BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123M14.T7 (MSMg01no123_m14.b1) | MSMg01-123M14.TJ (MSMg01no123_m14.g1) |
ACC | AG333304 | AG333305 |
length | 1,284 | 1,190 |
length of high quality (start - end) | 659 (89 - 747) | 530 (126 - 655) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_m14.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_m14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:59 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_m14.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_m14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:59 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GAATTCTTNNNNNTCCATTGGGCGCTATAGACTACTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCAGGACAGCCATGCCTACCTATATAGACTCTTGTCTCCAA
AAGGAAGAAGAAAGAAAAACCGTCTCCATGGTCTCAATATAATTTAAAAG
TCCAATCTCTTAATTGTAACCCCCATAAAAAGCAAATTATGATCTTTGAG
CACACAGGCACAGAGTGTGCATTGCCGTTCCAACAGGGAGGAATAGTGGC
ATAGGAAGGAAACGCTGGACCAAGCAAGATGGAAACCCAGTAGGGCAAAC
TCCGAATCCTATCTCTGTCTGATATCCAAAGGTCTTACGTGGCTCTTCCT
CACAGCTCGGTAACTGCAGCCTACGCCTCTCTTGGGTTATTTCTGCTCCC
TGTCTGCAGCTCTCCCTAGCAGATATCCCACAGCTCTGGCACAGTGGGAT
CGCCAGTGTGATCCAGGCTCCACTTTCACTGTTCACACAGTGGCAGCTCT
GGGCTACGCAGACTCCCTACCACACACCTGACCTCAGCAGCTCTCAATCC
CGGAGGAAGATTCTACAACCCATTTTCTTATATATCCCTCATGATCCTAT
AGCCAGAACCACAAGACCAATGCTGCCAAGTTATGCTGCCTGTTGGGGAC
GGAGCCTGGTCCCTACATTTTTATAAATTTTGTTCTGTTACTGCCTTTTG
GGAACAGAAAATTTCTTATGCCTTTTTCTTCCATAAATTGCAGGATTAGC
TCAGGTGGTGTCTTGCCCTGAGGGTACTCAACCCCTTATTCCATTTCTCA
TCAGTCTTCTTATTTCTTTCAGCCCAAGCCTTGGCTCCAATGTTGAATTT
CCCAGCGATCTTTTTCTCCTCCAAATTGTGTATTATTCATCCAACCTCAG
AATTGCTGTCTTGAAATTTCCCTCTGCCCAAGAATACAGCTGAAAGGTTA
CCACTTGATTCTATGCGCATGTGCTCTAATTACTGTTTTAACTACCGACC
GACTTTTTCATCCTATATTTTTGTTGGTTTTTTGTACCCCCTCTCCTTTG
GAGATCTCCCTTTCTCCCTTTCCCTTGTCTTAAATTTCCTCTGTTATTGC
TCATGGATTCCCCTTCTTTGGTGTTAATGTTTGCTAATTTTATTTTTGTG
ATCCTTCCTGATTATAATTCCTCTCCCGCGCACAATTATTACCCTGTCTC
TAAATACATTAATCTTATCTTCTTCTATTCGCTTTCCCTTTCTCAACTTT
CTCTTATCTGTTCTTCTTCTCTCTATTTGCTATC
| GTATTTTTTNNNNCAGCATGGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTGAGACCCTATCAGGTTTAAT
CAGAGGATGTTGTGATCCTTTGGAAATGCCTGTCGAAAGCATAAAAGGAA
AGCCACAGGCACCATCAGCCTCTCCTGGTTAGTTACCTAGGGAGGTTTCT
GGGAGAAGAGTCAGCCCTGGGTTTTTTTAAGACAAGGAAGACCTACCTAA
GTGATGCCCTCCCTCATGGCTTTTACCTTCTCTTACAGGTCCCAGAAGCC
ATCCGCAAGTGCCAGCGGGCAGGTATCACAGTCCGCATGGTCACCGGTGA
CAATATCAACACAGCCCGGGCCATCGCCATCAAGTGTGGCATTATCCACC
CTGGAGAGTACTTCCTGTGCCTGGAAGGCAAAGAATTCAATCGGAGGATT
CGCAACGAGAAGGTGGAGGTACGCATGCGCATGTGCCCTCCGCAAAGGCT
CTGAAGTGGGCCAAGCTCCAGAGGGGGCCGGGAGGCATGGGCCCTGCATG
CTTGAACAGAAGCCAGCTGAAGAGCCCAGCGACTCTGCATGGGGCTCGAT
TTCTCTCTGTGACCCCCCCCCACCGACATACCACACCCCTCTCCAGATTG
AGCAGGAGCGGATTGACAAGATCTGGCCAAAGTTGAGGGTGCTGGCTCGC
TCCTCGCCCACGGATAAGCACACGCTTGGTCAAGGTAAGCCTGGAGTAAC
TATGGTGATTGTGAGCCCCAGAACTAACCCAGCCTAAACCAAGCCCGATT
TGCATGGCCTTCGCAGTTTCCCCCCATGGGTGCTCTAGCTGGTTCCTTGG
CTATGGGTTGACACAGGTTTCCCCATTGTAAAAGGGCAAAAAGGGCCACC
TAGAACTCTTCTTTTTCCCTGGGGGGCCTTTCCGGCCTTGGTTCACTTTT
CTACCCCTTGAATAAGACATTGCCCAAGGCCTTTTTATTCTTGATCCATC
TTTCTCTCCCTTTTTTCTTTCTATCCTCTTTTTACTTCTCTCTCCTTTTA
TTCTCTTATTTTCTCTTTCTCTTCCTTATTTTATCTCTATCTCTCATCTC
TTATCTTATCCTTTTTCTCCCTTTATCTATCCTTTTTCCCTCTCACTTTC
TCACCTCTCTCCTCCTCCATACGTCCTCTTCTTTCTTCCG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 6 7 8 14 19 15 7 6 6 6 8 19 21 10 8 8 12 11 12 22 24 33 33 23 24 24 28 31 31 33 33
37 37 37 33 33 36 39 39 44 47 37 31 31 31 31 31 36 36 36 36 33 33 21 21 9 11 11 11 8 6 6 6 6 6 10 15 15 28 28 28 20 20 30 30 35 35 53 53 53 53
53 57 57 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 59 41 33 19 11 14 10 10 9 10 13 19 30 30 37 22 21 17 17 17 26 24 34 34 43 43 43 53 53 53 53 53 53 53 53 53 68
54 54 48 48 48 48 43 48 42 42 37 30 30 30 30 37 43 48 50 47 54 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 54 54 54 57 57 57 68 68 68 57 59 48 48 48 48 44 59 59 59
57 57 57 54 54 50 50 59 59 54 54 54 57 57 57 68 57 57 57 57 59 68 68 59 57 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 52 52 52 52 52 43 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 43 52 43 43 43 44 57 57 52 52 62 62 62 59 59 52
52 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 44 59 52 52 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 45 62 52 52 62 62 43 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 68 62 62 62 62 62 43 43 39 39 23 23 23 23 23 12 12 23 39 41 62 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 52 52 52 43 43 62 43 52 52 62 62 62
52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 44 44 43 43 35 35 27 35 23 43 35 59 43 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 62 62 62
62 52 52 43 62 62 39 39 39 43 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 43 38 23 38 38 43 33 35 39 59 59 57 43 43 29 38 38
43 32 32 32 33 37 52 52 52 52 57 52 57 57 57 52 57 57 44 44 38 43 43 50 50 68 59 59 59 59 38 35 35 59 50 48 48 50 59 50 54 54 59 59 54 54 54 59 59 57
57 37 37 39 39 43 44 57 48 42 42 35 35 28 42 42 42 42 42 42 37 42 37 44 39 44 40 39 43 43 43 43 42 47 47 43 43 43 43 43 47 43 43 39 39 32 36 36 43 43
39 36 30 25 25 34 40 36 28 28 28 37 37 43 43 43 43 48 48 47 48 47 46 41 41 41 32 30 18 17 19 22 37 37 37 37 35 35 30 39 39 37 32 26 26 32 39 34 32 21
15 13 12 22 24 24 30 28 34 28 30 30 39 34 33 29 29 25 29 29 39 39 39 34 26 26 17 17 22 29 30 25 23 22 30 26 35 35 37 30 26 19 16 16 23 24 22 11 11 10
15 13 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 17 30 28 32 28 19 19 21 15 15 10 11 17 22 17 14 11 11 11 13 22 19 12 12 12 19 15 19 12 19 24 25 17 10 10 14 15
17 9 10 11 11 11 13 13 15 30 21 28 19 23 11 11 11 9 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 11 11 11 11 10 10 9 8 8 8 8 10 17 19 16 16
15 16 11 10 6 6 8 12 16 19 19 14 15 18 21 14 13 9 10 10 8 8 8 8 10 19 19 18 18 12 15 8 8 8 11 8 9 12 17 13 9 9 9 9 12 10 11 11 11 11
8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 13 13 22 11 11 9 9 10 10 13 19 12 17 16 19 16 10 12 9 10 12 10 10 14 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 8 8 8 9 9 9
10 10 10 14 13 10 9 8 8 10 8 8 6 6 8 6 10 10 10 11 11 11 8 8 6 6 8 8 10 11 9 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 10 9 9 10
10 10 11 12 9 9 9 9 9 10 9 9 8 8 7 6 8 8 11 10 10 8 8 8 10 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 7 8 8 12
12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 10 15 13 13 10 16 16 23 17 10 10 10 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 11 10 8 10 8 8 8 8 10 8 10 8 6 6 6
7 8 8 8 8 8 13 11 11 14 10 10 8 9 9 10 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 11 11 11 9 9 8 8 10 8 8 6 8 8 8 9 9 9 9 10 11 12 12 11 11
9 8 12 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 6 8 11 8 8 8 8 8 7 8 10 10 10 13 16 12
16 10 10 10 10 9 9 8 7 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 15 8 8 6 6 6 7 11 6 7 8 7 7 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 7 6 6 6 10 6 7 6 8 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 9 10 12 12 16 17 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 7 8 10 11 8 8 9 9 12 9 14 15 15 15 12 14 16 33 23 36 24 24
17 20 20 28 37 36 36 37 37 34 35 36 38 38 36 47 41 50 50 50 37 29 21 13 9 10 10 11 16 12 15 11 12 12 22 24 33 30 28 27 30 33 33 47 36 36 36 53 44 39
39 35 35 43 43 50 36 36 36 31 31 33 30 28 18 23 20 23 19 15 23 15 13 13 15 21 21 28 37 26 33 21 32 32 50 57 59 59 57 50 50 50 53 53 53 59 59 59 68 59
59 59 48 48 48 48 48 42 42 30 30 30 42 42 46 46 42 42 37 39 42 46 57 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 48 48 48 57 57 57 57 48 48 42
44 43 48 48 57 57 59 59 50 47 47 43 43 43 44 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 50 43 43 57 57 57 57 57 57 57
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 57 52 57 62 62 62 62 43 43 35 43
43 52 62 52 52 52 52 62 62 52 52 52 52 52 62 44 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 44 44 62 43 43 43
43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 43 43 39 39 43 43 43 43 35 39 43 43 43 35 35 35 43 44 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 43 43 19 15 21 12 13 13 14 23 26 44 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 41 43 43 39 39 62 43 62 43 39 39 39 43 39 43 43 62 62 62 62 62
52 52 52 52 52 52 52 52 32 32 13 13 13 13 13 15 24 38 43 52 52 38 38 29 35 32 38 27 33 33 44 44 59 59 43 43 43 42 42 42 43 38 43 57 57 43 44 32 35 35
43 43 43 43 35 35 35 43 43 27 23 23 38 43 43 43 33 32 18 38 38 43 50 43 52 43 43 27 28 21 15 15 15 27 12 34 12 24 27 28 28 14 21 26 38 24 35 35 30 42
35 35 33 40 33 37 37 42 36 42 22 22 17 30 27 32 32 37 44 40 37 37 36 29 22 28 28 23 28 28 36 31 39 36 37 33 40 34 57 39 39 35 42 30 28 19 21 22 28 43
43 46 46 48 46 47 43 47 59 59 59 59 47 47 43 40 41 40 39 37 37 32 27 27 37 37 30 28 28 34 37 36 37 37 39 39 37 43 43 43 43 43 43 39 32 34 34 42 36 30
32 15 15 14 16 16 15 13 15 10 10 8 8 8 15 23 23 18 22 24 24 28 28 26 18 10 10 10 10 11 12 24 37 34 34 28 28 23 34 28 32 37 39 39 39 32 24 22 18 18
31 24 32 28 15 13 11 10 10 15 15 20 8 8 8 8 6 8 10 15 10 10 12 10 8 8 6 6 6 8 8 8 9 13 25 22 22 11 12 11 11 18 11 16 10 10 9 9 11 15
15 22 24 29 25 10 10 8 8 8 11 22 19 12 15 10 12 13 10 9 9 9 9 10 11 19 12 10 10 11 11 9 9 9 9 10 10 11 11 16 16 21 17 10 10 8 8 8 8 8
10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 13 9 9 9 10 9 9 11 11 11 15 15 10 10 10
16 16 24 30 22 14 8 8 6 6 10 8 10 10 10 12 10 10 9 10 8 8 10 8 10 11 12 12 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 10 12 12 11 11 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 12 9 10 8 8 8 8 8 10 9 10 9 9 9 15 15 14 11 13 11 10 10 9 9 10 10 13 8 8 6 6 8 8 16 10
10 9 9 10 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 10 10 9 9 10 9 10 9 10 8 8 8 10 12 10 10 10 16
11 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 10 13 16 12 10 9 9 9 8 8 7 7 8 8 14 13 11 14 14 12 15 11 11
11 10 8 10 7 7 8 8 11 8 12 12 12 9 9 10 12 13 10 13 12 12 10 10 13 8 8 8 8 13 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11
8 10 10 12 9 9 10 8 10 8 9 9 9 8 8 8 8 6 7 8 8 11 9 8 8 10 10 8 6 6 8 6 7 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 7 6
8 8 8 6 6 6 8 7 7 10 8 8 8 8 10 10 11 6 8 6 6 8 8 8 10 12 13 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 |