BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313C24.T7 (MSMg01no313_c24.b1) | MSMg01-313C24.TJ (MSMg01no313_c24.g1) |
ACC | AG435189 | AG435190 |
length | 1,237 | 1,203 |
length of high quality (start - end) | 723 (140 - 862) | 322 (499 - 820) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_c24.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_c24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_c24.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_c24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:36 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCTTCTNNNNNNNNCCCACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGG
ATCCGCGGAATTCCAGTTAGCAAATGTAGCATTAAAGACCCAAATAGGAA
CCCACCATTGGACAGACAACCTTAAAAACCTCCACCCCAGTTAGATCTGT
GAATACAAGTTGGAGGAAGACCAGAATTTTCATAGTTTCTAACTGTCTTC
CCCACAGATATTTATACACTACAAAGGGAAAGATGTTAACTTCATGGTAG
AAAGGCCAGGAAGCACGCAGCCATAGAACACACGGGTACCATTCACTTCC
TGAAGTGTGTATGAAGAGTCAGTCATGCAGGCACAATACACTGCTCCTCT
TGCCAATCATCCTATTTGATCCTGAGAGAACAGAACACAGCCCCAAGCAA
AGGACGTACAATTAACAACTGTTCTTTATGGACATCCCTGTGAGAAACTG
CTTAGATCACTGGATCACTGGGGTGGGAGGACCAACCCTACCTGTAAGCT
CGAGTCCTGGGCGGAGGGAAAGGAGAACACAGACCAAGCGCTTCCACGCA
CCTGCCTCTGCTTCTGAGGCGCAGATACAATGCGGTCAGCTGCCTCAAGC
TCCCACCGCCTTGACCTTCCCACAGGACAGGCTGTCTCCTCAAACTGGGT
CAAAAATAAACCTTTCCTCAGGTCGCTTTTGTATTTTGCTGCAGCGCCTA
GATGAGTAATTAATATAGTGTTCAGATCACAGAGGATAAGAAAAGATACA
TAGGCAAGTTTAGGATACAGGAGACTAGAGAAACGCTAAGTGCATCCTGG
GATCTTGAATTGGAGTGTAGGTAGAATCTGGACTAGAAAGGCTCATCAAC
ATAAAAATCAGTGTAATTTAAATGAGATCATTTACTTAATAACACTTTAC
CAATATTGATCTTCCATTTTTGACAATTGTATAATGCTTATATCAGCAGA
AACTGACCCCAGATTGTATGAAGATTATTTTTTTTTACAACTTTTTAAAT
CTTAGGCTAGTTTAAAATTTTTAGGGATGTGAGCTAAGAATGGTTTCCCT
CCCTTTGGTATAGCAGTCCCCGGTGTTTGGATGGGAAAAAACAATTTTTG
GGAAATTTAAAACCCGGACCCCCAGGGACCCCCCAAAAATTTTTCGGGTT
TTTTTCAACGGTGGGGGTTGGTTTCCCAAAGGAGTATTCTTTATTTTTTC
TCTCACAAGGGGTTTCTAAGAACCCACTCTTTTGTAA
| NNNCCCCTCAGGGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATCAGCTGGATGGAATGCCAATGTAGA
TAAATGATCTTTATTTTGTTCTGCCACTCTCTCCACACAGCCCTGGCTGT
CCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAATTCGCAGATATCTC
CTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGTACCACCACCTTC
TGGCTTTTTCCTTCTTTTAAAGTCAGAGTATGGGTAGCCCAGGCTGGTCT
CAAACTTAAGTTTTCTTGCCTCTGTCACAAGAGTGCTGAGCAAAATGAAG
CCTGTTTACATGACGTTTTCATCTCTCTTCCCTCAGTCATCTGACCTTTC
CACCAAACGCAATTATTGGACTGGATGGGACAAAAATAAACTTTATTGTT
TTTTTTTTGCCCCCCATTTACCAAATGCTTGCTCATAAAAAAAAAAAATC
TATCATGGTTTCGAGATACATATGGAATGTTCCCTCCTTTTTCTTTTTTT
TTTCTACAAAATTAAGCAAACACACACACGTATTAAATGATTTGCTATAT
AGTCATTAATGCGTGATTAGGGAAATAAGTTTCAGAATTTTCAGATCTGT
GGGACATGAATTGTTTATATCTGATTAAAAAAAAAACAGTGGGGACACAT
GTTGGCCAAGTGTGAAGCAGGGGCTAGTTCTTCTATGCAAATTTGTTAAG
AAATGTAAGAGGGCTCTCTGCTTTGACAGTCAAATCCCTGACTGAGACTA
GTTTACCCTTTACCTTGCTTCACAGGGAGGGAGGGAGCCCTGTGTCACCT
GGAATCTTTGCTTCAGAATGCCAATGGGCTTGCTGAGTTCTTTTTATTCA
CTTATAAGGCGTGAAAAGACCTTTTCTTTTTCTTGAGGCAGGGCTCTTGA
GATTGACCCCCAAACCCATCCTCCTGCCTCGGTCTCCCGAATGCAAAGAT
TGTGTATCGCCTTTAACCACCTAAGGGGCAATCTTTTTAAAGCAACATGG
GGTTTGTGGGAAAGATATATAAAGTTTTTAAAAAAAAATTCCAAAATTGT
TTTGGTGGCATCCCAAAAAGGGGGGGATTTTGCCCCCAAAACTAATTTTT
CTCCCCCCCAAAAAACTCCTTTTATATCCGGGTAACGTTTTTTCTTCTTT
AAT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 7 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 8 6 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 12 9 8 8 8 12 10 24 26 35 30 28 28 24 28 33
33 37 37 37 37 37 37 37 32 28 32 37 37 25 28 28 28 30 30 44 39 50 47 37 23 23 11 9 9 9 9 9 14 13 21 12 15 12 17 12 12 11 12 22 26 33 33 33 44 44
53 53 57 57 50 50 50 50 36 36 44 44 39 50 42 30 27 12 12 9 11 11 10 9 10 12 13 17 13 9 9 9 9 11 12 18 18 19 19 16 27 27 35 47 38 50 50 50 53 53
53 43 53 53 53 50 43 50 53 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 57 50 50 48 48 53 59 59 59 57 53 50 50 47 44 44 39 37 33 29 22 13 8 8 8 10 15 34 39 47 47
41 48 48 48 48 48 48 50 53 53 57 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 48 48 57 57 68 68 68 68
68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57
59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 48 54 54 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 68 68 50 50 59 59 59 57 57 57 57 48 48 57 48 48 59 59 59 59 59
59 50 50 50 47 34 27 15 11 10 9 9 9 9 11 12 18 30 36 47 50 50 50 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 46 46 44 48 48 48 48 36 32 19 17 18 18 21 34 32 48 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 59 57 68 68 57 57 54
57 57 50 43 43 44 57 59 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 57 59 59 59 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 47 48 48 48 47 59 43 54 59 57 59 59 59 59 59 48
48 48 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 54 48 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 28 24 34 34
34 41 41 41 50 50 41 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 43 43 43 39 33 33 33 33 33 37 41 39 44 44 39 39 39 39 39 39 39 39 37 39
40 44 48 50 50 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 43 43 40 40 37 44 37 37 37 37 39 39 43 43 43 30 31 28 35 36 36 32 37 33 41 43 48 39 40 40 39 29 19 15 14
8 8 13 15 20 30 30 37 37 44 44 37 37 41 41 41 21 14 9 9 9 19 19 30 18 22 28 32 32 29 31 39 30 27 15 15 14 18 16 11 9 9 9 14 23 34 30 24 30 30
25 23 23 22 21 21 34 28 20 20 20 24 21 28 14 15 15 14 19 11 14 14 17 19 12 12 22 25 28 22 18 10 10 8 8 8 9 9 11 11 11 11 17 11 10 12 23 24 32 30
31 35 36 34 30 24 20 28 17 15 11 9 9 9 9 14 13 14 19 16 14 19 14 22 12 12 10 10 9 19 13 19 14 15 18 18 18 19 22 27 37 32 23 15 10 10 16 12 13 11
16 11 22 19 23 18 10 10 10 9 17 19 18 15 10 12 8 8 10 13 9 11 9 9 12 15 18 14 9 9 8 22 22 25 22 13 17 9 9 12 12 11 13 19 12 8 8 8 8 9
10 13 17 14 13 13 14 18 10 10 10 13 13 11 10 12 13 13 27 26 9 9 9 12 9 14 11 11 11 8 8 8 8 12 10 15 11 11 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 10 8
8 8 11 10 8 8 8 10 9 10 10 8 8 6 6 6 6 6 7 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 7 8 10 11 11 16 16 16 16 21 13 16 10 10 8 8 8 10 8 8 8
10 9 10 10 10 10 10 8 9 10 8 9 9 10 8 6 6 6 10 10 15 13 8 8 6 8 8 8 8 13 20 22 20 23 28 30 30 31 29 30 16 11 13 8 8 8 8 8 8 9
10 18 21 16 11 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 11 8 8
8 10 10 9 9 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 7 10 10 8 8 8 8 8 10 15 13 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 15 9 8 9 8 15 8 14 16 20 20 16 21 21 33 29 32 24 24 35 36 36 36 50 50 37
47 47 47 40 42 47 53 53 57 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 48 50 47 47 47 47 47 48 48 48 48 53 53 68 68 68 57 54 54 54 42 43 32 32 32 36 23 29 30 34 39
39 43 47 50 59 59 57 57 48 42 38 38 53 53 41 50 50 50 39 30 22 15 12 8 8 8 8 8 22 22 33 37 37 37 48 48 53 50 57 57 57 47 50 47 47 47 50 50 50 50
50 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 54 47 50 50 43 43 54 54 53 68 68 68 54 44 32 21 15 12 19 12 32 32 57 59 59 54 54 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 37 37 37 50 50 57 57 59 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57
54 57 59 59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 37 37 28 34 18 15
12 12 20 24 40 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 50 53 53 44 44 43 43 39 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 36 28 22 8 9
9 11 11 19 27 16 9 9 8 6 8 8 9 9 9 9 9 11 12 21 27 36 59 59 59 59 59 59 48 47 46 46 41 25 19 8 8 8 8 8 14 12 13 11 10 10 11 11 12 18
28 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 53 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 47 47 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 54 54 59 57 57 57 50
50 38 37 37 50 50 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 57 57 68 57 59 57 48 48 48 59 59 59 48 59
57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 54 48 48 48 48 48 59 48 40 40 28 28 35 40 40
47 39 39 39 36 36 43 59 59 48 47 47 39 35 39 37 37 41 41 37 41 39 43 37 39 40 34 34 25 32 34 43 39 46 47 47 43 39 41 37 41 59 59 41 41 41 32 26 18 20
18 27 32 41 41 37 37 24 24 17 24 17 15 19 18 28 32 33 33 28 28 30 41 37 46 43 31 28 28 28 28 28 37 43 39 37 43 37 33 33 30 25 20 20 10 10 10 25 28 36
35 31 31 39 39 37 37 28 30 30 30 25 24 37 25 28 27 23 23 19 14 14 17 21 21 18 18 16 15 12 18 14 21 10 10 12 19 15 19 17 23 18 13 12 11 10 9 9 9 9
11 10 8 8 8 13 23 27 16 8 8 8 9 12 11 11 11 16 20 25 20 22 18 20 19 18 10 11 10 11 11 17 18 19 19 12 11 13 13 24 19 16 17 8 8 8 12 12 11 11
10 10 11 13 16 12 8 8 7 7 7 8 8 14 21 22 14 12 12 15 11 16 17 16 14 14 15 18 25 23 18 18 18 14 15 10 11 11 16 18 20 21 16 12 11 12 10 10 10 6
6 6 8 9 15 10 10 12 23 15 15 11 17 15 9 9 9 6 8 6 8 9 12 12 17 15 9 8 8 8 8 8 8 10 9 8 9 9 11 9 10 10 10 13 13 13 9 9 9 12
14 10 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 15 13 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 8 10 8 8 8 8 8 9 18 19 11 12 10 8 9 9 10 10 10 10 9 10 10
11 10 8 8 8 8 8 10 15 11 11 11 6 6 6 7 6 8 12 11 8 12 15 10 8 8 8 9 10 10 12 12 24 23 16 14 14 9 10 9 9 9 9 10 10 11 11 11 12 12
12 23 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 10 14 11 9 12 10 10 12 12 12 15 18 18 18 14 12 12 12 11 11 10 10 12 12 20 10 11 11 14 15 19 20 10 13 8
8 8 10 16 13 16 10 10 8 8 11 15 19 14 10 10 10 10 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 7 7 10 10 16 13 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8
9 9 9 |