BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-141I10.T7 (MSMg01no141_i10.b1) | MSMg01-141I10.TJ (MSMg01no141_i10.g1) |
ACC | AG346375 | AG346376 |
length | 1,282 | 1,266 |
length of high quality (start - end) | 614 (94 - 707) | 564 (83 - 646) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_i10.b1 PHD_FILE: MSMg01no141_i10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:00:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_i10.g1 PHD_FILE: MSMg01no141_i10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:00:01 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATCCCCTTTTNNTACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCAGTAAGGCCATGAGATCCCTATAACGACCTTCCATAATCG
TCAGATACTGATATGTGCCTCTACAGCCCCTTAATCCGTTTGACATCAGA
CAGGTTATTTTGAGAAGTAACAGCAGCCTGCCATGAGCACCCAGATTTCA
GGGTTCAGGACCCACATAGTGAAAAGAAATACGCAGCACCCTCACATGTC
CTCTGATCTCCACATGCATATGTCTCTGTGTTTTTCAAACAAACATAAAC
CACGTTTTAATAAAGAAACACCAACAATAGCAAATAATAGAAGACTTTAA
AAAGGCAAAAGATTTAGCTCAGAGCTATACAAAAAAAAAAAATACCTGTA
ACCATGCACAATATTACTTAAGTAATCCTTCATTATAGGTGAAAGTTAAT
AAAATAGGATAATATTTAAAGATTCCTAAAATCTAAGGTGTTTGAAGCAT
ACTGTGTTGATGCGAGTATAGAAACTGAACAGTTTTGCTTTTTTTTCCTG
TGGCTACAAAAATATAAAACCATCATAGAAACACTTTGACAGTTAATTCC
ACTTTAAAGGACAAATTCTAAGGGTGTACCTGCATAAAGGGGTACAGTTA
CTCATTTTAAAATTATTTGTAAAGGCACAGGATTAACAAATTCTAAGTCA
TAGGTTGGTAAATGGGTCATAGAGCATTCAGACAATACATTATTTTGCTA
TATAGTGAAATGAAAATCATCACATGTCTTCACAGAACAGCCACAATGTT
ATATGGCTCATAGCAAAGTATATGTGAAAAGAGACAAGGTCCCGTGCACG
ATAACCTGTCAGAATATGGACTCAGCCGCACCGTAATTGTGATATCTTGA
AGAAAGCCTCCTAAGAAAAGGAAATTCCGTTCCTGGGTGAACTGGGAAAT
TTTTTTTCCTTCTTCCACCCCTTTGCAATAAATTTGTCTAATGGACCTGC
CTAATCTCAATTTGATTTATTATTAAATCCTAAAGTCTATTGTTTGAATG
TATTATTGACCTGGTTTTCTCTTCTCTTCTTTCTTTCTTTCCACCCTAGA
TTTCTTATTCTTCTTTCCTTTTCTCCCCCCCTCCCTCTATCTCACAACAA
TCTCCCCTTTGGTTGTCATTTTTACCTCTATACCTTCTTTGTCTTAAATT
TCTATCATTTCCTCTCATATCTATTATTTACTTTAATTCCTAAGTTCTCT
CTTCTCCTTTATTCCCTTCTCTATCTCATATA
| CTTTTTTTAACATGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTTGAATAGCTCTGTACCTCATTTTTT
AATAGGGTTATCCTTTTTTCTGGAGTCCCACTTCTTGAGTTCTTTATATA
TATATATTGAATATTAGTCCTTTATCGGATACCCAAGATAAAATTTGCAA
AAACTCATGAAATTCAAGAAGAAGGGAAACCAAAGTGTGGATACTTTGAT
CTTTCTTAGAAGGGGGAACAAAATAGCCTTGGAAGGAGTTACAGAGACTA
AGTTTGCAGCTGAGACCTAATAAAGGACTATCAATAGACTGCCCCCCAGG
GGATCCATCCCATAATCAACCACTAAACCCAGACACTATTGCATATGACA
ACTATTTTTTACTGACAGGACCCTGATATAGCTGTCTCCTGTGAGACTAT
ATACCAGTGCCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGG
ATGGAACACAGGGTCCCCAATGAAGGAGGTAGAGAAAGTACCCAAGAAGC
TGAAGGGGTCTGCAGCCCCATAGGAGGAAAAATATTAAGTAACCAGTACC
CGCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTAACAGAGGATGGCCTAGTCA
GCCGTCAATGAGAGGAGAGGCCCTTGGTCTTGGGAAGATTCTATGCCCCT
GTATAGGGGAATGTCAGGGACAGGATGTGGTCATGGATGGTTTGATGATC
AATATGATAGTTGAGTGTCAAGCGTCATTTTCTTTATTTTTTTATTATTG
TTGTATTTTCTTCATTGTTATGTTATTATTTCTTTATTTTTTTTATCTAT
TCTTTTTTTATTTCTCTTTTTTTATCTTTACTACTTATTTTTTTTTATTC
TTTCTTTTATTTCTTTTTATTTTGTTTTCTCATTCTATTTTCTTATATAT
TTTATTTTTTCTCTTTCTCTTTATACATTCTTTAATTTTTTTTTATTTCT
ACTTTTTCCTTTATTTTATCTTTTTTCTATTTTTTTATTTATTCTTTATC
TTAATATTCCCATTCTATTCTTTTTTTTTTCATTTCTACTCATTTTTTTC
CAATATTTATTTCTTTTTCTATTTTATATTATTTCTTCTAATCTTTTTCC
TCTATTTCGTGTTGATATCATCTTATTATATTTCCCTGACATATTTCCTA
TTCTATTATCTTTCTTTCCTCTTCTTCATCCTATTATCTCTTCTCACTTT
TCTTCTGCTCTGTACT
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 12 6 6 6 6 8 8 3 0 0 3 9 9 9 7 7 8 8 9 12 10 8 8 8 8 8 8 15 19 8 8 8 8 12 15 19 19 35 28 24 28 28 33 33 37 47 47
50 57 47 47 47 50 37 37 47 35 34 34 30 35 35 53 50 50 37 30 28 27 19 19 9 9 9 12 7 8 6 6 6 6 9 11 11 11 11 21 15 13 12 11 22 26 33 33 53 53
53 53 53 42 38 36 36 36 31 31 31 31 31 27 22 10 8 8 8 8 10 12 17 17 28 32 32 43 43 31 31 31 31 24 22 10 10 10 10 11 23 25 37 37 37 39 41 50 50 50
57 57 48 47 47 47 47 53 53 59 59 59 59 59 57 36 36 36 42 42 42 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 53 48 48 57 57 57 59 48 48 48 57 57 57 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 39 39 43 48 57 68 57 57 57 59 57 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 53 50 57 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 37 31 21 16 15 12 12 13 15 15 20 21 29 30 47 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 47 39 32 32 32 37 43 43 43 47 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 54 54 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 59 59 68 68 68
68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 57
57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 59 57 57 57 57 57 68 59 59 57 52 52 52 57 50 52 52 52 52 52 52 54 57 57 68 68 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 57 50 43
43 50 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 47 44 42 42 33 30 31 37 39 46 57 57 57 47 43 43 47 47 48 48 44 44 30 30 30 44 44 54 54 54 54 54
46 57 48 48 42 48 48 48 47 47 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 47 47 32 31 18 21 22 29 29 39 48 30 30 14 14 14 23 23 24 27 25 32 31 34 28 28 33 33 33
29 24 16 16 16 18 14 23 16 19 18 18 16 19 11 8 8 10 13 15 25 26 28 37 24 29 16 17 13 12 11 26 18 19 19 29 30 37 37 37 37 37 38 36 31 35 36 36 39 39
30 28 16 13 12 11 11 11 14 19 19 12 12 12 14 21 32 33 32 39 36 34 23 19 10 8 8 8 10 17 12 22 24 30 34 31 31 37 37 25 24 12 12 12 12 12 16 16 10 10
10 10 18 14 12 11 11 11 19 16 19 8 8 10 9 8 13 10 10 10 13 13 20 28 19 23 16 16 19 15 20 17 8 6 6 6 10 10 11 8 8 8 13 10 9 9 9 9 9 10
11 21 19 23 25 17 14 8 8 8 8 12 8 9 9 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 10 10 9 9 9 9 11 10 13 10 11 11 17 10 8 7 6 8
8 10 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 9 9 9 9 11 11 13 10 10 9 9 9 8 8 12 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 9 9 11 12 13 12 12 11 12 17
22 23 19 17 7 7 8 7 6 8 9 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 9 13 10 10 9 9 10 8 8 8 10 15 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 13
8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 9 15 23 21 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 14 12 8 9 9 8 10 8 8 8 6 6 7 7 10 11 14 13 13 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10
9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 13 15 18 14 12 12 10 10 9 10 10 10 10 11 11 11 15 16 15 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 15 15 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 10 19 10 8 8 10 13 11 9 10 10 10 9 9 9 8 8 10 8 8 9 9 10 10 10 13 13 11 10 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 6 6 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 13 10 10 9 9 9 17 11 12 12
12 12 8 10 11 10 10 13 8 10 10 8 8 8 8 8 8 7 8 10 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide.10 10 17 12 12 12 16 16 8 9 9 6 6 7 7 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 10 13 9 7 9 8 9 9 17 11 12 8 9 12 22 21 24 16 16 19 32 36 42 42 37
37 37 36 36 36 36 47 48 48 50 50 50 50 47 41 34 27 18 9 9 9 9 9 9 9 9 8 6 8 8 8 8 14 27 28 28 31 31 35 35 36 50 50 50 50 57 57 53 53 53
53 41 41 37 33 33 33 21 21 10 10 10 11 11 11 19 20 28 32 32 33 36 32 30 37 19 21 8 6 7 7 8 15 26 30 39 42 42 33 33 36 36 38 38 42 53 53 53 53 53
53 53 53 53 53 53 50 50 59 68 68 68 47 47 47 47 43 43 57 57 50 68 68 68 50 50 57 47 47 51 51 50 50 48 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 54 54 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 57 59 52 52 52 52
52 52 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 59 59 43 43 41 43 43 40 40 40 57 57 57 59 54 59 59 57 57 57 57 57
57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 15
15 8 8 8 8 8 9 27 27 47 41 46 39 43 39 48 48 48 48 48 50 50 53 50 50 50 53 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 44 42 29 29 29 36 42 46 42 42 46 43
43 43 43 41 44 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 43 44 44 57 59 43 43 43 57 57 57 59 59 59 43 43 37 50 43 50 50 59 59 68 59 59 57 57
57 57 52 52 52 52 52 52 52 42 42 33 43 43 50 50 52 52 52 52 52 50 44 38 33 33 35 43 43 57 43 42 42 43 43 52 52 37 45 52 43 43 42 41 41 35 43 32 32 32
43 44 52 43 43 33 33 35 43 44 43 43 42 43 31 31 31 43 43 43 38 33 29 29 33 38 37 42 43 35 35 35 50 50 50 50 35 35 35 30 30 35 37 43 42 35 28 28 28 25
25 19 24 20 24 33 36 39 37 47 43 42 42 31 31 32 42 36 44 44 57 39 39 35 35 37 48 48 44 44 25 20 20 23 32 36 31 28 28 42 31 31 25 18 26 24 24 12 19 15
17 15 15 21 20 19 18 20 19 14 10 12 12 19 19 24 24 30 37 24 24 17 24 18 25 14 15 23 19 24 20 17 13 15 18 10 9 10 13 11 19 32 39 37 27 16 11 10 10 10
13 15 20 20 18 13 13 11 11 11 18 19 21 12 9 9 9 9 9 11 15 18 15 17 11 9 10 10 10 10 10 11 10 11 8 8 8 10 10 10 21 19 10 13 8 8 8 10 6 6
8 8 11 11 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 17 15 12 8 8 8 9 10 10 18 18 16 11 13 6 6 8 8 9 8 8 10
11 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 11 11 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10
8 6 6 6 8 10 14 9 10 10 10 9 9 6 6 6 6 11 15 19 24 15 10 9 9 11 17 15 10 9 9 9 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 10 10
11 11 11 11 10 13 12 9 8 8 10 9 9 9 12 8 8 7 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 8 8 8 6 7 8
8 10 12 8 8 8 8 11 11 11 12 11 14 12 12 12 12 12 9 7 11 8 9 8 8 6 6 8 8 11 11 10 10 10 10 8 8 9 9 9 9 10 10 11 11 9 11 8 10 10
8 9 9 10 8 8 10 8 6 6 7 10 10 14 10 13 8 8 8 7 7 11 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 11 11 11 9 9 9 9 9 9 13 8 8 6 6 8 8
8 6 6 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 9 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 7 7 8 10 15 12 11 11 8 8
8 8 8 8 9 8 10 10 15 10 10 9 10 8 8 10 9 9 9 10 10 10 10 12 7 9 8 10 8 10 10 8 16 10 10 8 7 6 8 8 8 10 10 13 15 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 13 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 12 9 9 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 6 6 6 6 8
10 8 8 8 8 8 12 12 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 11 11 8
8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 6 10 8 8 8 8 |