BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-454E01.T7 (MSMg01no454_e01.b1) | MSMg01-454E01.TJ (MSMg01no454_e01.g1) |
ACC | AG541073 | AG541074 |
length | 734 | 772 |
length of high quality (start - end) | 558 (76 - 633) | 241 (78 - 318) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_e01.b1 PHD_FILE: MSMg01no454_e01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_e01.g1 PHD_FILE: MSMg01no454_e01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:23 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (134,083,306 - 134,083,861) | (134,268,601 - 134,268,841) |
---|
sequence | ACCATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCTCATTCCACGAATAAAACTTATTTGAAATTACCCTCTAAC
CATCTTTCCATGAGAACACCAGCGTTATTTCTTCCTCCCTTGATTCACAA
CACGTGTCGCCTGTATTTCCAGAAGGTATTTGATTAACAGTAGGCTCCAA
CCCAACCTCTCATCCTTTTTTAGGTCCTAGTGTAAGAATAAGTATGTGAA
TGGACCAGAGTGGTCCCCATAATTTACAGAAGCCCCCTGTTGAATAATTC
AGAAGAGGGAGATGCTCGTGGTATTAATAGTTCTGAGCTTTTGACCTTTC
TAGAATGGGCCTGGAAAGGAGCGGAGGGAAAGACGTTGTTTTCCTATACA
GCATGAATGAGTGAGGTGCTTTTACATGGAAGTTTCAAGTTCACAGGTTA
AAAATAAGCCCAATCAAATTGGTACCCTTCATTAGCCCTTCATGCTGTAG
GCAGCATTGGACGGGGGAGATGTAAATAATTTCAAATTCAGTAAGTTGTT
CTTATGGGAACATACATTTTAAGAGGTTTATATAATGGTTAGGGAAATGT
GCCTTTCATCCCTTGCCCTCAGCCGTTTCCAACTTTCCTCTCCCTTTCTG
AAGCTTATCGTTCCTTCTTCCCTCCTTGGGGATATTACAGTTGACCTCAG
AAATTATTATACTTCCCCCTTTGTCCAGCAGTTN
| TAGCCAATGATATGGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCTGTGCTTGCTTCCCAGGGTG
GAGAGTGTAGGTGGGTGCTATCACATGGGTTGTGAGGTACTTGGTTTGCT
ACATGGGTATGAAGAGCACTTTAATGATTGAGACGTCTCCCCAACCCCAA
GCCCAGTTCCCCTGAATGTGAGTTCCTCAACTCTTGTCCTCTAATTACAA
AATTATATATATTTAAAGTCAGTATCCATACTGGAGATGGAAAAACCTGA
AAAATGCTACTCTGCTGATTATTTCTACAGAGAACACCTCTAATTCCTTC
TCACAAGACTACTTTTGAGTTCTCAACTAATGGGTTTCATTATGGCATTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACACACATTCCA
TCTATAGTTTTTTTTCTTTTCATCCCCCTCGATTCCTGTGTTTCACTTTG
TTCCCCTACCCCCCTTTTTCCTCCCCCACTATCTTCCCACCTTGACTACA
CCACTCCCTTTTTCACATAACCTTCTATCTTCCACACACCTCCCCAGATT
CACCCCTTCTTCCCTCCATCTACTTCTCCTGTTTTCACTTACGCGACATA
CAGTTTTGACCCCACCCTATACGCCATTTATGCATCTAGCAACTCCTTTT
TGTTCTTGGCGTCTCCTACACTTACCTTGTTCTTAACTCATCCCGTCCAC
TTTATTTCGCTCTTTTTACTTG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 8 8 11 19 19 37 39 39 30 30 28 24 24 28 37 28 26 24 32 25 30 41 39 27 19 20 17 15 7 10 10 10 9 9 9 9 10 11 17 17 22 17 16 22
28 41 59 33 28 33 33 33 30 23 22 9 8 8 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 15 21 43 59 59 50 50 48 53 36 38 53 53 47 47 48 47 57 57 57 57 57 48 43
36 40 42 47 68 57 50 50 48 42 42 42 57 34 23 18 12 12 12 12 11 20 26 42 47 57 57 57 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 57 57 54 50 50 48 48 57 50 50 57 57 57 57 57 54 54 52 52 52 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 54 54 57
52 52 57 52 57 54 54 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 57 68 68 68 57 59 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
46 40 40 40 37 37 35 44 44 57 59 59 59 48 47 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 54 54 54 48 48 43 43 37 42 42 48 47 48 47 59 57 57 59 59 57 53 48 48 40 40
35 39 39 43 59 59 59 59 48 48 48 48 42 39 37 32 24 22 12 11 11 11 20 18 30 30 47 46 46 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 53 50 50 50 48 59 57 57
57 57 57 68 68 57 47 34 41 20 28 41 37 37 39 37 36 41 41 28 23 28 32 36 47 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 57 57 57 57 59 57 48 47 47
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 54 54 59 59 59 59 57 57 54 52 57 57 59 68 68 68 57 57 52 52 52 52 57 57 52 52 52 57 50 57 57 59 59 59
59 68 68 59 59 59 47 35 35 43 43 57 59 43 43 39 59 59 59 59 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 50 50 43 44 57 50 43 43 57 57 59 59 59 59 59 59
57 59 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 47 43 35 35 37 42 37 44 39 35 35 41 59 59 68 68 59 44 39 32 32 37 42 44 42 33 32 30 40 42 57 59 59 43 34 34 25
33 33 47 43 59 48 48 57 37 43 34 43 39 39 39 39 39 37 48 41 40 39 39 36 37 35 35 35 39 39 37 33 33 33 30 27 26 27 35 39 47 43 41 46 46 59 37 37 28 28
20 20 20 32 41 35 35 35 33 28 28 28 25 31 22 25 25 37 24 17 10 11 11 12 24 28 30 24 20 19 19 19 22 21 25 19 25 25 16 13 12 16 16 19 28 28 18 18 14 15
17 19 21 24 21 25 10 10 10 8 8 8 8 11 14 29 22 14 14 9 9 10 8 10 10 12 11 24 19 10 10 9 9 9 13 8 12 10 10 6 6 8 13 11 9 9 12 8 8 8
8 9 13 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 11 21 16 22 27 15 15 8 8 8 10 16 12 12 11 11 11 3 0 | Open.Hide. 8 10 6 6 8 8 8 17 9 8 8 8 13 13 8 8 8 8 8 8 12 17 18 19 15 14 12 12 18 20 19 21 16 12 9 9 7 6 6 6 10 8 8 8 25 21 29 23 24 37
37 33 36 33 33 33 33 41 34 25 18 10 8 8 8 8 8 8 12 21 15 12 16 22 28 31 31 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 48 47 47 68 68 68
68 68 54 54 57 57 54 57 57 57 54 57 48 34 34 13 21 21 37 38 38 25 25 25 32 27 57 59 59 68 57 57 68 68 68 57 57 43 43 57 59 59 59 59 59 59 68 59 57 47
57 43 43 32 32 15 14 14 36 38 57 57 48 48 52 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 52 52 50 50 50 57 54 57 57 57 59 59 59 52 52 43 59 52 43 43 52 52 52 52
52 52 52 57 52 52 50 43 50 50 52 57 52 37 37 36 36 57 57 57 57 57 57 47 50 57 50 44 43 57 57 57 57 57 57 43 42 35 44 42 42 42 42 42 48 43 38 24 16 16
24 24 35 44 48 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 54 54 46 48 43 43 47 43 43 43 46 43 39 37 31 31 30 30 25 40 25 28 30 40 40 48 48 43 43 40 39 35
39 39 57 57 57 57 48 48 48 48 47 59 59 28 25 12 12 10 10 9 9 9 10 9 12 12 23 25 34 37 37 37 37 47 37 48 48 43 43 46 46 59 59 59 43 43 43 48 48 43
43 43 43 37 36 39 39 43 34 34 35 35 37 59 59 59 59 57 48 50 48 32 32 36 30 30 40 44 40 32 28 24 20 20 27 27 32 32 39 39 44 36 32 20 20 28 28 42 41 57
43 43 43 46 57 57 57 57 44 44 43 39 39 44 44 57 57 57 54 54 54 54 46 37 34 23 23 28 28 30 30 13 13 12 12 12 14 12 12 11 11 12 11 11 12 15 20 12 12 11
12 11 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 20 21 19 19 19 12 12 12 12 12 12 10 8 8 8 8 8 11 10 10 11 11 16 16 14 15 13 9 8 8 8 8 8 10 6
6 8 8 9 9 11 10 11 12 11 12 10 17 13 10 10 10 10 10 9 9 9 12 11 9 10 6 6 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12
11 8 8 8 15 10 10 14 12 12 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 10 9 10 10 10 23 12 11 11 11 11 18 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 11 8 11 8 9 10 9
9 10 12 13 11 14 14 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 11 13 10 10 10 11 11 11 13 13 13 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 12
12 8 8 8 21 19 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 12 8 13 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10
10 10 10 11 11 11 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 10 11 8 8 8 10 15 15 10
14 13 10 11 11 11 10 8 8 11 12 12 15 16 16 22 10 10 7 9 9 9 |