BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323E21.T7 (MSMg01no323_e21.b1) | MSMg01-323E21.TJ (MSMg01no323_e21.g1) |
ACC | AG441764 | AG441765 |
length | 1,156 | 1,182 |
length of high quality (start - end) | 570 (123 - 692) | 473 (86 - 558) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_e21.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_e21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_e21.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_e21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:42 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCGCCCTATGGNNNAACATTGCGCGCTATCGACTCCTATGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCACACAAATACTCTGCCTTCTAAAGCTGTGTACATGCACT
CCCTAGTGCTGAGCCGTTTGAGAGAGCTGTGTACATGCACTCCCTAGTGC
TGAGTTGTGTGTGAGAGCTGTGTACATGCACTCCTTAGTGCTGAGGCATC
TTTCAGTTCTTAATTTTTTTTAAGCTTATTCTCTGCTAACCTCAGATAAA
GGAAGTATCAAACACTTTAGAATAAAAAGTTTTTGCGATAGATATAGATA
TATGAGAGAGAGAGAGAGTGAGTGAGAGGGTAAGAGAGAGAAAGAGAGAG
AGAATGAGCTTCAGTGTGTGACTATGTGCACATGAACGAAACACCTGTTT
TCTTCAAGAGTAGAAAGCACTGTGATCACTGAACCATACCCTATTGCACT
GTGAAAGGCAGTCTGGGTTCTGGTTGAGTGAGGCTTACTGGAACGACCCA
GTAGAAAAATCTACAAGGGACCAAACTGTAAACTATGCTTCCAGACACAA
GCGCCTGACACCACATCAACTACTCAACTCCATACTCGTGTGACTATCAG
TCACATAGACAATGTCCAAGCTCCTGGTGTTCTGCTCCAGCCAGGTAAGC
TTCTCCCCACAGTTACTTGGCAAGTAACTTGGCAAGGTAGCCCAGCCCAC
TATAAAAGTGGCTGCTCGGCCCCTCCTCTCTCTCTCTTAAGCTCTTGCTC
ACTTCTTGTCTCTTATCTCTAGCTTTCCTTCTCCCCCTCCCTTATCCTCT
CTCTCCACATGGGCATGGCCAGCCTCTCCTCTACATTCTCTTTTTCTGGT
TTTTCACAAAAAAGGTCTTAAAATATGGAGCATTTCTTGTCCTTTGAGAA
TTTTTTTTACTGAAGCCCAAAAATAAAGGTTTCCTCTTTTTAGACTTTTT
CCTAAATTTTTTTGTATCTTGAAAAACTGGGTTGAGGTTTCTAAAACCCC
AGGTGGGCCAGGGACCCCAAAAAGAATTTTTTTTTGGTTTCTAAAAAAAT
AGGGGGGCCGAAAAATAAAAATAAAAAAAGNCTTTTTCCCTTCTCCTTCT
AAAGTTTCTCTGTCCAACNCTCTGCTCCTGTTTTCTTGGAGATTTCAACA
AAATTA
| NCCCCCTTTTNNNNACCTCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAATACACCTATGCAGTGAC
CTATGTTCCTATTTGCCTCTGACATTGCCTAACTAACTCCATATTCTCAC
GCATAATACTCCTTTCAATGTCCTGTATTTTTTCTGACGATGCACTAAAT
CCAGTTAATGCTTCTCACTCAGTCATGGGTGTAGAGCCATCCACTGGAGC
GTGTGAAAAATCTACCAGTGGCTACATCCCCAAAGAGAACTATTCTCCCT
CCTACAGCAGCTATCAACTGCCACTAGTCCCCTTAAAAAGGCATGAGGCA
TGAAGATTTCCCCTATCTATACAGGGGGTGGGGGTGGGGGGTGACTGTAT
TGATCTTGTCNGGTTCTATGCNGCTNAAAGCCTATAAATGAACTATTTCC
ACAGTTGTGTCGTGTCCAGAAGGCAGCATTTCATAAGACTACTTTCATTC
TACAGCTCTTATGTTCTTTCTGCCTACTCTTCAGGGACTTTCCTCTGTGC
TTGATGGNGTTTGNAAGAGTAATAACGACTCCCTTCCCCAGAGAGAGAGT
GTAGTGTAGGAATTCAGCCTTCCCAGACAAATCACACATGGAAAAGACTT
GTTGGTAAATAGAGTACTACATTCTGCATCAAGCTTATTGCAACCTTAAT
ACACAGGCTTTTCTCAAAATGTATTGGAGGGAAAAAAAAATCTATTTTCT
ATTTTTTTATTATAATATTATAACACTTGTACAGCCCCCGGTCTCTTTGA
TTTCTTCCTTCCGAACATAAAATACGTTAAACCTAGCCAATTGCATTCTA
AATTTTGCAAAACCTCAACCCCTTTTATAAAACCTCTTCTTGAGCTAATC
TTGCTTAACTATTATAACATTTCGTCCTAAAAAACCATCCTGAATAATTT
TCTAACCATTAAAAACCCTTGTCTTTTTTTGAATCTCCCCTAAAGGACTA
AAAAACGGACATAATACTTTCTTCTTTTTCATAATATTAATCAAAATTTT
TCCTTATAAATCATACTTTTCAAATAAATACAACATTTTATCATCTTTTC
TTTTTAAAATAACTTATTCTCTTCTATTCCAACCACTAAGTGTCTTTTTA
TGCTCTTAATATATATTACCTACCCTTCACTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 9 8 8 7 7 8 9 3 0 0 0 3 6 6 7 7 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 14 14 19 10 10 10 14 10 8 8 22 19 28 28 28 30 31 31 33
33 37 33 30 30 28 24 19 19 12 9 9 22 22 50 50 50 50 37 37 22 21 13 9 9 9 12 12 11 11 10 13 10 10 9 15 16 10 12 23 26 35 36 53 53 57 53 50 50 50
50 36 36 35 31 31 31 30 28 30 33 19 13 6 6 6 8 8 11 11 11 16 11 24 24 37 33 33 28 29 29 32 36 36 42 53 53 50 50 50 50 50 50 53 47 47 47 47 51 51
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 48 57 40 40 28 32 36 44 57 68 68 68 68 68 68 57 68 68
68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 51 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 48 59 59 68 68 68 68 68 53 53 53 53 59 59 59 57 57 57 57 50 53 53 53 50 50 50 53 59 59 59 35 24 28 20 22 16 18 18
19 15 15 25 22 36 41 44 50 53 53 57 59 59 59 59 57 57 48 48 57 50 53 53 53 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 17 13 8 8 8 13 19
31 37 37 41 50 50 53 59 59 59 59 59 35 37 37 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 48 48 54 54 54 57 57 59 59 57 59
48 57 57 57 57 57 57 57 57 44 57 42 44 42 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 42 42 32 37 44 44 48 48 59 59 59
59 59 59 59 68 57 57 57 54 54 57 57 57 48 48 47 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 37 43 43 59 59 59 59 43 43 43 44 43 48 48 48 48 48 57 59 48 48 48
47 41 41 39 37 37 43 43 41 41 31 32 43 37 41 41 47 59 59 59 59 41 47 43 40 34 31 39 36 37 36 37 37 39 47 30 34 28 41 41 57 57 57 57 48 57 57 57 57 43
39 34 47 43 43 32 32 32 50 50 50 47 41 39 39 39 31 27 27 25 30 32 37 37 37 30 37 41 32 28 22 22 28 23 28 37 32 33 26 23 16 17 25 30 27 11 11 10 10 11
23 26 23 24 24 30 30 30 25 34 36 43 59 37 37 32 34 23 23 9 9 12 20 24 36 36 34 34 25 25 25 34 28 25 25 34 28 39 30 29 32 37 32 39 39 41 46 46 37 37
25 25 14 15 20 27 27 30 18 15 21 21 21 28 24 28 19 19 20 15 15 13 13 12 9 9 8 8 8 19 25 36 36 37 37 37 18 18 16 19 22 14 18 23 24 25 18 18 18 25
28 25 25 25 28 24 27 28 19 19 11 11 11 16 22 21 31 20 23 11 12 11 17 13 18 16 18 18 14 14 14 10 13 8 8 8 8 17 9 8 8 10 8 9 10 10 10 9 9 9
9 9 7 8 8 9 10 8 9 15 8 8 9 11 11 9 10 10 9 9 9 9 10 10 12 10 8 8 10 8 8 11 11 12 11 11 10 8 8 6 6 8 6 6 6 9 9 10 8 7
6 6 10 12 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 10 7 6 6 6 7 7 10 10 12 12 12 15 10 10 10 10 14 15 11 8 8 7 7 7 6 8 8 12 12
11 6 6 8 8 9 9 9 9 9 10 8 10 10 8 8 8 8 8 11 8 9 9 14 21 17 11 9 9 11 11 13 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 17 20 14 8 8
8 6 6 6 9 11 11 11 11 11 9 7 8 8 8 8 16 15 11 10 9 6 8 6 6 8 6 7 12 18 15 12 11 15 10 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 15 10 15 11 11 17 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9 10 16 10 11 11 11 8 8 6 3 0 3 8 6 6 8 8 10 13 19 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 11 8 8 6 6 6 6 9 10 8 10 8 6 8 3 0 3 6 8 8 8 6 8 10 10 11 11 21 19 15 9 9 12 7 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8
8 9 8 8 8 7 | Open.Hide. 0 3 7 7 7 6 6 6 8 3 0 0 0 0 3 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 13 8 8 9 8 15 12 19 22 20 20 17 22 29 30 22 24
17 17 24 29 35 35 37 37 36 36 36 36 36 36 36 44 44 50 50 47 47 34 27 10 8 6 6 8 8 9 8 8 11 13 17 21 21 25 33 30 31 31 33 35 35 35 35 35 38 42
43 43 42 47 47 50 50 42 42 42 42 42 29 24 21 15 20 15 15 10 17 13 31 31 46 46 46 42 37 37 32 32 37 48 48 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 51 51 51 51 50 50 68 57 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 68 68
68 54 54 54 54 57 57 57 57 59 57 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 59 59 59 50 37 37 37 23 19 15 10 10 10
11 11 11 11 18 18 33 29 29 3 0 3 23 23 59 59 59 59 27 27 3 0 3 22 3 0 3 7 7 9 14 37 47 59 59 59 59 50 50 50 50 43 28 24 16 8 8 6 6 6
8 10 21 25 46 46 50 59 59 48 47 39 39 30 36 37 43 39 48 48 48 50 57 57 59 59 43 47 59 59 59 68 59 43 37 30 23 32 36 36 43 48 48 54 54 54 57 57 57 59
59 59 57 57 57 59 59 59 59 54 48 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 59 27 25 11 11 11 28 28 59 59 57 57 57 57 47 47 47 44 48 46
46 42 41 39 25 25 3 0 3 23 27 29 3 0 3 20 20 30 36 32 39 39 48 47 30 28 14 14 23 28 39 43 43 39 32 28 28 23 23 14 24 17 23 19 23 23 40 37 24 19
8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 10 26 29 32 34 15 13 12 27 27 40 24 24 12 11 11 18 18 22 22 23 29 15 10 10 10 13 23 15 14 9 8 13 8 10 9 13 11 17
9 11 16 11 11 10 17 15 8 8 6 8 8 14 17 25 25 24 28 20 20 18 23 12 11 11 10 10 10 11 11 21 25 32 35 30 41 16 12 9 14 11 11 11 13 19 20 25 8 8
6 6 6 15 10 16 16 16 22 19 10 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 15 10 8 8 8 8 8 10 11 11 14 13 19 17 16 10 10 8 17 11 20 11 12 16 23 15 9 9
9 23 23 16 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 7 8 6 6 8 6 6 6 10 17 19 11 10 10 21 10 9 9 11 11 6 7 7 6 8 6 6 7 11 11 7 7 7
8 15 22 10 10 6 6 6 10 9 8 8 8 8 10 9 9 8 8 10 12 13 13 8 7 7 8 11 17 13 18 8 8 8 8 8 11 9 14 8 6 6 6 8 8 8 9 9 9 9
6 6 8 8 10 6 6 6 6 15 19 10 8 8 8 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 10 9 11 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 6 6 11 7 7 6 6 8 8 8 8 9 11 6 8 6 6 10 7 6 6 6 6 15 9 9 10 15 15 15 10 9 10 10 8 8 8 8 8 10 12 12 12 13 9 9 9 8
8 8 8 10 12 21 13 15 12 12 12 11 11 11 15 8 10 12 12 8 8 9 9 12 21 21 22 13 8 8 8 8 12 8 10 10 13 9 9 10 8 8 9 15 19 15 11 8 8 8
11 11 18 12 8 8 8 8 11 7 7 8 8 8 8 10 15 15 11 11 13 8 8 6 6 10 8 9 8 8 8 8 10 7 9 9 9 11 8 8 8 6 6 8 6 8 9 9 12 11
8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 9 9 10 8 6 6 10 10 13 22 10 9 9 9 9 9 11 12 16 12 8 8 8 6 6 6 8 8 12 19 12 7 6 8 8 11 11 11 9 9
12 11 8 15 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 13 11 10 10 8 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 13 12 13 10 10 11 10
8 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 6 7 8 10 7 9 10 11 7 7 8 6 |