BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-233D22.T7 (MSMg01no233_d22.b1) | MSMg01-233D22.TJ (MSMg01no233_d22.g1) |
ACC | AG399509 | AG399510 |
length | 710 | 793 |
length of high quality (start - end) | 318 (44 - 361) | 213 (81 - 293) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no233_d22.b1 PHD_FILE: MSMg01no233_d22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:49:55 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no233_d22.g1 PHD_FILE: MSMg01no233_d22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:49:55 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCACAGAGATCCTCCTGCTTCTGCCTCCTGAAGGCTGGGACTTAGGCTA
TGTACCACCATGCTTAGTTTATTTATCTACTTTTCTTTTGGGGTGTTGTG
TGAGGGTGAACTTTGTATACTACATGCCTTTGCAGACCAGTAACTCCCTT
GGAACTGAAGTTATTGGTGATCGTGATCTGTCTGATATGGGTGCTGGGAA
CTGAGCCCAGGTCTTCTAAAGAGCATTGAATACTCTTAACCACTGAGCTA
TCTTCCCAGCCCCAATGCTATGAATCTTACAGACGAGAAAGTATTTGACT
TAACCTCTAGGATCTTGGTTCACAACCTGACACTCTTTCTACTACTACAC
AAACAGGCCTCAGAGTTTTTTAAAAAGGAATTTGCTCCAACTTGGGTATT
GCTTAGATTTTTTGCTAGACATAAACAGTGTTATTTCAGAATTTGTGTTG
TTGCTCTAGCAGATATAGCATGAAGGGTTAATTCTCCTTGTCTCCGTGCC
ACACCTTTACCTAAGTGGCAGACATTCACCCAAGCCTGTCTAATATTGAA
AGAAGTGTCTTCAATATTTCTGTCTGGCTTGGAACTCCAAGAGCATCCTG
CTCATCCCTCATCCTGGTCGGTACAGGCAAGGGTTCACAGGAGCCTTTAT
TGTTAACATG
| NNCCACAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCAGATCTTCCTCCCTTTC
ATTTGTCATTCCACTCCCCACGCTGCAAAAAGAGCCTGAACACAGCTCTG
CTGCAAAACACATTCCAGGTATTTAATGACTTGTAACTCAATGACCTCCT
TGCCTGTCTTCCTTCCCACTCTGCCTACCTACAGGGGCAGGCTTTGAAAG
TAAGGGAGGGAGAGGGGAAAAGAGAGGGGAGAGGAGAGANANNNNNNCNN
ANANNNNNANACNAANANACAATGTTTTTTTTTACCAGACTGAGAAACAG
AAACAGAGTGAGAGTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCTGATNA
ATGATATTGTAGGAGGATTTTGTTTACCCCCACCACAATAAAAAAAAAAT
TTGGTCGGGGGGGGTGGCGTGCCCCTTCTATATTGAAAAATATCTTAGCC
CCATTCAACACAGCACTGCCCCCCTTATTGTCTAGATTAAAATATATTAT
ATCCCCTTACCCTTTTTCATTGTCCCCTTTTATTCTCCCATCTACCCATT
TTCCTCTCCCTAATTCTTTTCTTATTCACCCAACCTCTATATTCAACAAC
CATAATATTATCTAAATATTAACTCACACCCCTTTTCTTATTTTTTATCT
ACCGCCACACCATCTTCCCAACATTCCACACCCTGTCATTCCTATCCATC
ACTTTTTTATAACACACTCTACACAATTAATCTATTTTTTATC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 14 17 31 31 37 37 37 31 31 37 37 33 33 33 34 29 32 37 27 21 13 11 11 26 23 53 48 47 42 43 43 48 48 42 42 32 34 36 42 43 68 68 47 47 47
47 50 50 50 50 50 50 50 50 43 50 50 51 57 57 57 57 54 59 57 57 57 57 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59
59 57 59 50 51 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52
52 52 57 57 57 45 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57
52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43 47 57 44 44 39 39 35 35 39 42 48 46 46 57 68 68 68 59 59 59 59 59 48 47 48 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 41 41 21 13 12 15 12 12 12 22 12 13 15 30 16 18 11 11 11 11 11 11 11 12 11 11 11 29 30 59 59 59 47 47 48 48 48 48 57 57 59 57 59 59
59 57 57 57 57 57 57 59 48 59 57 48 57 59 59 43 47 41 33 32 32 30 36 37 43 43 47 42 36 31 28 28 28 32 39 32 44 44 57 44 44 42 47 43 43 43 42 42 42 43
47 47 34 44 31 35 35 47 47 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 48 48 48 59 44 44 28 37 28 28 28 44 44 57 57 48 44 39 35 35 39 59 43 48 43 43 43 43 43 37 32
23 23 28 37 47 57 57 48 43 59 57 59 59 59 48 48 48 46 46 47 43 39 39 35 31 31 39 37 41 39 40 40 46 48 48 48 48 48 57 48 48 48 57 57 48 57 57 48 57 43
43 43 47 43 57 57 54 54 54 54 54 48 54 54 54 48 48 43 46 39 42 30 37 37 43 43 43 48 48 48 48 48 48 46 47 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 47 47 47 47 47
59 41 37 31 37 36 36 36 36 37 39 37 29 24 32 34 43 43 47 43 37 30 30 30 35 31 34 39 39 39 28 26 26 30 34 34 30 24 24 24 32 32 37 37 35 39 39 37 37 39
41 40 47 47 48 48 48 48 40 41 40 41 41 39 34 30 20 23 23 34 30 34 23 31 28 30 30 28 24 24 24 32 37 37 33 37 32 32 32 22 22 11 11 11 16 25 39 39 39 29
22 22 16 19 24 30 27 25 25 22 | Open.Hide. 0 0 3 9 9 12 19 12 10 10 10 9 10 12 13 26 22 27 37 37 41 41 40 41 37 41 47 47 53 50 50 57 57 50 50 48 53 50 57 50 40 30 33 22 28 28 43 34 54 54
54 54 48 48 48 48 48 54 54 59 59 57 50 48 48 30 40 36 36 41 48 44 57 57 50 50 50 50 68 57 57 44 44 35 35 35 44 44 68 59 59 59 59 59 59 59 68 50 50 50
50 50 50 59 54 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 52 52 52 59 57 52 52 54 54 57 57 68 57 57 57 57 52 57 57 57
57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 59
59 57 59 50 57 48 50 48 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 54
54 54 59 59 54 54 47 59 43 43 43 43 43 59 59 48 48 48 59 59 48 48 48 48 47 59 59 48 48 48 46 46 41 36 47 47 23 23 3 0 3 0 0 0 0 0 0 3 0 0
3 0 3 0 0 0 0 0 3 0 3 3 0 3 3 0 3 0 3 12 16 18 22 22 16 15 21 23 37 37 20 13 10 8 8 7 9 9 15 12 11 11 12 12 12 21 21 24 10 6
7 7 6 11 10 18 18 17 15 10 8 8 10 10 8 10 10 12 14 14 32 39 32 19 16 15 19 19 18 11 11 11 12 12 19 32 32 28 22 22 19 13 13 10 12 16 15 3 0 3
6 6 8 6 10 10 10 13 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 6 6 6 6 7 13 9 9 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 9 12 15 12 11 10 10
10 9 9 9 9 9 11 12 15 15 15 15 15 12 12 8 8 6 6 8 6 6 10 10 23 18 12 9 8 8 8 8 8 10 10 10 13 9 10 10 10 9 9 8 8 9 6 10 8 9
8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 11 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 6 8
6 6 8 8 10 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 15 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 12 12 15 10 11 11 11 11 9 13
10 10 8 8 8 8 8 10 16 22 11 11 10 10 10 10 10 8 8 6 7 10 9 7 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 15 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 7 8 8 10
8 8 8 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 11 12 11 21 17 19 14 12 12 9 9 12 12 12 11 11 8 6 8 8 8
6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 10 12 9 10 10 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 10 12 10 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 13 13 8 11 11 11 8 8
6 6 10 10 10 12 8 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 7 6 6 6 8 8 10 10 8 10 16 15 15 16 9 10 9 9 |