BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-398K08.T7 (MSMg01no398_k08.b1) | MSMg01-398K08.TJ (MSMg01no398_k08.g1) |
ACC | AG498699 | AG498700 |
length | 765 | 756 |
length of high quality (start - end) | 199 (126 - 324) | 246 (75 - 320) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no398_k08.b1 PHD_FILE: MSMg01no398_k08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:11:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no398_k08.g1 PHD_FILE: MSMg01no398_k08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:11:27 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TCCAGGACAGTTCGCAGATACACAGAAAAACCCTGTCTCAAAACAAACAA
ACAAACAAACAAACAAACTAACCACAACAAAAACAAACAAACAAACAAAA
AACAAAAAAAAAACCTTCTGAAAATATTCTTATAAATTAGGAATATGGAA
GCCCTATTAAAATGTGTAAGAAAAGCATAATATATTCAACTATTGGTATT
TCATTTGGCAGCAGCAATTCCATGAAAGATTTCAAGAAAATCGAACAGAC
TAGAAGAGCAATGATAGCATGTTTATTATTAGCATTACATCATCTAACAT
CTATATCATAATCATCAAATTCAGCACAAATAAGGAAAGAAATTAAAAAA
AAAAGTAAGTGCAGTACATCATGAAATCACACATTAGGGTTCAGTGTGTA
AAGTTTCTTGCCACTTAGCTTGACAACTGTGTTCAATACCTGGAACCCAC
GTAATGGATAGATACAAAATTTTATGAGATGTCTTGTCATTTTAACATGC
ATGTCATTGTATGCAAACTCACACATACACACACCCTTGTGTACTTACAC
ACACTCACATAAGAAACATTTACGCTAATCCCACCATGTACTTTAAATAA
CCCTAATTCAACTTCCCTTTAAGACACGTTTTTAACACCTAGGGGAAACA
TTATTGAAGCAAGATAGCTGCGAATTGCTACTGTATTTATAAAATCGTGC
AACAGTTCATTCATA
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXTTCCGAAATTCTCCATCATTCTTTTCCTTATGAATTTGT
TTAACTTCCTTCCCTCATCTTCCTCTTCCTCTTGCCTCTCCCTTCTCTTT
TTCATTATTTCTTTTTTGTTTCTTTCCTTTCTTTTCTTAAAATGTGTTTT
ATATATTTTAGGTGTGTGTGTGTATAAGCACCTTGCATGTCTGGTGCATA
TTTAGATAAGAATAAGGTATCTAATTCCCTGTATTTGGAGTTACAGATGG
TTGTTAGTTACCATGTGATTGTTGTTTAATGAACCCAGGTCCACTATAAG
AGCAGCAAATACTCTTAACCACCAAGGCACCTTTCCAGTCCTGCTTTGCT
TTGTTTTTTGCAGTAAGGGGTTGATAAGTAGCCCAGGCTGGTCTGAAATT
TAATATGTAGCTCAGGCTGGCCTCAAACTTTTGATGATTTCTATAATTCA
TAAAATAACCATCCACCACAACCTAAGGGACTGGTATAACAATCATTTGC
TTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTGCTTCTTGCTGAATTGTGCTGAAG
AATTCCCTTCCTGCCACCCACAGAGACATACCTAAACTTGCTTTTTTCAA
AGTTTATCTTTTTGACTTCATTTGCCCTCCAGTCTCTATGTGCTGAAAAA
TTCATGTCCTTCCTTTATTCCTGACTGCATATATTTTAAAGTTCGTCTAG
CACTAC
|
quality values | Open.Hide.15 19 29 21 32 30 30 32 32 28 24 24 23 25 20 19 30 30 34 36 42 30 28 28 25 23 21 27 9 7 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 17 21 25 11 12
10 22 22 30 30 27 21 15 9 6 6 6 6 6 6 11 10 10 12 12 24 23 37 37 37 37 39 39 47 53 53 53 53 59 59 59 53 53 50 50 50 57 48 48 50 50 50 53 53 50
50 50 50 47 47 39 39 39 47 37 37 33 33 33 33 17 17 9 9 9 12 22 19 15 15 15 19 30 34 43 48 43 43 40 40 39 39 39 42 39 43 43 48 48 57 48 48 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 44 37 37 36 42 48 57 57 54 57 57 47 54 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 54 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 59 59 46 43 43 47 41 34
44 43 43 43 44 42 33 33 33 44 44 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 57 57 57 54 54 54 57 57 42 42 30 30 30 37 42 47 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 30
34 24 30 30 39 39 43 47 43 48 48 48 48 48 40 39 39 22 17 11 13 10 7 6 6 6 6 6 6 8 8 11 24 30 47 41 41 48 48 48 48 59 59 59 48 48 48 57 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 68 43 59 43 41 41 24 22 18 28 30 59 47 43 43 43 43 43 43 43 43 57 47 57 43 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 46 41 43 57 44 48 48
57 57 57 46 43 43 44 46 48 48 54 46 46 43 43 42 42 42 47 43 47 57 57 57 48 47 47 47 47 43 47 43 47 37 34 24 18 18 24 30 39 44 24 18 11 11 12 12 12 24
27 37 43 43 46 46 57 57 48 43 43 43 43 48 42 43 28 28 13 19 25 40 37 48 48 43 43 43 39 37 39 37 32 26 19 17 17 26 26 26 23 14 14 21 28 28 35 30 34 33
36 36 36 43 43 43 43 36 43 36 43 43 37 37 28 28 23 34 30 32 29 30 32 37 37 34 28 20 18 15 19 19 22 25 25 19 19 15 21 16 28 28 28 24 24 39 39 37 37 28
18 18 13 13 14 24 24 28 13 13 13 26 23 19 12 12 12 11 11 11 13 11 11 16 19 19 22 14 14 12 10 10 10 8 8 10 16 15 14 10 10 9 9 9 10 14 14 11 17 11
10 10 10 10 18 10 11 11 13 16 11 11 12 12 16 11 11 13 18 18 12 11 11 19 19 12 13 19 13 16 14 11 11 10 16 10 10 11 12 10 11 11 17 19 11 9 10 9 9 11
7 9 9 10 10 15 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 11 11 15 10 15 8 8 8 8 10 18 22 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 12 12 11 11 11 10 9 9
9 9 8 13 10 8 8 8 9 9 9 9 10 10 12 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 9 9 8 10 11 13 13 13 15 12 10 11 8 8 8 8 8 8 8
6 11 8 8 8 8 8 6 7 8 8 11 12 11 11 | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 15 9 9 9 18 23 31 37 37 31 30 34 28 34 37 41 40 40 41 41 47 27 27 9 9 7 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 13 15 26 33 33 33 33 33
33 50 50 47 47 27 27 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 19 24 28 28 41 41 53 53 53 53 57 59 59 59 57 57 57 57 50 50 50 47 47 47 47 47
47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 42 31 22 22 22 31 36 48 48 37 37 37 44 44 57 57 57 59 59 59 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 59 54 54 54 57 54 54 48 48 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 43 43 47 59 59 57 57 53 50 50 50 57 50 53 50 50 43 43 31 23 23 12 12
10 11 15 10 11 12 22 27 25 37 37 41 43 37 37 36 36 36 39 39 43 59 59 59 59 59 48 48 43 43 43 48 48 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 41 23 23 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 11 22 37 47 50 50 48 48 48 59 59 59 59 59 47 48 48 47 28 34 34 59
57 59 59 59 57 40 43 23 25 19 15 15 12 15 15 27 23 43 43 43 43 43 39 37 35 35 39 39 48 57 57 57 59 57 47 42 42 42 42 59 59 57 57 57 57 57 57 59 54 54
57 57 48 48 48 57 59 57 47 32 32 16 16 16 30 27 41 27 23 18 19 18 20 24 13 13 11 15 12 12 12 12 21 28 18 23 14 15 23 32 32 35 35 39 43 48 48 43 47 43
34 33 33 30 30 30 29 29 17 20 20 32 32 28 30 30 30 28 23 23 20 25 34 30 30 30 37 37 40 59 59 47 39 39 39 42 42 48 43 43 40 39 39 35 35 39 34 34 17 17
17 30 30 57 57 42 42 35 35 35 39 36 30 19 17 17 19 21 19 32 19 19 18 22 12 11 22 15 15 12 18 18 28 28 25 25 32 36 36 32 32 25 36 23 28 28 40 44 43 48
37 42 33 36 36 33 32 32 33 32 32 35 36 40 25 25 25 33 22 28 28 33 33 34 39 37 33 22 25 25 28 28 32 37 37 36 32 26 17 22 12 12 12 10 10 10 10 15 9 9
9 12 13 16 14 17 14 13 11 9 8 8 9 10 11 10 17 24 15 11 11 11 10 10 10 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 13 9 10 18 15 13 10 8 8 8
8 9 9 10 8 8 8 9 9 13 14 18 10 10 11 8 10 12 8 8 8 25 25 11 11 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 19 12 13 13 14 15 10 11 10 10 10 14 12
15 11 11 11 19 14 13 9 8 8 8 9 12 14 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 6 8 8 8 6 6 10 8 8 10 12 10 10 8 8 8 10 9 9 9 12 11 8 8
9 8 8 6 6 6 |