BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-134J08.T7 (MSMg01no134_j08.b1) | MSMg01-134J08.TJ (MSMg01no134_j08.g1) |
ACC | AG341262 | AG341263 |
length | 1,188 | 1,176 |
length of high quality (start - end) | 342 (499 - 840) | 671 (135 - 805) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_j08.b1 PHD_FILE: MSMg01no134_j08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:50:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_j08.g1 PHD_FILE: MSMg01no134_j08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:50:07 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (147,430,515 - 147,430,855) | (147,307,568 - 147,308,238) |
---|
sequence | AAATTANNNNNAATCACTGGGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCTCAGCACATACTTTTCATGTGATTCTGACTTTAACATATATC
ACCTATAATTTTTTACCTCCACACCTAGTAAGCACCTGAGCACCAATTCT
AATAAAGCTTCTATCATATGTAAACTAAACTCATCCTCTAGAACACAATT
CTCTCAAGTTACATTAAAAAGTCCTTTTCAGAAACATGCCTTCATGCCTT
AACTCTGGCGACTCAAAACCCTTTTGGGCAGTAGCTGGGCATGGTTTTTC
TTCATCACAGTGACACCTTGGCAAACCAAGCTTTCCCACGGAGAAGCCAG
GTACTCCCATAGTGCTGTTCGTGTGCTATAAGGTCAGCAGTGTCCTATAG
GAGTGCCACCTGGCCTTGCTTCTCTACTGAGTCAATTAATTTAATTAAAC
TCTTTTTTTGCCCCTTTCTGGGAGACAGGAAGGACATTCAAAATAATTTG
CTCAAGTTCCTTTCCTTCCTAAATTCTTCAAATTGTGTGTAAATCTTCAG
TTGGTGTTTTATATTTTATACTGAACCTTAAATAACTATACCAGCATTGC
CATAGTAACCAACAAGTAAAAACCTAGCCCCAAACTACACATGACTGAAG
GAACCAGAAAGTCACACCCTGGACCTACCTAACAAGGATGTGGAACTCTC
AGCTTATGGCCCTGCTTCCAAGGAGTTCTATAAATAAGGAAATGAATGTC
AGCACAAGCCAATGTGAAATGAAAGCCTATCTCTTTATTACATCTGCAAA
CCATTCAATCTTCCTCAGTTATAAAGATGATACAGACTATACCACACAAA
AGGTCACAGAGAAGCTCACTGGACAGACCCATCATATCAAGGGTCTATAG
ACAGGAAATTCCTTCTGTAACAATATACCTGTATATGCTCTATTATGACA
CTCCAAAACTAACAACCACCAGTAACTTTCTATCTATCAAATGGGAAAAA
AAATCAGGTAACTTCCGGCAACTAATTCTTGGAAAATTCCCAAAAACCCT
CCTTGGTTTTTTTCCCCCACCCCAGGGAAAAAAAGGGGCTCCTGGCGGCT
TTTTTACGGGGGAAAATCCCTTATGGAAAAAAATCTTTTTCTCCCCATAA
AAAAATTTTTGTTCCTTGGAACACAAGGCCTAAAAAGA
| CCGTTCTTTTTTAAAGAAGTGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAGTCCTCAGAGAACAGGGCTTT
GCGTGATTGGTTTCATTCTACACCTCTGTTGCCTGCAACTGTGTTTGACA
CACATTGAGTCTTCTGGATGTGTTTATTTTCTGATCCACAAACTACTCAG
TTCCCCCTTTGAACAATCTAGGAACTGACACATCTTCAAAAGAGCCATTA
AAATAACTTGCAGGGTATTAAACCCCTAACAGTGAACAGTGATCAGATGT
TTTCTCTTGTTAAAGAATATTTGTACCCCACATTACCCCCAACACACACA
CTACTGTGCATAATACCCTACATGGTTAAGACAAAGCATTAGATTGCCTA
TCTTGGCTTCCTGGGTGCCTCAGCTCTGAGGGGCTGGGAACAGTCCATGC
CCTGAATGGACCAGAATGGACAAGTTTTCTGGGTTGTTAGTCATGGCAAG
TGTACAGCACATTCTCATTGGCCATTCTGTGCATGTCCCATACGTGAGCA
GTCAGTGTTAATAGTTGTTCATGTTCTTGTCTGTGTATCAATAAGCCCTA
TGATAGAGGCCACCCAGAAAGGAGGGAGAGGAGACACTTGCCTTGCATCC
GGCATCTGAGAGTAAACGTCACATTTGTTTCATGAGATTTGGGGGTCTTG
GGGATGGCAATGAAGACATTCAGAGCTTTGGGGAGAGAGCTTCTAGTCCT
GCTGACTAGCTTTTGTGACTTTGATGTGAAGTACTCCCCAGGTGGTGATG
ATGTTTTGAAAGCACATAGAACCTTTAGGAAGTGTGACCTTGACAGAAGA
AGTGAGTCAATGGGGGAGGGTCTTAAGAATTTTCAGTTCTTCCTACTTCC
TGTCATTTTTCTGTGACCAGTGTTCTCAGACTTTGCCAGCCAAGCCTTTT
CCCAGTGATGAATGGGATCCCCTCAAACTGTAGGTCAAAACTAAACTCCT
CCCCTTTAAATTGCTTTTGGCAGGTACCTGGCCCTTATCCCTGAAAAAAA
AAAAAAAATCCCTCCCCCCTCCCCCTGGCGTTTCCTTGGCCCCCTTGTGC
TTTTTCCCCAAGAGCATTGTAATAAACAAATCCTCCCAAAAAATAAGTTT
TCTTTTCAAATTACCCTTTATATCTG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 9 9 13 9 11 12 10 8 8 10 8 8 19 19 24 23 13 14 8 8 8 19 22 37 33 37 37 40 42 43 43 43 42 43
39 42 42 48 48 68 68 68 54 50 48 47 47 54 54 68 68 68 68 68 68 48 48 35 35 35 35 39 46 46 57 57 54 54 48 50 50 50 50 50 51 51 50 68 68 68 68 53 54 54
50 50 50 50 50 53 53 53 53 59 43 42 33 26 28 21 21 24 30 30 43 43 33 31 31 30 30 30 30 31 21 17 11 10 10 10 11 21 25 37 59 59 59 50 50 53 53 53 53 53
53 53 53 53 53 53 57 50 50 47 47 47 47 47 50 47 47 43 42 37 36 36 38 36 53 53 53 50 50 50 50 46 33 32 14 10 9 9 9 9 11 18 28 32 32 24 19 18 18 19
28 28 24 30 30 44 44 53 53 53 53 53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 59 59 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 34 27
15 14 14 14 15 15 31 32 59 59 59 59 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 25 24
11 8 8 9 9 10 10 14 21 16 13 11 11 11 12 12 12 12 24 28 59 59 59 59 59 59 46 43 39 32 28 28 28 28 24 28 15 13 13 12 10 9 9 11 11 11 18 15 15 13
28 28 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 48 54 54 54 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 57 57 48 48
48 48 50 42 42 37 33 32 30 26 26 32 39 41 41 41 41 41 37 37 39 39 39 47 48 50 57 59 59 59 48 48 48 59 57 50 50 50 50 53 57 59 59 59 59 39 33 28 28 28
33 33 41 41 41 41 37 37 31 31 39 39 44 41 46 46 46 48 47 47 47 47 43 39 39 31 28 39 39 59 47 47 47 50 23 27 14 10 10 21 23 48 48 47 46 46 34 34 14 13
12 12 15 22 36 34 46 34 34 28 30 32 29 31 32 22 18 11 11 11 18 15 24 22 31 39 41 44 36 36 28 28 23 32 32 32 18 17 11 11 11 12 12 12 11 12 12 14 14 18
18 15 12 16 18 16 22 28 29 26 27 25 22 28 28 31 34 37 28 21 15 15 14 16 26 28 30 24 24 27 23 21 15 15 10 13 10 17 17 18 34 16 16 10 10 13 12 12 16 17
19 15 15 15 18 21 19 20 19 25 19 25 30 28 16 10 8 8 8 8 10 15 9 10 10 13 13 14 19 23 18 15 15 10 15 19 21 15 15 16 19 19 23 34 28 32 26 30 17 15
15 11 12 7 7 7 7 9 8 13 9 8 8 8 8 8 8 12 8 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 13 10 11 11 11 11 13 17 26 22 16 11 18 18 29 30 19 17 19
21 15 10 9 11 11 11 15 8 7 7 8 10 8 9 7 7 8 8 8 8 9 10 14 10 10 13 9 11 10 10 10 13 15 9 9 10 8 8 8 10 12 10 10 10 10 11 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 25 11 11 11 11 21 15 17 13 12 8 8 6 7 10 8 10 10 9 9 10 14 10 11 11 11 8 8 8 6 6 10 10 7 6 11 11 11 10 13
13 17 14 14 7 7 8 7 8 9 9 10 14 10 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 12 28 27 18 10 10 8 8 8 9 9 15 8 10 8 12 10 8 10 9 7 8
8 11 10 10 10 9 12 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 8 8 21 21 19 19 8 8 7 6 6 6 7 6 6 8 7 7 6 6 6 7 9 12 13 8 7 9 9 16 10 15 19 20 20 24 28 28 29 29 24 10 10
22 21 21 10 11 11 24 21 35 36 38 36 53 44 50 50 50 42 47 25 21 10 8 8 9 10 9 9 10 10 10 10 13 13 11 11 11 18 23 37 53 53 53 53 57 57 57 53 53 53
53 47 47 41 41 33 37 33 33 21 21 9 10 11 11 10 9 8 8 8 8 10 21 20 24 18 22 16 25 25 21 21 11 12 12 19 28 36 50 50 50 50 53 48 57 57 57 57 57 57
57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 47 48 47 47 47 50 50 50 53 50 50 50 53 53 53 53 44 44 39 37 37 37 26 27 9 9 9 9 14 23 39 42 50 39 41 37 33 31 25 25
28 36 43 59 57 57 57 53 53 50 57 57 57 57 57 68 68 54 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 54 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 68 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 57 57 50 47 47 47 50 57 59 54 54 54 59 59 68
68 59 59 68 68 68 59 59 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 52 52 52 59 59 59 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 59 59 59 59 59 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 44 62 43 43 29 32
21 21 15 33 24 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 52 62 52 43 44 44 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 44 44 52 52 52 52 52 52 62 62 52 62 62 62 68 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 57 43 43 43 41 43 43 57 44 57 43 44 50 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 37 43 44 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 50
48 48 47 48 48 54 59 59 43 43 43 47 47 57 57 48 48 48 57 57 54 48 57 43 43 39 35 35 47 47 48 48 43 41 40 40 40 43 44 44 48 48 47 36 36 30 37 37 37 31
31 39 39 39 41 40 34 37 28 37 39 32 32 30 30 17 26 26 39 34 39 30 23 26 24 24 35 41 30 33 30 34 34 23 28 28 39 39 48 41 41 59 59 25 13 9 9 9 9 10
27 28 36 28 28 21 28 28 43 48 57 41 41 37 28 28 37 37 48 48 57 48 48 43 43 40 43 47 57 42 39 33 33 33 37 48 47 30 26 14 14 22 23 25 25 30 37 37 39 42
23 23 10 10 8 8 9 15 12 22 15 15 15 27 27 30 29 19 23 15 19 17 26 32 24 22 12 13 21 19 25 18 18 9 9 9 9 16 13 10 10 10 17 13 17 11 11 9 11 11
13 15 19 16 13 10 10 10 10 10 15 8 8 8 8 10 12 17 13 10 10 12 11 8 9 8 8 8 8 10 15 13 11 8 8 10 10 9 12 15 15 10 9 10 8 8 8 8 9 13
22 19 20 8 8 8 8 17 15 32 15 10 9 9 9 9 17 13 11 11 19 23 18 16 14 13 13 10 10 9 10 12 25 16 19 16 18 16 21 12 11 16 10 10 11 20 23 28 30 28
22 17 13 10 10 13 14 12 11 9 9 9 9 9 6 8 8 8 8 10 9 11 11 12 12 12 15 10 10 10 10 8 8 9 11 16 20 15 11 10 10 8 12 10 10 11 9 12 13 12
12 12 11 10 10 11 13 12 9 9 13 15 14 22 22 15 17 10 9 8 10 8 10 8 10 8 8 8 8 9 9 10 9 11 12 10 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 16 24 29 25
28 21 23 14 10 9 8 10 10 8 8 8 10 10 10 10 13 8 10 13 15 17 10 16 16 13 13 8 8 8 8 8 10 10 13 15 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12
18 19 20 18 19 19 10 11 11 8 8 6 6 10 8 10 10 10 10 12 12 16 15 9 8 8 8 10 10 15 8 8 6 6 6 7 11 11 11 11 18 13 12 8 8 8 8 12 19 15
19 14 16 19 19 13 10 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 13 8 8 6 7 10 8 8 6 |