BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-268P20.T7 (MSMg01no268_p20.b1) | MSMg01-268P20.TJ (MSMg01no268_p20.g1) |
ACC | AG409244 | AG409245 |
length | 739 | 744 |
length of high quality (start - end) | 663 (77 - 739) | 292 (76 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no268_p20.b1 PHD_FILE: MSMg01no268_p20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:07:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no268_p20.g1 PHD_FILE: MSMg01no268_p20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:07:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXNGACTCCGCGG
AATTCTTTTGTGATTGCCATACACACTAAGGATGATATCCTCCAAAAACA
TTCATTTTCCAAGAATTTCATAAATTCATTGCTTTTAATAGCTAAATATT
ACTCCATTGTGTAAATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCTTCTGTTGAG
GGACATCTGGGTTCTTTCCGGCTTCAGGCTATTATAAATAAGGCTGCTAT
GAACATAGTGGAGCATGTGTTCTTATTACCAGTTGGAACTTTTTCTGGGT
ATATGCCAAGGGGAGGTATTTCTATATCTTCTGGTAGTACTATGTCCATT
TTTGTGAAGAATCTCCAGACTGATTTCCAGAGTGCTTGTACAAGCTTGCA
ATTCCACCAGCAATGGAGGAGTGTTCATCTTTCTCCACATACTCGCCAGC
ATCTGCTGTCACCTGAATTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTGTGAGG
TGAAATTTCAAGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTAATGATTAAGGATGT
TGAACATTTTTTCAGGTGATTGTCAGCCATTCAGTATTCCTCAGTTGAGA
ATTCTTTGTTTAGCTTTATACCCCATTTTTAATGGGTTATTTGAATTTCT
GGAGTCCAGACTCTTGAGCTCTTTGTATATATTGAATATTAGTCTCCTAT
CAGATTTAGGATTGGTAAAAATCCTTTCCCAATCGGTTG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTGAACAGCTATTATGGAGGATAG
TGTAATGACACCACCAATAATTAGGACTTTTCATTTTCAGTTTCTCTGCT
AAGCTTGAATTTATTAAATAAATAAATTTAAGTTTACTTTGATGGTGAAC
ACTGAATAAATTTGTGGAGTTTTGTGAAGTTGCCTTTTCTTCCATGATTT
ACTGCCTGCTTCTTTTGCAGTCATTGGTTCTTTTTAATTGTTTTTCTATA
GTCCAAATAAATGTTACTTAGTATAATTTAATACTAGTACAATTTAGAAA
TAACACCCAGGTATACTGTTTAGAGTTGCCTACGCATAATTTACCATTAC
CTTTCTTTATTCATTTAGAAGTATTATTCCTTAGTTTGCCTCAAATTCCT
GACTACCATTGAGTTCATTCTCCATCTTCATGACTTATGGGAAAATGGAT
GAGGTCATTAATCAGATGATGAAGTTCACATAGACAACTTATGGAAAAAT
GTCAAGGTTACAAAAATAATTTGGGTTCTTCAAAGCTAGACCAAATTGTA
ATACCCGTCGATGAAAAGTTTTAAGTAGACATGAAGCTGCTAAGTCAACT
CTTTAGAAAGATTAGTGTGGGGTCACCCTAGGGACAGACTGAAGATAAGT
GAATTAGCAGTCAACAAGGAAATCAGAAGGCTGCACATGGCATA
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 11 14 21 34 30 33 32 32 28 28 37 44 33 33 33 29 29 30 34 48 29 28 28 28 25 25 25 12 7 7 7 7 7 3 0 3 6 6 6 6 8 12 22 16 26
26 28 31 33 33 59 59 47 33 27 12 9 9 9 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 14 18 28 28 33 33 33 36 36 36 53 53 53 53 53 43 43 47 47 57 57 53 53 50 47
47 47 47 51 47 68 68 42 42 41 41 43 50 54 68 51 50 51 50 50 50 54 54 47 47 47 47 47 47 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 48 57 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 57 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
57 44 42 35 27 29 20 18 31 32 47 59 59 59 57 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 47 47 59 59
59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 50 50 50 42 47 44 27 25 12 12 11 11 11 11 9 11 11 27 27 59 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 47 43 28 40 31 21 15 14 14 14 23 24 39 37 39 35 32 28 21 14 13 15 12 11 11 11 11 19 23 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 59 59 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 57 59 59 68 57 57 57 57
59 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 50 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 59 57 57 59 48 57 57 48 39 37 37 44 44 57 57 57 57 59 59 48 48 59 59 59 54 42 42
42 42 54 57 59 59 57 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 37 37 37 37 31 31 43 36 36 39 40 44 44 37 32 31 37 37 37 41 41
31 32 32 29 20 20 25 18 18 20 28 28 39 43 35 35 30 30 30 39 59 59 59 59 34 33 25 34 34 37 37 43 43 41 37 37 41 41 43 43 59 47 47 35 39 32 37 41 44 37
37 18 18 11 18 13 17 15 14 15 16 22 28 30 31 39 37 37 31 28 28 30 22 22 39 28 28 23 32 28 28 37 36 25 18 17 14 14 14 | Open.Hide. 9 9 9 14 9 9 9 9 18 21 35 37 37 41 41 41 47 40 48 48 48 48 57 53 53 53 47 47 47 48 48 48 48 57 57 53 48 42 36 36 36 42 42 54 68 68 68 54 54 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 32 42 36 36 41 48 44 68 68 48 48 42 42 50 50 57 47 47 57 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50
54 54 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 59 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 48 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 53 53 57
57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 28 25 24 16 18 12 13 12 16 20 11 12 12 18 15 13 12 12 9 9 9 9 9 9 9 12 15 21 25 34 59 59 59 53 53 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 30 13 12 12 12 24 22 31 34 34 37 39 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 54 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 57 57 54 54 54 54 57 68 59 59 57 59 57 57 54 54 54 54 57 57 59 57 57 57 57 48 48 48 53 48 48 48 48 48
57 57 50 48 59 59 47 46 46 41 41 41 41 41 41 44 44 44 37 37 39 39 39 39 41 46 46 46 46 43 59 44 44 41 37 44 41 59 41 42 41 41 39 39 39 41 37 34 41 41
47 47 30 31 17 17 14 27 17 30 24 18 18 22 22 26 22 25 24 31 35 37 37 30 35 31 36 34 43 41 31 29 34 28 33 32 39 43 41 41 34 34 17 21 14 24 20 19 30 37
32 29 30 26 26 28 28 34 36 34 43 32 31 31 37 31 28 35 29 30 25 25 30 29 16 15 17 18 20 25 32 32 32 23 23 23 28 20 16 14 21 14 19 14 |