BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313F12.T7 (MSMg01no313_f12.b1) | MSMg01-313F12.TJ (MSMg01no313_f12.g1) |
ACC | AG435298 | AG435299 |
length | 1,303 | 1,290 |
length of high quality (start - end) | 244 (501 - 744) | 383 (71 - 453) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_f12.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_f12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_f12.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_f12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:56 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCCGTCACTGGGGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTCAACTGAGGAATACCAAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAATGTTCAAC
ATCCTTAGTCATCAGAAAAATGCACATCAAAACAACCCTGAGATTCCACC
ACACACCAGTCAGAATGGCTAAAATCAAAAACTCAGGTGACAGCAGATGC
TGGTGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGCTGGTGGGATTG
CAAGCTGGTATAGCCACTCTGGAAATCAGTTTGGCAGTTCCTCAGAAAAT
TAGACATAGTACTACCAGGGGATCCAACAATATCACTCCTGGGCATATAC
CCAGAAGAAGCGCCAACATGTAATAAGGACACATGTTCCACTATGTTCTT
TGCAGCCTTACTTATAATAGCAAGAAGATGGAAAGAACCCAGATGTCCTT
TTTTTTTTTACCCCCCCATAAAATGTGCTACCCCTATACAAAAAAGAACT
ATGCAGCTATTAAAAACAATGAATTTATGAAATTATTAGACAAATGCATG
GATCTGGAGGATATCATCCTAAGTAAGGTAACCCAATCACAAAAGAACAC
ATATGATAGGCACTTACTGGTAAGTGGATATTAGCCCAGAAGCTCGAGAA
TAACCAAGATACAATCTGAAAAACACATGAAACTCAAGAAGAAGGAAGAC
CAAAGTGTGGATACTTTGGTACTTCTCAGAAGTGGGAACAAAATACCCAT
CGGAGGAGTTACAGAGACAAAGTGTGAAGTAGAGACTGAAGTAATGACCA
TCCCGAGACTTCCCCAACTGGGGATCCATCCCATAAACAACCCCAAAACT
CATTAATACTTCTAACACTTGTTGAGTTTGTTCTTTGACAATTTTCTTAA
ACACATATAGTACACATTGATTACTGTCACCTTCACCTTCTCCAGTTTTC
CTCCCAACCTTAATACCTGCCCTGTCCTCCCAAAAAATTCCTTATTTAGG
CTCCTGGCCCAAATTAAGTGCTGGTCTCCCTCTTAATCAAAAAATCTTCT
TTTTGCCATTAACCTTTTCTCGCCTTTCCAAAGGAATTTAAATTAATTTA
ATCTCCCCCCCGTCCCTAAGGTGGTAACTCTTTTGGTTCCCTCTAAAAAA
TGGGATATTAACCCCTAAAACAGGCATTTGTTTGGCCCCTACCATTCTTT
TTTATATTACTAAGTGTCAATACCAAATAAATCGTTTCTCTTTCCTCCCG
CCTTCTCTTCNTACCCATTATTTAATTACTCTCCAAAATATCCGTGTACA
TCT
| NNNCCTATGACGGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATGTTAGGCAAGGATACATAGTGAGACCA
TGTCTGAAACAAATCCTGTTTATCCTAGAGAGAATATGTGCCAGTAGTTT
TTCTTTTCTTATTACCATTTTTTCCTGAATATCATTGAAGTGTTAGGAGT
AAAGATTAGATAGTGAGTGTAGATACATCACAATAAGCAAGCACTATTTG
TCTGAAATGTTTTTATATTGGTATATTCTGATTCTCAATAGTATTGTCAT
CTATAGATCAATACATTTTTCACAGTCCAATATCCTGCCAGAACCCATGA
CCCATGCCATTTTCCCAAAGTTAACCCTGGTTTAGGACAGGGTCTTTTTC
AATCTGAGCACTTAAGTCAGGATTTCCTGGGCTGCTTGTGAAAGTTTTTT
TTTTTCCCCCCCCCCANGGGGNGACCTCCCTCCAAAAAAAAGGGGGGGGG
GTGNTNTGTNTTGCCNTNNTCTCCNNCGTGGTTGTGTTNNGAGGTGGGTC
CTTTAGGGAACAATTAGACTTGGGGAGGCCATGAGAATGGAGGATCTATG
ATCTGATTAGCTCTTTTATATGAAGGGGAGGGTACACTTTAACTTCTTTT
TTAGTTCCCTGATATAGCAAGAAGGCAGCTCTCTGTGAATCAGAAGATGT
TCTTGACCAGACCATGCCTATACTATACTCTAGCTCTGGACTCTCAGCTT
CCTGACTCTATTAAACCTATGACCCTGACTTAAACTATTTTTTCCATACA
ATCTTCTTACCACCTTATTCAGAAACTGGATCTTCTACCCTCACGAATAA
CTTCTTGGAATCGTACCCTTCAGGTAGTATTATCTCTTCATTTGTGTCTC
CAATCCATCTTACATTACCGGCTCTTCTCCGTCCATCTTACTTTCACTAT
AAACTCCCCTCCTCTATCTCTTTCTCTATACTTTACTAATCCACCTACAT
GCTCTCTATTATCTTTCTATTCTAACCCTTTTTCTATACTCTTTTTCATC
TTCTCTTTTCCCCTCATAACCCCTTTCCTGTTTCTCCTATTTCCTTTCTC
TTTTCATCCTCTACCTTTCCCCTTCTTACTTTCTCCTATTACTCTCATCC
TATCCTTCCTCTTTTTATTTCATAACACTCCTCTCTTTTCCCACTCTTCC
CTCTCACCTATCTACTTACATTCCTCCCATCTGCCACTTATGACTTTATC
TCCTCTTATCACCTCTCTTCACCCTATCTCTCCTCACTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 19 8 8 8 8 10 13 18 21 15 15 8 8 8 21 21 28 24 28 28 33 34 42 43 43 39 39 39 33 33 42 42 48 57
48 48 42 41 41 41 41 46 41 46 48 51 51 51 43 35 23 20 20 17 28 32 32 47 41 48 41 47 47 48 48 68 50 50 50 50 50 48 48 47 48 48 57 57 57 57 48 48 48 57
57 57 57 47 43 37 28 28 28 28 28 37 37 37 37 50 50 47 59 34 27 15 9 9 12 11 11 12 15 15 32 41 59 59 48 37 39 47 39 44 50 57 47 48 48 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 68 68 51 50 50 51 51 68 68 68 68 59 41 34 19 15 19 24 18 19 21 40 42 47 57 48 42 38 32 27 23 36 44 57 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 37 43 43 57 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 46 48 47 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57
59 57 57 57 57 57 68 59 59 54 54 59 54 54 54 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 31 30 14 12 10 10
9 9 10 11 25 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 43 43 43 43 48 48 59 59 57 57 57 48 48 48 48 50 50 47 33 21 12 8 8 9
9 13 14 23 20 18 9 10 8 9 9 9 12 14 10 11 9 13 13 30 41 41 32 28 19 13 13 11 11 10 14 11 12 10 10 15 18 17 19 17 19 11 11 10 11 11 11 11 11 15
18 23 25 41 41 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 54 47 47 48 48 54 59 59 57 54 54 59 57
57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 46 44 44 47 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 43 43 47 59 59 68 68 68 59 59 57 54
54 59 57 68 68 57 57 57 57 57 48 48 54 57 57 54 46 46 46 47 54 54 59 57 68 57 57 48 48 57 57 57 43 43 37 43 43 37 33 39 33 33 39 43 43 48 41 40 40 41
59 43 39 31 28 32 39 39 39 39 39 36 37 43 47 48 57 47 42 42 39 43 39 43 43 43 43 43 48 48 48 40 41 39 39 36 36 33 30 31 25 25 30 30 33 33 40 43 43 47
43 47 41 33 33 33 32 30 29 31 39 39 41 41 42 37 37 37 37 37 39 41 34 37 41 34 34 25 24 23 26 37 37 32 41 30 34 34 28 26 29 25 25 15 16 16 26 15 16 15
24 17 23 16 16 18 18 20 27 28 34 23 23 23 24 21 18 14 14 14 18 18 23 28 28 30 24 31 31 31 26 26 13 26 20 37 37 28 24 21 21 21 17 18 27 22 19 14 14 19
18 9 10 9 9 9 9 11 13 16 19 28 28 30 27 30 33 32 19 12 11 19 19 15 10 10 14 21 26 30 33 28 28 22 31 13 13 10 8 8 8 10 10 15 21 16 16 16 16 18
18 30 17 9 9 9 12 12 15 37 30 27 23 18 9 10 10 11 8 8 13 10 12 21 10 10 11 22 19 13 8 8 8 8 12 19 17 8 8 8 8 8 8 10 10 14 19 19 14 21
27 13 14 14 21 17 18 10 10 9 10 9 10 11 9 8 8 10 13 19 16 14 12 8 8 8 8 9 11 10 21 10 10 9 9 9 10 16 22 24 28 21 12 11 12 10 11 13 13 10
10 10 12 15 27 19 19 19 17 13 12 9 9 10 12 13 14 24 23 12 10 9 12 9 9 9 12 16 16 22 11 15 15 21 22 32 18 24 19 16 9 9 11 11 10 10 10 10 10 10
21 11 14 14 12 9 11 9 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 13 12 11 13 11 21 21 21 24 16 14 15 10 8 8 8 6
8 13 8 8 8 8 8 8 12 11 16 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 12 15 12 12 11 12 12 9 10 8 8 8 9 9 8 10 18 12 11 11 12 9 8 8
8 8 8 8 8 10 10 16 12 13 10 7 7 7 8 16 16 23 22 13 7 7 7 7 14 8 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 9 12 8 12 10 10 8 8 10 14 21 13 13 9
8 10 6 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 10 8 14 17 23 13 9 9 7 13 8 13 9 12 18 9 9 9 12
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 9 10 10 10 9 8 8 6 6 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 9 9 9 9 8 8 8 15
13 11 10 10 9 9 8 9 12 3 0 3 6 6 6 6 8 10 15 8 8 8 8 6 6 8 8 12 12 12 10 8 8 12 10 10 9 10 10 11 10 13 9 7 7 8 8 8 8 9
9 10 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 8 7 7 6 6 6 6 7 12 6 6 8 7 10 15 15 12 7 8 3 0 3 3 0 3 10 10 14 27 23 33 29 29 22 28 28 29 33 42 36 36 43
43 42 34 36 40 40 48 48 57 57 46 43 43 43 42 53 53 48 43 42 35 23 23 26 26 26 22 43 43 68 68 50 50 50 50 42 42 32 32 32 42 33 32 29 31 36 39 39 39 34
34 34 43 43 47 57 48 57 57 48 48 48 48 44 33 33 33 30 24 19 11 9 8 8 8 8 9 9 14 27 32 47 43 48 48 43 43 43 59 43 57 48 47 42 47 47 50 53 57 53
44 48 48 54 54 54 54 50 50 50 68 68 68 68 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 57 57 42 39 35 42 42 44 44 43 46 44 43 43 43 43 37 44 46 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 57 57 57 54 59 59 52 52 52 43 43 43 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 52 52 43 42 35 35 42 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 47 33 27 11 12 11 11 10 10 11 12
12 26 30 47 47 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 50 50 53 48 48 48 48 46 43 47 59 43 43 43 41 59 41 59 50 50 47 27 25 15 15 13 17 24 34 41 39
32 22 18 13 8 8 8 14 15 17 17 14 12 9 9 3 0 3 27 29 3 0 3 18 18 15 10 8 8 8 8 8 12 12 18 17 22 20 21 14 12 12 9 11 10 10 11 11 13 11
21 27 3 0 3 0 3 29 3 0 3 29 29 29 3 0 3 0 0 3 27 27 23 3 0 0 3 22 23 47 59 39 39 35 35 22 23 3 0 0 3 22 23 32 36 36 30 30 20 24
32 39 34 41 39 36 36 31 31 33 28 30 30 25 28 18 28 28 40 37 43 32 26 15 14 15 23 20 20 23 32 28 26 14 14 24 30 34 28 25 30 37 25 20 20 21 24 28 28 47
47 39 39 42 48 48 37 23 12 8 8 8 15 19 39 39 39 40 39 39 30 37 28 28 28 30 36 34 25 31 25 33 28 35 32 37 39 47 32 15 8 8 8 8 15 30 36 33 35 35
26 28 21 21 21 15 15 15 18 20 21 33 24 19 24 24 24 22 21 21 20 25 25 31 27 19 15 13 11 16 21 24 21 24 17 19 19 10 9 8 11 8 8 8 9 11 11 14 10 10
13 19 27 18 18 11 13 13 10 12 16 26 23 13 13 10 10 8 11 13 10 10 8 12 12 13 18 9 9 9 18 11 11 9 9 13 18 16 17 15 18 8 8 8 11 13 15 21 23 22
20 19 15 17 10 9 9 8 8 8 8 8 10 9 11 11 11 9 9 9 14 14 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 13 15 24 21 28 17 20 11 11 10 11 10 10 6 6 8
11 11 14 17 17 11 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 12 10 10 14 10 10 11 12 11 11 12 15 13 13 10 10 15 15 22 21 11 6 8 7 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10
10 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 9 9 10 18 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 10 12 9 10 10 12 8 8 7 7 8 8 8 10
10 10 10 10 16 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 9 10 10 15 12 12 12 10 10 10 9 9 9 10 8 6 6 8 8 9
8 8 6 6 6 6 10 11 16 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8
8 8 12 10 10 11 8 8 8 8 7 9 9 9 12 8 10 9 9 9 9 9 10 12 12 11 11 10 10 10 10 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 12 11 11 11 11 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 12 15 15 12 12 12 12 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 10 7 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6
6 8 8 9 9 10 12 18 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 11 11 11 15 12 10 8 8 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 17 16 24 12 11 10 8 8 8 8 17 12 17 15
16 14 17 12 19 8 8 8 8 8 10 16 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 11 7 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10
8 8 8 10 8 8 8 8 10 9 10 10 13 8 8 8 8 13 8 8 6 6 8 10 9 10 13 26 11 10 10 10 10 10 8 9 9 10 12 9 |