BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161P14.T7 (MSMg01no161_p14.b1) | MSMg01-161P14.TJ (MSMg01no161_p14.g1) |
ACC | AG361238 | AG361239 |
length | 1,224 | 1,275 |
length of high quality (start - end) | 420 (27 - 446) | 385 (81 - 465) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_p14.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_p14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:29:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_p14.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_p14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:29:13 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGACTATGCGCGCTAAGNATCCTTAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTC
TGTACCTCATTTTTAATAGTGGTATTTGATTCTCTGGAGTCTAACTTCTT
GAGTTCTTTTTGTATATTGAGTATTAGCCCTCTGTTGGATATAGGATTGG
TAATTATCTTTTCCAAGTCTGTTGGTTGCTGTTTTGTTTTATTGACAGTG
TCCTTTGCCTCACAGAAGCTTTGTAATTTTGTGAGGTCCCATTTGTCTAT
TGTTGATCTTAGAGCATAAGCCACTGGTGTTCTGTTCAGGAAATTTTCTC
CTGTGCCCATGTGTTCTAGACTTTTCCCGACTTTCTCTTTTATTAGATTC
AGTGTATCTGGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCCACTTGGCCTTGATTTT
TGTACAGGGAAATAAGAATGGATCGATTTGAATTCTTCTACATGTTTTTT
TTCCCCCCGCCCCAGTACCATGTGATGAAAAAGAAAAAAACCACTGGATG
GTTTTAGCTCCTTTGTCAAAGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCAT
TTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTCATCTACCTGTCTGTCTCTCTACC
AATACCATACAGTTTTTATTACTATTGCTCTGTAATGCAGCTTGCCAACC
TGTTTGCCATTGTGTAAAATGCAGAGGGGGCATAGGACACTGGAACCTTT
TTGTAAACAAACCATTGGGGCTCATGAAGCCAGGTATAAACCAGTGTGCT
TAAAACTCTCTGTAGGTCAGTAAACTCATTAGGTTTGTATCTGATGAGTG
GTACGCATTGATTGTTATTTAAAAGATATCGTCCTAAATAGTTCTGGTAA
ATGTTTTTGTCTCATTTATATATCTGGTCTTTTGAATTGTTTCCCCTCTG
CCTCCTAAACAGTTTGTCCTTATTTCTTATTTTTTTTCTCCTCACTTTCT
CCTCTTATTTTCTTTTTTTATTCTTTTTATCTTTCTTTCGTTTTTTAATT
TACTTTTTCTATTTTTTTAATCTTTTCTTTTTTTTCCTTTTTCTCTCTTC
TTTTACTTAACCACCTTATTTTCTTTATTTTTCTTCTTTTCCTTCTTCTT
CTTGTCTTCTTCTTTCTATTTCCTTTCCTTTGCTTTCTTTCTACACTTTC
TAACTACTTATCTCCTCCCTTTATCTTTATCTTCTTTATTACCTTTATCT
CTTTTTTATATCTTTTCTACATTC
| CCAGTTTNNNNNNACAGAAGTGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATGACTCCAGGGAGTAGAC
AAGGGGATAACAGGACAGAATTTGCTTCCACAAGCCTTCTAGCTAGCCTC
CACATGCTTCTGAAAACTAAGCACGGGGCTTCTACTAGGAACTACAAAAG
ATTCATCTTCGGTTTGCCTCGGTCTCTGGAGAAGACAGGTGAAGCAGCCA
AAGCTCAGGGAGATGGACCCTAGGCATTGCCCTGGCCACCTCAGGAGAAT
CTGAAGACCCTGGAGCCGACAGCAGCCACTTGGAGAGTAGTACACTTCTG
CGGTTCCTCTTGTCACATTGTAAGTTGACTATTGCCTGGCACTTTGACAA
TGGACTTCAAGAAAAAAAATGTTCAACAAACTTTTTAAAGGGGCAATGGC
CACTTAGCAGTATTGATTTGACTCCGTCTGTCTTGTGAAAAAATCGTGCA
GGAGGTAACCCCAAGACAGAATAGGTCACATTGGAGCTAAGGACCCTAGT
GATCCTGTCAAGTCTGCTTAAGGCAATAAGTGGGTATGAGGCCAGGTCAG
TGACACAATGGCGATGCAATTAGCTGACTGCTCACCCAAGGCCTCATCCC
AGAGCTGGTCTGTTGACCTCCCAGCCCTCAGCAGTGACTCCACAGAACTT
TGTCAGCACAGGGGACAGGAGAGGTGGATCACAGGAGTGTCCCCAATGTG
TACCCACTCCATCTGGAGACATCTGTCAGTCAAAGGAGCATTTTTTTAAA
TGCTCACCCTGATTCAGATCCATTACATCTCANAACCCTTTCATTTCAAC
GCTCACAACAAAGAAATGTATGGGTGAGCTTGTGAGATAGGCCTTTTCAG
GAAACAGGCTCAAAACCAGAGGAATTACCCTCCTTAGCATCTTATTAATT
CCCCTGGAGGCCCCAAACCGTCTGTCTTGCTTAAAACTGAAACCTTTTCT
GGAACGGGAAGGGACTCTTCCTCCTCCTAAAATTTAAAGCAGAAAGGGGT
TCCGTTCCACTCTTGTGTGCAACAAAAAACAGGCGTAACAAAGAAAATTC
TAAACGGGGCCCCGGGTGTAACTTGTTGCTCCCCCTCTAACTCAGGAATT
CTAAATAAAATCTCTCTAAAAGGCGTGTTTTCTCGTAGGACACCCCCCCA
ACTAACACTCCGGCTTTGCGCTCCCCTGTCCCGTTTGCATTATCTTTCAT
TATNATTGCTTCTCTTTTTATCTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 7 7 7 6 6 8 9 15 13 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 19 19 30 33 33 36 33 36 36 42 42 43 42 39 43 43 34 43 43 43 57 48 48 48
43 42 43 43 47 54 50 48 48 48 53 32 23 10 8 8 22 22 47 47 54 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 42 47 47 47 47 47 47 50 47 57 57 57 68 57
57 57 68 57 57 57 57 57 68 57 50 50 50 50 50 50 50 50 68 51 50 51 51 42 43 35 35 24 28 26 37 37 42 42 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 41 28 20 16 23 12 12 11 11 12 12 34
34 59 59 59 59 59 50 50 59 50 53 50 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 53 57 57 59 59 59 59 57 57 57 53 53 50 59 59 59 59 39 21 20 9 12 9 11 13 13 14 20
20 22 22 22 20 11 11 7 7 7 8 11 23 25 41 59 59 59 59 59 41 39 28 26 23 19 19 18 15 8 8 8 8 8 8 14 13 13 11 10 10 10 10 12 15 18 41 41 50 50
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 42 42 39 39 41 47 59 57 57 48 48 48 44 47 57 48 54 57 57 57 68 59 59 68 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 57 41 48 50 41 42 44 43 43 43 44 48 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 57 59 57 57 57 57 57 48 57 48 48 48 57 57 57 57 47 47 54 54 48 47 59 57
59 59 59 47 47 43 43 47 43 43 43 43 43 57 57 59 59 57 59 59 59 48 48 48 57 43 43 35 35 37 37 28 19 18 22 28 24 29 25 25 34 34 43 37 31 29 24 24 27 28
33 39 34 41 25 15 15 23 23 32 31 18 18 14 14 30 30 43 34 23 14 10 10 15 10 21 18 10 8 8 8 10 13 13 15 15 18 19 22 22 31 31 33 31 31 28 33 39 43 57
41 24 17 17 24 24 28 32 30 21 16 13 13 10 10 10 12 12 12 11 11 11 18 17 19 18 11 11 15 11 11 11 19 11 8 8 8 8 11 10 12 13 13 13 15 20 12 10 10 8
8 8 8 10 10 9 10 10 10 21 25 30 17 17 17 15 24 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 14 13 20 11 12 12 20 23 13 10 10 13 10 15 12 14 9 9 8 8 10 8 8
8 8 8 7 8 8 9 10 11 11 19 18 16 16 10 13 9 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 10 8 8 9 13 8 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
9 11 8 8 8 8 9 13 8 8 8 8 10 9 11 8 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 7 7 16 15 11 9 8 11 8 8 8 10 7 7 8 8
8 7 6 6 8 8 8 8 8 10 11 10 12 14 10 9 9 9 12 13 15 18 8 8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 22 12 11 7 6 8 8 8 8 9 10 9 8
8 7 6 8 8 8 8 8 13 12 7 7 8 8 10 16 15 8 8 6 6 6 6 8 8 14 10 11 7 7 10 12 10 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 13 16 19 20 19 12 8
8 8 8 8 12 15 10 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 7 7 8 8 8 8 12 14 16 13 8 8 8 10 10 16 10 13 7 6 8 8 8 8 8
8 9 13 10 10 10 10 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 11 12 12 12 10 8 8 10 11 10 11 8 10 10 7 7 10 8 15 10 10 9 7 10 6
6 8 8 9 9 6 8 8 8 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 10 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 13 13 12 9 13
9 10 9 8 8 6 6 8 8 8 11 8 6 6 10 10 8 8 8 10 13 10 10 11 10 11 11 8 8 8 6 6 6 11 11 11 11 11 11 9 8 6 6 10 10 8 10 10 12 8
8 8 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 6 | Open.Hide. 7 7 8 8 10 9 3 0 0 0 0 0 0 3 9 9 7 6 6 6 7 7 7 3 0 3 6 6 6 7 10 9 10 13 7 7 9 9 12 10 17 19 15 8 9 9 23 23 31 30
30 30 30 32 35 36 37 37 37 43 43 43 43 42 53 53 53 53 53 53 50 50 41 28 28 12 15 15 10 10 10 10 12 14 22 25 22 30 29 37 28 35 36 35 35 35 38 42 53 48
48 48 57 50 53 50 50 50 50 68 68 68 68 57 43 32 19 19 15 15 16 15 26 18 24 29 30 30 28 30 30 37 37 57 57 68 57 48 42 37 35 35 35 36 36 48 48 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 54 57 57 57 57 57 57 57 57 50 52 50 50 50 50 50 50 57 59 57 52 52 52 52 52 54 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 44 44 57 57 57 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 68 68 59 59
57 57 57 57 57 57 38 32 18 15 14 15 15 23 32 41 59 59 59 68 68 59 59 57 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59
59 59 59 59 48 47 47 46 27 25 15 11 11 11 11 12 14 28 23 15 15 12 11 11 12 9 11 11 23 21 37 37 59 59 59 59 59 47 37 43 33 32 31 30 30 25 25 21 25 12
12 12 12 12 11 11 12 24 28 37 37 47 43 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 54 48 54 54 47 43 43 43
46 48 32 44 32 41 23 44 37 48 48 44 47 35 39 39 48 48 54 54 54 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 43 43 43 43 28 28 14 18 18 30 41 43 43 37
43 43 40 34 37 30 30 30 39 33 37 41 43 47 41 41 41 41 43 43 59 48 48 48 59 41 39 32 30 30 37 37 36 37 35 59 32 32 31 34 34 32 32 39 37 41 39 41 41 40
31 31 25 28 28 30 30 39 43 37 47 37 39 37 39 37 37 37 41 43 47 41 41 41 31 31 41 39 37 35 39 37 39 48 43 43 43 43 39 41 36 36 36 37 37 37 37 41 41 41
43 39 39 35 37 37 39 39 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 37 36 36 36 37 36 37 27 30 32 37 36 36 36 37 33 33 33 33 33 39 43 43 43 43 43 43 39 47 35 36 36
37 32 27 27 32 36 36 32 29 29 32 37 37 41 34 36 39 39 39 41 47 46 47 48 48 41 40 40 39 37 37 37 32 31 39 43 41 41 41 33 25 23 24 22 19 19 29 23 23 20
25 30 28 28 23 23 20 30 30 37 37 39 32 26 15 13 12 12 14 14 19 19 25 30 25 22 12 12 15 18 18 3 0 3 23 14 22 24 24 18 22 10 10 10 16 15 19 17 15 17
15 16 15 13 13 9 9 8 8 11 15 8 8 13 26 27 32 30 30 30 33 29 28 25 20 20 10 10 10 12 11 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 12 23 20 14 12 12 12
13 22 32 23 15 10 9 9 9 8 8 10 12 12 14 15 14 12 13 10 10 8 8 6 6 8 8 10 15 12 10 10 12 10 14 10 11 10 9 12 9 9 9 8 8 10 10 13 11 17
18 15 15 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 14 14 17 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 9 10 9 12 10 10 10 10 10 10 10 10 8 9 8 8 8 8 10 10
10 8 6 6 6 6 7 8 10 11 11 9 10 9 9 9 10 11 11 11 11 11 11 11 11 9 9 9 9 9 13 12 8 8 8 8 8 7 6 6 9 9 7 7 10 8 7 6 6 6
8 6 9 12 10 12 12 11 11 11 11 11 10 12 9 9 8 8 8 8 8 10 10 11 15 16 20 10 10 7 6 6 6 8 7 8 8 8 8 9 12 9 10 10 13 12 16 12 10 10
10 11 11 12 12 12 12 12 12 12 12 12 12 15 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 12 15 18 16 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 8
8 8 8 6 6 6 6 7 7 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 15 9 9 9 10 10 9 13 12 13 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 10 10 10 12 10 10 8
8 7 7 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 9 9 6 8 6 7 13 15 11 7 7 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
10 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 |