BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-437A09.T7 (MSMg01no437_a09.b1) | MSMg01-437A09.TJ (MSMg01no437_a09.g1) |
ACC | AG527953 | AG527954 |
length | 755 | 753 |
length of high quality (start - end) | 246 (78 - 323) | 492 (76 - 567) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no437_a09.b1 PHD_FILE: MSMg01no437_a09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:02:15 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no437_a09.g1 PHD_FILE: MSMg01no437_a09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:02:15 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GTTCCTCTATAATTTGCGGCGCTAAACGACTCACATTTTCAGAAAAGCGC
GGAANNCTTTTTGGTAGCACCACGAAGCACACTGAAAGAGTTTCCCTGAT
TCTAAATACCATTACATTGTACAATCAAAATTATCCATCACATGTCCAAC
CCTTGTAAACTTAGCTGCTAAAGGCATCACTTAGAAATTGTAACATTCTA
CCCCTTAATCCTAAAGTCTTATTTTTATCTCATATTCCAAAATACTTTTG
TTTAATCCAACTCTAAAAGTCCCCACAGTGTTTAACCGTCCTAGAATTAT
TCAAAAGTCCAAAATCCAAAGTCTTTTCTGAGATTTGAGGCAATCTTTTA
ACTGTGACCACCTTAAAAAAACAAACAAGTTACATGGCTCAAGTATATAA
TGACACAGAATAATATCCCCCAAAAGGATGGGATCAGACCAAAGCAAGCC
CAAAGGCAACAGACAAACAGTAAATAGCAAGTCCTGAAGCTCCTTATCCC
GCATCTGTAGCCTGTGACATAATCTCTTGGGCTCCATTTTCATCTCCAGT
AGCACCCAAGCACATTATAGTTTTTTGCACACACTCCACTCTGCATTTGT
TTTTTCTTAGCCGATATCCTGCGTCCTTTTATACCTCCCATCCCCCCATT
ATCTTCACTTTTAACCTTACTCTTTTATCCTCCCCCGTTTTCTGTCACGG
TGTTCTCTTTTCTGAAAACCCCGGTGATTATACTTTCCTCCCCTCCCCTT
AATGN
| NCACGATGCAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGTCATCTTGGCCACTAGTGTATT
TACCCACTGAACCATTTCACTAGCCTCCTGACTTATTTTTAACTGCAATA
TCCATTTTGGGGTGGGACGGAGAAGGAGTCTCATGTAGCCAGGAATGAGC
CCAAACTCATACTTATGTGATGATGACCTTGAACTTCAGACCCCTGACTC
ACACCCAGTTACCAAGGAGTCTCTCCTAATAGCATTATCACATAGCTGCT
CCTTAGCTCAGTAAGAGACCCATTTTATGTCCATGCATGTATCGTGTGAG
GCCCTGGAAATTCATAGTTTCTTCTTCTAGTAGTGATATCGAATTATGTC
TTTATTAACTGTGTATGCGAGCATTCTGTGTTTCTAAGTGTGGGAACCAA
AGCAAAACATAATAGAAACAGAACTAAATGAAATAGAACATTCTCAAAAA
ATATTCTATTAGAGTTGGTTGGTAGATAGAGGTAGGAAGATCAAGGGTCC
TAGATCTTTCTCTGTGACCTAATGAGTCTGTGGCCAGCCTGGCCTCCTTG
ACATTCGACTCATAACTTAACAAAAATACAGCCTAACATATCCCTATAAA
CAAAAATAACACTCATTTCACACCAACTTGCTGTGCGTGTATTCTGCCAG
TAAATTGACTTGCCTGGCATATAGAATTTAAGCCTTATCACAAAGGCCTT
TAT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 7 13 9 8 8 10 10 10 11 28 28 22 14 14 14 24 19 28 16 14 10 22 22 41 30 19 19 8 8 8 12 8 10 10 6 6 6 9 12 12 9 9 12 11 23
21 21 21 3 0 0 3 29 29 29 29 9 9 9 7 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 11 12 18 28 34 37 37 50 41 27 22 9 9 9 22 23 53 59 59 57 53 53 50 50
50 57 57 57 57 57 57 54 54 53 53 68 68 68 68 32 32 24 14 12 15 15 10 10 15 12 28 25 57 57 57 47 47 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
57 57 57 44 48 37 42 35 42 42 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 54 57 54 57 54 54 68 68 50 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 59 59 59 37 23 10 8 6 6 8 17 12 10 10 10 17 11 19 25 34 40 41 48 48 48 48 48 59 59 59 43 48 48 44 44 48
57 48 48 48 50 50 44 44 48 48 48 57 59 47 43 43 43 47 47 48 48 48 43 43 46 43 43 43 43 43 43 57 57 57 47 44 42 42 35 42 37 43 43 48 57 57 46 43 43 32
32 30 37 30 24 24 24 24 29 32 30 37 37 43 47 48 48 54 42 34 24 20 20 23 20 20 23 28 25 21 11 10 10 10 13 19 16 23 32 28 23 19 25 12 12 12 22 22 30 28
30 18 18 11 9 9 13 13 15 16 15 15 14 15 15 23 24 12 11 11 10 10 8 10 10 8 14 12 12 12 13 15 18 18 19 18 15 11 11 11 11 21 10 12 12 13 12 25 13 11
13 15 21 18 19 15 11 11 13 17 13 13 13 15 10 13 10 8 8 8 8 8 13 10 12 12 12 12 11 12 10 10 15 20 15 30 17 19 22 28 22 24 12 12 12 23 15 15 15 11
10 10 10 15 13 11 11 11 11 11 11 12 10 10 13 13 10 8 8 8 8 19 12 14 10 10 10 9 9 9 11 11 15 12 19 22 29 23 25 18 15 12 19 15 14 10 12 10 9 8
9 11 13 10 10 11 11 11 9 7 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 9 10 15 19 17 19 16 15 11 11 11 15 19 22 26 21 18 10 15 15 12
9 9 9 8 8 10 11 9 9 8 8 7 7 10 6 8 8 8 10 8 8 9 9 11 14 14 18 15 8 6 7 6 8 8 11 12 11 15 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 16 12 11 11 10 8 8 8 6 7 6 6 8 13 12 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 11 11 11 12 19 19 10 6 6 8 10 19 20 14 11 8 12 10 8 8
6 6 6 3 0 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 11 10 11 11 10 10 13 11 9 9 9 19 30 37 32 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 35 25 18 9 9 7 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 25 21 11
11 10 26 26 50 50 42 30 27 18 8 6 6 6 8 8 6 6 6 7 9 9 9 10 13 18 21 28 37 41 50 50 53 53 59 59 53 53 53 53 53 53 53 50 50 50 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 43 51 57 57 41 50 50 50 42 42 46 37 37 37 42 39 43 57 44 47 48 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 57 59 44 43 37 37 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 54 50 50 50 50 57 57 59 57
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 50 50 50 50 51 57
68 57 57 41 41 28 28 28 32 44 44 57 57 48 48 48 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 44 43 43 43 43 59 59 57 59
59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 44 44 37 37 41 39 34 28 19 10 8 8 8 9 10 10 11 12 12 23 22 39 37 39 43 46 46 48 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43
43 43 44 48 48 43 43 48 48 32 40 31 26 26 31 36 39 43 43 43 43 47 47 43 43 43 59 44 54 43 40 32 30 30 30 40 43 59 59 43 43 43 59 59 57 48 48 48 48 57
59 59 59 59 59 59 48 48 48 47 46 41 39 39 15 15 8 8 8 11 19 28 37 37 40 43 43 43 59 43 43 43 39 39 36 36 32 43 33 35 35 39 42 43 43 43 42 43 35 35
35 37 32 30 28 28 24 24 14 14 14 26 26 29 29 25 28 30 37 42 42 47 43 43 36 36 24 24 17 32 24 42 42 42 35 35 35 39 44 44 48 57 57 57 48 48 43 43 43 43
43 46 57 57 57 57 57 54 32 32 17 14 14 24 26 28 30 32 36 32 26 25 25 28 28 30 30 30 39 32 36 22 22 22 31 33 43 46 46 40 40 28 28 25 33 31 32 32 36 42
47 41 33 30 32 32 43 43 57 48 43 39 33 33 19 19 10 10 11 21 18 23 23 20 16 12 10 16 9 10 8 11 7 7 12 12 12 20 28 20 18 12 16 16 31 30 33 33 22 16
8 8 8 8 6 6 8 8 15 15 15 15 14 12 12 10 12 14 10 10 10 10 10 10 9 13 13 11 11 11 19 18 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 11 13 10 10
10 10 10 10 11 11 13 8 8 8 9 8 8 8 8 7 7 10 11 11 11 10 10 14 8 8 8 8 10 8 9 9 8 10 9 9 9 9 9 10 9 9 10 10 11 11 12 10 8 7
7 6 7 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 11 14 14 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 15 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 12 14 19
10 10 9 |