BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305D07.T7 (MSMg01no305_d07.b1) | MSMg01-305D07.TJ (MSMg01no305_d07.g1) |
ACC | AG430253 | AG430254 |
length | 1,323 | 1,328 |
length of high quality (start - end) | 421 (45 - 465) | 387 (75 - 461) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_d07.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_d07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_d07.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_d07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:50 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNCCCACTCATTGCGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCCTGTGGAGGTTTCCACATTGAATAGTGAATATAATGAGACATTCG
AGCCACAGAAGACAAACAAGGTTCTAAAGAACTTGACCCTGTAGGAATGA
GGATTTTGGATCATGCTATCTCTAAAAGCTTTCAACCAAGGGAAGTACTG
AAAAAGAAACATGGAAAATGGATTTTTCCCTGCTGATGTGGATGCTGGGA
ACCGAACTTGGGTCCTCTGCAAGACCAGGCAGTTCTACTTACAGATGAGC
TGTTTCTTTAGATCTCAGTAAATGCATGAAAATGCATATCGATAAATGTA
TATGTTGCTTTGAGCTTTGCAGTCTATAGAAATTAATCCAAAATTCATCT
TCAAACACTTTTTGTCTACCAATCACATTACTTATTCAAAATATAATTCT
AGAAAATTTTTTTATCCCCCCCCCAGACATAAAGTGTACAATGAACAAAA
AGAGGCCATTGCCTGGATTACACAGATTTAGAAATCTCTTCTATTGATAC
CACCAAACACTTAGCACCCCCCACAGTTGTTTTCAAATTAATAGAACATG
CCTTACATTGGCACATAATTTTAAAAATAAAAATTGTTTTTTTGTACCTG
AAATATTTATGCTCGCAGAAATAGAAACCAGTATTTGTTACAAAAATAAC
CAGACAGGAGCAATAAGAATTCCTCAAAACAGCAAATTTATAGTTTGGGA
GTTTATAAATATTTCAAGAAGATTGCGAAATCTACTGACTATATAGAGCA
TTTCTTTCTGGACAGGCATACAAACATCGGATGTCATTGGCTGATCCATC
CCTTCTGTTTTAACATGTAATTTATTACCCTGTACTTTCTGTTTGGAGAC
AGCCTGAAGTGTTTACTCTAATACAATTTTGCACTTTGAGCTTTGTTTGT
TGTACTTATGCCATGCCCATTAGACCCTGGACTTCTCATGNACTGCTGTT
CATAGTTAAGTTCTCTGTAAGACTATATTCACCCAAGGCTTGAAAAGAAA
AGCTCTGCTCCAAAGAAGACTAAAAAAGCCCATTTAAGCCGCCTCTCTAA
ACCCCAGGTGGAACGTAAACTATTGCCGGAACCTTTTGTAAGTAAAACAC
GTTAAACACGGAAACTGTTGGGGTAACCCCCCAAAATTAAGAAAATTCCG
GCCCTGGTAAATACCAAACCGAAAAACAGCCGTTTTTACATAATAAATTG
TTCTATGTCCAAATCCAAACAAATCCCTGTTTTAGTCCAAAGACTTGGTT
TTAGGCCCCCCACCCGGCGTTTC
| NNNTTTCACTGAGGCTGAGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTAACATCTACATCCCAAATGCCAAA
GCACCACATTTGCAAAAGAAATATTACTAGAGTGTAAATCACACATAGAA
CCCCACTCAATAATAGCAGGAGACATTAACACCCAACTCTAAACAATGGG
CAGGTTATCAAGACAGAAACTAAATAGAGAAATAATGTAACTAACAGGTA
TTACAATTCAAATGGACCTAACAGATATCACAGAACATGTCACCTAAACA
CAAAATAATATATCTACACAGCACCTCACGGAACCATCTCCAGAACTGAC
CATATTTAGTCTCAAAGAAGGTCTCAACAGACACAAGAAAAATTAAAGCA
ACCCTCCTTTTCTAATCAAACAACCAGGGATTAAAGCTCAATTTCAACAA
CAAAAAGTTTATTTTTTCTCCCCCCCCCAANAANTCCCTTCTGAACAAAA
AAAAGAGAGGGGGGNNGATAAAGAAAGAAATTANAAACTTCCTAGAATTC
AATGAAAATGAGTGCACAATATACCCAAACTGAGGAGCCACGATGAAAGC
AGTGCTAAGAGAAAAGTTCATAGCATTAAGTAACTTCATAAAGAAAGAGA
GAGATCTCATACTGGCAACTTAACAGTGTACCGGAAAGCTCTAGAATAAA
AAGAAGCAAGCACAGCCAAGATCAGTAGATGACAAGAAATAATCAAACTT
AGGACTGAAATCAATAAAATAGCAACAAAGAATCAATTAAAACAAAGTGT
TGTGTATTTCTAGAAAATCAATGAGCTAGATAAATCCTTATCCAAACTAA
CTAAAATGCAGAAAGAGAAAATTCAAATTAACAAAATCCGAAAGAAAAAC
AGAGACTTATCCATAGGGCCCCAAGGAAATCTGAAAAATCCGTAAGGTCA
TACTTTAGAAACCCTGTACTCCACAAATTTGAAAGGTCCTAAAAGAATGG
CACAAATTTCTTGAAAGATTCCCCTTACCCAAAGTTATCCAGAACAGATA
ACCATTTTAATAGCCCTAAATACCTAAGAAAGTAAAAGCGTCCTTAAAGG
CCCTTCCCACTCCCTCAAAATCAAAACGCCCCCCAGCTAAAATTCTCCGA
ATTTTCAAGAAAACAATCCCTTATTACCAGAGTTTTTACCAAAAAAAAAA
GGACTTTCCAATTTCTTTTAAATCCCACCCTATGACGCCCCCCCACAAAT
TCCCCAAATTATAAAATTTCCCTGAAAGTGGGAAACACCTAAATTCTAAA
TGCGCCCCAGAACCTAAGGTCCCCGTTA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 6 6 8 9 6 6 8 19 15 15 10 10 10 8 8 8 10 14 18 23 23 23 23 21 23 26 28 42 33 30 36 36 36 37 42 42 42 50 48 50 50 42 47
47 50 68 68 68 43 40 40 40 40 40 47 50 57 57 57 51 68 57 50 46 46 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 44 43 50 50 50
54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53 53 59 59 59 41
30 18 12 11 11 12 12 13 15 33 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 41 30 24 13 14 21 27 32 26 22 21 17 14 13 15 15 18 22 26 25 24 18 12 12 12 25 25 41 47 59 59 59 37 37 35 33 31 24 20 20 26 16 15 10 9 9 11 9 9
9 12 9 9 9 10 9 15 28 32 59 59 59 59 53 53 53 53 53 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 47 47 47 47 39 39 44
41 41 39 44 44 47 47 50 59 59 59 59 47 47 47 43 37 37 31 36 43 59 47 47 37 37 39 41 41 47 48 48 48 48 47 47 59 47 44 44 44 37 41 44 59 59 59 59 59 59
59 48 48 48 42 50 41 41 39 39 38 37 37 44 59 59 37 31 30 30 31 37 41 47 47 41 37 32 32 37 37 37 59 40 36 31 31 34 37 39 39 37 35 32 37 44 41 34 43 35
36 27 29 32 37 32 29 37 41 41 39 39 39 39 41 31 31 43 36 15 19 10 11 11 21 25 32 31 26 26 32 39 41 47 46 46 46 48 48 48 48 48 34 33 26 26 19 24 24 37
32 27 31 32 29 30 37 35 35 31 34 32 37 24 25 15 15 17 25 19 19 14 19 14 25 39 33 32 22 22 22 28 23 30 30 32 29 29 29 36 41 34 34 28 35 28 28 32 31 26
22 30 24 30 28 37 32 27 29 16 17 10 9 9 15 15 8 8 8 10 10 15 16 28 30 31 39 32 37 21 23 15 21 21 25 19 18 18 13 14 13 19 16 16 18 18 13 13 10 11
11 17 16 22 25 19 21 14 12 13 15 13 14 16 18 18 25 25 27 26 22 27 28 23 19 21 15 15 17 32 30 18 18 13 9 9 9 17 10 12 12 14 21 21 25 24 19 20 16 12
15 22 18 17 28 28 37 32 35 26 21 13 10 9 15 17 15 13 22 14 13 9 9 9 15 10 11 10 10 10 8 12 8 9 9 15 13 18 18 3 0 3 15 15 21 19 23 23 20 16
15 9 9 9 9 9 11 12 12 10 10 11 13 13 13 13 9 12 9 8 8 7 11 11 11 11 11 10 11 10 12 11 20 20 22 18 20 15 12 12 15 12 14 12 15 9 9 9 10 9
9 9 9 9 10 11 11 11 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 19 15 9 10 9 9 10 15 12 12 13 10 7 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8
10 15 12 10 10 10 10 9 9 9 9 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 9 9 12 10 9 7 7 6 8 10 6 6 6 6 8 10 10 15 15 9 8 8 8 8 6
6 8 8 10 6 7 7 7 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 19 10 8 6 6 6 8 8 11 10 9 9 8 13 11 11 9 10 9 9 9 13 10 9 9 10 6 11 10
10 6 7 6 6 6 6 12 8 13 10 9 9 9 10 11 11 15 11 11 11 11 11 8 13 6 6 6 8 8 10 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 7 6 6 6 11 12 11 9 9
9 9 8 8 7 7 8 8 6 6 6 8 8 10 11 11 6 6 6 6 6 11 10 8 8 7 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10
10 9 9 10 8 8 8 9 8 10 6 6 6 6 8 6 6 7 7 8 7 6 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 10 7 7 6 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 10 17 10 14 15 8 7 9 3 0 3 17 19 17 8 9 10 23 21 31 28 24 18 22 21 28 34
28 37 37 37 37 37 24 23 28 26 36 43 43 42 57 44 68 68 48 48 43 43 48 43 47 39 39 36 36 33 34 30 29 31 36 47 50 50 50 50 41 41 39 25 19 9 9 9 12 17
28 32 20 23 24 32 32 43 36 38 38 42 47 47 48 59 59 59 59 57 50 50 50 50 53 53 68 53 50 48 48 48 42 42 41 41 42 42 37 37 30 30 30 36 28 48 48 68 68 68
68 68 68 68 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 34 32 17 21 24 36 32 50 50 52 57 43 43 43 38 33
33 35 44 44 57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 52 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 57 57 47 44 44 37 43 43 59 57 57 57 68 68 57 59 59 59 59 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 57 48 48 59 59
59 59 32 30 26 19 15 12 12 12 11 12 11 25 23 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 53 57 59 59 48 48 48 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 27 27 9 9 9 25 25 21 17 9 9 9 12 14 30 31 31 26 11 10 7 7 3 0 3 3 0 3 27 23 47 47 34 37 25 23 11 11 11 16 14 22 28
30 19 12 9 9 7 8 8 8 10 15 11 10 3 0 0 3 29 29 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 29 29 3 0 3 27 25 47 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 48
59 57 57 59 59 57 57 48 57 57 57 48 48 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 54 54 59 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 54 54 54 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 57 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54
57 54 48 48 54 47 47 48 48 57 59 48 48 48 47 47 47 48 57 57 59 59 59 59 59 48 47 46 41 41 39 39 19 11 11 11 11 18 23 41 47 47 43 41 41 41 44 44 44 47
44 44 44 37 37 44 44 44 41 47 42 42 47 47 43 44 44 37 28 30 32 33 33 37 47 59 47 47 41 41 41 41 41 37 37 37 32 31 37 30 30 11 10 10 15 16 17 32 27 31
32 37 37 37 37 37 39 36 36 39 41 43 43 40 31 31 31 31 31 33 37 28 25 20 19 19 26 30 37 19 16 19 19 25 25 30 18 18 12 13 13 13 28 28 34 34 15 15 14 13
15 11 11 11 23 23 21 12 15 12 23 23 47 47 41 34 34 28 25 25 31 30 37 39 17 15 13 9 9 9 10 8 9 8 8 8 11 16 23 23 22 11 9 9 12 9 10 13 15 18
15 15 15 30 30 28 22 19 19 15 20 10 9 10 14 9 9 15 27 21 22 18 15 10 10 10 10 16 15 17 17 18 23 21 11 10 10 9 9 8 7 8 9 17 18 18 19 11 10 9
9 8 13 10 11 9 12 10 9 9 9 9 15 9 10 12 9 9 11 13 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 11 12 11 9 10 10 10 10 10 11 11 11 10 12 9 8
8 6 8 8 8 10 7 7 7 9 9 9 9 12 14 10 11 11 12 12 12 10 10 10 14 21 9 9 9 15 15 13 14 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 8 8 10 10 10 6 6
6 6 10 7 8 8 11 12 10 14 12 9 8 8 8 6 6 6 6 6 7 6 9 8 9 9 11 11 11 10 20 11 11 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10
17 12 10 10 8 9 8 8 8 8 9 9 8 10 13 8 8 8 8 8 8 11 14 14 16 10 10 10 8 7 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11 13 19 8 8 8
8 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 15 15 12 13 11 12 8 9 8 8 8 8 14 17 12 14 14 8 11 11 10 10 8 10 7 7 9 9 10 11 9 8 9 10 8 13 10 9 11
12 12 8 9 9 6 8 6 6 6 13 8 8 8 11 21 32 30 21 19 13 13 16 27 11 9 9 6 6 6 6 10 10 28 23 19 8 6 6 8 10 24 12 17 10 8 8 8 10 10
12 12 11 12 12 11 11 11 10 13 12 15 13 11 11 11 16 12 12 11 10 8 8 6 7 10 8 10 10 15 12 12 12 9 9 9 9 8 11 9 12 10 13 7 7 6 8 8 8 8
8 10 12 12 9 9 9 8 8 6 6 7 10 10 11 10 7 7 6 6 8 10 10 10 10 10 10 8 6 8 6 6 8 10 13 9 9 7 6 8 8 9 8 8 9 9 11 11 11 8
8 6 6 6 7 9 6 6 6 6 6 8 7 7 9 12 10 10 10 10 11 7 7 6 6 6 6 6 |