BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176J11.T7 (MSMg01no176_j11.b1) | MSMg01-176J11.TJ (MSMg01no176_j11.g1) |
ACC | AG371245 | AG371246 |
length | 1,313 | 1,287 |
length of high quality (start - end) | 779 (93 - 871) | 377 (75 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j11.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_j11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_j11.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_j11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCATATTNNNNNNNNGACATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCCATTCTAACAACAAAACCCTTTAGAAGCAATAATAACT
TTTCCTTAATACCTCTTAATACTCTATGAACTCCATTCCCCAATAGAAAG
ACATAGAATAACAGACTGGTAAAGTAAACAGGAGCCAACATTTTGCTGCA
TACAGGAAACCTACCACAGTGGCAAAGACAAACACTTCTTCAGAGTAAAA
GTCTGGAAAACAATTTTCTATGCTAATGGTCCCAAGAAACAAGCTAGAAT
ATCCATTCCAATATCGAACAAAATCGACTTTTAACCTAAAGTTATCAAAA
AATATAAGGAAACACACTTCATACTTATCAAACAAAAATCTACCAAGAAC
TCTCAATTCTGAACATCTATGCTCCAAATGCAAGGGCAACCACATTCATT
AAAGAAACTTAACTAAAGCTCAAAGCACACATTGCACCTCATACAATAAT
AGTGGGAGACTTTAACACCTTACTCTCATCAATGGACAGATCATGGAAAC
AGAAACTAAAAAAGACACAATAAAACTAACAGAAGTTATGACAATGGATT
TAACATATATCTATAGAACATTTTATCCTAAAACAAAAGGATATATCTTT
TTTTTCTTCTCAGAACCTCATGTTACCTTCTCCAAAATTGACTGTGATTG
TCTTTATAATCAGTTCCAAAACACACCTCAACAGATACAAGAAAACTGAA
ATAATCCCATGAATCCTAACAGACCACCATGGACTACGGCTGATTTTCAA
TAACAACATAAAGAATAGAAATCCCACATACATGTGGAAATTTAACAATA
CTCTACTCAATGATAACTTGGTCAAGGGAAGAAATAAAAAAAAAATTAAA
GACTTCTTAGAGTTCAATGAAAATGAAGCCCCAGTATACCCAAACCTATG
GGACACAATAAAAGCAGTGCTAAGAGGAAAACTCATAGCTCTGAGTGCCT
CCAAAAAGAACTGGAGAGAGCTTACCTAACAGCTTAAAATACCCCCTGAA
GCTCTCAACCAAAGGGAAGCAATGGAACCTAACAAAAAAACAGGGCCAGA
AAAAATTCAACCTCGGGCTTGAAATCCACCCATTGGAACCAAGAGAAATC
TTTTCAGAATCCAACACACCCGGGCCTGTTTGTTGAAAAAAAAAACAATA
TAAAACACTCTTATCCCAATTACAATAAGGGGCACGGGACGCCTCTCTTT
TATCTAATCTCAAATTGAAGAAAGGGGAACTTATTTTCTCTCTAGAGAAT
CCCAAAACTCTTC
| NNNTTTATGTTGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATGTCATTTGTAAACACAAACAAAC
CTTCCTTCAGAATTAGTCATACCGTGACATTGAAAATTCTTTAGCTTTTA
TAAACATATTCATCATATTCATTAAAGTAAAATTCCATTCTATTTTTTTC
TCCCTTCCATATGTCCCTACTCCACAATCAAATGAAGTCTATAACACAAG
AATCTAGCCCCAAACACACATTTGCTATTTTGGGAACTTTTCTTGCTCCA
TGGCATAAAACATCTGGTCAAGTATAGCTACCTTCTGTGGCTATAATCCT
CTCCTGGGAAATTAGTCTCTTTGGAATATCTTTATGCAAATAAATATTAT
TTTTGCTTAGACTTCAGAAAGTGTCTAGTGTTGTAAATTGTTGCTCAAAA
ATATTTTTTTTCCCCCCCCCAGTGATTTTAACACCTCCCTAACAAAAAAA
GTTAGTTGGACATAATTTCATAATGCCCTTGAAAATGGGTTTGACTTCTG
CTCAGCATTTATATTCATTAGTCCCATTGTTTTTGAGATGATAATTATGA
CATTTCACCCTTACCTTTCCTCATTCCAAAACTTCTCATACACTCTGTCA
AATCAATGTTCTTTTTACATGATCTGTTGCCAGCTAAATACTTTCTCAAA
CAATTGTCATTACATAATTTTAAAAATTCTTTATTTGTTCATTAAGAAAA
ATGCCTCATAATTTTAGTTTTGTGAATAAGAAGGAACATTGGGGAAGTGG
GAATAAAGAGTAATAGAAACAGAAATAGTGAAATATATTTGACAATAGTA
GATAATTTAAATACTAACTGAAGTTTAAGAACTTTGTAATGTGTTCTTTA
TTACATTCTCCAACAATATGTAATTACTGCTTGATTATTAAAAATAACTT
TTCCCCTTGTGATTAAACCCAAAATACCTTACTTACCAAACTAGTTTTGA
AGCTTATATTTTTGAAATTCACCCTCTGTTGGACAGGGCCCACCCATTTA
ATTTTTAACTAAAAATATGTCCCTTATTTAAAACCAAAACCCTAAATAAA
AACCCGGGGCAAAATATAGTAAACCCACCCCCCATAACCAAATGAATAAA
TTTTCTCATAAACCCCCCCCCAAAAGGGATCTTATTTTGAGGGGGCCTTC
TTATTTCTCCTCATATTCCAGACTGTTTTTCCAAAATTCAAACAGCATAA
TGCAGCCCTGATATTTATAACCCACATCTTCCATTCA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 8 7 6 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 11 13 8 8 8 12 13 16 19 24 35 28 23 24 23 23 23 42
43 47 42 39 42 39 39 47 42 26 29 17 17 17 31 24 28 35 35 31 33 33 33 33 37 27 20 12 12 12 15 12 8 8 9 12 10 9 11 11 11 11 21 19 34 34 33 33 33 43
39 39 48 48 42 38 38 31 31 31 37 37 37 40 40 37 26 23 9 9 9 9 10 9 10 10 19 22 31 42 22 25 13 13 12 28 32 48 54 57 54 47 46 48 46 47 54 59 57 59
57 57 48 42 37 37 42 42 42 48 47 47 43 43 57 47 46 46 46 46 41 46 50 57 57 57 57 57 54 54 50 57 57 50 48 48 52 52 54 54 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57
57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 59 57 52 52 57 57 52 52 57 57 59
59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 35 35 31 43 43 62 43 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 54 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 43 43 52 62 62 62 62 62 52 52
52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 43 39 39 12 23 23 27 27 43 43 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 43 43 43 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 44 44 43 43 39 59 59 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
52 52 52 52 62 62 43 43 35 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 59 68 68 68 68 59 59 43 35 35 44 44 68 68 68 57 57 57 57 52 57 59 57 52 52 52 59 59
59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 57 52 52 52 57 52 54 57 59 59 59 57 57 57 57 57 52 54 54 57 57 50 50 48 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57
59 59 57 57 57 48 48 48 57 44 57 43 41 41 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 68 59 59 57 54 47 47 43 43 48 59 48 48 54 59 59 48 48 43 43 43 43 43 43 48
48 43 43 43 57 57 57 59 59 59 57 48 48 59 59 59 47 48 48 48 48 43 43 36 36 36 43 28 22 16 16 25 28 33 33 30 30 22 28 28 33 28 32 37 41 41 43 43 37 37
39 41 37 37 41 59 59 41 46 46 46 46 46 41 41 37 37 28 34 34 37 37 37 31 37 39 39 39 37 37 31 34 39 39 40 41 35 33 30 37 37 37 32 31 31 31 32 28 28 30
34 31 31 32 32 31 39 39 39 41 39 39 39 39 36 43 41 41 39 34 34 25 20 20 16 18 18 28 24 37 31 31 31 37 37 31 36 23 21 10 10 10 21 17 30 28 28 23 30 30
18 18 23 28 28 28 28 23 23 23 23 34 30 36 36 39 30 24 22 22 13 10 9 9 9 10 10 16 18 20 23 22 29 25 22 22 19 17 17 32 37 19 12 10 10 10 8 11 9 9
10 13 19 11 14 14 13 13 9 11 12 23 16 10 8 8 8 8 9 11 11 11 15 22 16 11 10 10 10 14 18 16 14 14 12 12 16 21 18 16 11 11 11 11 14 22 18 17 13 11
8 8 10 8 8 9 8 8 10 10 9 10 8 8 8 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 10 16 19 11 9 8 8 8 8 11 11 10 10 10 9 10 10 14 9 11 10 10 9 9 9
9 9 10 15 18 18 9 9 9 9 11 10 8 8 8 8 9 9 9 11 10 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 12 11 12 12 21 18 14 8 8 8 10 10 9 7 7 6 8 6 6
6 8 8 8 8 8 11 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 11 9 9 10 10 12 11 12 10 10 9 8 9 11 11 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 12 7
11 9 10 12 12 9 9 12 10 8 8 6 8 9 9 9 11 8 7 7 7 10 9 9 12 12 10 9 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
9 9 6 6 6 8 8 10 12 8 8 8 8 8 10 8 6 6 11 7 17 15 11 9 9 9 9 9 6 6 6 6 10 8 10 10 14 18 20 22 15 15 15 12 9 9 10 6 6 6
7 7 10 13 11 7 9 9 9 9 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 7 8 10 10 10 10 11 8 7 8 7 8 10 17
10 10 8 8 6 6 10 8 6 6 6 11 8 8 8 7 6 8 6 6 6 7 8 9 8 8 6 6 6 7 8 7 6 8 8 10 10 12 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 9
8 6 6 9 7 7 8 11 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 10 6 8 9 9 9 9 10 12 13 9 8 9 8 9 9 16 15 15 8 9 10 22 19 29 15 24 24 30 32 35 36 37 37 37 37
37 37 37 42 57 48 50 50 48 48 48 43 43 46 46 68 68 57 57 57 47 47 41 47 47 41 41 41 41 41 47 57 48 50 50 50 50 50 57 59 59 44 44 47 57 57 57 57 42 44
37 46 44 47 47 57 40 40 35 37 37 50 50 42 41 48 42 47 50 50 57 36 25 10 10 10 14 13 32 32 50 50 57 57 57 57 57 52 52 52 50 50 37 41 41 52 50 50 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 57 57 59 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57
57 57 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45
45 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 43 39 39 39 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 50 52 54 52 59 52 52 52 50 50 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57
54 54 54 57 50 52 57 57 57 57 57 57 57 50 43 43 33 43 43 59 44 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 59 59 48 48 48 59 59 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59
59 44 34 21 14 14 17 25 20 26 26 44 44 40 40 30 30 30 43 43 48 48 48 48 48 59 59 47 39 39 43 59 47 48 48 59 59 57 57 48 48 48 48 48 47 59 59 31 25 19
11 8 8 8 9 9 12 27 22 19 14 11 15 18 18 16 11 10 8 8 8 10 18 30 39 30 39 32 26 16 11 11 11 11 12 12 13 19 14 10 10 9 9 9 21 16 22 21 18 12
13 10 10 8 8 12 19 30 59 59 47 47 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 57 57 54 47 46 46 59 47 47 46 46 54 54 54 57 57 57 54
57 41 41 17 17 17 41 41 59 59 59 57 57 57 57 57 57 42 47 35 41 41 43 59 59 59 57 57 54 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 68 59 68 68 68 59 59
48 48 48 59 59 59 57 54 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 59 59 54 57 57 57 57 57 68 57 57 54 54 54 59 57 57 57 48 47 43 39 39 30 40 26 26 17 30 32 48
57 57 57 57 48 43 46 43 47 47 48 57 57 59 57 57 43 43 36 36 43 43 46 46 59 47 47 41 41 34 31 41 41 41 41 47 46 59 48 48 48 48 57 57 31 30 30 30 37 43
59 43 46 40 42 33 25 25 11 12 19 27 21 23 23 18 18 23 41 41 59 59 59 59 59 48 43 39 37 37 33 33 27 24 20 20 25 30 27 30 33 37 30 30 17 17 15 19 21 19
17 19 23 32 20 19 19 30 30 41 41 31 32 39 39 36 27 22 24 24 27 28 33 18 16 11 13 10 9 9 9 12 15 8 9 8 10 10 8 8 8 9 13 22 24 24 23 23 18 16
13 11 13 13 25 21 29 32 37 28 23 18 21 21 13 13 9 9 9 13 10 7 6 6 6 10 17 24 28 18 19 12 14 12 18 10 10 10 10 12 15 14 13 14 15 17 30 28 18 12
9 8 10 19 15 11 11 18 14 26 25 27 37 37 37 29 21 23 15 16 10 14 10 10 11 23 15 12 11 8 8 11 14 15 17 11 10 8 8 8 7 8 7 10 8 8 8 13 15 9
13 11 16 11 14 13 12 13 13 8 8 9 10 11 11 11 14 22 19 8 8 8 8 8 9 13 8 8 8 12 9 9 9 9 7 10 6 8 8 10 11 11 10 10 10 10 15 17 11 9
8 8 8 8 10 14 17 20 10 12 10 16 15 15 10 9 9 10 10 16 22 11 15 6 6 8 8 12 14 10 10 10 15 13 10 10 11 10 15 10 10 9 9 13 11 13 10 12 10 10
10 10 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 18 22 15 10 10 9 9 9 10 10 10 11 10 10 10 10 11 9 9 9 9 11 13 14 16 15 10 10 8 8 10 10 6 6 6 6
6 6 9 9 15 15 8 8 8 8 8 8 11 12 10 8 8 8 7 7 13 15 10 11 11 8 8 8 6 6 14 9 8 8 8 8 10 19 18 14 12 12 9 10 8 8 8 8 13 13
23 23 16 16 12 12 11 10 10 10 13 15 15 10 8 8 8 10 10 12 10 11 10 9 9 9 10 13 15 30 25 18 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
9 9 9 10 11 11 11 11 12 12 12 12 12 15 12 12 15 11 10 11 13 13 10 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 12 13 15 13 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 10 8
8 6 6 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 8 9 9 9 9 9 12 12 8 8 8 8 8 8 16 12 10 10 10 11 11 11 6 6 6 8 8 8 8 15 12
8 8 7 7 8 8 12 12 9 8 8 8 8 10 12 14 14 14 15 21 12 8 8 6 6 6 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 6 |