| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-171N02.T7 (MSMg01no171_n02.b1) | MSMg01-171N02.TJ (MSMg01no171_n02.g1) |
|---|
| ACC | AG367934 | AG367935 |
|---|
| length | 727 | 722 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 314 (46 - 359) | 284 (85 - 368) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_n02.b1 PHD_FILE: MSMg01no171_n02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:42:07 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no171_n02.g1 PHD_FILE: MSMg01no171_n02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:42:07 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (120,484,442 - 120,484,748) | (120,368,742 - 120,369,022) |
|---|
| sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAGTGACACAGACTGGACCAGGGGCTCGCTTCTGTGATGTCCAGTG
ATGCCATGCGTCTTCATAGCATGCAGAGTATACCTTAACTATCTAACAGG
CATAAATACAGCTAAAACATGTTACAAGTCTGCAGACATTTCCTTACCTA
CAAATTTCATCAAACGATTACCAAACTATTCATTAAAGTTTAAAGCCTTG
TTCTGACAGGCACTTAGAAACTGTGTTTGTTTTATTTTATTTTTTTATTT
TATGTTCACTGGTGTTTTGACTGCATGGATGTCTGTGTCAGATGTCAGGA
GCCCTGTAATTATATTACCCCACCCCCGTGAGCTGACATGTGGGTCCTGG
GAATTAAGCCAGGTCTTCTGAAAGAGCAGCCCCTACATGGACTTTGTTTA
AAAAGATCTTTTTCTTTGAGCTTATAAGACAATCTAACGCAGCAAGGGAT
GTGTTTTTAACTGACTCTTGACACAAGCTACAGGAACTTAGGGATGCTGG
CCATAGTGGATTACCCCGCACTTGACAGACAGAGGCAGGTGGATCTCTGT
GAATTCCTGGCTAACCTTCATTACCTAGTGAGTTCCAGACTGAGAATCAC
ATGTTGAAAACTTGTCTTAAGAGAAAAACAAAGGCCACGCAGCGGTGGTG
ACATATGCTTTTAACCCTAGCACAGAG
| NTCACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATACATTGTTACAGG
TGAGGAATAATTCATGTGTGTGCTTTGGCACTCTCACAGCAGTTGATAAA
CCACTCCTGGTAGAGGTATTAGTGAAGTGGTCTTTTCAGTTAACTTAGCC
TTCATTATAATTTATTTCTGTTAGCTTGTATCAGATGTGAAATTCAAACT
TGGAGTCTTAGGCAAACTCTTATTTCATTAATCTATGCTGTATCCATGAA
AAGCAACCAGCATATATTTAAACTTCTGTCAACAGACTCTGCTAAAGAAT
TTTATCCCTCAGAGATTTTTTTAATTCCTCCCCCACCCTGAACAGTTGAA
CATCTTTAACAGTAGTCAAAGAGGATAGATACACTTTGGAATTTCAGTTT
TTGTCCTTTGACAAGTTGTCCCTTGTCTGAGTCCATTTTTCTTATCAATA
AAATCTGGGAATTCGTAACTGTTGTGTACAGTTGTGAAATTTTAATTAGA
TAACATACCTGTGATGTGGTGCCTGAGTTATAACCATCACCCCCATTTTC
ATGATTGATAGGACTTCTACGCCGTTTCCCGTCCTTTATATATTTATGTT
ACCCGACCACCTTTTCTCCCCCTTCCCATTTTTTTCGCTTTTGTTCTTCT
TTTTCCCCTTCTTTCTCCTACC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 17 37 44 41 37 37 37 31 31 37 37 37 37 37 37 37 37 37 39 31 24 28 28 28 35 43 47 43 43 43 43 46 57 57 34 34 28 29 29 42 41 57 57 47
42 42 41 41 41 41 42 42 47 47 41 41 41 41 41 41 57 57 57 57 50 50 50 68 68 51 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 50 50 50 51 51 51 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 50 50 50 50 50 50 57 54 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 57 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 57 68 68 68 68 57 57 57 59 54 59 59 59 59 59 44 48 43 43 43 43 43 43 46 43 48 68 48 48 48 48 57 48 48 57 48 50 50 50 50 57 59 59 59 57 57 48 48
48 48 43 32 19 10 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 9 10 10 10 8 12 8 9 9 9 11 11 15 21 32 34 41 41 48 48 48 43 43 39 39 59 43 59 59 48 48
42 39 43 42 42 42 47 59 59 59 59 43 43 43 59 59 59 59 54 54 47 47 24 24 14 12 12 12 15 15 30 34 57 48 57 57 59 54 57 57 48 57 57 44 47 35 35 35 42 42
57 57 57 48 48 48 48 48 48 59 59 48 48 48 59 59 59 57 54 54 50 50 43 44 43 44 36 43 42 47 42 48 48 57 57 48 48 48 42 47 35 35 35 59 59 57 57 57 47 47
47 57 59 48 48 48 48 46 48 47 47 47 48 57 57 54 54 54 54 48 42 42 32 32 36 36 36 39 42 42 37 30 30 33 37 43 43 34 34 23 23 22 32 31 36 36 37 34 37 30
30 34 31 28 21 15 15 19 19 30 37 37 39 40 40 40 43 43 40 43 40 43 39 39 28 28 28 31 24 22 22 22 23 28 28 36 36 31 34 23 20 19 28 24 24 30 32 32 39 39
43 39 39 37 33 37 37 32 27 27 32 25 30 22 19 19 25 33 33 33 37 37 32 28 24 21 15 11 16 16 28 23 27 25 30 30 25 19 24 25 21 23 11 11 11 16 15 20 24 31
33 36 39 39 39 39 36 19 25 22 24 18 18 23 23 28 23 23 13 12 12 15 21 23 30 24 19 21 14 14 14 15 19 18 12 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 14 15 11 16 10
12 10 12 12 17 17 36 39 31 30 22 12 10 10 9 9 8 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 8 10 8 8 8 7 10 11 18 30 27 32 37 37 37 37 40 39 37 37 37 37 39 34 31 39 37 37 39 40 40 40 40 43 39 36 36 38 42 42 47 47 57 48
48 48 47 47 48 48 39 43 43 59 59 57 57 57 57 29 41 41 41 41 41 47 47 57 50 50 48 48 48 47 47 47 47 47 57 57 57 47 47 47 47 57 48 57 47 41 41 41 50 41
57 57 57 57 46 50 47 47 48 50 57 57 57 50 50 50 59 59 59 50 50 43 44 44 57 57 54 50 50 43 43 52 52 52 52 52 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52
43 43 43 52 52 52 43 43 43 44 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 43 44 35 35 43 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 44 43 43 31 43
43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 52 57 57 57 57 39 39 37 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 43 50 35 43 43
50 43 57 43 47 38 41 43 44 43 57 57 59 50 57 43 43 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 50 50 48 50 50 57 59 57 57 57 48 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59
57 57 57 57 57 57 54 57 48 57 57 54 57 59 59 59 68 59 59 59 59 35 30 36 36 41 31 37 28 39 35 47 59 47 47 43 43 43 46 46 43 43 43 43 43 48 48 57 53 50
50 50 59 57 48 48 59 59 59 59 30 22 16 12 12 15 13 19 23 25 29 24 12 12 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 21 25 39 41 42 42 48 48 48 48 48
39 39 37 43 43 43 43 57 48 43 43 43 43 34 34 25 30 30 40 40 48 54 57 57 57 57 44 44 22 27 18 23 20 23 23 21 24 13 18 19 44 44 57 57 48 57 48 54 46 59
43 47 37 37 37 43 47 59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 43 42 43 43 43 50 50 43 37 37 43 43 33 37 37 43 50 57 57 57 59 57 57 54 54 57 57 37 42 33 42 42 44
59 44 44 35 42 32 32 27 35 35 44 44 42 42 35 37 37 57 43 44 40 47 47 41 40 30 30 30 36 43 42 42 36 39 33 46 46 48 54 54 48 43 42 36 36 32 32 17 18 14
23 21 37 37 39 39 39 43 43 39 39 35 35 39 39 34 39 36 23 16 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 10 8 8 12 10
11 10 10 13 12 8 8 8 10 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 9 10 15 17 10 9 8 8 8 8 10 10 15 10 10 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 6
6 8 8 8 8 10 9 12 12 11 11 11 18 13 10 10 8 8 8 9 11 13 16 12 10 8 8 12 12 11 11 15 10 13 13 10 11 11 21 17 15 8 8 8 10 10 13 21 29 33
37 36 28 21 21 16 14 10 10 10 10 10 12 12 8 8 10 12 12 12 19 15 |
|---|
