| Query= MSMg01no449_c16.g1 MSMg01no449_c16.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no449_c16.g1 PHD_FILE: MSMg01no449_c16.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 19:18:42 2005
(242 letters)
>mm_chr6_143365392_143366033
Length = 642
Score = 381 bits (197), Expect = e-110
Identities = 223/241 (92%), Gaps = 16/241 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 cccagctaaacaatcacagaagaaactcggaaaatataaacttctacctagatgcatgga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 306 cccagctaaacaatcacagaagaaactcggaaaatataaacatctacatagatgcatgga 247
Query: 61 ctctgaaaatagaagcttcatcattttcagtatttgctaaagagattagatagatagata 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 246 ctctgaaaatagaagcttcatcattttcagtatttgctaaagagattagatagatagata 187
Query: 121 gatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatacatatttt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct: 186 gatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag----------ac------t 143
Query: 181 gaaagatgatagatagatgatagatgataaatggacagatagatgatagatcagatagat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 gaaagatgatagatagatgatagatgataaatggacagatagatgatagatcagatagat 83
Query: 241 g 241
|
Sbjct: 82 g 82
Score = 126 bits (65), Expect = 1e-33
Identities = 83/91 (91%), Gaps = 6/91 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 107 tagat-agatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag 165
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 tagatcagatagat-gatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag 38
Query: 166 atagatacatattttgaaagatgatagatag 196
||||||| ||| || |||||||||||||
Sbjct: 37 atagatagata----gatagatgatagatag 11
Score = 101 bits (52), Expect = 5e-26
Identities = 58/60 (96%), Gaps = 1/60 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 107 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataga 166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct: 64 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat-gatagataggtaga 6
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 119
Number of extensions: 37
Number of successful extensions: 37
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 24
Number of HSP's successfully gapped: 9
Length of query: 242
Length of database: 642
Length adjustment: 9
Effective length of query: 233
Effective length of database: 633
Effective search space: 147489
Effective search space used: 147489
X1: 7 (13.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 7 (14.4 bits)
S2: 7 (14.3 bits)
|
