BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-234O19.T7 (MSMg01no234_o19.b1) | MSMg01-234O19.TJ (MSMg01no234_o19.g1) |
ACC | AG400662 | AG400663 |
length | 769 | 746 |
length of high quality (start - end) | 233 (134 - 366) | 290 (73 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no234_o19.b1 PHD_FILE: MSMg01no234_o19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:52:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no234_o19.g1 PHD_FILE: MSMg01no234_o19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:52:04 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (145,058,755 - 145,058,986) | (145,222,695 - 145,222,984) |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTACAGAATAAGCGG
AATTCTATCAGAGCCTTTCTGAAAGGCAGGAATTCTGGAGCGATGGTGCC
TAGGCTTTGAAGCGTCCTTTTTAAACCGTCAGAGATTGTTATCTGAGGTT
TATGGAGTTGTAGTTCCTGAAGGATTCATAGAGCCTTTGCCCAGCTTAGT
CCTAGAGACATACCGGGCAAACCTGAAAGGTTCTTATGGCTAAGCATTGC
TTAGGTAACGGCTCCTTCGGAGAACTCCTAGATCAGATAAGAGGTTTTGG
TGTGTGGAAACTGGCTTGCTAAAGGTTTTGAGCTTCCAAAAGGCTCCTTA
GCAGTCTAGTCCTTCTTTTTTTGATCTCTGTCCTGCTGAGAAGCCAAAAT
TCATCCTGCAGTCTCTATCTTTATCCCATATAACAAAGAACACCGACAGT
GCACCTTCCTTCCCTTTTTCCAGGCTATGTAATCTTCTCTATAGAGTCAC
TGTGTGTGTGTGTGTATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTG
TGTGTGTGTACATGTCCCGCTCCCCTTCCTTCTTTTCCCTTTTTATCCCC
CCNNCGTATTCTTACCCCCTTCTTCTCTTTTCCCTTTTTCTTTCTTTTTG
TCCCCCTTTCCTTCTGCTTTTTTTCTTTTTCTTTTCCCTCTATCCTTCAT
TTCTCCCCCGTTTTCTCTTCCTTTCTCCCCCTCTATTTTCCCTCTTTTTT
TTCTCTTTTCCCCTTCCCT
| CGATGCAGTGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGCCGGCTGGGGAGCAACCATGCCGGAG
AATATGAAGCACGTGGTTCTAGTTCCTTCCAGCCTTCTAAGTGTGTCAGC
TCTTTGAAATGGCTCCAATTTCACGGTGACATAGTCAGTAATTCCTAGAA
TAAGAACTTTCCTTTTCTAATTGGAACACAACTCTTAAGTAATCTGAGTC
CTGGTGGGGTGTGGCCACTACCCAAGAGGCTGGGACAGATGACACAGAGG
CTGCGAAGTCATAAAGGACTGGTCTGTCCATCCAGGAATGACAAGCAGTC
TTTAAAGAAACCTTGNTTTACTTCCGAGGGCAAGGCTGACATTTGTTGCG
CAACAAGAATGAAGGTTTAAGAAAGTTACTCAAACAAAATCATAAGGCGG
CGCTGTAGATCTCATCTTGAAGATAAGGACATTGGAAGCTAAGCAGGCGA
AGTCATGTGCTCAATGCCGAACACGTTCAAAGATTACTGAATGGAGTCAT
TTATCTAGCTGTTTTCTCTGCAGCGTGTGAGAATTGAACCCAGGGACCCA
TGCACAAGAATCAAGCAGTCTACCACCAAGCTACATCCTTGAGCCAGTTT
CCACAGCTTTCATGTAAATGTAGAACTGAGCTAAAACATAACACTTGTTT
GTAAAAAATCATATTAAATCAGAGGCTAGGGAGAGACTCATTGGAG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 14 34 43 43 39 39 39 37 37 44 44 33 33 33 37 33 33 48 43 33 33 33 33 33 37 27 27 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 9 9 15 15 27
27 31 31 44 44 50 50 42 41 30 25 12 6 6 6 6 6 6 9 7 7 8 8 8 9 9 9 11 18 21 30 30 33 31 31 50 50 48 48 48 47 47 47 47 53 53 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 27 21 14 9 7 6 6 6 8 6 9 15 15 12 14 15 19 27 29 37 41 42 50 44 53 53 57 57 57 59 59 53
53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 51 43 43 43 47 68 68 53 53 50 50 50 51 51 51 50 59 57 54 48 48 57 57 59 59 59 59 43 43 59 59 43 39 39 44 44 33 33 33
42 42 57 47 54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 44 42 33 33 44 44 59 59 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 57 44 44 42 43 42 42 42 47 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59
43 43 30 28 28 43 43 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 50 50 34 28 16 12 11 11 10 11 11 9 9 10 11 12 29 30 41 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 33 33 11 11 11 9 11 10 16 16 22 19 21 30 24 24 18 18 11 11 11 18 18 23 23 23 23 18 28 34 43 43 57 48 57 57 59 59 59
59 59 59 57 57 59 53 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 41 39 39 39 37 25 23 11 10 10 10 10 11 11 17 17 24 28 28 32 32 43 46 47 59
47 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 35 34 16 16 11 16 16 31 31 37 39 43 47 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68
68 68 59 59 59 54 54 54 54 54 57 59 59 37 32 30 42 39 43 43 48 48 47 41 41 30 24 24 28 28 43 43 43 35 35 39 39 57 59 59 47 37 37 28 28 28 37 37 43 48
39 32 24 19 15 16 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 6 6 6 8 8 11 18 15 19 15 12 11 11 10 13 13 12 15 14 21 13 19 15 10 9 10 11 6 6 6 6 8 19 12
10 3 0 0 3 6 8 8 9 16 9 9 9 13 11 14 22 25 23 18 10 12 9 9 10 12 9 9 9 12 11 15 21 16 17 9 8 6 6 6 9 13 12 15 15 16 13 12 8 8
9 10 10 13 16 18 17 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 13 21 19 15 10 11 11 15 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 8 8 8 11 9 9 11
19 17 11 8 8 8 8 12 8 11 11 19 18 10 8 8 8 10 15 10 10 8 7 8 7 7 13 12 19 10 12 10 16 10 10 10 15 16 12 12 14 11 12 12 10 13 18 28 30 26
24 10 10 9 10 12 19 18 17 12 9 10 10 15 16 16 15 12 12 | Open.Hide. 8 8 8 10 10 10 10 9 15 7 7 7 8 8 19 34 39 39 47 47 50 50 48 48 50 50 57 53 48 50 37 37 30 28 23 16 10 10 11 17 18 23 11 9 9 9 10 9 12 27
26 43 43 25 25 25 36 33 40 33 30 33 40 44 47 43 41 41 48 48 50 50 47 47 50 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 50
50 50 50 50 50 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 50 50 35 35 43 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 36 43 35 43 43 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 50
42 50 35 37 37 50 50 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 50 50 51 57 57 48 48 48
59 59 57 47 43 43 42 42 42 44 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 48 47 43 37 37 43 43 46 54 54 54 48 48 48 48 48 48 48 48 48 43
46 39 39 35 35 35 39 39 59 59 59 59 59 59 48 42 47 41 41 32 25 19 11 11 12 16 11 15 12 22 28 34 39 48 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 59 46 43 43 59
59 59 59 59 59 59 59 34 30 19 12 12 12 6 3 0 3 7 6 6 6 6 12 11 11 9 9 9 7 7 7 7 7 9 9 9 12 12 12 22 30 59 59 47 48 46 43 43 48 47
47 48 48 47 59 46 43 48 57 57 57 57 59 59 57 50 50 43 43 31 34 25 28 28 35 28 25 16 12 11 12 12 12 9 9 9 17 8 9 10 10 10 19 13 13 10 9 10 15 11
11 11 12 15 11 12 12 15 28 30 41 41 47 46 48 48 59 48 39 39 30 30 30 32 37 39 43 48 48 48 57 48 57 59 57 57 48 48 54 43 43 54 54 57 59 59 59 57 57 57
59 54 54 54 54 54 59 59 57 57 57 43 43 43 47 57 57 57 59 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 48 46 39 40 28 28 28 28 37 39 43 43 48 59 59
59 59 57 48 43 43 36 43 39 39 36 36 28 30 30 28 23 23 19 19 8 10 6 9 11 17 25 43 43 35 35 28 30 34 37 30 28 24 22 22 32 36 36 30 33 33 33 33 31 31
18 19 15 24 26 33 32 36 33 40 33 30 30 33 31 23 20 20 20 31 32 39 39 36 35 35 39 37 43 36 36 39 39 37 39 39 37 37 41 41 41 41 38 32 37 39 41 41 41 37
32 31 35 35 39 39 40 43 39 39 40 39 37 32 30 30 25 25 28 27 27 33 22 22 16 16 18 28 21 30 30 37 18 15 15 17 18 18 25 28 28 30 24 22 33 33 28 28 28 29
29 37 32 29 29 32 29 28 15 10 8 8 8 9 12 29 31 37 32 31 20 15 15 21 21 21 21 13 15 17 32 31 31 27 22 22 22 18 18 20 16 16 14 14 12 12 |