BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176P06.T7 (MSMg01no176_p06.b1) | MSMg01-176P06.TJ (MSMg01no176_p06.g1) |
ACC | AG371497 | AG371498 |
length | 1,255 | 1,240 |
length of high quality (start - end) | 288 (442 - 729) | 232 (470 - 701) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_p06.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_p06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_p06.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_p06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:49:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATACCTNNNNNGCTCACTGCGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCTGGCAGGATTGAAGACCTTTATAGCCCCAACCAACCTAA
GCTATTCAGAATTAAGAGCCTATATATTATGTGACAAGATGGTTTTCAGA
TAGTATACAAGACAAACCAGGACCTAACAGGTGTACAATTATAAGCCTTT
TTAAGTTAGGATACATGGCCGAGTGCTTTATTTAATTGACAAACATGGAC
AGGTGTTGGGCGTATCTTATACTTAATAAATTAAAACATGGTACTAGTTG
TTCTCAATTTATATCTGAGAGAAAAAGCCTTTTAATTGGACCAAAAGAAG
GAAATGTAGATTGCTGAATGTAACCAGGTGAGGCCCATGAAATCTTAGTC
AGATAAGGCTGTTTACTGATTGGGCAGTGGAACAAGAAGGCCGAGCCGAA
AAGTTTTATAGAGGGGATAGACAGAGGAGAGAGACAGAGATAAGATGCAA
CATATAGATGATGATAAACTGGATCCACCTGGCCTGAAATAGCCATAGGT
AGCTATGGATATCATACAAGAGCAATAGAGTAGGGCACATTTGAACTATT
CTAGATGTGCAGCTTATATCAATATCAATTGAGTTTTGAGTTCTTTGTGT
GGGCATTTTGGGAGTTAAGGATTTACTATTATAAATCTGGCTGGTAAATT
ATAAGCCTCTGGAGCTTTCATTTTACGGAGTTAGCAGGACGCAGATGGCC
TGGGAAGATACGAGCAATTTGGCAGCAGCAAACCTGCGAAGACCATGGCT
TGTGCCTCCCAGTGAGCCAGCGGAGACCGCATTGTATGGGTGTATCCCTG
CCCAGCCCGCATTGCTTTTCATTATTACCCGCTACCGGTTCACGCAAAGA
AAATCCCCAGCTTACGCAGCTCTACCCCCCCCTCCCTTTTCTCTCTCCCT
CTTCCTTTCTTCTTTCTCTCTCCCTCTCCTCTCCCTTCCTCCTCTTCTCT
CCCTCCTCCCCTTTTTCCTCCTATCTCTTCCCCCTCCTCTCTACTCCTCT
CCCCTCCCCCTTACCTCTCTTTATCTCTTCCCTCCTCCTTCCTCCACTCC
TCCTCCCCCTCCCTTCTCTTCTTCTTATATCCCTCCTTCCTCCTTCTTCT
CCTCTCTTTCTTTTACCTCCTCTTCTCCCTCCTCCCCTTCTCCCCTTACT
TATCCTCCTCTCACCCCTTCTTTTCTTCTCCTCTCCCGTCTCTCCTCCTA
TTCCC
| CCCCNCCTCACACGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAACCCCCCAGGGCTACTTGGTGAGA
TCATGTCTAACCTTTTAAACCCCCCTATAAAAATGAAATGAAATTAAACA
TTTTTAATGTTAGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTAAGGTAGAGCAG
AGTCCTAGCAGGCCTCTTTGACCAGGGCTGTGGCTCAGTTTGTTGAACAC
ATGTTCAAAGATCTTGGTTCAGACCCCAACACTGACTAAACCAGGTGTGG
TGGCACATCTGTAATCCTAGCCCTTAGGAGGTAGAGGCTGGAGGATCAGG
AGGTCTTCAGCTACTTTGAGGCCATCTTGGGCTACACGAAAGCATGTCTT
GTTTTATCAAAAACAATAAAGCGTGAAAAACAAAAGCAAAAAAAGCTAGC
ATGTCCCTTATGTCTGCAATGAAACTTAGCATGAAACACATATTTATCTG
AAAATAAGCCAACATACCCAAGAGGGATCAGGGAACCACAAAGTGGAGAG
AAGGGTCCACGCAGAGTTGGGAGTTCACTAGGATGCAATATGGCTGCTTC
ACCCACCCACTAGCAATGTGCCTGGGGTATGTGCCAAAGACATAGAGGAG
ACAAACGGCCACTTACTGTCACCTACTCAACGTCCAGCCATCATGCCCCC
AGAACCTTGGACAGGGACAGCCTGGGAAGGATCCCCAGGGAGGGCTGCAG
TTCAGGGGACTGAAGCCCGTCTGTTCTTGCTTCTCGGAGTCCTTTGGCCT
GAAACATTTGGTGTACCCCATTAATATTATAAAGCCCAGTGTTTGCAGGC
TCGGAAAGTCAGCCCGTTTTCTCTGATATGGCAAGTCCTGTTTAAGGAAA
CCATCTGTCATTAATGGCTCTTCACCCATCCCTAACCACATTTAGTGATC
TAAAAAATCCCTGGTAAATAATCAGCTTCAGGAAACATAATGAAAATTTG
ACCATCCCTTGCCCAAAATCTCCCCGGGTTTCTCCTTAAAATCCTCCCTA
ATTTCCTTTAAAAACCATTTTTAATCCTACTGCTGCTCCCATTCTGTCCC
AAAGTGTCAAAATAAACCTCTCAAAATTTTTCCCCATCATATTCTATATT
TTCCCCCTCTCTCCTTCATATCTTGTGTGACTATCTCCTCTCTCCTTTTA
TAAAATCATTTATCCCTCTTTATCACTCTATTTTCCTGAT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 3 0 0 0 0 0 3 7 8 7 7 7 8 8 8 8 13 13 10 8 8 10 8 12 13 24 21 15 12 10 16 10 10 24 26 37 37 34 34 29 23 19 16 16
16 23 21 24 32 21 15 15 15 15 27 27 18 18 14 13 11 26 24 28 28 33 30 33 19 15 8 8 9 9 9 7 11 6 6 6 8 9 9 9 10 10 25 30 33 31 31 30 35 31
21 23 12 16 12 23 23 22 22 12 17 15 15 13 18 11 11 11 11 12 12 11 10 13 12 14 13 15 13 13 11 11 18 18 19 20 20 35 41 30 26 17 24 24 37 37 28 28 14 14
12 22 12 23 11 21 21 28 24 28 23 23 20 24 19 16 14 14 14 18 29 37 43 43 42 33 28 28 28 28 42 32 28 21 14 14 15 28 19 24 23 21 21 32 18 18 11 12 12 22
21 28 28 25 28 31 25 22 28 37 28 24 12 12 12 23 18 19 12 12 12 22 25 36 37 33 33 43 43 43 32 23 15 11 11 18 22 32 32 24 10 8 8 8 10 15 27 32 37 33
37 32 28 23 23 23 37 32 23 20 20 20 20 23 36 36 43 42 44 48 57 44 44 31 23 18 18 15 15 13 12 15 11 11 9 9 9 9 10 10 14 16 10 10 10 10 24 12 12 12
25 25 32 34 25 25 25 20 32 28 30 28 32 32 17 12 12 16 16 23 32 28 28 32 32 39 39 43 48 30 30 18 18 11 15 11 15 12 15 13 11 11 11 12 19 34 34 47 41 43
37 37 35 35 32 30 24 12 12 12 25 25 40 47 39 39 32 43 30 30 23 19 14 12 12 12 12 13 13 18 21 10 9 9 9 9 10 14 23 23 28 28 39 30 28 21 11 11 12 12
18 22 31 28 18 12 12 9 9 9 11 11 11 11 16 16 28 31 30 28 26 30 30 34 23 28 20 20 28 23 20 12 12 12 30 19 23 23 19 22 17 17 17 27 27 37 37 37 37 44
59 59 41 41 39 43 43 47 32 28 20 20 20 24 18 23 23 34 28 26 26 14 14 14 21 23 34 34 34 28 33 33 30 30 28 28 37 41 32 39 28 28 25 25 25 33 36 29 36 43
36 43 43 44 43 43 28 25 33 40 46 48 48 57 57 57 32 32 20 31 20 44 44 34 30 14 14 14 34 27 46 48 48 32 32 28 23 23 28 28 42 32 32 14 16 16 34 41 57 44
44 37 33 33 33 35 31 43 43 59 43 43 27 18 12 10 10 10 10 12 13 21 32 38 38 38 43 43 43 43 43 35 35 43 43 43 43 38 38 38 42 38 44 43 43 38 43 43 52 57
43 43 37 37 43 50 52 44 43 33 33 33 44 44 59 43 39 35 35 35 35 35 43 42 42 30 30 30 43 44 44 42 35 35 35 42 42 42 42 59 43 43 37 37 30 27 14 14 14 15
12 16 20 27 32 25 37 36 30 18 15 13 13 13 28 30 43 40 37 28 32 32 35 37 40 40 35 35 30 24 26 14 15 16 19 28 15 21 17 19 18 28 24 29 28 35 39 39 39 37
37 30 30 30 28 32 30 30 28 28 18 11 13 10 10 10 10 19 15 15 15 30 30 34 41 19 12 12 20 20 18 18 20 22 25 16 13 13 19 16 18 19 15 17 10 13 10 10 10 10
13 11 16 18 19 24 15 16 15 13 11 10 10 15 10 13 13 24 22 27 15 15 12 13 13 13 12 12 15 12 12 13 11 10 13 9 9 9 15 17 10 10 12 10 10 12 11 12 12 16
16 8 8 8 8 8 12 19 20 12 11 11 16 18 12 10 10 10 10 10 10 10 12 11 9 9 9 9 10 9 12 10 16 10 10 10 10 13 13 8 8 8 8 12 12 9 9 11 10 10
8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 9 10 10 11 11 12 12 13 10 10 10 10 12 10 10 8 8 8 10 9 9 10 11 11 14 11 11 10 7 7 7 8 8 8 9 8 9 9 9 9
10 12 11 9 9 9 9 9 9 10 11 11 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 9 9 8 8 11 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 11 9
8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 10 10 10 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 8 8 9 9 10 9 10
8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 9 10 10 12 15 11 9 12 11 11 12 11 9 8 8 8 8 8 8 13 13 18 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10
14 8 8 7 7 8 10 13 14 10 9 9 9 11 9 9 8 8 6 6 8 6 9 9 12 16 10 10 8 8 9 15 10 10 10 8 8 8 8 8 13 12 10 8 6 6 12 12 15 15
15 12 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 12 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 10 10 8 10 10 11 15 10 10 10 8 10 10 10 13
16 13 10 10 10 13 10 10 15 10 9 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 8 9 9 9 9 10 13 12 10 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7
8 8 9 10 10 8 8 6 6 12 10 10 9 11 9 12 12 9 8 8 8 8 8 12 9 9 8 10 18 16 9 15 15 15 8 8 9 9 9 17 15 19 12 8 8 8 8 6 6 6
6 6 6 8 6 | Open.Hide. 7 7 7 3 0 3 6 6 6 9 7 6 6 6 6 8 6 6 6 10 6 6 6 6 9 8 10 8 7 8 3 0 3 10 10 15 8 9 9 10 19 19 16 16 23 28 23 28 28 28
28 34 23 29 34 36 36 47 47 50 50 50 50 41 43 22 20 9 7 7 7 8 8 8 8 7 8 10 24 24 22 22 16 19 16 18 10 13 23 29 36 36 50 43 47 47 39 39 39 39
39 39 37 37 40 33 28 28 17 17 11 16 14 22 22 23 23 25 23 19 11 11 9 9 9 9 9 16 22 22 22 41 41 32 39 35 47 59 59 59 59 59 43 37 37 28 28 29 33 40
40 43 39 39 42 42 37 43 43 43 43 43 46 46 43 46 46 47 47 41 48 43 40 37 31 23 23 44 37 37 37 37 34 30 20 19 24 32 30 37 37 24 24 14 14 14 18 18 13 13
24 30 37 37 42 44 35 35 43 44 34 44 32 43 43 57 57 57 57 59 57 50 50 37 37 37 44 38 43 27 27 27 32 32 32 43 27 27 44 43 43 43 43 38 24 16 10 10 10 13
24 35 42 43 43 35 35 35 43 43 57 57 59 44 44 33 33 33 44 44 29 29 29 44 44 57 57 43 43 32 42 37 57 57 57 57 43 43 29 29 27 43 44 44 52 43 43 43 32 23
23 23 32 28 35 35 43 43 50 50 44 43 43 44 50 50 43 43 31 43 43 44 44 32 32 13 20 14 20 20 21 24 27 27 20 28 28 35 44 28 28 28 40 40 47 57 46 37 37 30
30 30 37 39 41 42 37 27 19 18 18 27 34 47 57 48 43 37 28 28 28 43 37 48 40 47 30 28 14 15 21 34 34 28 21 20 20 32 23 28 28 32 39 43 43 39 39 43 21 19
8 8 8 9 8 8 8 11 12 19 29 30 35 35 59 59 59 39 39 30 30 28 28 28 39 39 43 43 43 43 43 43 34 34 25 25 25 30 33 39 43 43 48 57 57 47 43 34 34 25
28 24 30 15 8 8 8 8 8 8 12 21 21 12 11 11 11 12 12 13 18 23 41 39 41 30 30 24 24 19 28 24 30 22 17 14 14 21 18 23 32 37 42 48 43 43 47 47 57 59
54 54 54 54 47 59 43 43 43 47 47 47 47 36 36 36 36 41 41 32 39 30 30 32 25 33 33 48 42 39 42 35 42 27 32 32 41 41 37 33 33 28 19 19 12 12 24 32 35 43
43 50 43 43 43 36 43 43 44 43 38 38 24 17 14 30 27 32 24 23 23 29 44 44 52 52 52 44 44 23 22 22 32 43 57 57 57 52 52 38 38 19 19 19 38 38 43 43 50 43
52 43 43 43 42 42 43 35 35 27 27 38 38 38 50 50 59 59 59 50 50 35 43 27 27 20 43 43 50 59 59 59 43 36 23 20 24 30 32 19 24 21 30 18 22 23 36 36 36 37
46 57 44 39 46 46 44 42 30 30 39 39 46 57 48 48 48 47 47 43 47 44 44 40 35 30 30 40 40 57 48 48 42 37 42 28 30 28 30 32 43 59 39 32 29 28 30 33 26 21
13 15 20 21 13 16 17 22 11 11 22 16 16 12 12 12 15 24 18 20 20 18 23 13 13 24 20 28 22 28 25 30 25 25 19 25 23 17 19 14 10 13 12 16 15 12 19 13 8 8
8 8 11 9 11 11 12 12 12 19 19 19 16 11 10 9 9 9 9 9 10 19 12 24 14 20 20 24 28 22 22 33 31 25 18 10 9 9 9 10 10 19 23 12 12 9 10 8 8 10
11 8 12 12 28 36 37 27 13 6 6 6 6 6 8 13 9 10 18 18 17 15 8 8 8 8 8 10 9 9 9 15 12 8 10 9 10 15 15 19 12 10 9 12 9 10 10 10 10 10
9 9 9 10 8 8 8 8 9 9 10 9 8 8 8 10 9 8 9 8 10 10 13 13 7 7 7 8 7 7 9 9 9 8 8 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 10 10 11 10 8 6 8 6 6 8 8 13 9 9 11 8 8 8 8
8 8 8 12 12 9 9 8 8 8 8 8 7 8 8 11 8 8 8 8 8 9 10 10 9 7 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 9 8 8 8 10 8 11 13 11 11 10 12 9 9
9 8 9 9 10 11 12 18 15 8 8 8 8 11 8 15 18 15 13 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 7 10 10 10 8 10 9 12 10 10 11 10 8 8 8 8 8 10 11 11
10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 13 13 10 9 9 9 9 10 10 15 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 6 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 10 10
10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 13 12 10 12 11 15 15 21 18 18 19 8 9 9 9 8 6 8 6 8 8 9 9 9 10 13 10 12 12 15
15 12 12 10 10 10 12 19 15 18 13 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6
6 8 8 10 11 10 10 8 8 8 8 7 7 8 8 17 10 10 10 9 12 10 12 19 18 22 17 13 13 11 16 10 10 8 8 8 8 9 9 9 |