| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-111F22.T7 (MSMg01no111_f22.b1) | MSMg01-111F22.TJ (MSMg01no111_f22.g1) |
|---|
| ACC | AG324056 | AG324057 |
|---|
| length | 1,119 | 1,153 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 769 (78 - 846) | 381 (65 - 445) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_f22.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_f22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:15:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_f22.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_f22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:15:36 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NNNGGGCTATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTCAACTTAGGAATACCCTTTGGCTTACAAGCACCTGAAAAAGTGTTCAA
CATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAAATTTCAC
TTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAGGTTCAGGTGACAGCAGTTG
CTGGTAAGGATGTGGAGAAAGAGGGACACTCCTCCATTTTTGGTGGGATT
GCAAGCTGAGATAAACGCTCTGGAAATCAACCTGGTGGTTCCTCAGAAAA
TTGGACATAGTAGTACCTGAAGATCCGTCAATACCTCTCCTTGGCATATA
CCCAGAAGATGTTCCAACTTGTAATAAGGACACATGCTCCACTATGTTCA
TAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCGAGATGTCCC
TCAACAGAAGAATGGATACAGAAAATATGGTATATTTACACAATGGAGTA
CTACTTAGCCTTTAAAAACAATGAATTTACAAAATTCTTAGGCAAATGGA
TGTATCTGGAGGATATCATCCTGAGCGAGCTAGCCAAATCACAAAAGAAC
ACACATGATATGCACTCACTGACAAATGGATATTAGCCCTGAAACTTAGA
ATTCCCAAGATACTATTTGCAAATCACATGAAACTCAAGATTAAGGAAGA
CCAAAGTGTGGATTCTTCGTTTCTTCTTAGAATGGGGAACAAAATACCCA
TGGAAGGAATTACAGAGAATAAGTTTGGAGCATAGCCTGTAGGAATGACC
ATCCTGAGACTGTGCAACTTGGGGATCTATCCCATAAACAACCACCAAAT
CCAGGCACTAGGCAAATGCCAGCAAGGGTCTGCTGACAGAAGCCTGATAT
AGCTGTCTCCTGTGAGGCTTTACCAGTGTCTGGCAAATACCTAAGTGTAT
GTTCATAGTTTTCCCTTTTGACAGAGCACAAGGTCCCCCCATGAAGGAAG
CCCGAAAAAATTTTCCCCCGAAACTTTAAAAGGAATCTAAAAGCCCCCCT
AGGAGAGGAAACTTCCAATATTTGAACTTACACGGTACCTCCCTAAAAGC
TCCCTTTGGGCACTATATN
| NTTTCCTATGGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCCCTTCAACAGATAGTGAAAAACTGAAATGGAAGAA
GGGGTCCCACTTAATTAAAACTTATGGCATTTATAAATGAAGTAAGAGTT
ATGAACTATAGATTACAAACAATATTACATGTTAATAAAACCATTGTTTC
CCATAAAAGTGTCTGCAGGTTTTAGCTAAGTGAATTATTAATATCTTCAT
AGCAGGCTGTTATGTCTTATGTGGGAAATGACAGCTGGTTCCCCTTTGAT
GAGCACATCTCCTTCTGAGAATTATGAGGTCTGTTTTAAAAGCTCCCCAT
GTTTGACAGATTAAAACATTGGGAGTCTGAGGATTTATCTCATGTGGCGT
AGTGCTTTATTGCCAACTAAAGTTGTGTTGGTACGTCTAATAGAACCACC
CATCCTCAGTCCTATACAGTTTCTTTCCCTTTTCAAAGACTACATTGAGT
ATATAAAACAGTGTGTTTTTTTTACAAACACACACACACACACACACACA
CACACACTCACACACTCATTCACTAATATATAGCGGCTTGATCCCCGTCA
GGATTGTTCTATTTATGACGCTCATTGTCAGACTAAGTCAATTCTCCCTG
ACCTACATCTCCCCCTTGTCTGTTTCTTTTCAAGTAAATGAAATAATTAT
TTCTCTGTAAAAAATTGTCAAATCCTTTTTCTTTGCTTTTCCTAGCCACT
GCGCCTGACATTCTTTTGTGCAGGCTTCCTCCTTTCGACACTTTACTATG
ATTTTCGGTAATGAGCTTTGAATGGAATCTTCGACCAAATATTTTGTAAA
AAATATTAACCCTAACATTCCTACCTATGTACTCATTTGCTCCAAACCCC
TAATTTTATTCCCCCATTTTCTCAATTCACTTTAACAAAGGTGTGTAAAA
ACCCCTTGTCTTTCATAATTGTTTCCCTTCCTTGCCTGGGAAATTTCCCA
CCATTAACCTATTTACCGGTGGACTTTTATCTTGGTTCCCCCGGGGCAAC
TAAGGAGAATAAATTTCCCCGAAAATCCTCAACTAATTTTTTTGGTTTGT
GCTAATTCCTTAAATTCTTGCCCCTGGATCCCCTATTTTTGTCCCTTTTG
CCC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 10 8 12 16 21 22 17 12 10 8 8 8 10 12 8 8 8 12 11 14 24 24 42 37 32 33 33 36 36 42 48 48 42 42 40 39 33 37 42 43 53
50 42 42 36 36 36 44 41 33 33 33 37 37 37 27 18 8 8 8 8 11 13 12 16 16 21 11 11 15 25 34 59 37 33 33 33 33 36 36 53 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48
53 57 59 34 32 19 19 15 19 21 36 36 42 42 46 39 43 43 43 46 46 59 59 37 37 37 48 44 57 54 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 57 57 37 37 37
46 57 46 46 54 57 57 46 43 43 57 43 43 43 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 52 54 54 59 59 59 59 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 68
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 43 43 52 45 43 62 62 62
62 62 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 52 52 52 45 43 43 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62
62 62 62 62 44 44 44 62 52 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 54 54 54 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 59 59 59 43 57 59 57 57 57 57 54 57 44 44 44 44 57
44 34 48 46 46 36 36 36 43 43 54 54 57 59 57 57 57 57 48 48 48 48 59 57 48 48 48 48 48 50 57 48 48 48 59 46 41 41 43 43 44 44 41 41 44 44 44 39 39 38
37 37 39 39 39 41 44 44 44 41 41 34 34 34 41 37 39 31 31 25 34 43 41 41 47 47 34 36 34 34 41 43 43 41 41 44 43 59 59 59 50 47 48 48 41 40 40 39 39 37
32 29 24 28 30 39 39 31 32 41 59 43 36 32 34 28 18 14 9 9 9 19 25 41 35 37 29 29 30 34 28 26 30 24 21 11 12 21 22 25 39 44 44 41 37 37 37 37 30 29
35 37 39 39 34 34 32 32 32 37 33 28 33 30 32 28 35 32 30 24 18 22 27 27 32 37 39 43 43 39 34 34 35 37 37 34 27 30 30 25 22 30 22 17 18 19 17 18 25 30
30 19 15 12 20 15 16 15 24 13 18 18 28 28 22 24 25 21 16 11 11 11 17 17 11 15 10 10 11 11 20 26 28 29 28 17 14 14 19 12 9 9 9 9 10 16 16 16 16 24
16 24 20 18 22 11 11 13 14 13 15 10 12 12 17 13 12 12 12 14 16 23 16 10 10 9 9 9 9 9 14 10 9 9 12 10 14 19 18 15 9 10 9 9 8 8 8 10 8 10
10 26 15 13 11 11 11 13 11 9 10 10 10 10 10 10 9 7 7 7 8 10 8 11 11 11 8 8 8 15 11 10 10 10 10 10 14 23 12 12 10 12 10 16 12 14 11 11 11 10
11 10 9 9 9 15 13 20 18 14 12 7 10 6 6 6 7 9 9 14 16 17 10 10 10 10 10 18 24 14 12 12 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 9 9 10 16 9 8 8
11 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 10 10 10 9 9 9 11 13 10 8 8 8 8 8 16 18 13 11 8 8 8 9 9 14 11 8 6 6 6 13 10 20 20 12 11 6 6 6
6 8 10 10 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 0 3 8 6 6 6 7 7 7 6 8 13 8 15 10 11 11 18 24 27 27 25 17 12 8 9 9 12 12 21 23 23 23 18 22 23 30 29 29 20 20 31 36 35 36 37 37 37 36 35
36 36 38 53 48 48 50 50 50 47 30 33 12 12 12 12 12 18 13 12 18 18 22 28 30 28 24 30 26 33 44 57 59 59 41 37 30 28 31 24 24 34 41 48 48 39 39 35 31 34
34 28 22 9 9 9 9 9 9 10 15 19 21 33 32 33 33 33 29 39 33 28 30 34 34 34 34 43 43 43 57 57 57 57 43 43 43 59 59 47 32 32 32 32 32 36 41 43 43 54
54 54 54 57 50 50 47 42 42 30 30 30 44 44 57 46 40 39 44 41 41 41 41 42 48 50 57 48 47 47 46 43 39 36 37 48 44 48 48 48 57 57 57 43 43 32 32 24 32 32
50 43 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 50 38 41 37 44 44 50 37 35 43 43 28 28 38 44 38 44 52 52 52 52 57 57 44 44 33 39 39 44 44 35 33 33
43 43 57 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 43 43 35 35 35 43 43 44 44 33 57 38 38 26 35 35 43 43 43 43 52 52 47 44 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 52 52 43 59 35 24 24 38 27 23 43 43 57 57 57 57 52 59 59 59 38 38 20 20 20 32 32 43 43 52 43 43 27 33 38 44 44 43 41 37
35 47 59 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 43 42 42 43 42 37 44 36 43 43 57 57 57 57 32 32 19 19 23 32 43 57 57 44 34 30 14 14 14 16 15 19 19 41 28 39
37 32 21 23 21 30 30 30 32 42 42 48 28 28 14 14 14 21 22 30 40 40 43 39 35 35 39 37 43 43 39 39 35 37 37 40 40 39 32 25 18 9 9 9 12 12 12 13 10 10
9 9 9 10 12 15 15 18 15 24 24 30 30 35 32 32 32 32 43 43 32 28 21 23 23 32 37 43 43 43 43 39 39 37 37 39 43 43 43 43 39 59 42 42 42 36 29 19 14 14
14 24 29 37 37 37 41 43 47 39 35 32 40 28 28 32 37 35 35 35 59 44 57 57 57 43 43 32 34 27 20 20 18 18 18 19 20 20 15 15 14 14 17 27 21 20 15 18 14 13
14 19 13 13 13 11 11 16 11 12 12 12 10 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 11 11 12 22 21 20 20 16 16 10 11 10 10 10 13 14 19 20 20 22 13 11 9 9 9 9 15
15 31 34 30 22 15 13 11 10 10 12 9 9 9 19 20 31 22 22 22 30 31 36 37 34 32 24 17 17 12 12 14 28 28 24 12 19 11 11 12 12 14 14 19 23 30 30 31 26 30
23 23 20 18 14 24 22 16 14 14 19 12 14 11 20 21 21 18 14 15 23 23 14 14 16 16 17 15 17 18 22 20 22 23 26 15 15 15 26 30 24 18 14 14 13 16 16 23 24 16
17 17 17 18 18 18 15 13 10 8 8 8 17 15 17 14 8 8 8 10 9 8 10 8 9 12 13 18 18 18 19 19 24 18 14 10 13 14 8 10 9 13 13 11 11 11 13 13 15 22
13 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 16 14 25 17 14 16 9 9 9 9 9 11 12 16 15 15 18 14 12 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 16 19 16 19 19 19
17 12 13 9 8 8 8 8 8 8 9 12 14 8 8 6 6 8 8 13 9 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 14 15
18 16 10 12 10 10 10 18 18 12 13 11 10 10 8 8 8 10 15 10 8 10 10 10 10 10 8 13 7 7 8 8 10 10 10 10 16 17 13 8 8 8 8 10 21 10 10 8 8 10
10 10 10 10 11 9 12 10 15 10 14 14 19 16 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 12 10 9 9 9 10 10 11 13 9 9 9 9 9 10 11 12 12
16 13 13 10 10 10 10 10 10 10 10 17 17 10 10 8 10 9 10 10 14 13 10 10 10 12 8 10 10 13 10 10 10 10 10 10 10 10 10 23 9 8 13 8 8 8 10 10 11 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 19 19 24 22 13 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 14 14 21 14 14 9 6 7 6 8 8 8 8
6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 11 14 9 10 9 9 9 10 10 8 8 10 13 8 8 15 10 10 10 10 10 17 21 28 18 13 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 8 8 11 11 13 15 8 8 8 8 6 8 12 14 13 6 6 6 6 6 10 6 8 8 6 6 11 13 8 8 8 8 9 9
9 9 9 |
|---|
