BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-438K22.T7 (MSMg01no438_k22.b1) | MSMg01-438K22.TJ (MSMg01no438_k22.g1) |
ACC | AG529219 | AG529220 |
length | 1,511 | 781 |
length of high quality (start - end) | --- | 493 (74 - 566) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no438_k22.b1 PHD_FILE: MSMg01no438_k22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:04:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no438_k22.g1 PHD_FILE: MSMg01no438_k22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:04:33 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTGTGTGGGGGTGGTNTTTGTGTGTGCTCGGTTGGGAGCCTCCCCCCACA
CCCGCCTCTCCCTAGGTCACCCCTCGCGACCNTACACCCGCGCGACGAGG
CGTNACTCCTCCACTCGACTAAGTGCCGCTGTACACCAGACTATCATCTA
CTTGTCTACTTTACTCATATCTAACTCAGAGTCATTGAGATGGTGTGTCT
CATGGCGTAGCCGCAGCGGCCACACGCTGGCGTGTAGTTATATAGTCTAG
ATAGCATACTTACTCTCGACTGTAAGAGCGCGCCGCGCGGTCTCGTAACT
AGGTGGCATTCTCCTGTACCATTCGTACTATTTCGCTAAATCTATTCGGT
TCCTCCTCTTGTCAGTGCTATCCGTCCACGCTACCGGACCGATTCGGTGT
GTGGGCTAGCAAGGCGTGTGAAACGCTAGATCACGCTCTGAGCGCGACAT
AAGGTATATCTGCTGTGACGAGGTCTTGCGGTGGGTAGAACATCTCGATG
GTGTATATGTGCTGACATAGCCGCCGATGCTGTTACACTGCACAGCAGAC
GGTTTGACTACTGATTTATCAACCGNAACACCAAGCGAGAGCATGGCGCA
GCCGAGCGACGCGCAAAGGGCGAACGGCCGCTCTACTCTATGGGCGCCTC
TCTGCTCACATATCTGCGCGTAGATGGCTGCTGTACTGATCTAGTGAATG
ATACCACTCTATCTCATCCTCTTTACCGCACGCCCTACTTCGCCTCACTA
CTGCTATTGACGACTTGCTCCTCATCCTCGCGCTCCTGCCGCGTCGCTCG
TTCGTCATGTCTACCTATGGCGTCGCGTTAGGGAGCAACCGCACGGAGAC
TCGCAGTGTCTGTGAGCGTCTGTGACGTGGCGATGTGTCGGTGCGATGCG
CGCCTGCCGGCCGGTCGCGTCGTGGCGCGCGTGGTCATCGGTGGCTTCGC
TGCACGCCGCTGACTCACACCGCTAACTGCCGCACTGCTGGCACTTAAGG
TTGATCCGTCCGTCCGAGTCTCGTGACGCTCATTATCCTATATACACCTC
CGCGTCGTCACTGGCCNCTCGCGACTGCAACGTCCGCATCTCGCGCAGCA
GTACCNGATACGTGCTACGCTCGCGTCTGCGTCCCTCTAGATAGGCGTTG
CTATGCGTGTCTAGCGCTTGTCACGTATATGCTCGGCGTCTAGGTCTGTG
CAGACCCTGAGATCCACGTCTCACTACCGACATAGGCGACGTACCTGGGG
CGGCGAGTGCCCNGGGTCCACCGCAGACGCGCGGGCGTCGTGCGGGGCGC
GCTAGTGAGTCGAGAGTCTCGCTGCGCCCGTTGCTGCTGCGTCTGAGCAC
ATCGGAGCTCTACGCTACGATTCGCGCTTACACAATGCGTCTTCTGTCTC
AGGCTCGCGTCGCGTGATCGCAGTCTGTACAACTAGTGTATCGACGTATG
TCACGGATGTGTGTGATGTTCGAATGCTGAAACGTGGTGTCAATAGTGCT
GAATGGTAGAG
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTATTTAAGGCTGTATTTTTCTGTTG
TTTACTTGATGCAAGGACATCTGTGGATCCTGGGAGATTCTCCTTTCTAG
TAAAGAACAGATAATTTTGTGATTCACAGTAAACTGAAGCAAATTTCATT
TTTCTTTTCTTTTTCTCGTGAAAGAAAGAAAAGCCCCCCCCATGATATTG
ATTGGATTACTTAAAGTGCCTAACTCACCTTAGAAATCACTAAATTCATC
ATGTAGAATGGTCACAGCAGAATGAGTTATAACCAGAGTAAATAATAGGA
AGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAAAGCCAAGCAGAGATAACCCATAAG
AAATGTCAAGTCATTATAGTGCTTATGGAACACTCCACAGCACCCTCACA
CTCATGTGTATTATTAAGCAAAAAAGTGAATGGTCCGGAGAACAACAGGA
AGCAGGAAGCTCATTGGTTCTCTAAGTGTGGTCTGGGTAGCCTCAGCATC
ATCTTGCCTGGGAAGCTGTAGAAATGCAGGCTCATATGCTCCACCTCAAA
CATTCCCCACTAGGAGGGAGAGCCAGTAAACCACTTGAAGCTCACAGGTT
GAACTAGGAACTTGAAATGTCCCACTGCCCTGGTATGGCCCGGGTTGACC
CCCTCTCTAATTGTGTGTTTTCTTCCGGCCGTACCTCTTCTTGTATTGTC
CTATTTCTGCTCTGTCTTTTCAGTACCCCTG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 8 10 10 10 10 10 10 10 10 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 7 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 6 6 6 8 9 15 15 15 13 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 19 18 3 0 3 14 8 6 6 10 19 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 3 0 3 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 11 11 11 11 11 8 6 6 6 8 8 9 10 9 10 12 11 11 11 16 16 11 11 11 9 9 8 6 6 6 8 10 10 8 8
7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 11 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6
8 8 8 6 10 7 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 15 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 7 10 7 7 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 9 11 11 12 13 10 9 9 9 8 8 8 8 8
8 10 10 12 7 7 7 8 9 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 13 13 8 10 8 8 8 8 8
8 7 10 7 7 7 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 7 6 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8
6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6
6 6 6 6 6 10 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 11 7 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 10 11 11
8 10 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 11 9 7 9 9 7 8 7 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6
6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 13 9 9 9 9 9 7 10 8 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 11 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 6 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8
8 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 13 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 7 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 6 8 8 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 13 6 6 6 6 10 10 9 6 8 8 8 10 10 12 21 12
10 10 10 10 9 13 13 10 9 9 8 8 6 6 8 6 9 9 10 10 10 9 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 15 10 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 10 8 10
11 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 8 8 8 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 7 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 8
8 10 12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 10 12 11 10 8 8 8 8 11 6
6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6
6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 9 11 11 10 8 8 8
10 9 8 10 8 10 8 10 8 7 7 7 7 8 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 6 6 6 6 8 8 6 6 10 8 8 6 8 6 6 6 8 12 10 10 10 11 11 11 10 10
10 8 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 3 0 3 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10
9 7 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 10 11 12 12 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 8 8 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 8 8 10 15 15 10 10 8 8 8 10 19 18 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 6 8 7 7 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 9 9 10 10 7 8 8 8 8 8 7 7 6 6 7 7 7 6 6 6 8 11 8 8 10
10 12 13 15 10 9 9 8 8 8 8 6 6 8 6 6 7 6 8 8 11 9 8 8 6 6 6 8 6 8 8 10 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
7 7 7 6 8 6 6 8 8 13 10 8 8 10 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 7 7 7 7 6 8 7 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8
8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 12 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 8 15 15 13 10 10 9 8 8 8 8 6 6 10
15 9 9 9 9 10 10 12 10 13 10 9 9 9 7 7 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 10 6 6 6 8 6 6 12 11 9 9 9 9 9 9 10 10 11 8 8 8 6 6 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 13 10 8 8 8 15 7 7 7 13 15 29 29 37 37 43 44 44 39 39 39 39 39 44 44 39 41 25 23 9 9 6 7 6 6 6 6 13 14 18 23 21 21 13 12 12 25 25 37
37 37 50 50 50 50 47 37 28 16 15 8 8 8 9 9 9 9 10 17 20 30 25 29 28 30 36 43 44 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 48 48 41 41 41 47 48 57 57 57 46 50 50 50 50 50 68 68 68 68 50 50 46 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 51 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 43 34 29 26 18 18 18 34 34 35 43 43 47 59 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 52 57 57 59 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59
57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 52 54 54 59 59 68 59 59 59 32 32 17 17 32 32 50 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 68 57 50 48 57 57 57 57 57 59 54 54 54 54 54 54 59 59 59 57 57 43 43 39 39 35 39 42 42 39 43 43 43 43 48 43 43
43 43 43 48 48 48 59 48 59 59 59 39 37 37 34 32 37 35 37 37 37 46 43 34 37 33 35 32 25 25 30 37 33 39 31 37 31 37 37 27 20 20 19 17 12 22 23 28 34 39
37 41 30 22 24 19 19 19 30 29 25 22 24 19 17 16 23 17 16 11 11 11 19 12 15 8 8 8 8 10 17 12 11 10 13 9 8 8 10 10 10 9 11 11 12 10 10 11 16 19
18 15 15 15 10 10 12 11 16 13 18 11 11 16 19 16 19 32 37 30 24 22 16 10 9 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 10 8 8 6 7 8 8 9 10 11
8 8 8 8 8 10 10 10 14 14 8 8 9 13 9 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 15 21 9 10 8 8 8 10 10 10 11 10 9 9 8 8 6 6 6 6 6
7 12 9 9 8 8 10 12 14 12 8 6 6 6 6 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 12
8 8 6 7 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 9 9 6 8 6 6 8 8 8 8 6 |