| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-218F18.T7 (MSMg01no218_f18.b1) | MSMg01-218F18.TJ (MSMg01no218_f18.g1) |
|---|
| ACC | AG397557 | AG397558 |
|---|
| length | 708 | 877 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 314 (48 - 361) | 160 (78 - 237) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no218_f18.b1 PHD_FILE: MSMg01no218_f18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:46:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no218_f18.g1 PHD_FILE: MSMg01no218_f18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:46:21 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCCAAAGGTTGGGGGTACAGAGGGAAAGACGTAGAAACCAACTTA
CCAGTCCAGTCCAGCACCCTGCTCAGTGATGCTAACTCCCCACCTGTTGC
TTCGATGTGCATCTTAGTTTGTGAAGAATCTTAGAATCTTAGTGTTAGGT
GACAGGATTTGAGGGTGTGCTTAAGATGCACAGTATGCTTCCTTTCCTAC
ATCAGGGGTTGCCAGGGAAGCCCAGGATCTCTGAATATTCCCTATGTCCC
GGCTTTCCTGTAGAGCAATGGTCTTGCTCTGGCCAGCCATGAGACTGCTG
TTTGTATCTATTAAATTGNCTGCCNNTACATACCCTATGCCCCACCCCTT
CCCCGAGCCTGGAACAAACCCCCACCACACAAAAATTGTTCTCTGGGGCT
TTGGGGAAGTGGACTTGCTACTTTTTAAAGGTCTAACCCTAGCAGAAGAC
AGTGAGCAGGCCAGAGAAGTAGAGCACTGCCCATGTTTCTTCAGTCTTCT
CTAAAGCTGCTTTGTATGTACCTTGGAGCATAGTCACTGACCCAGCGAGC
CTTGCAAGCCCTCCTTCCTCTCCAGAGTGATATAGGATGGGTTCAGAAAC
TCCATGGCAAATGATGGGGGACAGCTTATAGATAGTGTTTAAGAGTTAGG
AGTTAATN
| ATGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATGTGCCAGGAGCAGTGCCTTG
CATTTGATAGGTACTCAGGAAATGTCTGAGTTGCACTGATGAATTTAAGA
GTTGGCTCTGTACTATAAATAGGAAGCCTTTGCTAGCTGGGAACATTATG
TATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGCACATACCCC
CCTCTCATATCTCTTCCTCCCTCTTCTCAACCTTTCTTCCCCCAATTCCC
TACACCCACCCCACATCTTTTTTTTTCCCTACTCTATTACCCTATTCCCT
CCCACACTTTTTANTTTTNATTCCCCAAAACAANAACCCCCATTTTTGTT
TTTTTCGTTTTTGTCCTTTTTCTTCTTTTCCCCCCCCCACAAAAAAAAAA
AAAAACATCCTTGTCGTGTGGGGGGGCTTTTTTTTTTTCCCACCTGTCCT
TTTCCCCACTACTTATCCCCCCTTTTTTTTCCCTTTTTTTACCACCTACT
TTTCTTTCCACCCCCCCCTTTTCTTTTCCCCCATTCACCCCTCCTCTCCC
CACCTTTTTTCCAATCTTCGTCTTTTCTTTCCCCACTTTCCCCTTTCTTC
TTTCTATCCTCCCGCGCATCTTTAACCTTTTTTTTTTCCTCCCTTCCTTT
CTACTTCTTTTCCTTTACCTTACCGTCTTTCTTCCTTCCTTCTTTCCTCC
CTCCCCCCCTTCTTTCTTCCCCCCTATCCATTCGCCCCCTTTCCCCTTCC
TTACATTTCTCCCCTCCTTCTCTATCCCCTATTTACCCCACTTTCACCAC
GCTTTTGCCTTACACCATTTCCTCCCN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 9 13 19 17 19 19 13 12 16 23 30 33 23 23 21 18 18 32 37 37 32 31 32 37 37 41 47 30 29 31 31 31 35 44 48 48 48 48 48 48 48 48 33 33 23 30 30 42 43 57
68 47 47 47 47 50 50 50 50 50 50 59 68 68 68 57 59 54 54 54 50 50 68 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51
51 50 50 50 50 51 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 68 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 44 43 43 43 44 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 26 21 15 11 11 17 18 11 11 12 28 27 41 41 47 47 48 59 59 59 57 57 57 48 48 50 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 59 28 27 19 17 12 9 6 6 6 6 6 3 0 3 9 15 12 3 0 0 3 9 9 7 7 9 9 10 9 15 15 23 22 26 30 34 34 35 35 35 47 59 59 57
48 48 59 57 47 39 35 59 59 59 59 41 41 41 41 41 41 19 9 9 9 9 6 6 6 8 6 10 10 11 11 20 14 12 12 11 12 11 15 20 41 43 59 59 48 41 34 23 23 23
32 32 28 37 41 59 59 57 57 57 48 48 48 57 48 54 57 57 57 57 59 57 59 53 50 50 48 57 57 57 43 39 37 37 37 39 37 43 30 30 17 17 17 26 22 24 19 25 17 17
17 22 34 34 46 39 39 28 28 22 18 18 30 23 25 22 22 17 15 15 23 23 40 40 59 59 59 43 31 25 25 32 32 28 33 33 43 37 37 27 27 29 32 37 37 32 32 32 39 37
37 37 31 31 37 41 34 28 25 28 28 33 33 33 33 33 30 34 28 28 14 14 15 15 10 10 25 37 24 24 22 12 11 11 19 18 10 9 8 8 8 8 8 14 14 21 22 17 17 13
12 15 13 10 9 10 10 9 9 9 10 10 10 17 12 14 13 18 26 37 23 24 19 19 16 18 22 19 19 13 13 9 9 9 12 12 19 15 11 9 10 9 12 12 9 12 10 12 14 14
14 12 9 9 9 10 10 12 12 10 12 18 18 14 14 15 14 13 13 8 7 7 7 12 13 12 10 7 7 7 10 10 13 15 8 8 9 13 17 13 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10
10 18 15 12 12 10 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 7 17 12 8 8 8 8 10 18 21 22 22 28 34 37 59 47 59 48 48 48 57 44 43 48 48 48 43 34 21 12 11 9 10 10 9 22 12 20 20 25 29 29 27 35 42 42
42 47 42 42 31 42 44 44 44 54 44 41 24 22 28 28 37 35 42 42 47 36 41 42 41 41 41 41 41 41 41 57 57 57 57 50 50 48 48 41 41 43 44 44 48 59 59 59 57 50
50 50 54 57 57 57 57 57 57 57 54 43 43 43 43 37 43 37 37 36 28 24 19 17 14 27 30 43 35 44 43 57 57 52 52 52 57 57 57 52 47 52 57 57 57 57 59 52 52 52
57 50 50 50 57 44 44 57 57 37 44 44 57 57 57 59 57 57 54 47 47 47 48 48 48 48 48 59 59 57 57 54 57 57 48 48 48 42 42 42 37 37 57 57 57 57 59 57 57 48
48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 54 54 54 54 57 54 54 54 48 48 59 48 48 43 43 39 40 35 39 39 57 48 48 32 32 20 20 18 25 11 10 10 10 10 10 11 12 15 12 11
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 16 8 13 7 7 8 11 10 10 11 11 11 6 6 8 8 8 9 12 16 10 10 10 14 10 10 15 8 8 6 7 7 10 8 10 8 8
9 7 6 6 6 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 16 16 23 14 12 10 10 9 10 9 8 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 14 10 8 6 6 8 8 12 10 10
10 10 12 10 10 10 15 11 14 12 16 3 3 0 3 7 7 3 0 3 6 10 12 12 12 9 9 9 6 6 6 6 3 0 3 6 9 12 12 10 9 9 8 13 8 8 8 8 13 18
19 23 25 17 17 10 12 12 13 11 11 11 10 10 19 16 22 24 17 16 19 18 20 12 10 11 10 10 10 11 10 12 10 12 14 11 13 9 10 11 12 12 23 23 47 47 30 21 19 17
12 12 9 9 7 6 11 10 14 15 13 11 11 9 9 9 9 9 8 8 10 15 19 12 10 10 10 10 10 12 28 32 22 28 28 24 28 30 17 13 9 8 7 8 7 9 9 17 17 22
9 9 12 21 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 15 10 8 11 10 11 12 23 24 21 22 17 16 12 12 10 11 14 14 12 10 6 6 8 6 8 8 8 10 15 15 13
13 11 10 10 13 12 14 15 16 15 12 13 13 14 17 21 22 22 22 22 10 12 8 8 8 13 26 23 12 10 9 9 9 9 12 10 10 10 10 11 7 6 8 8 8 8 8 8 8 13
8 9 9 13 10 10 10 13 13 10 11 10 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 10 9 9 11 15 15 8 8 11 15 8 6 6 6 7 7 8 8 10 13 12 13 15 19 18 23 14 14
12 17 12 10 10 10 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 8 8 13 24 16 15 15 16 26 23 26 12 8 8 7 6 7 7 21 19 11 11 8 8 8
8 8 8 10 13 10 6 6 8 8 10 15 15 15 15 10 12 12 9 9 7 7 6 6 8 8 10 10 15 11 9 9 18 13 8 8 10 8 8 8 8 10 16 15 10 12 9 9 9 12
15 11 11 12 20 12 12 10 15 8 6 6 13 15 20 17 16 14 9 11 12 16 16 9 8 8 10 8 8 8 8 10 8 11 8 11 10 9 13 11 20 20 13 8 8 8 8 8 8 12
11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 14 15 9 9 6 6 6 6 6 6 10 9 12 22 12 11 13 8 8 8 8 8 8 8 11 9 10 15 8 9 10 8 6 6 6
6 6 8 7 11 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 10 10 11 12 16 16 11 3 0 |
|---|
