23 26 28 25 13 13 28 28 37 37 29 23 18 18 22 23 22 19 16 14 22 22 30 21
21 10 11 11 19 19 33 23 23 35 22 23 19 17 28 17 13 18 18 28 28 22 28 31 31 25 20 17 17 15 21 28 37 37 39 39 36 28 28 30 20 17 10 10 8 8 8 11 12 19
30 24 24 27 28 23 22 26 16 14 12 14 14 16 16 19 15 12 13 8 8 9 11 11 11 10 10 10 13 15 14 19 10 10 9 10 10 10 10 10 12 15 12 28 23 32 18 19 9 11
13 10 11 8 10 10 10 12 12 13 16 16 18 16 15 17 23 12 10 10 13 8 8 8 8 9 9 12 12 12 23 16 19 11 11 11 12 14 14 14 23 15 12 8 8 8 17 8 9 9
9 17 12 16 13 14 12 12 10 9 9 9 9 9 9 12 18 14 15 17 9 8 8 8 8 8 8 8 8 19 18 22 20 18 25 22 18 14 11 14 9 8 8 11 11 11 11 11 18 16
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 10 9 9 9 9 15 15 10 9 9 9 17 13 20 23 16 16 9 9 8 11 8 8 8 8 8 8 11 10 11 11 19 10 10 10 8 8 8
8 10 10 8 11 8 8 8 8 8 9 9 8 9 12 8 10 11 13 10 11 10 11 15 15 15 11 10 9 10 15 9 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 12 8 8 6 6 8 8
9 8 11 8 8 10 13 15 9 8 8 7 7 7 9 10 8 10 12 12 11 9 9 12 10 15 11 12 11 11 11 11 15 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 11
13 13 12 11 11 12 12 19 15 10 10 10 10 11 10 8 8 8 8 10 10 9 9 11 11 11 11 11 13 16 16 16 14 18 10 10 10 12 16 15 24 15 15 10 8 8 8 10 8 11
8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 15 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 6 8 8 10 13 7 7 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 10
12 9 9 11 17 12 15 12 8 6 6 11 11 10 7 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 8 6 6 7 13 8 10 9 8 6 6 6 3 0 3 6 8 8 8 8 7 7 8
7 10 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 10 9 6 6 8 7 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 3 0 0 3 12 11 9 6 6 6 6 7 8 6 6 8 6 6 6 13 21 10 9 8 8 6 6 8 6 9 13 15 19 8 9 9
9 9 10 8 13 11 13 16 19 28 29 25 28 28 28 31 31 31 30 28 28 28 23 12 9 9 9 7 7 6 6 9 10 9 10 10 10 7 6 6 6 7 7 15 16 11 11 11 23 13
10 8 8 8 8 25 23 31 29 31 31 31 35 31 44 33 33 33 30 21 19 9 9 11 9 9 10 13 13 17 18 16 12 12 11 16 11 15 13 25 26 37 37 37 18 9 9 9 9 24
30 59 59 59 46 40 48 48 48 48 57 57 48 39 39 34 34 34 34 34 34 40 42 42 42 42 48 48 57 68 57 59 54 54 57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 44 44 39 37 43 37
39 35 42 42 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 50 50 50 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 44 43 37 43 52 57 57 57 59 59 59 57 57 57
57 57 52 43 43 44 43 54 59 59 59 59 52 52 52 59 59 59 59 59 57 59 57 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 57 68 57 57 57 57 46 46 37 43 43 44 57
57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 59 57 48 48 48 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 59 57 68 68 48 48 43 43 43 47 46 57 57 50 53
50 50 50 50 48 48 48 48 48 48 47 47 31 25 23 18 12 12 12 11 11 11 11 11 11 16 28 32 46 46 46 48 48 48 48 39 39 35 35 35 39 39 48 48 48 57 48 57 48 48
48 59 42 43 36 36 39 43 43 43 30 30 25 33 28 33 33 35 35 32 41 23 19 15 12 15 18 24 24 13 13 13 13 13 13 22 25 32 27 27 15 15 20 41 41 48 48 48 59 43
43 43 41 41 41 59 59 31 30 17 17 17 19 29 31 33 30 30 37 37 47 47 47 47 48 37 37 28 28 28 40 33 43 39 39 39 43 43 48 48 54 54 48 48 46 48 39 42 35 37
39 46 42 32 32 20 20 20 34 32 48 48 48 48 48 57 57 59 57 57 57 48 48 32 32 17 17 17 32 32 57 57 57 43 37 44 46 47 47 47 48 48 47 57 47 40 33 28 28 28
25 40 36 47 47 47 57 57 37 37 37 43 48 54 59 42 36 32 32 37 31 30 30 42 42 48 36 30 15 15 9 9 11 24 25 39 43 43 42 33 33 25 25 23 34 28 28 28 31 31
39 43 30 30 15 13 12 15 15 15 15 11 15 15 28 28 17 17 18 19 10 8 8 8 8 11 21 28 25 20 20 23 23 19 16 19 12 14 14 19 16 26 18 18 13 19 13 16 16 15
10 9 8 8 10 18 12 12 12 18 9 9 9 19 19 29 34 28 22 22 23 14 12 11 9 9 15 15 12 11 11 10 10 10 10 12 12 14 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 12
16 21 21 19 14 11 13 12 12 13 10 10 9 8 8 8 8 6 7 8 10 14 11 11 19 16 19 20 26 19 15 13 19 18 18 20 26 26 12 8 8 8 8 8 8 10 8 10 12 16
14 12 11 11 11 17 12 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 15 10 9 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 13 15 9 9 10
8 6 6 8 8 10 10 21 22 19 19 11 10 10 10 9 9 9 10 10 14 15 21 18 18 11 11 11 15 12 11 12 10 9 8 8 8 8 8 10 12 9 9 10 8 8 8 8 8 15
15 18 15 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 8 8 6 6 6 6 19 19 12 12 10 10 10 10 10 8 8 10 10 10 10 11 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10
9 9 8 8 8 8 8 8 10 15 16 14 14 14 11 9 11 11 16 17 28 19 15 11 10 10 10 10 13 11 11 10 10 12 15 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11
11 11 12 13 22 22 26 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 10 22 14 14 11 10 10 12 13 13 17 15 12 8 6 6 6 6 8 8 8 9 10
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 12 12 15 9 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 8 11 11 10 10 9 9 9 12 12 12 11 12 8 13 8 7 8 6 6
6 6 11 11 13 15 28 24 28 23 16 8 8 8 8 8 8 10 12 17 21 9 9 7 7 8 8 10 8 10 10 10 8 8 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 13 13 15 15
15 15 13 8 8 8 8 13 15 25 16 14 9 14 12 11 10 10 11 12 8 8 8 8 16 21 15 13 9 9 9 9 8 8 8 11 13 25 13 8 8 8 11 10 13 12 12 8 8 8
8 8 8 10 9 8 10 8 8 8 7 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 9 9 |