| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-454H12.T7 (MSMg01no454_h12.b1) | MSMg01-454H12.TJ (MSMg01no454_h12.g1) |
|---|
| ACC | AG541238 | AG541239 |
|---|
| length | 1,328 | 739 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 491 (78 - 568) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_h12.b1 PHD_FILE: MSMg01no454_h12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_h12.g1 PHD_FILE: MSMg01no454_h12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:40 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | GGTCGAGAGTGGCGAGGGAGCTAGCGTATCGGAGAGAGGGGGTGTCAGTT
TATACTAGATGGCACGAGAGCGGAGAAGAGTGTCGGTGGTGATGTTCTCA
CTTCATACTATATGCATAACACATACTCACCACGCGCGGATACAAACGAA
GTATCAGTCAGCATGAAGATGTAGACGGTAGTGCATAGGTGATATATACG
TATTGAGATGGATGTCTACTACGTGATATACATCTACCGCGTACCTCACA
GACCCATCGACACGCATAATCGCCTGTATGAGCAAGTCAGGAATGACGCC
CACGAATATACANAATTATATATGTACCGTCGCGCTAATTAATACAGNTC
GGATCAGCACAGCGTGCTACTCTTCCGCTATTATCAAATCTATTATCGTG
CGTCCGCGCGGTAGCCGTGTGGGACTATACTCTACGCGACATACAGCATT
AGACCGCATTATGTTAGCGTCTCGATGATTCGACGCGCTCGCCTCATCTA
GCGCGCCCGGCAGCACACGACATGTAACGCTAACAGGTACGGCACGACTC
ACGCTTAGCCAACCCATGATCACACACATATATTATATGATAGTATTCAT
CTATTTGTCTACTCAGACCGACGGAGGAGATCGCAGGCTCGCGCTCGCTG
GCGCACGCGCGTCGTAAACGACGCGAGATACGAAGCGTGTCACCGGCGCG
GCCACGAGATATATATGTGGCCACCCTCGGCACTCACATCTGGCGTTGTC
GTAACGCCTCATTCATATATCGTCGCGCATGCGCCGCCCCTCTGGTTCGT
TGCGCTCGTCACGAACTATTCACACAATATGTGGCGGACGATTTCGCCTG
ATACGACCTGTTGTGTGATGCTGTTATACGGGTGTGTGTTAGTCGCAGAT
CGGTTTTGCGTGCTAGCGGCGCGTGTCGACCATCAAAGTCGCGAGACTAT
AGGATCGCCAGGCGACGGGGTATACGCGCGCGTGTTATGTATATCTTGAG
TGAGTGGTATCGAAAGAGGAGGTGGCAATGACAAGAACTGCGGCGTGGTG
CGGTATACGCATGGTATACACTATCACGCACANATCTCACTTGACATCGC
GTCGACGTATACTATAGGTAGACGGTGTGATTCGGCGCGCATTAGTATGG
AGCGTGGTGGTTTTGTCGAGGTGAGGATCACGACGCCGATCCCTAATCTC
TATCGTGCGGCGCTTACCTGCTGTCGGTGCTGTTTCGAGCACGCGCACGT
CACGACGCTCGACGTCAGTCACACGAGCATAGATTGTCGTAGTGAGACAC
GTTTTTACACCACTATCATATTTCGGGG
| NCCTCAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTTTGGTTACTGACTAAAGATC
TCTAATGTCAAAAATCAGTGGCAGGAGCCACTGTTTATACTACCAGCCTT
GGAAAAAGGAGAAACAATACTGTGTCAGGCTGAGAATGGCATTGATTACA
TTGATTTCATACATACAGTGACACAGTATCTCACTTACATAGGTCTCCTT
CCTCACTGAGACCATGAGGAATACTAGAAAGTTGTTTTGTATGATGAATG
TAAAATACTTACAGTCNTTAATATTCTACATATGATTTGACAATAGACAT
ACACTCTTTGAAGCCTGCTAGACTACCTGGTGTTATAAGAATTTATTACT
TATTACTTAGAGAAGAAAAAGTATACAAATATATACATACACACATATAT
GCATTTATATATGACATTCATGCATATATTCATTCATATAGCATTGTTAT
GCTTTTTATATACATACATATGGTTGTATGTAAGAGAGAAAGGAGAGAGA
AAGAGAGAGAGAGACTTANCTNAAGAAATTACTTTTTAAATCTATATTTT
ATTTTGAGATCAAAAACTCCCTAGGAACTCCCTGAACAGTTCCTTTTTTA
TTGGGATATCAAACCCTTCCTCCTCCCTTTCCCATCTACTGGTAACACAT
TTTGTGAATCAACAGGCCTTGGACCACCGCGTGGGATTN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 12 10 7 7 6 7 6 6 6 6 6 6 7 8 7 7 7 6 6 6 9 8 8 6 6 6 6 11 8 8 7 7 7 6 6 8 8 8 8
7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 7 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 6 8 8 6 6 6 6 9 6 6 6
6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 13 13 10 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 6 6
6 6 8 8 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 8 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 10 9 11 10 10 10 13 13 11 11 11 11 8 8 8 10 10 10 9 10 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
8 8 8 6 6 6 6 6 7 6 7 8 8 9 10 9 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 9 13 10 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 7 7 8 6 9 9 9 9
9 10 9 6 6 6 7 8 6 10 13 3 0 3 10 8 9 9 9 10 8 7 6 6 6 8 8 11 9 10 10 11 11 11 9 6 6 6 6 8 6 8 10 10 9 9 3 0 3 9
10 10 10 10 11 11 10 6 8 6 6 10 10 14 7 6 6 6 8 8 13 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 8 7 8 8 8 7 6 6 6 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 6 9 6 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 9 10 8 10 6 6 6 6 10 8 8
8 9 10 8 10 6 6 8 8 13 10 11 11 9 9 9 7 10 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 10 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 6 8 6 6
8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 12 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 6 8 8 9 9 10 10 11 11 10 8 8 8 6
6 6 6 8 8 8 6 7 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 9
8 6 6 6 8 8 11 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8
8 10 10 8 8 8 12 8 8 9 13 10 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 11 8 8 7 7 7 10 9 10 10 10 11 11 11 9 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 7 7 8 8 9 9 11 9 9 9 9 7 7 8 10 10 10 14 10 9 10 9 8 8 8 9 8 8 9 9 9 9 11 11 11 9
10 8 8 8 11 15 15 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 12 9 12 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8
11 10 10 9 9 9 9 10 10 11 10 8 8 8 10 10 9 9 11 10 10 7 6 6 8 12 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 12 11 11 8
8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 13 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 17 8 9 9 7 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 10 9 8
8 8 11 10 10 11 8 8 6 6 7 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 8 10 10 11 12 10 9 8 8 8 8 9
9 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 13 10 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 13 13 13 12 9 9 9 10 8 8
10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 13 10 8 8 8 8 8 12 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 16 15 13 10 6 6 6 6 6 6 8 6 11 10
10 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8
8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 12 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 10 8 8 8 7 7 7 9 10 10
13 15 12 10 7 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 7 6 8 6 9 10 8 8 6 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 3 12 12 14 10 10 9 9 15 12 15 8 8 8 9 26 30 39 39 39 39 39 37 31 31 37 18 17 9 8 7 8 6 6 6 6 6 6 13 17 16 24 12 19 26 32
33 33 33 33 33 37 41 27 22 9 9 9 9 9 9 9 9 9 16 16 11 10 10 19 21 31 31 36 36 36 57 57 57 53 53 50 57 53 53 57 53 53 53 57 57 50 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 39 39 32 31 23 21 11 11 11 21 27 48 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 51 51 51 51 51 68 68 68
68 50 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 41 34 30 30 42 42 43
43 42 44 44 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 54 54 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 53 53 50 50 50 50 59 34 27 16 8 8 7 3 0 3 6 6 6 6 17 15 30 30 47 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 59 59 46 40 36 28 28 32 37 42 43 44 44 35 39 42 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 39 59 59 59 59 68 68 68 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 43 43 43 59 47 54 57 59 59 68 57 57 48 48 43 46 43 43 43 59 59 54 54 54 54 48 48 43 43 43 40 40
48 48 48 59 57 57 57 46 46 43 34 34 25 25 25 34 28 30 30 37 25 21 15 15 15 23 30 37 59 47 46 46 59 59 59 59 44 39 36 32 38 31 32 35 37 37 37 37 37 32
29 25 37 37 37 39 37 37 41 41 41 41 23 19 10 10 9 3 0 3 3 0 3 21 15 21 22 16 21 10 10 11 16 16 31 37 30 17 11 9 9 9 9 9 18 18 15 16 15 11
15 10 11 12 14 20 15 15 12 15 15 14 17 10 8 8 8 8 8 9 13 12 9 9 9 10 10 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 12 12 9 12 12 11 12
12 11 14 9 8 8 8 8 8 10 9 11 11 11 11 17 17 11 8 8 8 8 8 8 10 10 12 15 11 9 8 8 8 8 9 9 8 8 8 10 8 7 9 9 10 10 10 10 10 17
13 10 10 10 10 8 8 6 8 7 6 8 6 11 11 11 13 13 19 9 9 9 10 9 9 10 8 8 6 6 8 6 6 7 6 10 9 3 0 |
|---|
