BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-479G01.T7 (MSMg01no479_g01.b1) | MSMg01-479G01.TJ (MSMg01no479_g01.g1) |
ACC | AG560273 | AG560274 |
length | 738 | 746 |
length of high quality (start - end) | 662 (77 - 738) | 642 (79 - 720) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no479_g01.b1 PHD_FILE: MSMg01no479_g01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:59:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no479_g01.g1 PHD_FILE: MSMg01no479_g01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:59:21 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNGGCTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCATCAGTTTACAAAAATCTGTACAGTTTTTATACTGAAGCTA
ATATTGAGCTGTACTTATATTTCACATCCTTAGCAAAATAATTGCCTGAG
CACATATACTCCACACTTTAGGACAGCCATTTATTCTTCATCCTCATCTT
CCCCCTCTTCATCTTCCCCCTCTTCATCTTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCC
TCTTCATCTTCCTCCTCTTCATCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTC
ATCTTCTGGTTCCTTCTTCTTCTTTGAGCCTGTTGGCCTATCAGAACCCT
TCTTTCCTGCTTCACTTTTGCCCTTGGCACGGAATGCAGCAATATCCTTT
TCATACTTCTCCTTTGGTTTAGCTGCTTTCTGCTCATATGGTTGTTTATC
TTTGGCAGATTGTTCAGACCACATCTCACCCAGTTTCTTCGAAGTATCTC
CAATAGACAAGCCAGGGTGATCAATTTTAATCTCTGGGCGATTTTCAGAG
CAAAACAGGGAGAAGGCAGACGGTGGTCTCTTCGGAGCATTTGGATCTTT
TTTCTTTCCTTTCTTATCACCTTTGGAAGGAACATAGTTCTTCATCTCCC
TGTCATAACGTGCTTTGTCGCTCTTGGCCAAATCTTCAAACTTCGACTTT
TCCTTTGCAGACATAGTGTTCCATCTCTCGGATCACTT
| NTTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGCTGACCTCGAACTCACAGA
GATCTATCTGTCTCTGCCTCCTGAACACTAAGATTAAAGGCATGTGCCAC
CATGTCTAATAGAGATAAAAGTTTCTTAAAATAAAATGGTGGAGGCTGGA
GAGGTGGCAGAGCAGTTAAAGGCACTCACTGTTCTTCCAGTAGAGCTAAG
TTTGGATCCCAGAACCCACACTAGATGGTTCTTAGCCACCTGTAACTCCA
GCTTCTTTAAACAGAGCACTCTAGATGTATAGGCAGGCAGTTCTCTGTGA
GTTTGAGGACAACCTGTTCCATGTTGTGAGGTCTAGGACAGGGTTACATA
GAATAATAAATGAGAGCATCATATGCCCTGAAGCTGTTATTATAAGTGGT
TATATAAGTGAGGTGCTTGATGTGAGTGTGGGGAACTCATGTCCTCCAGG
AGAGCAACGAGTGTTCTTCTTATGGCCCTCAACTTTGTGCATCTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCGTGGGAAGTTA
CAGCAGCAGGAATGAGAGGCACTTGGTCACATTACATCTGAGGTCAGCAT
GCAGATATGAGGTGGGGGAAGACAGAGAGACAGAGATAGCCTAATGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGAG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 10 9 9 12 16 31 34 33 33 33 33 33 30 21 16 9 9 9 25 25 43 28 28 25 19 19 10 12 6 7 7 6 6 6 11 11 10 10 13 12 14 18
34 37 46 36 36 31 31 33 33 37 26 18 13 10 10 8 8 8 8 8 13 21 29 24 21 16 23 24 24 28 33 33 36 36 59 57 57 57 57 57 48 48 48 44 44 44 43 43 43 44
57 68 68 68 68 48 57 48 48 48 57 59 48 48 48 59 59 68 68 48 48 39 36 36 39 42 44 47 47 36 44 44 37 43 44 57 57 68 68 68 68 57 57 44 43 43 36 42 42 32
32 43 43 44 57 57 57 44 44 43 37 35 43 43 43 52 52 44 44 68 44 44 43 43 52 57 52 52 52 59 57 68 57 57 52 52 52 52 52 54 54 57 54 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 57 62 62 62 62 62 62 62 52
62 62 62 52 52 52 45 52 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 39 39 14 27 27 44 26 26 11 15 26 39 43 44 59 68 62 62 45 45 52 62 44 62 45 62 44 44 43 52 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 68 62 62 52 62 62 62 62 62 62 45 52 52 62 62 62 62 43 43 35 43 43 57 59 59 59 59 57 57 57 59 57
57 57 57 57 57 68 68 59 59 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 59 43 52 43 59 43 52 52 57 57 57 57 54 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 52 52
52 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 50 32 43 29 44 32 43 43 47 44 44 43 44 43 43 43 43 42 42 42 59 44 44 42 42 42 42 33 35 47 44 57 48 44 42 42 42 42
37 37 44 44 59 57 41 47 42 43 39 37 43 43 44 44 68 46 44 42 37 36 36 46 46 68 68 54 43 43 37 37 39 37 37 59 59 43 43 39 59 59 41 41 32 28 23 34 34 46
46 46 59 39 35 35 36 39 31 41 44 59 59 59 59 39 39 39 59 39 39 39 39 39 32 32 26 32 39 39 34 34 25 25 40 36 43 43 43 48 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59
59 59 59 48 48 48 59 48 48 48 46 59 47 48 48 48 48 48 48 48 48 41 47 59 59 59 59 41 36 29 37 37 37 33 30 30 39 39 43 32 32 40 40 39 39 39 39 37 37 39
39 36 36 36 39 39 48 43 43 43 43 41 43 43 59 59 43 43 40 30 30 28 28 32 21 16 9 9 9 15 18 34 31 31 20 22 22 24 24 29 36 37 43 36 36 39 39 41 37 37
32 28 26 31 28 39 37 37 26 26 13 15 15 25 24 28 28 13 13 13 19 19 32 37 37 37 36 36 39 39 40 39 39 36 32 35 30 26 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 13 12 8 8 6 8 8 18 26 23 28 25 22 22 25 39 37 37 37 37 39 33 39 37 37 37 23 23 9 9 9 9 11 10 9 9 9 10 17 17 19 13 18 34
34 33 36 36 33 33 33 37 37 41 33 27 12 9 9 6 6 6 6 6 11 12 14 14 27 27 33 33 28 33 33 47 39 44 39 42 37 31 26 26 42 31 26 31 25 22 28 21 42 42
42 42 42 42 47 57 54 48 47 57 39 39 39 39 43 43 43 43 43 43 43 41 44 43 39 39 43 41 30 41 32 51 47 50 50 50 68 59 59 48 48 48 57 57 48 39 37 37 37 35
35 35 44 44 42 43 43 57 38 68 68 68 50 51 50 50 50 51 68 68 68 43 43 33 42 41 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68
68 68 68 68 57 57 43 43 41 59 59 43 43 39 59 59 68 68 68 59 59 52 52 43 43 43 33 33 43 43 44 44 31 42 43 43 43 33 35 38 34 68 44 44 43 43 43 59 59 68
68 59 59 68 44 44 32 28 27 24 15 34 34 37 36 42 35 42 42 43 32 32 44 44 68 68 68 44 44 30 37 30 35 34 24 14 24 24 37 39 39 59 59 59 33 33 34 34 25 25
30 32 34 34 37 37 43 43 44 47 37 39 32 37 37 43 43 28 30 30 24 24 12 12 11 12 12 12 10 11 11 23 23 39 40 59 47 48 48 41 41 23 32 32 37 37 43 43 59 59
59 59 59 59 59 59 44 44 43 43 37 37 33 41 41 59 59 43 43 39 39 44 44 68 68 68 68 68 68 44 59 35 30 37 44 44 44 42 42 42 44 44 68 44 44 42 33 24 34 34
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 50 50 50 48 48 48 59 59 59 57 52 52 52 52 44 44 57 54 54 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 38 44 35 32 33 44 44 38 35 43 36 28 21 21 38 44
68 57 57 57 47 57 43 43 43 59 59 59 41 41 20 33 36 42 37 39 59 59 57 57 57 43 43 44 44 47 47 57 57 59 59 59 59 59 57 47 44 43 39 42 44 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 54 48 48 57 48 48 57 57 48 46 47 59 59 59 59 57 48 46 47 59 47 48 57 59 48 48 59 59 50 47 41 39 39 39 31 31 31
28 28 25 25 22 17 17 22 28 31 41 41 41 41 40 59 35 31 31 39 39 39 41 43 39 39 31 28 34 34 40 40 39 39 34 34 28 33 22 25 12 12 12 21 21 20 32 32 47 59
47 37 24 32 20 32 32 34 34 28 24 24 35 36 37 37 44 44 44 37 37 37 37 37 37 32 37 37 37 37 35 28 28 28 34 30 30 24 28 22 17 24 17 19 30 37 41 43 46 46
46 43 37 36 36 36 37 37 32 32 33 37 39 32 28 32 24 30 24 24 14 18 18 29 23 30 12 12 12 24 21 28 20 23 20 15 15 18 15 15 12 12 11 16 11 11 |