BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305B10.T7 (MSMg01no305_b10.b1) | MSMg01-305B10.TJ (MSMg01no305_b10.g1) |
ACC | AG430171 | AG430172 |
length | 1,297 | 1,254 |
length of high quality (start - end) | 305 (480 - 784) | 734 (125 - 858) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_b10.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_b10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_b10.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_b10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCGGCCCTNNNNNNNGGCATTCGCGCATCGACTCCTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCCAGGAATGCAGCTGACTGTCAAGGCTCCCCAAGAACTAN
AGNNACAGACTGGGGCCCGTGAACACGAGAGNGCTAGGAANCAGACCTGG
AACCTCTACAAGCCAATACTCTTAACTCCTGAGCAACCTTTCTAGTCCCA
AGACTATATAGCTTTTCCACCAAGCTGCTGGTGGTCATTTTTAACCCTTT
CTCCCACTTCCTGTCTCATGTTGGCAACAATGTCACAGATACTCATTGAC
CCTATTTTCTCTGTGTGTGCATGATCCATTTTCCAGACCAAGCAGGACCG
CATTACCTCAGCGATGCGATCTTTGCCACTGATTCTAACTCTTGGGGCGT
CATGAATTTTTCAGGNANCCCAAACAGGAGGGAANNAGNAGAAAGCCCGG
AAGGCAGCGCTGTTATCTACCCCCCCGCCGGGGCTCGTGAAGGGGTGAGC
AAAAGCAGACTCTCAAGGACCTGGGGTTGGAGGCGGGGAGCTGAGAGCTT
CCGAGCCCACTGCTGGGAGCTTCCGAGCCCACTGCTGGATGTGTGTGCAC
GAAGACACTATGAATCTTACTCGTGGACACATCTGCCACGGGGGAAAGAT
GGCCACCCTTTCCATTTGCCTCATCTCCTAATGGGTCCCTCGTTGACAGA
GTCTGAGCTGTGCCCTGTCACTGTGGTTCCAGGCTTCTCTCCTGAGATGA
GGGCAGTGGAGCTGGTGGAGTGGACAATGAACTCCTTGTATTCCACCCCC
CACCCCCCCCACACACCGATCTTGTCTTGCCCCCACACCAATCCTACTCA
CTGGATTTTAGCCAGAAAAACCATTTTCAGTACACTTGGTTCTCTTAATC
AAAATTCTAACAGATTCCCATTTCCACCAAGTCCAAAATAAAACAGACAC
TTGCTCTCCAGGGGCCCGAAGGACACTGTAGCGGCCTCTGCCTCTTTCGN
CCCACCTCTCTCATCTCCCCCCGAACCCCAAAGGGGGACCCTTTTTGCTC
CTTTTCTTAAGGGATCCCCCCTTTCTTTTTCGGGCCTTCCAAGCTTTTCA
GGTTCTGAATTCCCGGCCAAAAACCTCCCCTAAACTTTAGGGGGGTCTGA
AGGGGGTTTTCAAAAAATTTTCTGGGTTGGATCACAACCCTTCAAAAAAT
CCCTGCACGCTCTGTTGAAAAAAAAACCACGGGGAATCTCCTTTTGGGTG
GAAGGGGGGATTGATAGGTTAATTAACAATGATCTGATCATGTATCG
| NCCGTCCTTTNNNNACCGAAGGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTATGGACTGAAGTTAAGGAT
GGTTGTGCGTTACGGATCTTCCTGGGGTTAATTGTATTTGATGTTAATTC
TATTCTCCTGTGAGGGGCTGCGAACAAGGAATGAGTTAGCACTCAAGTGA
TTTCCTGTAAACCTTCTTCCTACCTTAATTTATAAAGGCTAGACCCAGTG
ATTGGGCAGAGAAAGAGAGGAAGGTGGAGCTGAAGGTTTTGGGAGAGAAG
GAGAGAGAGGACGACTGAGGAGGAGGAAGGAGAGTGGAGCATAAGCACCT
GGCCTGGAGAAACTGCAAGTTATAAGGGGTCTCTTATATAGGGAAGGTGG
CAGTGTAGTGTTAGATCAGCTCAATCTAGGTACACATCACATATTGTTAT
TAATTAAGTTGTATTTTCATTGCTCAGACTTATTGGGTTGGAAATTTACT
ACAACAGTTATGAGCCATAGTGCTAGGAACTGAACACAGTTCAATTCAGC
TGCACTGTTCTCTGTTTTCTATTCTCTGTGCTTATTTCTGTTTTAATGTT
TGCTATTTCTTTCTATCTGCTAATTCTGAGCTTCATTGCTTTCCCCTCTA
GGTTCTCAGAGTTGTACCAATAGGTGATTTAATATCAAGAATCTATCAAC
TGCTTTCCAAAATTGTTGTACCATTTTGACCTTCTACAGAGAGAGGGACA
TTTGCTTCACAATCTTGCCAATAGCAGGGACACCTGGGCCCTTCACCTGT
CACTGTTCTAGCGTGTAGGAGGCATGGCTGTGGCTGTAGCTCCCATTTTC
CTTTTGAACAGCAAGGTTTAATATCTTANAGGCCATGCACAGTACCTTTT
GTGTAAGCAGCTTTGCTTTTATTTGTGGCTTTTGACTCTTTGTTGAATTT
TTATTTTTTTTCCCACTCCTGGAAAAAAAGGCTTTTTTAAAAAGGGGGAA
AATTTATTTGGGTTTCAAGGTGCCCAAAAGAAAATTGCCCCTGATTTTTT
TTCCTTTAAAAAAAAAGGATTTTTTTTTATTAAAAAAAATTTAAAAATTT
TTCTTTTTGAGTAAAAAAAAAAATTTGTTTTGGGAAAGGGACAAAGCCTC
CTTTTTTGTTTATCAAAAAAAATTTAATATTTGTTGGTGCCTCTCCTTTC
TTAATAAGAGGTAAAAAAGAAATCTTCTCTCCCCTNTGTGTGTTGATTTT
TTGT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 9 10 8 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 8 9 13 15 10 10 8 12 8 8 8 22 19 28 28 28 28 30 30 33 33
37 33 30 30 30 26 21 24 33 22 13 9 9 23 23 31 31 30 37 33 19 19 9 9 9 9 9 7 7 7 8 8 8 11 13 11 11 11 23 27 36 37 37 33 33 29 21 21 3 0
3 3 0 0 3 27 27 37 23 19 9 9 9 9 9 9 9 6 8 6 6 6 8 8 11 18 18 14 12 12 3 0 3 23 23 37 37 25 27 3 0 3 27 27 39 41 42 50 50 50
50 53 53 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 50 50 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 34 27 19 13 13 12 17 17 32 32 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 34 24 18 17 19 18 18 20 34 44 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 53 53 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 33 27 15 11 11 9 8 8 8 6 6 9 9 3 0 3 0 3 29 29 59 59 59 59 50 42 41 39 39 19 7 7 3 0 0 3 3 0 3 23 23 59 59 22 9 9 9 9 9
9 22 31 30 10 8 8 8 7 7 9 10 10 9 9 9 6 8 6 6 6 7 17 19 20 11 11 9 11 18 15 31 34 59 59 59 48 48 53 53 57 50 59 59 48 28 25 21 12 14
14 27 14 13 13 13 28 28 41 41 41 47 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 50 43 43 37 36 36 37 39
48 48 59 59 59 47 47 41 41 39 39 35 36 37 44 44 44 39 42 42 41 39 39 39 37 37 37 34 39 39 39 41 42 50 50 50 50 50 59 59 57 50 44 44 32 32 35 39 39 43
41 41 41 59 44 44 39 36 39 37 39 39 40 36 37 44 34 34 34 30 30 39 33 39 39 37 37 39 34 31 18 25 15 15 15 10 13 10 10 10 10 16 14 20 30 32 36 44 39 21
21 10 10 10 21 21 33 33 33 33 33 37 37 44 39 38 38 35 32 28 28 21 27 24 19 19 24 30 30 30 29 23 25 12 12 12 25 22 15 8 8 8 10 20 30 32 34 28 25 25
15 9 9 9 9 15 23 37 47 44 28 27 13 12 13 21 24 26 23 24 14 11 10 10 19 8 8 8 19 12 14 10 12 11 11 18 19 21 31 34 34 34 17 17 12 10 9 11 12 10
9 9 19 13 14 14 20 23 18 19 22 18 23 14 10 10 8 8 8 17 19 30 19 16 14 17 18 28 21 22 13 9 9 10 14 17 12 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 15
17 19 15 14 14 17 18 10 8 8 7 6 6 6 8 9 9 10 11 11 8 8 8 7 7 8 9 9 9 9 9 9 9 15 17 17 12 10 10 13 10 11 12 12 11 9 8 10 3 0
3 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 15 17 14 10 13 8 9 11 9 10 10 10 10 11 11 14 30 20 20 20 20 20 23 15 10 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8
17 19 17 10 10 12 8 11 12 18 14 14 17 16 17 17 14 12 12 11 10 8 6 6 6 6 6 8 9 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8
9 9 12 8 8 8 8 10 10 14 15 14 12 11 11 11 12 15 14 9 10 8 9 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 15 12 13 18 19 43 18 9 7 10 8 8 8 8
10 10 10 15 16 19 13 13 13 10 8 10 12 13 15 13 19 10 10 8 6 6 6 6 6 6 10 10 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 13 10 11 11
11 11 17 10 9 9 10 9 9 9 10 8 9 8 13 9 10 10 11 9 15 11 10 12 12 10 10 10 10 10 10 12 18 12 11 11 11 11 8 8 6 6 10 8 11 8 10 6 6 6
8 8 8 10 16 18 10 10 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 6 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 6 7 3 0 0 0 0 3 7 6 6 8 8 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 8 8 13 8 7 9 9 16 10 19 19 19 8 9 10 21 19 19 12 12
19 24 28 35 35 37 37 37 35 30 35 35 36 36 36 50 50 50 50 47 41 27 27 9 9 9 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 21 21 28 31 31 35 35 36 36 36 57 57 57
57 53 53 53 53 53 36 33 31 31 30 28 23 21 12 9 9 9 12 11 10 10 13 15 19 24 24 28 31 31 36 36 38 38 42 42 42 53 57 59 57 57 50 53 53 53 53 47 47 51
51 51 47 47 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 59 57 57 53 53 50 50 50 50 37 37 37 22 21 11 12 12 23 21 34 34 37 37 39 44
50 53 53 57 57 50 50 53 53 53 53 57 59 59 59 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50
51 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 57 57 57 57 57 57 68 54 54 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 53 53 59 59
59 59 59 37 30 26 12 12 9 15 15 16 11 11 12 21 30 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 59 48 48 48 47 47 41 41 43 37 37 37 30 28 32 30 30 23 18 16 11 11 11 23 25 40 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59
57 48 48 48 48 48 57 48 54 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 68 59 59 59 59 59
43 43 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 39 39 35 39 39 59 47 57 68 57 68 68 59 59 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 48 48 48 48 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 48
59 59 59 59 59 47 47 44 27 19 9 9 10 22 29 59 59 37 37 37 37 39 47 48 57 59 47 47 42 42 39 43 39 39 39 30 42 32 43 36 36 36 39 39 42 31 36 25 25 25
36 43 57 59 59 59 57 48 48 48 59 59 46 46 47 59 37 37 37 31 31 37 41 41 41 41 36 31 31 37 37 37 37 41 41 59 59 43 37 37 43 43 37 37 37 37 39 41 59 59
48 57 48 57 48 48 48 43 43 41 40 41 41 41 24 25 12 12 12 16 13 18 32 28 37 31 31 43 43 37 32 29 30 32 37 34 34 23 23 23 32 31 31 31 31 26 17 18 17 17
17 28 34 34 25 18 15 10 10 10 17 15 8 9 9 9 10 12 16 12 15 12 12 15 19 12 14 3 0 3 8 8 8 12 28 28 23 23 28 28 37 19 19 10 10 10 16 21 25 13
11 11 11 18 18 12 12 12 21 13 17 11 19 10 8 8 8 8 18 19 17 13 11 15 10 10 12 12 12 15 21 24 19 19 14 12 12 14 12 11 11 11 11 11 10 11 10 12 10 8
8 8 8 8 15 9 10 10 19 17 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 11 10 8 10 7 7 8 8 10 19 21 15 10 9 9 14 20 15 14 8 8 8 8 8 10 15
15 18 19 10 9 9 10 12 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 6 11 8 10 9 8 8 8 8 11 10 9 7 8 6 6 6 6 8 8 9 9 8 6
9 8 8 6 6 10 10 9 10 21 19 15 13 8 8 8 8 8 8 13 13 16 10 20 20 26 22 15 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 12 10 10 9 9 9 10 16 18 16 22 15
11 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 11 15 24 20 18 16 15 11 11 12 12 11 10 10 10 10 9 9 8 10 10 6 6 6 7 10 10 8 8 6 6 8 8 10 12 12 10 8
8 8 8 8 10 10 10 11 6 10 6 6 8 12 16 15 13 6 6 8 12 15 17 15 8 8 8 8 13 13 13 9 10 10 8 8 6 6 7 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8
8 10 10 8 8 6 7 7 7 8 6 9 9 9 10 11 9 8 10 10 12 13 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 9 21
17 11 9 9 |