BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124M04.T7 (MSMg01no124_m04.b1) | MSMg01-124M04.TJ (MSMg01no124_m04.g1) |
ACC | AG334030 | AG334031 |
length | 1,266 | 1,216 |
length of high quality (start - end) | 365 (33 - 397) | 339 (123 - 461) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_m04.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_m04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_m04.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_m04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:17 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ACTGCCAGACATTGCGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAA
TTCAATGAAAAGCAATTTCTTCTAACAGATACTGGAACTCCTGCATTTGA
GCCAGTGCTTCTTGTGTCTGAAGCCCTGCCTGCCTCTCGATATTCTCTTT
AATTCCCACACATCAGAGTGGGCCCCCTCAAAGTTCTCAAGACTGTTTCT
CCTCCAGTATTGTTCTCCTGTAGATCCATCTCTTCTTATTGACTTAAAAT
CTAACCATTCGCAGTCAAAGTCAAATGTACGTTCACTCTGAAAAAAATCT
TCTGAGAGATCCAGGGTTCTGCTTGCTCCCTAATCTCTGATCCCAAAATG
ATGAACTGTGTCATTTAAATTTTAATCTCTTTGATTAGAGCCAAGCCACG
TTGTTAGATATACACACATTCTGAAGAGCCTGGAGCGCCCAGTGTTCAAG
TTTTTTTTGCCCCCCTTGTTGAGACCTTCTTTCACAAAAAAAAAAAGAGA
AATCCTCTGGTATAGCTCAGTGTTTGCCTTAGAGTCATTCACTAGGACTA
CAAAATATGTACGAACAAATAAACAACTCTTGTGTCTTATGTAATGTTGA
CCAGGAGTCAGCACATTTTTTTCCAGCTATGTGCAATTTTGAACTCACTG
CAAATTCTCCACATGGTGCTGATACAGTCTGTGAGGCCATACACTGTTGA
TATGATGACATTGCCCATGGCATATCATGGCTACTGAGATTCTGTTAGAT
TTCCCTCCAATACTCGGCAGTAGCCTCTAACTTCTATACTCTTTCCCTGT
TTTATCCATTTAAATTGAAAATTATTAAAATAATTTCGTTCCATCATGGG
ATCCTCCTAAAACGCCGAAGTGTAATTTTTTTAGAACTTATCAGCCTCGT
TATTTTAAAATAAACCCGCGCTCTTAACACCTCTAGCTTTTCAAACTTCT
CTTTTTTCAACTAAATATGCTCCGAAGAATTTCAACTCTTCCTTATTTTC
TTCAGATGTTTTAACAATCATTTCCCCTATCTTACTTCCTTTAATGTTTT
TTTCTTGCCAAAAAAACTATAGGCATTTCATTTTGCTCTTAACTTCCCTC
CGGGACAGGTTATATAATTCTCCCACTCTCCGNNNTNGGNTATATTATTT
TTATTATATCTAATANACTGGATTACTCTACTCAAATCCTCCCCATCACC
TTTTTATGTCCTCTCTTGCACATAAACGCTCTTTCATCCCTACACTCCTT
CTTATTATTTCTTCCG
| CCTTACTTTNNNNAACATTGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAGGAATGCTTTAAATGGGG
CTTAATGGGTCATCCTCCTATGAATATGGAAGACTTTGTTGCTGGGAGTA
ATTTGAACTGTGTTGACCTGGCCCAAGAGATTTCAAAGGAGAAGAATTTC
AGTATGTGGCATAAAGACTGTTTTTGTGGTATTTTGGTGAAGAACGTGGC
TACTTTTTACCCTTGTCTGAAAAGTCTGCCTGAGGCTAAGGTGAAGAGAC
TTGGATTAATTGCATTGATTGCATTGACAAAGGAAGTTTCAAAAAAGCCC
AGCAGAGACTTTGTTCTCTGGTTAAGTCTCACAAAGAGAAGTTTGAACAA
GCATAGCAAGCTTAGAAAGGCAAAATATAAAATATATGGTTCGAGTATTA
AAGGCATACCAGGAAGTGAAATGGAGCAAAATCCTGTGTTCTAGGAAATA
ACAGATTAAGGGAGTGGGACCTTGGGGCAAGACCCTACCCAGCTGAATTT
AGAACCAGGCATGTTGGTACACACCTTTAACCCCATGAGACAGGCATGCT
GATCTCTGCATTCAAGGTCAATCTACAGAGCAAGAACCAGGATAGCCAAG
CTATGTGAAGGATTTAGAAAACATAAAGCCAGTGATAATGTAATAGTACA
AGCGGATCATGTTCTAGATCCTGTAAGCAGCAGAACTTGGCAGCTTCAGC
CATGTGGCTCTGGCTCTAGAGTTAAGAATGGAAGGAACTACTGTGACAAT
TGATGCTGGTTAGCTGGAGCTAAGACATTAACAATGACTAAGAAGAGACC
AGCATCACTGAGTTGAAATCTGGGAGTTGTTTTCTGGGAGCACAAAGAAG
CTGCGTTCCAGAGATAGTCAAGTTTGTACCTCGTGCTGCAGCTGGACTTG
GTAATGTGTAAGAGTCCACCAGGTGGTACTGGTTTTTGAGGCCTTAAGGT
GTCCTGAAAAACAGCTGAGGCTTGTCCCGGTGAAAGGCCTGGAAAGGCCC
TTGGAAAAAGTGGTACCTCCAAAGTTATTGAATGGCCCGGAATTAAGGTG
TCCAGGCACAGGTTTTGATGGTTTTACCCCTGCCCCCAGTACCTGTAAAG
CTTTTGTGAAAACCCATATTGGGGGGGAACCCCCCCCTGGTATTGAAAAT
TACTCTTCCCTGGGAG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 10 9 19 8 8 6 6 6 7 8 6 6 8 8 8 19 15 8 8 8 8 17 19 19 18 12 12 8 8 8 13 21 37 24 33 33 36 42 48 36 36 25 25 24 21 21 40 34
26 16 12 12 21 32 44 54 57 57 44 44 35 32 39 43 44 44 35 35 35 32 32 20 38 32 47 47 47 57 57 37 37 43 57 57 57 47 46 57 37 36 32 28 28 32 44 44 57 54
43 44 28 33 32 42 42 35 30 50 36 37 37 50 50 50 50 41 47 50 50 59 59 43 43 50 50 32 36 17 32 19 38 36 50 50 50 41 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57
57 68 57 57 57 59 57 52 52 57 57 57 43 43 35 35 42 42 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 62 44 44 43 52
52 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 44 44 43 43 52 43 43 35 44 43 62 62 44 44 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 52 52 62 44 44
43 43 35 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 57 52 52 52 52 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 52 59 59 59 59 43 43 33 33 33 33 35 43 44 39 38 31 43 43 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 37 37 43 43 52 59 59 59 57 57
57 57 57 57 50 44 37 32 35 43 43 43 50 43 50 44 50 43 43 42 44 42 43 37 43 43 47 47 48 59 57 48 48 48 32 32 42 43 44 44 42 26 26 11 11 11 24 21 28 24
26 18 18 16 23 15 20 23 31 36 44 44 43 43 41 43 43 43 43 57 48 48 40 40 28 25 25 33 33 37 39 32 30 30 32 39 39 35 32 32 32 34 30 30 37 24 26 15 12 11
11 9 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 11 11 10 9 9 9 17 27 34 30 30 24 28 22 25 24 18 17 13 15 12 12 12 12 12 13 14 28 28 28 22 14 12 10 10 10 10 10
10 12 18 26 30 35 32 28 34 34 27 27 12 9 9 25 25 30 14 14 14 28 28 43 47 47 48 59 41 41 17 17 17 34 34 36 35 37 42 35 35 28 23 23 11 11 12 26 28 40
28 28 28 36 36 43 48 48 48 43 39 30 30 28 32 28 32 32 37 37 47 37 37 28 17 13 8 6 6 8 8 20 28 59 59 47 21 17 8 8 8 21 25 59 59 59 47 23 22 12
9 9 12 17 17 28 28 21 29 17 17 15 27 25 39 39 47 59 59 30 30 13 16 10 13 13 10 19 22 36 28 32 30 37 37 43 34 43 43 42 42 42 48 47 47 39 39 37 39 32
30 37 33 30 30 28 28 15 11 11 12 12 15 23 16 22 22 32 32 37 37 36 28 24 19 19 18 24 18 22 23 30 30 21 21 16 17 11 13 15 28 9 9 9 13 19 21 43 25 25
12 12 12 25 24 39 37 31 28 19 19 12 8 8 10 10 10 13 15 13 21 21 28 25 26 17 12 12 13 12 13 13 22 19 16 21 12 12 12 18 18 18 24 15 23 23 16 16 15 22
17 11 8 10 8 10 8 8 8 13 13 12 14 11 12 10 17 16 14 12 12 11 11 10 17 10 8 10 8 19 12 16 16 12 19 24 28 28 22 22 14 14 11 17 14 12 12 10 10 11
8 8 10 12 15 17 14 10 10 9 9 10 14 14 12 13 8 8 8 10 13 16 16 23 12 12 10 9 11 8 11 10 13 12 13 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 11 12 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 13 10 11 10 12 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 12 12 8 8 8 6 8 10 11 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10
13 13 15 8 8 8 8 8 8 11 11 12 12 14 12 12 12 15 15 12 14 10 10 10 10 13 10 10 9 9 8 10 6 7 6 6 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9
9 8 8 14 10 10 8 8 8 8 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 11 9 9 7 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 9 12 8 10 8
8 8 8 8 7 9 9 9 9 10 12 10 15 15 24 8 8 8 8 8 8 16 11 10 8 10 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 10 13 10 8 8 6 10 8 8 8 8 8 13
15 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 12 18 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 6 8 8
8 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 10 8 8 10 9 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 3 0 3 3 0 3 8 9 10 8 8 6 6 6 8
10 18 10 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 6 3 0 3 10 8 9 9 9 9 10 10 13 16 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 12 13 16 11 11 11 10 8 8 8
9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 13 10 13 10 10 9 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 11 12 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6
6 8 10 10 14 10 10 8 8 6 10 10 10 8 7 7 | Open.Hide.11 11 11 11 9 9 10 9 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 10 10 13 8 8 9 9 16 16 22 21 17 10 10 10 19 21 33 28 28
30 35 35 35 36 37 37 37 35 32 35 35 35 36 36 50 50 50 50 47 41 27 27 9 9 10 10 9 9 8 8 8 8 10 10 22 19 26 28 28 30 31 36 36 36 50 50 53 53 59
38 38 36 36 36 36 48 44 39 37 33 33 21 21 10 9 9 9 9 9 9 13 13 18 28 33 37 37 43 43 43 39 47 53 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 47 47 47
47 54 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 54 54 50 48 48 48 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 43 43 43 44 47 48 57 57 59 59 54
54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 54 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 59 59 59 59 57 57 59 57 57 68 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68
59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 57 54 54 57 57 57 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 34 26 18 12 11 11 11 15 15 25 18 28 34 41 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 48 48 48 59 59 68
59 59 59 59 43 43 43 34 30 18 14 14 14 23 22 19 18 15 15 20 15 15 13 20 18 28 32 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 54 54 57 57 47 48 47
57 57 54 54 54 57 57 54 54 57 59 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 57 59 59 59 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
43 43 31 44 44 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 57 39 43 33 43 43 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 68 44 44 27 29 33 38 41 38 18 18 23 41 41 59 59 57 57 57 57 52 50 50 54 57 57 57 57 44 43 43 44 44
44 50 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 44 44 59 47 54 54 57 48 54 54 57 48 57 47 47 43 47 47 54 54 54 57 44 44 25 26 23 44 44 54 54 48 48 48
48 48 57 59 59 59 59 59 48 48 47 43 48 40 39 39 39 48 57 57 59 59 48 48 48 50 41 41 37 34 28 23 20 18 20 23 30 32 31 29 37 32 32 36 39 39 40 43 43 39
39 40 43 43 46 48 37 37 25 31 30 30 19 20 22 31 28 32 32 40 40 40 39 43 35 37 31 26 29 23 19 24 24 19 21 16 18 25 34 34 23 23 9 9 9 15 20 26 25 28
26 30 36 36 37 37 39 29 31 25 25 13 13 13 21 21 34 34 34 25 21 16 21 23 23 10 10 10 21 17 21 28 17 15 16 21 28 24 20 14 12 22 21 37 34 36 25 23 22 22
17 15 9 9 9 9 9 14 23 27 17 18 9 11 12 19 19 17 17 24 21 14 11 11 18 18 19 25 28 22 20 21 18 18 16 16 24 22 17 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12
12 12 20 21 28 22 22 16 13 16 13 13 13 13 13 10 8 8 8 10 8 10 10 10 16 14 16 19 22 26 27 28 22 15 14 14 13 13 10 15 15 19 23 12 14 13 13 9 8 8
8 11 9 10 21 28 16 17 13 17 11 9 9 8 8 9 11 12 13 10 10 10 9 9 9 10 13 13 14 12 9 9 9 9 9 19 19 19 13 11 9 10 11 8 10 8 8 11 13 8
8 7 7 7 11 13 16 16 18 12 8 10 9 9 8 8 8 6 8 8 10 15 23 11 11 11 10 8 8 8 8 8 10 11 14 14 11 9 10 9 9 9 10 14 28 22 22 24 22 21
21 16 9 9 8 8 9 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 10 10 10 10 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 10 11 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 7 7 12
11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 15 14 13 14 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 14 14 17 17 22 13 15 11 10 10 9 11 11 11 11 10 10 10 13 13 10 10 9
10 10 11 13 14 8 8 8 8 10 18 12 9 9 6 6 6 6 8 9 9 10 8 9 9 9 8 10 12 12 12 13 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 11 11 10 10
8 8 6 6 8 8 8 10 9 9 11 9 8 15 13 13 |